MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 plasmid pSTU288-1

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021155	GTGCC	2	10	3153	3162	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021155	GGGCG	2	10	7651	7660	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021155	GCCGG	2	10	8870	8879	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_021155	GTGCC	2	10	10102	10111	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_021155	GCAGG	2	10	11277	11286	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021155	AAAAG	2	10	14333	14342	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021155	AGGAA	2	10	17983	17992	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021155	TTGCA	2	10	25567	25576	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021155	CAGAC	2	10	35887	35896	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021155	GGAGC	2	10	38216	38225	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021155	GACGA	2	10	41549	41558	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021155	TAAAT	2	10	76376	76385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021155	CGGGG	2	10	78465	78474	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021155	CCCGT	2	10	87903	87912	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_021155	CCCGT	2	10	89080	89089	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_021155	TTATA	2	10	97512	97521	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021155	CATTA	2	10	99661	99670	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021155	ACAAA	2	10	101038	101047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021155	TGGTT	2	10	104613	104622	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021155	GCCGC	2	10	104669	104678	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_021155	GCCGC	2	10	105180	105189	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_021155	AGGAT	2	10	111080	111089	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021155	ATCAT	2	10	114940	114949	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021155	TATCA	2	10	115049	115058	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021155	CGAGC	2	10	115152	115161	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021155	TGCTA	2	10	115184	115193	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021155	TTTAA	2	10	134341	134350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021155	CCGCC	2	10	134930	134939	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
29	NC_021155	CAGAC	2	10	148279	148288	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.