MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 plasmid pSTU288-2

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021156	TGCC	2	8	35	42	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021156	GCCA	2	8	56	63	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021156	ATCC	2	8	212	219	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021156	CCAT	2	8	1324	1331	25 %	25 %	0 %	50 %	482907337
5	NC_021156	ACCG	2	8	1659	1666	25 %	0 %	25 %	50 %	482907337
6	NC_021156	GGGC	2	8	3101	3108	0 %	0 %	75 %	25 %	482907337
7	NC_021156	GGTC	2	8	3211	3218	0 %	25 %	50 %	25 %	482907338
8	NC_021156	CTGC	2	8	3614	3621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021156	CAAT	2	8	3630	3637	50 %	25 %	0 %	25 %	482907340
10	NC_021156	CCGC	2	8	5078	5085	0 %	0 %	25 %	75 %	482907341
11	NC_021156	GCAG	2	8	6022	6029	25 %	0 %	50 %	25 %	482907342
12	NC_021156	TCTG	2	8	6241	6248	0 %	50 %	25 %	25 %	482907342
13	NC_021156	GAAA	2	8	6412	6419	75 %	0 %	25 %	0 %	482907342
14	NC_021156	TCTG	2	8	6772	6779	0 %	50 %	25 %	25 %	482907343
15	NC_021156	GGCT	2	8	7849	7856	0 %	25 %	50 %	25 %	482907344
16	NC_021156	ATCT	2	8	8496	8503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021156	AGTG	2	8	8763	8770	25 %	25 %	50 %	0 %	482907345
18	NC_021156	GCCT	2	8	9180	9187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021156	GCCG	2	8	10116	10123	0 %	0 %	50 %	50 %	482907346
20	NC_021156	CGCT	2	8	10146	10153	0 %	25 %	25 %	50 %	482907346
21	NC_021156	GCCG	2	8	10234	10241	0 %	0 %	50 %	50 %	482907346
22	NC_021156	GATG	2	8	10449	10456	25 %	25 %	50 %	0 %	482907346
23	NC_021156	TGCT	2	8	10476	10483	0 %	50 %	25 %	25 %	482907346
24	NC_021156	GCAA	2	8	10510	10517	50 %	0 %	25 %	25 %	482907346
25	NC_021156	CAGG	2	8	10525	10532	25 %	0 %	50 %	25 %	482907346
26	NC_021156	CTGC	2	8	10690	10697	0 %	25 %	25 %	50 %	482907346
27	NC_021156	CCGC	2	8	10830	10837	0 %	0 %	25 %	75 %	482907347

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.