MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azotobacter vinelandii CA6

Total Repeats: 4206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021150	GCCGA	2	10	5067550	5067559	20 %	0 %	40 %	40 %	482902428
4002	NC_021150	GGCCG	2	10	5072607	5072616	0 %	0 %	60 %	40 %	482898208
4003	NC_021150	AACCC	2	10	5075799	5075808	40 %	0 %	0 %	60 %	482898207
4004	NC_021150	TCCCT	2	10	5075848	5075857	0 %	40 %	0 %	60 %	482902430
4005	NC_021150	TACGA	2	10	5076829	5076838	40 %	20 %	20 %	20 %	482898210
4006	NC_021150	CGGCG	2	10	5077102	5077111	0 %	0 %	60 %	40 %	482898210
4007	NC_021150	GGCGA	2	10	5077922	5077931	20 %	0 %	60 %	20 %	482898210
4008	NC_021150	CCAAG	2	10	5081832	5081841	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4009	NC_021150	TGCGC	2	10	5085789	5085798	0 %	20 %	40 %	40 %	482898170
4010	NC_021150	CCTCG	2	10	5085924	5085933	0 %	20 %	20 %	60 %	482898170
4011	NC_021150	CGCGA	2	10	5086297	5086306	20 %	0 %	40 %	40 %	482902435
4012	NC_021150	CATCG	2	10	5086645	5086654	20 %	20 %	20 %	40 %	482902435
4013	NC_021150	CCGCT	2	10	5086932	5086941	0 %	20 %	20 %	60 %	482897918
4014	NC_021150	TGCCG	2	10	5087319	5087328	0 %	20 %	40 %	40 %	482897918
4015	NC_021150	GCCCG	2	10	5089131	5089140	0 %	0 %	40 %	60 %	482902436
4016	NC_021150	TTTCA	2	10	5090868	5090877	20 %	60 %	0 %	20 %	482902437
4017	NC_021150	GCGCC	2	10	5091573	5091582	0 %	0 %	40 %	60 %	482902437
4018	NC_021150	GCATG	2	10	5092056	5092065	20 %	20 %	40 %	20 %	482902438
4019	NC_021150	ATGAA	2	10	5092990	5092999	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021150	GCCGC	2	10	5093052	5093061	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4021	NC_021150	CCTGC	2	10	5093470	5093479	0 %	20 %	20 %	60 %	482902440
4022	NC_021150	GAGCG	2	10	5095354	5095363	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4023	NC_021150	CGAAT	2	10	5097013	5097022	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4024	NC_021150	GCGCG	2	10	5103062	5103071	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4025	NC_021150	CGCTC	2	10	5103227	5103236	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4026	NC_021150	CGGCC	2	10	5103975	5103984	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4027	NC_021150	GCCGC	2	10	5105149	5105158	0 %	0 %	40 %	60 %	482902448
4028	NC_021150	GGCCG	2	10	5105417	5105426	0 %	0 %	60 %	40 %	482902448
4029	NC_021150	GACCG	2	10	5107049	5107058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4030	NC_021150	CATCG	2	10	5107131	5107140	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4031	NC_021150	CGGAC	2	10	5108495	5108504	20 %	0 %	40 %	40 %	482902451
4032	NC_021150	GCCCT	2	10	5117627	5117636	0 %	20 %	20 %	60 %	482902457
4033	NC_021150	GCAGG	2	10	5118530	5118539	20 %	0 %	60 %	20 %	482902458
4034	NC_021150	GGCGA	2	10	5118618	5118627	20 %	0 %	60 %	20 %	482902458
4035	NC_021150	CGAGC	2	10	5121055	5121064	20 %	0 %	40 %	40 %	482898760
4036	NC_021150	GCGGT	2	10	5122820	5122829	0 %	20 %	60 %	20 %	482898758
4037	NC_021150	CAGGT	2	10	5124358	5124367	20 %	20 %	40 %	20 %	482898756
4038	NC_021150	ATCAG	2	10	5125475	5125484	40 %	20 %	20 %	20 %	482898752
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4040	NC_021150	TGCTC	2	10	5131243	5131252	0 %	40 %	20 %	40 %	482898445
4041	NC_021150	GTCGG	2	10	5131370	5131379	0 %	20 %	60 %	20 %	482898445
4042	NC_021150	AGGCC	2	10	5133069	5133078	20 %	0 %	40 %	40 %	482902462
4043	NC_021150	CCGAG	2	10	5134701	5134710	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4044	NC_021150	CGGCG	2	10	5135938	5135947	0 %	0 %	60 %	40 %	482898466
4045	NC_021150	GGCGC	2	10	5137081	5137090	0 %	0 %	60 %	40 %	482898157
4046	NC_021150	CCGGC	2	10	5137184	5137193	0 %	0 %	40 %	60 %	482898157
4047	NC_021150	GCCAC	2	10	5137297	5137306	20 %	0 %	20 %	60 %	482898157
4048	NC_021150	CCGCG	2	10	5138605	5138614	0 %	0 %	40 %	60 %	482902464
4049	NC_021150	TCCCG	2	10	5138902	5138911	0 %	20 %	20 %	60 %	482902464
4050	NC_021150	TCGGC	2	10	5138954	5138963	0 %	20 %	40 %	40 %	482902464
4051	NC_021150	CCCTC	2	10	5139209	5139218	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4052	NC_021150	CGGCG	2	10	5141659	5141668	0 %	0 %	60 %	40 %	482902466
4053	NC_021150	GTTGC	2	10	5142943	5142952	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4054	NC_021150	GGCCG	2	10	5142970	5142979	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4055	NC_021150	GCGGT	2	10	5144805	5144814	0 %	20 %	60 %	20 %	482897588
4056	NC_021150	CCGCC	2	10	5146480	5146489	0 %	0 %	20 %	80 %	482897588
4057	NC_021150	CGGTG	2	10	5147329	5147338	0 %	20 %	60 %	20 %	482897588
4058	NC_021150	AAGCG	2	10	5148865	5148874	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4059	NC_021150	CGCCC	2	10	5149352	5149361	0 %	0 %	20 %	80 %	482897587
4060	NC_021150	TCGGT	2	10	5149733	5149742	0 %	40 %	40 %	20 %	482897587
4061	NC_021150	GCCGA	2	10	5150957	5150966	20 %	0 %	40 %	40 %	482897587
4062	NC_021150	GGGTC	2	10	5154575	5154584	0 %	20 %	60 %	20 %	482897586
4063	NC_021150	GCCGA	2	10	5155432	5155441	20 %	0 %	40 %	40 %	482897586
4064	NC_021150	CGGTA	2	10	5157022	5157031	20 %	20 %	40 %	20 %	482897589
4065	NC_021150	TCCTG	2	10	5158910	5158919	0 %	40 %	20 %	40 %	482897591
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4067	NC_021150	GGCCG	2	10	5166002	5166011	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4068	NC_021150	GCTTC	2	10	5168607	5168616	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4069	NC_021150	CCGCC	2	10	5169618	5169627	0 %	0 %	20 %	80 %	482902470
4070	NC_021150	GCCGA	2	10	5169764	5169773	20 %	0 %	40 %	40 %	482902470
4071	NC_021150	GCGCC	2	10	5171086	5171095	0 %	0 %	40 %	60 %	482902471
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4074	NC_021150	AGGCC	2	10	5172428	5172437	20 %	0 %	40 %	40 %	482897830
4075	NC_021150	CGGCG	2	10	5176243	5176252	0 %	0 %	60 %	40 %	482897829
4076	NC_021150	CAAAC	2	10	5176867	5176876	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4077	NC_021150	GCGAC	2	10	5177397	5177406	20 %	0 %	40 %	40 %	482898679
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4080	NC_021150	CCGAC	2	10	5180134	5180143	20 %	0 %	20 %	60 %	482902473
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4082	NC_021150	CTCCC	2	10	5183520	5183529	0 %	20 %	0 %	80 %	482902475
4083	NC_021150	CTGTC	2	10	5184518	5184527	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4084	NC_021150	CTGTC	2	10	5184706	5184715	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4085	NC_021150	GGAGA	2	10	5186368	5186377	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4091	NC_021150	CTTGC	2	10	5191871	5191880	0 %	40 %	20 %	40 %	482897571
4092	NC_021150	GCGGA	2	10	5192596	5192605	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4093	NC_021150	TCACG	2	10	5192868	5192877	20 %	20 %	20 %	40 %	482902480
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4096	NC_021150	GTGCT	2	10	5194135	5194144	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4097	NC_021150	TGTCC	2	10	5194718	5194727	0 %	40 %	20 %	40 %	482898850
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4099	NC_021150	TCATC	2	10	5196392	5196401	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4100	NC_021150	GCGCC	2	10	5196585	5196594	0 %	0 %	40 %	60 %	482902482
4101	NC_021150	GGCCC	2	10	5196882	5196891	0 %	0 %	40 %	60 %	482902482
4102	NC_021150	CCTGC	2	10	5198564	5198573	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4103	NC_021150	GCTCC	2	10	5198677	5198686	0 %	20 %	20 %	60 %	482902485
4104	NC_021150	CGATC	2	10	5199249	5199258	20 %	20 %	20 %	40 %	482902484
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4108	NC_021150	CCGGC	2	10	5208985	5208994	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4109	NC_021150	AACGG	2	10	5210198	5210207	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4110	NC_021150	CGTGC	2	10	5211235	5211244	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4111	NC_021150	CGCGC	2	10	5211717	5211726	0 %	0 %	40 %	60 %	482902492
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4113	NC_021150	CGGAA	2	10	5215517	5215526	40 %	0 %	40 %	20 %	482902494
4114	NC_021150	CGCCA	2	10	5215632	5215641	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4115	NC_021150	CGGCG	2	10	5218321	5218330	0 %	0 %	60 %	40 %	482898703
4116	NC_021150	TGCCC	2	10	5219150	5219159	0 %	20 %	20 %	60 %	482898701
4117	NC_021150	CGGCG	2	10	5219886	5219895	0 %	0 %	60 %	40 %	482898701
4118	NC_021150	GCCGG	2	10	5221742	5221751	0 %	0 %	60 %	40 %	482898701
4119	NC_021150	CCGTC	2	10	5221895	5221904	0 %	20 %	20 %	60 %	482898701
4120	NC_021150	CCCAG	2	10	5222192	5222201	20 %	0 %	20 %	60 %	482898701
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4123	NC_021150	CGGGC	2	10	5224465	5224474	0 %	0 %	60 %	40 %	482898702
4124	NC_021150	CGCCT	2	10	5225897	5225906	0 %	20 %	20 %	60 %	482898702
4125	NC_021150	GCGAG	2	10	5226428	5226437	20 %	0 %	60 %	20 %	482898442
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.