MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 2788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021151	AGGTA	2	10	2259	2268	40 %	20 %	40 %	0 %	482902550
2	NC_021151	ATTGC	2	10	3102	3111	20 %	40 %	20 %	20 %	482902551
3	NC_021151	CGGCG	2	10	3850	3859	0 %	0 %	60 %	40 %	482902552
4	NC_021151	CCGCG	2	10	6890	6899	0 %	0 %	40 %	60 %	482902554
5	NC_021151	GATGA	2	10	8621	8630	40 %	20 %	40 %	0 %	482902556
6	NC_021151	GCGTG	2	10	13696	13705	0 %	20 %	60 %	20 %	482902561
7	NC_021151	AATCA	2	10	15212	15221	60 %	20 %	0 %	20 %	482902562
8	NC_021151	GGCTG	2	10	18557	18566	0 %	20 %	60 %	20 %	482902566
9	NC_021151	AGAGC	2	10	19078	19087	40 %	0 %	40 %	20 %	482902566
10	NC_021151	CCTGA	2	10	19619	19628	20 %	20 %	20 %	40 %	482902566
11	NC_021151	TACCG	2	10	20756	20765	20 %	20 %	20 %	40 %	482902567
12	NC_021151	GGCCG	2	10	21380	21389	0 %	0 %	60 %	40 %	482902567
13	NC_021151	CTTTT	2	10	23099	23108	0 %	80 %	0 %	20 %	482902568
14	NC_021151	CGGTA	2	10	24267	24276	20 %	20 %	40 %	20 %	482902569
15	NC_021151	CTGTT	2	10	24306	24315	0 %	60 %	20 %	20 %	482902569
16	NC_021151	TATTT	2	10	25140	25149	20 %	80 %	0 %	0 %	482902570
17	NC_021151	GCGTC	2	10	28063	28072	0 %	20 %	40 %	40 %	482902571
18	NC_021151	ATCTG	2	10	30671	30680	20 %	40 %	20 %	20 %	482902575
19	NC_021151	TTACG	2	10	30726	30735	20 %	40 %	20 %	20 %	482902575
20	NC_021151	GGGCG	2	10	31495	31504	0 %	0 %	80 %	20 %	482902576
21	NC_021151	TGCGT	2	10	31874	31883	0 %	40 %	40 %	20 %	482902577
22	NC_021151	AAAAG	2	10	32268	32277	80 %	0 %	20 %	0 %	482902578
23	NC_021151	TATAA	2	10	33871	33880	60 %	40 %	0 %	0 %	482902579
24	NC_021151	AGCGA	2	10	35297	35306	40 %	0 %	40 %	20 %	482902581
25	NC_021151	TCCTG	2	10	35507	35516	0 %	40 %	20 %	40 %	482902581
26	NC_021151	GGTCA	2	10	37742	37751	20 %	20 %	40 %	20 %	482902582
27	NC_021151	TTCAT	2	10	39014	39023	20 %	60 %	0 %	20 %	482902583
28	NC_021151	TGAAA	2	10	39833	39842	60 %	20 %	20 %	0 %	482902584
29	NC_021151	ACGGC	2	10	44193	44202	20 %	0 %	40 %	40 %	482902587
30	NC_021151	TTTTA	2	10	44519	44528	20 %	80 %	0 %	0 %	482902587
31	NC_021151	GGGCT	2	10	46267	46276	0 %	20 %	60 %	20 %	482902588
32	NC_021151	GCGTA	2	10	48143	48152	20 %	20 %	40 %	20 %	482902590
33	NC_021151	GACCA	2	10	48748	48757	40 %	0 %	20 %	40 %	482902590
34	NC_021151	CCGGC	2	10	48890	48899	0 %	0 %	40 %	60 %	482902590
35	NC_021151	CAGAC	2	10	50080	50089	40 %	0 %	20 %	40 %	482902590
36	NC_021151	TGTGC	2	10	52841	52850	0 %	40 %	40 %	20 %	482902594
37	NC_021151	GTTTG	2	10	55163	55172	0 %	60 %	40 %	0 %	482902595
38	NC_021151	CACTA	2	10	56294	56303	40 %	20 %	0 %	40 %	482902595
39	NC_021151	CGGCG	2	10	56832	56841	0 %	0 %	60 %	40 %	482902596
40	NC_021151	TTCAC	2	10	57087	57096	20 %	40 %	0 %	40 %	482902597
41	NC_021151	AAAAT	2	10	58658	58667	80 %	20 %	0 %	0 %	482902599
42	NC_021151	GGAAA	2	10	59445	59454	60 %	0 %	40 %	0 %	482902599
43	NC_021151	CGCTG	2	10	59935	59944	0 %	20 %	40 %	40 %	482902600
44	NC_021151	GCCTG	2	10	64494	64503	0 %	20 %	40 %	40 %	482902603
45	NC_021151	GCGCG	2	10	64648	64657	0 %	0 %	60 %	40 %	482902604
46	NC_021151	CGTGC	2	10	71071	71080	0 %	20 %	40 %	40 %	482902610
47	NC_021151	TTGAT	2	10	71241	71250	20 %	60 %	20 %	0 %	482902610
48	NC_021151	ACCGC	2	10	71801	71810	20 %	0 %	20 %	60 %	482902610
49	NC_021151	CGATG	2	10	77463	77472	20 %	20 %	40 %	20 %	482902616
50	NC_021151	GCGAA	2	10	78404	78413	40 %	0 %	40 %	20 %	482902616
51	NC_021151	CGTAC	2	10	79294	79303	20 %	20 %	20 %	40 %	482902616
52	NC_021151	TTGCC	2	10	80930	80939	0 %	40 %	20 %	40 %	482902618
53	NC_021151	CGTCC	2	10	81040	81049	0 %	20 %	20 %	60 %	482902618
54	NC_021151	TTCAG	2	10	84157	84166	20 %	40 %	20 %	20 %	482902621
55	NC_021151	GGCCA	2	10	84306	84315	20 %	0 %	40 %	40 %	482902621
56	NC_021151	GTACG	2	10	86877	86886	20 %	20 %	40 %	20 %	482902623
57	NC_021151	CAGAA	2	10	87590	87599	60 %	0 %	20 %	20 %	482902623
58	NC_021151	CCGCA	2	10	89709	89718	20 %	0 %	20 %	60 %	482902626
59	NC_021151	CGGTT	2	10	90214	90223	0 %	40 %	40 %	20 %	482902627
60	NC_021151	GCTCC	2	10	91350	91359	0 %	20 %	20 %	60 %	482902627
61	NC_021151	TGGCG	2	10	91994	92003	0 %	20 %	60 %	20 %	482902629
62	NC_021151	TTTCC	2	10	95908	95917	0 %	60 %	0 %	40 %	482902633
63	NC_021151	GTGGC	2	10	96477	96486	0 %	20 %	60 %	20 %	482902633
64	NC_021151	TGCAC	2	10	98394	98403	20 %	20 %	20 %	40 %	482902634
65	NC_021151	TGGCA	2	10	98463	98472	20 %	20 %	40 %	20 %	482902634
66	NC_021151	TCTGT	2	10	98789	98798	0 %	60 %	20 %	20 %	482902635
67	NC_021151	GCGCT	2	10	99099	99108	0 %	20 %	40 %	40 %	482902635
68	NC_021151	GGCGC	2	10	99513	99522	0 %	0 %	60 %	40 %	482902635
69	NC_021151	GCGAC	2	10	99826	99835	20 %	0 %	40 %	40 %	482902635
70	NC_021151	AACGT	2	10	102283	102292	40 %	20 %	20 %	20 %	482902638
71	NC_021151	CCCAA	2	10	104433	104442	40 %	0 %	0 %	60 %	482902641
72	NC_021151	TTGTT	2	10	105140	105149	0 %	80 %	20 %	0 %	482902641
73	NC_021151	GCTTC	2	10	106520	106529	0 %	40 %	20 %	40 %	482902642
74	NC_021151	TGCGT	2	10	106807	106816	0 %	40 %	40 %	20 %	482902642
75	NC_021151	TGATC	2	10	108507	108516	20 %	40 %	20 %	20 %	482902643
76	NC_021151	TGGCG	2	10	111667	111676	0 %	20 %	60 %	20 %	482902645
77	NC_021151	AGCGC	2	10	112227	112236	20 %	0 %	40 %	40 %	482902645
78	NC_021151	ACGTT	2	10	113044	113053	20 %	40 %	20 %	20 %	482902646
79	NC_021151	CCGCG	2	10	113312	113321	0 %	0 %	40 %	60 %	482902646
80	NC_021151	ACAGA	2	10	116639	116648	60 %	0 %	20 %	20 %	482902648
81	NC_021151	CAGCG	2	10	117814	117823	20 %	0 %	40 %	40 %	482902650
82	NC_021151	GCCGG	2	10	118114	118123	0 %	0 %	60 %	40 %	482902650
83	NC_021151	CGAGC	2	10	118239	118248	20 %	0 %	40 %	40 %	482902650
84	NC_021151	ATTTG	2	10	118682	118691	20 %	60 %	20 %	0 %	482902650
85	NC_021151	TTGCC	2	10	123186	123195	0 %	40 %	20 %	40 %	482902654
86	NC_021151	AGCAG	2	10	123863	123872	40 %	0 %	40 %	20 %	482902655
87	NC_021151	AGTTT	2	10	126093	126102	20 %	60 %	20 %	0 %	482902656
88	NC_021151	TCGAT	2	10	127941	127950	20 %	40 %	20 %	20 %	482902657
89	NC_021151	CGGCG	2	10	130252	130261	0 %	0 %	60 %	40 %	482902660
90	NC_021151	CGTTT	2	10	130714	130723	0 %	60 %	20 %	20 %	482902660
91	NC_021151	GACCG	2	10	132158	132167	20 %	0 %	40 %	40 %	482902662
92	NC_021151	ATTCC	2	10	135815	135824	20 %	40 %	0 %	40 %	482902665
93	NC_021151	AAAGC	2	10	138112	138121	60 %	0 %	20 %	20 %	482902667
94	NC_021151	CCGCA	2	10	138645	138654	20 %	0 %	20 %	60 %	482902667
95	NC_021151	AGTTC	2	10	141016	141025	20 %	40 %	20 %	20 %	482902669
96	NC_021151	TGCCT	2	10	141116	141125	0 %	40 %	20 %	40 %	482902670
97	NC_021151	AAGCG	2	10	145769	145778	40 %	0 %	40 %	20 %	482902673
98	NC_021151	GTTTG	2	10	147672	147681	0 %	60 %	40 %	0 %	482902675
99	NC_021151	CGTAT	2	10	149143	149152	20 %	40 %	20 %	20 %	482902676
100	NC_021151	ATCAG	2	10	150979	150988	40 %	20 %	20 %	20 %	482902678
101	NC_021151	CTGCC	2	10	152988	152997	0 %	20 %	20 %	60 %	482902679
102	NC_021151	CGGCG	2	10	155718	155727	0 %	0 %	60 %	40 %	482902682
103	NC_021151	CCGGC	2	10	159071	159080	0 %	0 %	40 %	60 %	482902685
104	NC_021151	GATCA	2	10	162389	162398	40 %	20 %	20 %	20 %	482902690
105	NC_021151	CGTCA	2	10	163135	163144	20 %	20 %	20 %	40 %	482902691
106	NC_021151	ATCCC	2	10	164835	164844	20 %	20 %	0 %	60 %	482902693
107	NC_021151	AGCGC	2	10	165543	165552	20 %	0 %	40 %	40 %	482902693
108	NC_021151	TGAGC	2	10	167392	167401	20 %	20 %	40 %	20 %	482902694
109	NC_021151	CGCAT	2	10	167654	167663	20 %	20 %	20 %	40 %	482902695
110	NC_021151	CGAAC	2	10	168383	168392	40 %	0 %	20 %	40 %	482902696
111	NC_021151	GTTCA	2	10	168649	168658	20 %	40 %	20 %	20 %	482902696
112	NC_021151	ATGAC	2	10	169615	169624	40 %	20 %	20 %	20 %	482902697
113	NC_021151	CTGGA	2	10	170205	170214	20 %	20 %	40 %	20 %	482902698
114	NC_021151	CAGAA	2	10	172324	172333	60 %	0 %	20 %	20 %	482902700
115	NC_021151	CGAAG	2	10	175195	175204	40 %	0 %	40 %	20 %	482902702
116	NC_021151	GGCAT	2	10	182474	182483	20 %	20 %	40 %	20 %	482902706
117	NC_021151	GGCCA	2	10	182896	182905	20 %	0 %	40 %	40 %	482902707
118	NC_021151	GCGCC	2	10	182909	182918	0 %	0 %	40 %	60 %	482902707
119	NC_021151	CGTTT	2	10	183411	183420	0 %	60 %	20 %	20 %	482902707
120	NC_021151	GGGGA	2	10	183463	183472	20 %	0 %	80 %	0 %	482902707
121	NC_021151	TCTGG	2	10	187096	187105	0 %	40 %	40 %	20 %	482902709
122	NC_021151	CCGCT	2	10	190747	190756	0 %	20 %	20 %	60 %	482902712
123	NC_021151	GCCCA	2	10	193299	193308	20 %	0 %	20 %	60 %	482902715
124	NC_021151	GCGCA	2	10	193704	193713	20 %	0 %	40 %	40 %	482902715
125	NC_021151	ATCGG	2	10	195095	195104	20 %	20 %	40 %	20 %	482902717
126	NC_021151	GCCGC	2	10	196305	196314	0 %	0 %	40 %	60 %	482902719
127	NC_021151	ATCCA	2	10	201655	201664	40 %	20 %	0 %	40 %	482902722
128	NC_021151	CGGCG	2	10	203772	203781	0 %	0 %	60 %	40 %	482902725
129	NC_021151	TGGTC	2	10	204638	204647	0 %	40 %	40 %	20 %	482902725
130	NC_021151	CGTCA	2	10	206336	206345	20 %	20 %	20 %	40 %	482902726
131	NC_021151	AGCGC	2	10	207287	207296	20 %	0 %	40 %	40 %	482902726
132	NC_021151	CGGCG	2	10	209202	209211	0 %	0 %	60 %	40 %	482902729
133	NC_021151	TTCGG	2	10	210082	210091	0 %	40 %	40 %	20 %	482902730
134	NC_021151	CTTGC	2	10	211091	211100	0 %	40 %	20 %	40 %	482902731
135	NC_021151	TGAGC	2	10	211503	211512	20 %	20 %	40 %	20 %	482902732
136	NC_021151	AGATC	2	10	213172	213181	40 %	20 %	20 %	20 %	482902734
137	NC_021151	CGCGG	2	10	213594	213603	0 %	0 %	60 %	40 %	482902735
138	NC_021151	CGCGG	2	10	213778	213787	0 %	0 %	60 %	40 %	482902735
139	NC_021151	GCCAG	2	10	215762	215771	20 %	0 %	40 %	40 %	482902736
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143	NC_021151	CAGCG	2	10	220329	220338	20 %	0 %	40 %	40 %	482902740
144	NC_021151	GGCGG	2	10	222079	222088	0 %	0 %	80 %	20 %	482902741
145	NC_021151	GTTGA	2	10	223928	223937	20 %	40 %	40 %	0 %	482902742
146	NC_021151	TTCAA	2	10	224034	224043	40 %	40 %	0 %	20 %	482902742
147	NC_021151	GGAAT	2	10	224788	224797	40 %	20 %	40 %	0 %	482902742
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149	NC_021151	TGGCG	2	10	226650	226659	0 %	20 %	60 %	20 %	482902744
150	NC_021151	TGGTC	2	10	226778	226787	0 %	40 %	40 %	20 %	482902744
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153	NC_021151	GCCGC	2	10	234576	234585	0 %	0 %	40 %	60 %	482902749
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155	NC_021151	CAGGT	2	10	237414	237423	20 %	20 %	40 %	20 %	482902753
156	NC_021151	CGGCG	2	10	238907	238916	0 %	0 %	60 %	40 %	482902754
157	NC_021151	TGCTT	2	10	239401	239410	0 %	60 %	20 %	20 %	482902754
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160	NC_021151	TTCGG	2	10	252325	252334	0 %	40 %	40 %	20 %	482902765
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166	NC_021151	TACGG	2	10	263610	263619	20 %	20 %	40 %	20 %	482902775
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169	NC_021151	ATGCC	2	10	267998	268007	20 %	20 %	20 %	40 %	482902780
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254	NC_021151	GCCGA	2	10	432696	432705	20 %	0 %	40 %	40 %	482902939
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260	NC_021151	GCGCT	2	10	438439	438448	0 %	20 %	40 %	40 %	482902943
261	NC_021151	TAAAT	2	10	440553	440562	60 %	40 %	0 %	0 %	482902946
262	NC_021151	CCTGG	2	10	440849	440858	0 %	20 %	40 %	40 %	482902946
263	NC_021151	GCAGG	2	10	443121	443130	20 %	0 %	60 %	20 %	482902949
264	NC_021151	GTACG	2	10	446788	446797	20 %	20 %	40 %	20 %	482902954
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