MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 62736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021151	CGG	2	6	60	65	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
2	NC_021151	TGG	2	6	182	187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902550
3	NC_021151	CGG	2	6	207	212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
4	NC_021151	CTG	2	6	370	375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
5	NC_021151	CGC	2	6	399	404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
6	NC_021151	CGC	2	6	564	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
7	NC_021151	CCG	2	6	614	619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
8	NC_021151	TGG	2	6	638	643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902550
9	NC_021151	CCG	3	9	671	679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
10	NC_021151	GCC	2	6	685	690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
11	NC_021151	CTG	2	6	705	710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
12	NC_021151	GCT	2	6	774	779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
13	NC_021151	CGA	2	6	939	944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902550
14	NC_021151	AAC	2	6	979	984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902550
15	NC_021151	GAT	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902550
16	NC_021151	GGC	2	6	1035	1040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
17	NC_021151	CGC	2	6	1050	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
18	NC_021151	GGT	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902550
19	NC_021151	TCC	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902550
20	NC_021151	CCG	2	6	1152	1157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
21	NC_021151	GCT	2	6	1197	1202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
22	NC_021151	TGT	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902550
23	NC_021151	TTC	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902550
24	NC_021151	TCT	2	6	1342	1347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902550
25	NC_021151	TGG	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902550
26	NC_021151	ACG	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902550
27	NC_021151	CCA	2	6	1385	1390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902550
28	NC_021151	CGG	2	6	1461	1466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
29	NC_021151	CGG	2	6	1470	1475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
30	NC_021151	GAA	2	6	1515	1520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902550
31	NC_021151	GCG	2	6	1544	1549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
32	NC_021151	ATC	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902550
33	NC_021151	TTG	2	6	1694	1699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902550
34	NC_021151	ACT	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902550
35	NC_021151	CGC	3	9	1824	1832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
36	NC_021151	CTG	2	6	1906	1911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
37	NC_021151	TGA	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902550
38	NC_021151	GAC	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902550
39	NC_021151	GCC	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
40	NC_021151	TGA	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902550
41	NC_021151	TAT	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902550
42	NC_021151	TGC	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
43	NC_021151	ATG	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902550
44	NC_021151	CGG	3	9	2447	2455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
45	NC_021151	AGC	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902551
46	NC_021151	GCC	2	6	2674	2679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902551
47	NC_021151	CGT	2	6	2812	2817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902551
48	NC_021151	CGC	2	6	2818	2823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902551
49	NC_021151	GCA	2	6	2913	2918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902551
50	NC_021151	TGA	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902551
51	NC_021151	GAA	2	6	2972	2977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902551
52	NC_021151	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902551
53	NC_021151	CAG	2	6	2993	2998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902551
54	NC_021151	TGA	2	6	3010	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902551
55	NC_021151	GCC	2	6	3170	3175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902551
56	NC_021151	TGA	2	6	3180	3185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902551
57	NC_021151	CGG	2	6	3411	3416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902551
58	NC_021151	AGT	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902551
59	NC_021151	CAG	2	6	3515	3520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902552
60	NC_021151	TGA	2	6	3568	3573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902552
61	NC_021151	GCA	2	6	3643	3648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902552
62	NC_021151	CGG	2	6	3766	3771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902552
63	NC_021151	GCG	2	6	3804	3809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902552
64	NC_021151	GTC	2	6	3896	3901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902552
65	NC_021151	GGC	2	6	3959	3964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902552
66	NC_021151	TGA	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902552
67	NC_021151	GAA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902552
68	NC_021151	GCC	2	6	4089	4094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902552
69	NC_021151	CTA	2	6	4111	4116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902552
70	NC_021151	GCT	2	6	4207	4212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902552
71	NC_021151	CGC	2	6	4249	4254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902552
72	NC_021151	GGA	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902552
73	NC_021151	CCG	2	6	4387	4392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902552
74	NC_021151	GCG	2	6	4424	4429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902552
75	NC_021151	GAT	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902552
76	NC_021151	CAG	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902552
77	NC_021151	GCG	2	6	4499	4504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902552
78	NC_021151	GCT	2	6	4660	4665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902552
79	NC_021151	CAT	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902552
80	NC_021151	GCC	2	6	4691	4696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902552
81	NC_021151	TGA	3	9	4707	4715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902552
82	NC_021151	TCA	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902553
83	NC_021151	AAT	2	6	4934	4939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902553
84	NC_021151	TCA	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902553
85	NC_021151	ACC	2	6	4983	4988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902553
86	NC_021151	TCA	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902553
87	NC_021151	TTC	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902553
88	NC_021151	CAC	3	9	5090	5098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902553
89	NC_021151	TGT	2	6	5274	5279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902553
90	NC_021151	CGT	2	6	5299	5304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902553
91	NC_021151	GCG	2	6	5461	5466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902553
92	NC_021151	GCT	2	6	5494	5499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902553
93	NC_021151	GCC	2	6	5685	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902554
94	NC_021151	ACC	2	6	5802	5807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902554
95	NC_021151	CAA	2	6	5816	5821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902554
96	NC_021151	CGA	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902554
97	NC_021151	CAG	2	6	6143	6148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902554
98	NC_021151	ATC	2	6	6153	6158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902554
99	NC_021151	GAT	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902554
100	NC_021151	ACG	2	6	6241	6246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902554
101	NC_021151	GCG	2	6	6568	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902554
102	NC_021151	CGA	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902554
103	NC_021151	GCC	2	6	6719	6724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902554
104	NC_021151	AGG	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902554
105	NC_021151	ATG	2	6	6801	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902554
106	NC_021151	GCG	2	6	6846	6851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902554
107	NC_021151	GCC	2	6	6932	6937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902554
108	NC_021151	AGC	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902554
109	NC_021151	TAA	2	6	7078	7083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902554
110	NC_021151	CAC	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902555
111	NC_021151	CAG	2	6	7551	7556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902555
112	NC_021151	AGC	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902555
113	NC_021151	CAG	2	6	7572	7577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902555
114	NC_021151	GTT	2	6	7578	7583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902555
115	NC_021151	ATG	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902555
116	NC_021151	AAG	2	6	7813	7818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902555
117	NC_021151	GCT	2	6	7838	7843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902555
118	NC_021151	TAC	2	6	8004	8009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902555
119	NC_021151	CGT	2	6	8030	8035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902555
120	NC_021151	GCA	2	6	8219	8224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902555
121	NC_021151	CTG	2	6	8316	8321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902555
122	NC_021151	GCG	2	6	8484	8489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902556
123	NC_021151	GAG	2	6	8519	8524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902556
124	NC_021151	TGA	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902556
125	NC_021151	GCT	2	6	8935	8940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902556
126	NC_021151	CAG	2	6	9235	9240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902557
127	NC_021151	GGC	2	6	9286	9291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902557
128	NC_021151	GAA	2	6	9304	9309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902557
129	NC_021151	CAG	2	6	9397	9402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902557
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253	NC_021151	CGG	2	6	18139	18144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902566
254	NC_021151	CCG	2	6	18174	18179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902566
255	NC_021151	GTG	2	6	18215	18220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902566
256	NC_021151	GCT	2	6	18331	18336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902566
257	NC_021151	CTG	2	6	18405	18410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902566
258	NC_021151	ACT	2	6	18413	18418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902566
259	NC_021151	TGA	2	6	18477	18482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902566
260	NC_021151	CCA	2	6	18523	18528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902566
261	NC_021151	CTG	2	6	18587	18592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902566
262	NC_021151	CGC	2	6	18678	18683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902566
263	NC_021151	CTA	2	6	18714	18719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902566
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265	NC_021151	CGA	2	6	19093	19098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902566
266	NC_021151	GCG	2	6	19127	19132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902566
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268	NC_021151	TGA	2	6	19189	19194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902566
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270	NC_021151	GAA	2	6	19451	19456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902566
271	NC_021151	GAT	2	6	19475	19480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902566
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274	NC_021151	CGG	2	6	19639	19644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902566
275	NC_021151	TCA	2	6	19831	19836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902567
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278	NC_021151	ATC	2	6	19992	19997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902567
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280	NC_021151	CTT	2	6	20019	20024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902567
281	NC_021151	CGC	2	6	20174	20179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902567
282	NC_021151	AAC	2	6	20185	20190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902567
283	NC_021151	CCG	2	6	20191	20196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902567
284	NC_021151	GAA	2	6	20453	20458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902567
285	NC_021151	GGC	2	6	20495	20500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902567
286	NC_021151	CCG	2	6	20509	20514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902567
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290	NC_021151	GCC	2	6	20838	20843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902567
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499	NC_021151	TTA	2	6	36146	36151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902581
500	NC_021151	GAT	3	9	36161	36169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902581

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