MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 11338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021151	ACCA	2	8	172	179	50 %	0 %	0 %	50 %	482902550
2	NC_021151	GATC	2	8	483	490	25 %	25 %	25 %	25 %	482902550
3	NC_021151	ATGA	2	8	2834	2841	50 %	25 %	25 %	0 %	482902551
4	NC_021151	GATG	2	8	4339	4346	25 %	25 %	50 %	0 %	482902552
5	NC_021151	CAGC	2	8	4348	4355	25 %	0 %	25 %	50 %	482902552
6	NC_021151	CTGA	2	8	4406	4413	25 %	25 %	25 %	25 %	482902552
7	NC_021151	CTGC	2	8	4676	4683	0 %	25 %	25 %	50 %	482902552
8	NC_021151	GCCA	2	8	6370	6377	25 %	0 %	25 %	50 %	482902554
9	NC_021151	TGAA	2	8	6996	7003	50 %	25 %	25 %	0 %	482902554
10	NC_021151	GCGT	2	8	7862	7869	0 %	25 %	50 %	25 %	482902555
11	NC_021151	AAGA	2	8	7944	7951	75 %	0 %	25 %	0 %	482902555
12	NC_021151	CTGT	2	8	8372	8379	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021151	GAAC	2	8	9424	9431	50 %	0 %	25 %	25 %	482902557
14	NC_021151	CAGG	2	8	9828	9835	25 %	0 %	50 %	25 %	482902558
15	NC_021151	TTGA	2	8	10683	10690	25 %	50 %	25 %	0 %	482902559
16	NC_021151	TGGC	2	8	10710	10717	0 %	25 %	50 %	25 %	482902559
17	NC_021151	TCGT	2	8	10830	10837	0 %	50 %	25 %	25 %	482902559
18	NC_021151	TCTG	2	8	11095	11102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021151	ATGG	2	8	11353	11360	25 %	25 %	50 %	0 %	482902560
20	NC_021151	TGGT	2	8	11444	11451	0 %	50 %	50 %	0 %	482902560
21	NC_021151	CAAC	2	8	11957	11964	50 %	0 %	0 %	50 %	482902560
22	NC_021151	AAGA	2	8	12031	12038	75 %	0 %	25 %	0 %	482902560
23	NC_021151	CCAT	2	8	12608	12615	25 %	25 %	0 %	50 %	482902560
24	NC_021151	GCGT	2	8	12636	12643	0 %	25 %	50 %	25 %	482902560
25	NC_021151	GGCT	2	8	13128	13135	0 %	25 %	50 %	25 %	482902560
26	NC_021151	CGGT	2	8	14298	14305	0 %	25 %	50 %	25 %	482902561
27	NC_021151	TCAG	2	8	14949	14956	25 %	25 %	25 %	25 %	482902562
28	NC_021151	TTTG	2	8	15239	15246	0 %	75 %	25 %	0 %	482902562
29	NC_021151	CGAA	2	8	15454	15461	50 %	0 %	25 %	25 %	482902562
30	NC_021151	ATTG	2	8	15466	15473	25 %	50 %	25 %	0 %	482902562
31	NC_021151	ATTA	2	8	16134	16141	50 %	50 %	0 %	0 %	482902563
32	NC_021151	ATAA	2	8	16226	16233	75 %	25 %	0 %	0 %	482902564
33	NC_021151	AATA	2	8	17702	17709	75 %	25 %	0 %	0 %	482902566
34	NC_021151	GGGC	2	8	18288	18295	0 %	0 %	75 %	25 %	482902566
35	NC_021151	CGTG	2	8	18988	18995	0 %	25 %	50 %	25 %	482902566
36	NC_021151	CCAA	2	8	20989	20996	50 %	0 %	0 %	50 %	482902567
37	NC_021151	GACG	2	8	21335	21342	25 %	0 %	50 %	25 %	482902567
38	NC_021151	TGGC	2	8	21988	21995	0 %	25 %	50 %	25 %	482902567
39	NC_021151	TGGC	2	8	22094	22101	0 %	25 %	50 %	25 %	482902567
40	NC_021151	CGCC	2	8	22360	22367	0 %	0 %	25 %	75 %	482902567
41	NC_021151	CTGG	2	8	22706	22713	0 %	25 %	50 %	25 %	482902567
42	NC_021151	TTAT	2	8	22971	22978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021151	TTTA	2	8	23204	23211	25 %	75 %	0 %	0 %	482902568
44	NC_021151	TCTG	2	8	23661	23668	0 %	50 %	25 %	25 %	482902568
45	NC_021151	TGAA	2	8	24172	24179	50 %	25 %	25 %	0 %	482902569
46	NC_021151	CCAG	2	8	24443	24450	25 %	0 %	25 %	50 %	482902569
47	NC_021151	ACCG	2	8	25120	25127	25 %	0 %	25 %	50 %	482902570
48	NC_021151	AAAT	2	8	25180	25187	75 %	25 %	0 %	0 %	482902570
49	NC_021151	TCTG	2	8	25637	25644	0 %	50 %	25 %	25 %	482902571
50	NC_021151	GCCT	2	8	25818	25825	0 %	25 %	25 %	50 %	482902571
51	NC_021151	CCTT	2	8	26324	26331	0 %	50 %	0 %	50 %	482902571
52	NC_021151	TCAG	2	8	26683	26690	25 %	25 %	25 %	25 %	482902571
53	NC_021151	ATCA	2	8	27096	27103	50 %	25 %	0 %	25 %	482902571
54	NC_021151	CAGC	2	8	27140	27147	25 %	0 %	25 %	50 %	482902571
55	NC_021151	AGCC	2	8	27630	27637	25 %	0 %	25 %	50 %	482902571
56	NC_021151	CCGA	2	8	27837	27844	25 %	0 %	25 %	50 %	482902571
57	NC_021151	ATTA	2	8	28230	28237	50 %	50 %	0 %	0 %	482902572
58	NC_021151	GGCG	2	8	28472	28479	0 %	0 %	75 %	25 %	482902572
59	NC_021151	ATGA	2	8	29677	29684	50 %	25 %	25 %	0 %	482902573
60	NC_021151	TGCT	2	8	30247	30254	0 %	50 %	25 %	25 %	482902575
61	NC_021151	TATC	2	8	30303	30310	25 %	50 %	0 %	25 %	482902575
62	NC_021151	GTAA	2	8	30340	30347	50 %	25 %	25 %	0 %	482902575
63	NC_021151	TTCG	2	8	30602	30609	0 %	50 %	25 %	25 %	482902575
64	NC_021151	GTCA	2	8	31112	31119	25 %	25 %	25 %	25 %	482902576
65	NC_021151	ACCG	2	8	31932	31939	25 %	0 %	25 %	50 %	482902577
66	NC_021151	AGGC	2	8	31970	31977	25 %	0 %	50 %	25 %	482902577
67	NC_021151	CCTG	2	8	32406	32413	0 %	25 %	25 %	50 %	482902578
68	NC_021151	CGCA	2	8	32596	32603	25 %	0 %	25 %	50 %	482902578
69	NC_021151	TAAA	2	8	32666	32673	75 %	25 %	0 %	0 %	482902578
70	NC_021151	CCAG	2	8	33052	33059	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021151	TTAT	2	8	33235	33242	25 %	75 %	0 %	0 %	482902579
72	NC_021151	TTGG	2	8	33619	33626	0 %	50 %	50 %	0 %	482902579
73	NC_021151	CTTT	2	8	33999	34006	0 %	75 %	0 %	25 %	482902579
74	NC_021151	GAAG	2	8	34039	34046	50 %	0 %	50 %	0 %	482902579
75	NC_021151	TAAA	2	8	34091	34098	75 %	25 %	0 %	0 %	482902580
76	NC_021151	ATAA	2	8	34370	34377	75 %	25 %	0 %	0 %	482902580
77	NC_021151	GTGC	2	8	34493	34500	0 %	25 %	50 %	25 %	482902580
78	NC_021151	TTAA	2	8	34503	34510	50 %	50 %	0 %	0 %	482902580
79	NC_021151	TGAT	2	8	34738	34745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021151	TGGA	2	8	35255	35262	25 %	25 %	50 %	0 %	482902581
81	NC_021151	GGGA	2	8	36199	36206	25 %	0 %	75 %	0 %	482902581
82	NC_021151	ATAC	2	8	37184	37191	50 %	25 %	0 %	25 %	482902582
83	NC_021151	GAAG	2	8	37256	37263	50 %	0 %	50 %	0 %	482902582
84	NC_021151	CACG	2	8	37819	37826	25 %	0 %	25 %	50 %	482902582
85	NC_021151	TAAT	2	8	37921	37928	50 %	50 %	0 %	0 %	482902582
86	NC_021151	CCAT	2	8	38377	38384	25 %	25 %	0 %	50 %	482902582
87	NC_021151	ATTA	2	8	38471	38478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021151	AATT	2	8	39754	39761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021151	GCGG	2	8	40245	40252	0 %	0 %	75 %	25 %	482902584
90	NC_021151	CTGG	2	8	40463	40470	0 %	25 %	50 %	25 %	482902584
91	NC_021151	CCGA	2	8	40980	40987	25 %	0 %	25 %	50 %	482902584
92	NC_021151	ATCG	2	8	41136	41143	25 %	25 %	25 %	25 %	482902584
93	NC_021151	TCAA	2	8	41197	41204	50 %	25 %	0 %	25 %	482902584
94	NC_021151	ACCG	2	8	41464	41471	25 %	0 %	25 %	50 %	482902585
95	NC_021151	GAAA	2	8	41515	41522	75 %	0 %	25 %	0 %	482902585
96	NC_021151	GGTC	2	8	42087	42094	0 %	25 %	50 %	25 %	482902585
97	NC_021151	TTTG	2	8	42611	42618	0 %	75 %	25 %	0 %	482902585
98	NC_021151	GTAT	2	8	42906	42913	25 %	50 %	25 %	0 %	482902586
99	NC_021151	TCCG	2	8	43300	43307	0 %	25 %	25 %	50 %	482902586
100	NC_021151	ATGA	2	8	45362	45369	50 %	25 %	25 %	0 %	482902587
101	NC_021151	AACG	2	8	45664	45671	50 %	0 %	25 %	25 %	482902587
102	NC_021151	TGAC	2	8	45748	45755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021151	GAAA	2	8	46612	46619	75 %	0 %	25 %	0 %	482902588
104	NC_021151	TCGC	2	8	46627	46634	0 %	25 %	25 %	50 %	482902588
105	NC_021151	GCTG	2	8	46818	46825	0 %	25 %	50 %	25 %	482902588
106	NC_021151	CACG	2	8	47516	47523	25 %	0 %	25 %	50 %	482902589
107	NC_021151	CAGC	2	8	47543	47550	25 %	0 %	25 %	50 %	482902589
108	NC_021151	CTGC	2	8	47680	47687	0 %	25 %	25 %	50 %	482902589
109	NC_021151	TACC	2	8	48027	48034	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021151	CATG	2	8	48248	48255	25 %	25 %	25 %	25 %	482902590
111	NC_021151	AAGT	2	8	49042	49049	50 %	25 %	25 %	0 %	482902590
112	NC_021151	CCAG	2	8	49100	49107	25 %	0 %	25 %	50 %	482902590
113	NC_021151	TTGA	2	8	49881	49888	25 %	50 %	25 %	0 %	482902590
114	NC_021151	GAAA	2	8	50216	50223	75 %	0 %	25 %	0 %	482902591
115	NC_021151	GCCA	2	8	50557	50564	25 %	0 %	25 %	50 %	482902591
116	NC_021151	TAAA	2	8	50950	50957	75 %	25 %	0 %	0 %	482902591
117	NC_021151	TCTT	2	8	51069	51076	0 %	75 %	0 %	25 %	482902591
118	NC_021151	AGTA	2	8	51643	51650	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021151	ATCA	2	8	51683	51690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021151	GAAA	2	8	51803	51810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021151	AGGG	2	8	51836	51843	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021151	CATA	2	8	52595	52602	50 %	25 %	0 %	25 %	482902594
123	NC_021151	TCAG	2	8	52606	52613	25 %	25 %	25 %	25 %	482902594
124	NC_021151	TGGC	2	8	53320	53327	0 %	25 %	50 %	25 %	482902594
125	NC_021151	GTTC	2	8	55737	55744	0 %	50 %	25 %	25 %	482902595
126	NC_021151	AGCC	2	8	57147	57154	25 %	0 %	25 %	50 %	482902597
127	NC_021151	AAAG	2	8	57226	57233	75 %	0 %	25 %	0 %	482902597
128	NC_021151	ATGG	2	8	57359	57366	25 %	25 %	50 %	0 %	482902597
129	NC_021151	TGAT	2	8	58031	58038	25 %	50 %	25 %	0 %	482902598
130	NC_021151	TGGA	2	8	58700	58707	25 %	25 %	50 %	0 %	482902599
131	NC_021151	CCTG	2	8	58736	58743	0 %	25 %	25 %	50 %	482902599
132	NC_021151	GATT	2	8	59098	59105	25 %	50 %	25 %	0 %	482902599
133	NC_021151	GATC	2	8	59467	59474	25 %	25 %	25 %	25 %	482902599
134	NC_021151	CTGG	2	8	60592	60599	0 %	25 %	50 %	25 %	482902600
135	NC_021151	GTGG	2	8	60757	60764	0 %	25 %	75 %	0 %	482902600
136	NC_021151	CTGC	2	8	60967	60974	0 %	25 %	25 %	50 %	482902601
137	NC_021151	ACCA	2	8	61603	61610	50 %	0 %	0 %	50 %	482902602
138	NC_021151	GTGG	2	8	61638	61645	0 %	25 %	75 %	0 %	482902602
139	NC_021151	CATT	2	8	61828	61835	25 %	50 %	0 %	25 %	482902602
140	NC_021151	TCAA	2	8	62869	62876	50 %	25 %	0 %	25 %	482902602
141	NC_021151	TACT	2	8	63188	63195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_021151	ACGC	2	8	216694	216701	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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