MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 plasmid pSTU288-1

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021155	T	7	7	1442	1448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021155	A	6	6	1852	1857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021155	T	6	6	2053	2058	0 %	100 %	0 %	0 %	482907136
4	NC_021155	A	6	6	4701	4706	100 %	0 %	0 %	0 %	482907142
5	NC_021155	T	6	6	7788	7793	0 %	100 %	0 %	0 %	482907146
6	NC_021155	T	6	6	8394	8399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021155	C	6	6	8476	8481	0 %	0 %	0 %	100 %	482907147
8	NC_021155	T	7	7	9936	9942	0 %	100 %	0 %	0 %	482907150
9	NC_021155	A	6	6	10003	10008	100 %	0 %	0 %	0 %	482907150
10	NC_021155	T	6	6	12458	12463	0 %	100 %	0 %	0 %	482907155
11	NC_021155	C	6	6	13130	13135	0 %	0 %	0 %	100 %	482907157
12	NC_021155	T	6	6	13475	13480	0 %	100 %	0 %	0 %	482907157
13	NC_021155	T	6	6	14262	14267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021155	A	6	6	14393	14398	100 %	0 %	0 %	0 %	482907158
15	NC_021155	T	6	6	15388	15393	0 %	100 %	0 %	0 %	482907160
16	NC_021155	T	8	8	17329	17336	0 %	100 %	0 %	0 %	482907162
17	NC_021155	A	6	6	17733	17738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021155	A	6	6	17780	17785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021155	T	7	7	19239	19245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021155	A	6	6	19321	19326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021155	C	6	6	19865	19870	0 %	0 %	0 %	100 %	482907165
22	NC_021155	C	6	6	20370	20375	0 %	0 %	0 %	100 %	482907166
23	NC_021155	A	6	6	20521	20526	100 %	0 %	0 %	0 %	482907166
24	NC_021155	T	6	6	20540	20545	0 %	100 %	0 %	0 %	482907166
25	NC_021155	T	6	6	20907	20912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021155	T	6	6	21455	21460	0 %	100 %	0 %	0 %	482907168
27	NC_021155	A	7	7	22388	22394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021155	A	6	6	22850	22855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021155	T	6	6	24531	24536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021155	T	6	6	24737	24742	0 %	100 %	0 %	0 %	482907173
31	NC_021155	T	6	6	24946	24951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021155	T	6	6	25090	25095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021155	A	7	7	25114	25120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021155	T	6	6	25347	25352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021155	T	6	6	25472	25477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021155	T	6	6	25496	25501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021155	T	6	6	25525	25530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021155	T	6	6	25532	25537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021155	T	6	6	25587	25592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021155	A	6	6	26367	26372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021155	G	6	6	27130	27135	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021155	A	6	6	28197	28202	100 %	0 %	0 %	0 %	482907177
43	NC_021155	G	6	6	29467	29472	0 %	0 %	100 %	0 %	482907177
44	NC_021155	G	6	6	30563	30568	0 %	0 %	100 %	0 %	482907179
45	NC_021155	G	6	6	31094	31099	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021155	A	6	6	31994	31999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021155	T	6	6	33012	33017	0 %	100 %	0 %	0 %	482907182
48	NC_021155	T	6	6	33211	33216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021155	T	6	6	35394	35399	0 %	100 %	0 %	0 %	482907185
50	NC_021155	T	7	7	35567	35573	0 %	100 %	0 %	0 %	482907185
51	NC_021155	T	6	6	35918	35923	0 %	100 %	0 %	0 %	482907186
52	NC_021155	A	6	6	37206	37211	100 %	0 %	0 %	0 %	482907188
53	NC_021155	A	7	7	37643	37649	100 %	0 %	0 %	0 %	482907189
54	NC_021155	T	6	6	38280	38285	0 %	100 %	0 %	0 %	482907190
55	NC_021155	G	7	7	38408	38414	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021155	T	7	7	38486	38492	0 %	100 %	0 %	0 %	482907191
57	NC_021155	T	7	7	38852	38858	0 %	100 %	0 %	0 %	482907191
58	NC_021155	A	6	6	38992	38997	100 %	0 %	0 %	0 %	482907191
59	NC_021155	A	6	6	39049	39054	100 %	0 %	0 %	0 %	482907191
60	NC_021155	T	6	6	39541	39546	0 %	100 %	0 %	0 %	482907193
61	NC_021155	T	6	6	41728	41733	0 %	100 %	0 %	0 %	482907197
62	NC_021155	C	10	10	42266	42275	0 %	0 %	0 %	100 %	482907198
63	NC_021155	T	8	8	43603	43610	0 %	100 %	0 %	0 %	482907201
64	NC_021155	A	6	6	43880	43885	100 %	0 %	0 %	0 %	482907202
65	NC_021155	G	6	6	45895	45900	0 %	0 %	100 %	0 %	482907203
66	NC_021155	A	6	6	50199	50204	100 %	0 %	0 %	0 %	482907205
67	NC_021155	A	6	6	50297	50302	100 %	0 %	0 %	0 %	482907205
68	NC_021155	G	6	6	50727	50732	0 %	0 %	100 %	0 %	482907206
69	NC_021155	T	6	6	50823	50828	0 %	100 %	0 %	0 %	482907206
70	NC_021155	T	6	6	51827	51832	0 %	100 %	0 %	0 %	482907206
71	NC_021155	T	6	6	52329	52334	0 %	100 %	0 %	0 %	482907206
72	NC_021155	A	6	6	52440	52445	100 %	0 %	0 %	0 %	482907206
73	NC_021155	T	6	6	52898	52903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021155	T	7	7	53916	53922	0 %	100 %	0 %	0 %	482907207
75	NC_021155	T	8	8	54298	54305	0 %	100 %	0 %	0 %	482907208
76	NC_021155	T	6	6	54724	54729	0 %	100 %	0 %	0 %	482907209
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78	NC_021155	A	6	6	56726	56731	100 %	0 %	0 %	0 %	482907209
79	NC_021155	C	6	6	58190	58195	0 %	0 %	0 %	100 %	482907210
80	NC_021155	A	6	6	58316	58321	100 %	0 %	0 %	0 %	482907210
81	NC_021155	T	6	6	58464	58469	0 %	100 %	0 %	0 %	482907210
82	NC_021155	A	7	7	59374	59380	100 %	0 %	0 %	0 %	482907212
83	NC_021155	A	6	6	59571	59576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021155	T	6	6	60151	60156	0 %	100 %	0 %	0 %	482907213
85	NC_021155	C	6	6	60464	60469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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87	NC_021155	T	6	6	65730	65735	0 %	100 %	0 %	0 %	482907221
88	NC_021155	A	6	6	65751	65756	100 %	0 %	0 %	0 %	482907221
89	NC_021155	T	6	6	66791	66796	0 %	100 %	0 %	0 %	482907222
90	NC_021155	T	8	8	68040	68047	0 %	100 %	0 %	0 %	482907222
91	NC_021155	T	6	6	69392	69397	0 %	100 %	0 %	0 %	482907225
92	NC_021155	A	6	6	69807	69812	100 %	0 %	0 %	0 %	482907227
93	NC_021155	T	6	6	70527	70532	0 %	100 %	0 %	0 %	482907229
94	NC_021155	C	6	6	71697	71702	0 %	0 %	0 %	100 %	482907230
95	NC_021155	T	6	6	73237	73242	0 %	100 %	0 %	0 %	482907231
96	NC_021155	A	6	6	73415	73420	100 %	0 %	0 %	0 %	482907232
97	NC_021155	T	6	6	73936	73941	0 %	100 %	0 %	0 %	482907233
98	NC_021155	A	9	9	74833	74841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021155	A	6	6	75079	75084	100 %	0 %	0 %	0 %	482907236
100	NC_021155	A	7	7	75166	75172	100 %	0 %	0 %	0 %	482907236
101	NC_021155	T	7	7	75634	75640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021155	T	6	6	76144	76149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021155	T	6	6	76286	76291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021155	G	6	6	76866	76871	0 %	0 %	100 %	0 %	482907238
105	NC_021155	T	6	6	77078	77083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021155	T	6	6	77426	77431	0 %	100 %	0 %	0 %	482907239
107	NC_021155	A	6	6	78051	78056	100 %	0 %	0 %	0 %	482907241
108	NC_021155	A	6	6	78172	78177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021155	T	6	6	78408	78413	0 %	100 %	0 %	0 %	482907242
110	NC_021155	A	6	6	79261	79266	100 %	0 %	0 %	0 %	482907244
111	NC_021155	A	6	6	79644	79649	100 %	0 %	0 %	0 %	482907245
112	NC_021155	T	6	6	80090	80095	0 %	100 %	0 %	0 %	482907246
113	NC_021155	A	7	7	83488	83494	100 %	0 %	0 %	0 %	482907249
114	NC_021155	T	6	6	83556	83561	0 %	100 %	0 %	0 %	482907250
115	NC_021155	C	6	6	83895	83900	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_021155	T	6	6	83920	83925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021155	T	6	6	84401	84406	0 %	100 %	0 %	0 %	482907251
118	NC_021155	T	6	6	84834	84839	0 %	100 %	0 %	0 %	482907252
119	NC_021155	A	6	6	85382	85387	100 %	0 %	0 %	0 %	482907253
120	NC_021155	T	6	6	87476	87481	0 %	100 %	0 %	0 %	482907257
121	NC_021155	A	6	6	87978	87983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021155	A	7	7	89932	89938	100 %	0 %	0 %	0 %	482907262
123	NC_021155	C	6	6	90527	90532	0 %	0 %	0 %	100 %	482907262
124	NC_021155	T	6	6	93353	93358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021155	A	6	6	93641	93646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021155	T	6	6	93702	93707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_021155	A	6	6	99487	99492	100 %	0 %	0 %	0 %	482907272
130	NC_021155	T	6	6	99706	99711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021155	A	6	6	100989	100994	100 %	0 %	0 %	0 %	482907274
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133	NC_021155	T	6	6	101474	101479	0 %	100 %	0 %	0 %	482907275
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.