MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 7517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021151	AAC	2	6	36	41	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021151	GTG	2	6	4768	4773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021151	CGC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021151	TTG	2	6	7114	7119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021151	ATG	2	6	7159	7164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021151	GGT	2	6	7212	7217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021151	CGT	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021151	ATC	2	6	7314	7319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021151	AAT	2	6	8428	8433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021151	TAG	2	6	9040	9045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021151	TCC	2	6	9052	9057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021151	GGA	2	6	9065	9070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021151	ATC	2	6	9660	9665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021151	ATA	2	6	9723	9728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021151	TAA	2	6	9757	9762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021151	TTA	2	6	11038	11043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021151	TGA	2	6	11152	11157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021151	GTG	2	6	11192	11197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021151	TTA	2	6	11246	11251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021151	ATG	2	6	11267	11272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021151	TTC	2	6	14459	14464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021151	TTG	2	6	14540	14545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021151	CAG	2	6	14583	14588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021151	TAT	2	6	14676	14681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021151	ATG	2	6	15707	15712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021151	CCT	2	6	15728	15733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021151	ATT	2	6	15761	15766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021151	ATT	2	6	17318	17323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021151	GTT	2	6	17410	17415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021151	GTT	2	6	17434	17439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021151	ATC	2	6	17463	17468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021151	GAT	2	6	17475	17480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021151	CCA	2	6	19737	19742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021151	ACT	2	6	22765	22770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021151	TTA	2	6	22872	22877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021151	GTT	2	6	23822	23827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021151	ACA	2	6	23901	23906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021151	GAT	2	6	23938	23943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021151	TAA	2	6	23965	23970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021151	TAA	2	6	23972	23977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021151	ACG	2	6	24012	24017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021151	AAG	2	6	24059	24064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021151	GAA	2	6	24105	24110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021151	CAG	2	6	24115	24120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021151	ATA	2	6	32840	32845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021151	CAT	2	6	32907	32912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021151	TAA	2	6	32961	32966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021151	GTG	2	6	33006	33011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021151	ATG	2	6	33033	33038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021151	ATA	3	9	34555	34563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021151	ATG	2	6	34643	34648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021151	TAG	2	6	34701	34706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021151	TTG	2	6	34749	34754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021151	AAT	2	6	34761	34766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021151	TAG	2	6	34858	34863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021151	ATT	2	6	34940	34945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021151	TTG	2	6	34959	34964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021151	TGT	2	6	34998	35003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021151	TCA	2	6	38460	38465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021151	TGT	2	6	39273	39278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021151	AAG	2	6	39282	39287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021151	TGT	2	6	39378	39383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021151	TTA	2	6	39384	39389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021151	TGT	2	6	39423	39428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021151	AAT	2	6	39474	39479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021151	AAT	2	6	39686	39691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021151	GAA	2	6	39717	39722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021151	AAT	2	6	41334	41339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021151	GTA	2	6	42622	42627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021151	TGA	2	6	43911	43916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021151	GTT	2	6	43920	43925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021151	ATC	2	6	45740	45745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021151	TCA	2	6	45810	45815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021151	TAG	2	6	45856	45861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021151	GAA	2	6	45866	45871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021151	AAC	2	6	51568	51573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021151	ATT	2	6	51600	51605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021151	AGT	2	6	51665	51670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021151	ATT	2	6	51691	51696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021151	TTA	2	6	51719	51724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021151	GGT	2	6	51757	51762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021151	CTT	2	6	52313	52318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021151	GTG	2	6	56962	56967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021151	TGA	2	6	58477	58482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021151	GAA	2	6	58535	58540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021151	GTC	2	6	58550	58555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021151	ACG	2	6	66624	66629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021151	GAC	2	6	66638	66643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021151	TGC	2	6	66730	66735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021151	CCG	2	6	66743	66748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021151	TAA	2	6	68143	68148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021151	ATT	2	6	68209	68214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021151	TTA	2	6	68216	68221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021151	TCT	2	6	73549	73554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021151	GGC	2	6	73657	73662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021151	TTA	2	6	75099	75104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021151	ATG	2	6	75138	75143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021151	GTT	2	6	75266	75271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021151	GTT	2	6	75276	75281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021151	GCC	2	6	75480	75485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_021151	TAA	2	6	76742	76747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021151	CGG	2	6	79991	79996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021151	TAA	2	6	80116	80121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021151	TTA	2	6	80200	80205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021151	CTG	2	6	80662	80667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021151	GGC	2	6	81349	81354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021151	CGG	2	6	82243	82248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021151	TAA	2	6	86383	86388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021151	TAT	2	6	87973	87978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021151	TTG	2	6	87986	87991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021151	ATG	2	6	88031	88036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021151	ATT	2	6	88087	88092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021151	CCG	2	6	88347	88352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_021151	GGC	2	6	91820	91825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021151	AAC	2	6	93287	93292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021151	AAT	2	6	93569	93574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021151	ATG	2	6	93807	93812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021151	CAT	2	6	94255	94260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021151	TAT	2	6	94434	94439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021151	TGA	2	6	94787	94792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021151	ATT	2	6	94827	94832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021151	GCC	2	6	95001	95006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_021151	ATT	2	6	95021	95026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021151	TAA	2	6	95032	95037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021151	TGT	3	9	95109	95117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021151	AAT	2	6	95126	95131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021151	ATA	2	6	95168	95173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021151	TAT	2	6	95181	95186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021151	TAA	2	6	95425	95430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021151	AAT	2	6	95498	95503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021151	TAA	2	6	95619	95624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021151	TAA	2	6	95658	95663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021151	TCG	2	6	97581	97586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021151	ATC	2	6	97651	97656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021151	AAG	2	6	97714	97719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021151	CTA	2	6	97750	97755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021151	TCA	2	6	97756	97761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021151	AAT	2	6	97887	97892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021151	TAA	2	6	97931	97936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021151	ATC	2	6	97944	97949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021151	ACT	2	6	100398	100403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021151	CAG	2	6	100441	100446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021151	CGA	2	6	100484	100489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021151	GGC	2	6	100512	100517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021151	GGC	2	6	101041	101046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021151	CAT	2	6	107895	107900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_021151	GAT	2	6	115140	115145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_021151	GGC	2	6	115928	115933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_021151	ATG	2	6	116102	116107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_021151	ATG	2	6	122199	122204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021151	TCA	2	6	122288	122293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_021151	TAT	2	6	128247	128252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021151	AAT	2	6	128267	128272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021151	CAT	2	6	128441	128446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_021151	ATA	2	6	128497	128502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021151	CTG	2	6	128504	128509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_021151	TAA	2	6	133976	133981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_021151	CAT	2	6	215080	215085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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265	NC_021151	GCG	2	6	218025	218030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_021151	TCT	3	9	220561	220569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_021151	GTC	2	6	220570	220575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_021151	GAA	2	6	220581	220586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_021151	TCC	2	6	223260	223265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_021151	TTA	2	6	223288	223293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_021151	ATT	2	6	229868	229873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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