MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021082	AGTTTA	2	12	41187	41198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021082	AATGAA	2	12	57765	57776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021082	AGTGAC	2	12	71049	71060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021082	TAAACT	2	12	130804	130815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021082	CACCCA	2	12	156169	156180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021082	CTTGAA	2	12	161620	161631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021082	TATAGG	2	12	206796	206807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021082	TATAAA	2	12	233716	233727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021082	ATTTTA	2	12	237456	237467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021082	GTTTTT	2	12	249075	249086	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021082	TTTTGC	2	12	267151	267162	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021082	ATTTCA	2	12	268372	268383	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021082	GCCTTC	2	12	271686	271697	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021082	AATTAA	2	12	272475	272486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021082	TAAATT	2	12	301423	301434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021082	TTTTGC	2	12	302913	302924	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021082	ATTTCA	2	12	304134	304145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021082	GCCTTC	2	12	307564	307575	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021082	AATTAA	2	12	308353	308364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021082	ACTTTA	2	12	365394	365405	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021082	CTATAA	2	12	376450	376461	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021082	ATTTCA	2	12	411567	411578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021082	GCCTTC	2	12	414881	414892	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021082	AATTAA	2	12	415670	415681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021082	AAAAAC	2	12	415880	415891	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021082	ATTTCA	2	12	470591	470602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021082	GCCTTC	2	12	474021	474032	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021082	AATTAA	2	12	474810	474821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021082	TTTAAA	2	12	478079	478090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021082	CTATTC	2	12	482647	482658	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021082	CAAAAA	2	12	511434	511445	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021082	CGAAAA	2	12	517204	517215	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021082	TCGGCT	2	12	552769	552780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021082	ATAATT	2	12	563649	563660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021082	ATTTAA	2	12	596969	596980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021082	TGATTT	2	12	635621	635632	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021082	GGAAAA	2	12	695007	695018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021082	TTAAAC	2	12	697492	697503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021082	AATATC	2	12	725729	725740	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021082	TTTTAT	2	12	732474	732485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021082	TATTTA	2	12	736488	736499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021082	GCTTTT	2	12	738770	738781	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021082	TAAGGC	2	12	761475	761486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021082	AAAAAT	2	12	767112	767123	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021082	TTAAAA	2	12	781575	781586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021082	TGAAAG	2	12	825760	825771	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021082	TAAAAA	2	12	829044	829055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021082	CTATTG	2	12	858160	858171	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021082	AATATT	2	12	875186	875197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021082	TATTTA	2	12	884711	884722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021082	AATTTG	2	12	905387	905398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021082	ATACAA	2	12	907589	907600	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021082	CAAATA	2	12	944322	944333	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021082	AATTGA	2	12	992237	992248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021082	TAATGA	2	12	992337	992348	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021082	TTAATT	2	12	1002220	1002231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021082	CGAAGG	2	12	1003009	1003020	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021082	TGAAAT	2	12	1006324	1006335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021082	AAGCAA	2	12	1007543	1007554	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021082	GGTAAA	2	12	1007633	1007644	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021082	TGAGAA	2	12	1043622	1043633	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021082	CACCAA	2	12	1056959	1056970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021082	AAATGA	2	12	1144917	1144928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021082	TTTATT	2	12	1184750	1184761	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021082	TAGAAA	2	12	1188950	1188961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021082	TTTTTA	2	12	1250219	1250230	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021082	TCAAAG	2	12	1267068	1267079	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021082	TCCCTC	2	12	1349510	1349521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021082	GGATAA	2	12	1382953	1382964	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021082	AAACAT	2	12	1382994	1383005	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021082	GGCAAA	2	12	1411712	1411723	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021082	GATATA	2	12	1477319	1477330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021082	AAAATT	2	12	1507100	1507111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021082	TTTGTG	2	12	1544927	1544938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021082	TTAAAG	2	12	1575590	1575601	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021082	TGCACT	2	12	1607591	1607602	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021082	AAATCA	2	12	1613410	1613421	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021082	ATTGTT	2	12	1616022	1616033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021082	AATTTT	2	12	1633467	1633478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021082	ATCTTA	2	12	1658300	1658311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021082	TAAAAC	2	12	1665722	1665733	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021082	TTTCCC	2	12	1677117	1677128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021082	GGCGTA	2	12	1677646	1677657	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021082	AACAAA	2	12	1695895	1695906	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021082	GTATAT	2	12	1738050	1738061	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021082	TTGTAA	2	12	1751276	1751287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021082	CCCCTT	2	12	1758424	1758435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021082	CAAGCT	2	12	1759086	1759097	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021082	TAAAAA	2	12	1775567	1775578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021082	AAAAAT	2	12	1778164	1778175	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021082	ATTTTT	2	12	1778207	1778218	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021082	TTAATA	2	12	1800815	1800826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021082	ACTTTT	2	12	1905375	1905386	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021082	ATTTTT	2	12	1938680	1938691	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021082	AGATTA	2	12	1947380	1947391	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021082	ATTTTT	2	12	1972786	1972797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021082	AAATAA	2	12	1989686	1989697	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021082	ATCACA	2	12	2011798	2011809	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021082	AACTTA	2	12	2026037	2026048	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_021082	ATAATT	2	12	2040452	2040463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021082	AAACAA	2	12	2133707	2133718	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021082	GCTCAG	2	12	2169187	2169198	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021082	CAAACG	2	12	2198514	2198525	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021082	AAAAGT	2	12	2285014	2285025	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021082	GTTTTT	2	12	2331926	2331937	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021082	AAAAAT	2	12	2366631	2366642	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021082	ATTTTT	2	12	2392715	2392726	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021082	ATTTTC	2	12	2393358	2393369	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021082	AAAATA	2	12	2394132	2394143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021082	AAAACA	2	12	2394203	2394214	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021082	AGCACA	2	12	2416603	2416614	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021082	AAATTT	2	12	2452899	2452910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021082	TTTTGC	2	12	2523339	2523350	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021082	ATTTCA	2	12	2524561	2524572	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021082	GCCTTC	2	12	2527991	2528002	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021082	AATTAA	2	12	2528780	2528791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021082	AAAAAC	2	12	2528990	2529001	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021082	TCTATT	2	12	2573896	2573907	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021082	ATATTC	2	12	2593545	2593556	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021082	TTTTCG	2	12	2605483	2605494	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021082	AGCCAT	2	12	2627392	2627403	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021082	TTTTAT	2	12	2650129	2650140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021082	AATGCA	2	12	2658481	2658492	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021082	GTTTTA	2	12	2671549	2671560	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021082	GATAAA	2	12	2726116	2726127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.