MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Propionibacterium acnes HL096PA1 plasmid

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021086	AC	3	6	3230	3235	50 %	0 %	0 %	50 %	482891397
2	NC_021086	GC	3	6	3722	3727	0 %	0 %	50 %	50 %	482891399
3	NC_021086	CG	3	6	3849	3854	0 %	0 %	50 %	50 %	482891399
4	NC_021086	GC	3	6	3889	3894	0 %	0 %	50 %	50 %	482891399
5	NC_021086	GT	3	6	7080	7085	0 %	50 %	50 %	0 %	482891404
6	NC_021086	TG	3	6	7118	7123	0 %	50 %	50 %	0 %	482891404
7	NC_021086	AC	3	6	8117	8122	50 %	0 %	0 %	50 %	482891406
8	NC_021086	GC	4	8	9575	9582	0 %	0 %	50 %	50 %	482891409
9	NC_021086	CG	3	6	9688	9693	0 %	0 %	50 %	50 %	482891409
10	NC_021086	CG	3	6	10991	10996	0 %	0 %	50 %	50 %	482891410
11	NC_021086	GT	3	6	11448	11453	0 %	50 %	50 %	0 %	482891411
12	NC_021086	TC	3	6	12120	12125	0 %	50 %	0 %	50 %	482891411
13	NC_021086	GT	3	6	12272	12277	0 %	50 %	50 %	0 %	482891411
14	NC_021086	TC	3	6	12857	12862	0 %	50 %	0 %	50 %	482891411
15	NC_021086	TG	3	6	13463	13468	0 %	50 %	50 %	0 %	482891413
16	NC_021086	TG	3	6	13615	13620	0 %	50 %	50 %	0 %	482891413
17	NC_021086	GC	3	6	13759	13764	0 %	0 %	50 %	50 %	482891413
18	NC_021086	TG	3	6	14018	14023	0 %	50 %	50 %	0 %	482891414
19	NC_021086	GA	3	6	14133	14138	50 %	0 %	50 %	0 %	482891414
20	NC_021086	GA	3	6	16107	16112	50 %	0 %	50 %	0 %	482891417
21	NC_021086	CA	3	6	17580	17585	50 %	0 %	0 %	50 %	482891420
22	NC_021086	TG	3	6	17692	17697	0 %	50 %	50 %	0 %	482891421
23	NC_021086	CA	3	6	18031	18036	50 %	0 %	0 %	50 %	482891421
24	NC_021086	GA	3	6	18555	18560	50 %	0 %	50 %	0 %	482891421
25	NC_021086	CG	3	6	20335	20340	0 %	0 %	50 %	50 %	482891423
26	NC_021086	AC	3	6	20901	20906	50 %	0 %	0 %	50 %	482891424
27	NC_021086	CA	3	6	26471	26476	50 %	0 %	0 %	50 %	482891427
28	NC_021086	GT	3	6	26541	26546	0 %	50 %	50 %	0 %	482891427
29	NC_021086	CA	4	8	26945	26952	50 %	0 %	0 %	50 %	482891428
30	NC_021086	GC	3	6	27788	27793	0 %	0 %	50 %	50 %	482891429
31	NC_021086	AC	3	6	30988	30993	50 %	0 %	0 %	50 %	482891432
32	NC_021086	GC	3	6	31526	31531	0 %	0 %	50 %	50 %	482891433
33	NC_021086	TG	3	6	33295	33300	0 %	50 %	50 %	0 %	482891435
34	NC_021086	TG	4	8	35629	35636	0 %	50 %	50 %	0 %	482891437
35	NC_021086	GT	3	6	37138	37143	0 %	50 %	50 %	0 %	482891440
36	NC_021086	CG	3	6	38900	38905	0 %	0 %	50 %	50 %	482891442
37	NC_021086	CT	3	6	40113	40118	0 %	50 %	0 %	50 %	482891442
38	NC_021086	AC	3	6	40202	40207	50 %	0 %	0 %	50 %	482891442
39	NC_021086	CG	3	6	40263	40268	0 %	0 %	50 %	50 %	482891442
40	NC_021086	AC	3	6	42150	42155	50 %	0 %	0 %	50 %	482891444
41	NC_021086	GT	3	6	42837	42842	0 %	50 %	50 %	0 %	482891445
42	NC_021086	TG	3	6	46719	46724	0 %	50 %	50 %	0 %	482891451
43	NC_021086	TC	3	6	46871	46876	0 %	50 %	0 %	50 %	482891451
44	NC_021086	CG	7	14	47189	47202	0 %	0 %	50 %	50 %	482891451
45	NC_021086	CG	3	6	47565	47570	0 %	0 %	50 %	50 %	482891451
46	NC_021086	GC	3	6	47903	47908	0 %	0 %	50 %	50 %	482891452
47	NC_021086	GC	3	6	48140	48145	0 %	0 %	50 %	50 %	482891452
48	NC_021086	AC	3	6	48750	48755	50 %	0 %	0 %	50 %	482891452
49	NC_021086	AC	3	6	49280	49285	50 %	0 %	0 %	50 %	482891453
50	NC_021086	CA	3	6	49398	49403	50 %	0 %	0 %	50 %	482891453
51	NC_021086	GT	3	6	53322	53327	0 %	50 %	50 %	0 %	482891462
52	NC_021086	GC	3	6	53403	53408	0 %	0 %	50 %	50 %	482891462
53	NC_021086	GC	3	6	53644	53649	0 %	0 %	50 %	50 %	482891462
54	NC_021086	GA	3	6	53653	53658	50 %	0 %	50 %	0 %	482891462
55	NC_021086	CG	3	6	54446	54451	0 %	0 %	50 %	50 %	482891464

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.