MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 29978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021082	TTG	2	6	234	239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884695
2	NC_021082	TGG	2	6	312	317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884695
3	NC_021082	CAA	2	6	488	493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884695
4	NC_021082	GTG	2	6	494	499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884695
5	NC_021082	TTA	2	6	569	574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884695
6	NC_021082	ATT	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884695
7	NC_021082	AAG	2	6	774	779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884695
8	NC_021082	ATT	2	6	824	829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884695
9	NC_021082	GCG	2	6	894	899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884695
10	NC_021082	TTC	2	6	948	953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884695
11	NC_021082	AAG	2	6	987	992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884695
12	NC_021082	GCC	2	6	995	1000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884695
13	NC_021082	AAG	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884695
14	NC_021082	TAC	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884695
15	NC_021082	AAG	2	6	1398	1403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884695
16	NC_021082	ATC	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884695
17	NC_021082	ACA	2	6	1498	1503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884696
18	NC_021082	TTA	2	6	1542	1547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884696
19	NC_021082	TTA	2	6	1556	1561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884696
20	NC_021082	ACC	2	6	1616	1621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884696
21	NC_021082	TGA	2	6	1708	1713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884696
22	NC_021082	GAA	2	6	1736	1741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884696
23	NC_021082	GTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884696
24	NC_021082	TTA	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884696
25	NC_021082	CCG	2	6	2191	2196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884696
26	NC_021082	AAT	2	6	2318	2323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884696
27	NC_021082	AAG	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884696
28	NC_021082	ACA	2	6	2517	2522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884696
29	NC_021082	CGC	2	6	2704	2709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884697
30	NC_021082	TGC	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884697
31	NC_021082	TAT	2	6	2988	2993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884697
32	NC_021082	CAA	2	6	3009	3014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884697
33	NC_021082	CCA	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884697
34	NC_021082	TGC	2	6	3206	3211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884697
35	NC_021082	AAC	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884698
36	NC_021082	CCG	2	6	3428	3433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884698
37	NC_021082	GTT	2	6	3645	3650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884698
38	NC_021082	TCA	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884698
39	NC_021082	AAT	2	6	3843	3848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884698
40	NC_021082	TCT	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884698
41	NC_021082	AAT	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884698
42	NC_021082	TGG	2	6	4148	4153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884698
43	NC_021082	ATT	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884698
44	NC_021082	TGT	3	9	4561	4569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884699
45	NC_021082	TGC	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884699
46	NC_021082	TCT	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884699
47	NC_021082	GTT	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884699
48	NC_021082	CCG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884699
49	NC_021082	AAG	2	6	5058	5063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884699
50	NC_021082	TAA	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884699
51	NC_021082	ACC	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884699
52	NC_021082	CCA	2	6	5390	5395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884699
53	NC_021082	TGT	2	6	5410	5415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884699
54	NC_021082	CAG	2	6	5435	5440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884699
55	NC_021082	CGC	2	6	5570	5575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884699
56	NC_021082	TTC	2	6	5602	5607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884699
57	NC_021082	CTT	2	6	5796	5801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884700
58	NC_021082	TCA	2	6	5975	5980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884700
59	NC_021082	GTG	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884700
60	NC_021082	CTT	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884700
61	NC_021082	TCT	2	6	6104	6109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884700
62	NC_021082	TGA	2	6	6121	6126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884700
63	NC_021082	TGC	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884700
64	NC_021082	CTG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884700
65	NC_021082	GCT	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884700
66	NC_021082	CAT	2	6	6255	6260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884700
67	NC_021082	CCA	3	9	6346	6354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884700
68	NC_021082	TGA	2	6	6427	6432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884700
69	NC_021082	GAA	2	6	6443	6448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884700
70	NC_021082	CTT	2	6	6459	6464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884700
71	NC_021082	TTG	2	6	6685	6690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884700
72	NC_021082	CAT	2	6	7028	7033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884701
73	NC_021082	ATG	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884701
74	NC_021082	ACC	2	6	7111	7116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884701
75	NC_021082	CAA	2	6	7124	7129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884701
76	NC_021082	ATG	2	6	7131	7136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884701
77	NC_021082	AAT	2	6	7169	7174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884701
78	NC_021082	TAT	2	6	7334	7339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884701
79	NC_021082	TAA	2	6	7368	7373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884701
80	NC_021082	TCT	2	6	7439	7444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884701
81	NC_021082	TGA	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884701
82	NC_021082	CAT	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884701
83	NC_021082	CTT	2	6	7628	7633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884701
84	NC_021082	TAA	2	6	7653	7658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884701
85	NC_021082	TTA	2	6	7726	7731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884701
86	NC_021082	ATA	2	6	7770	7775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884701
87	NC_021082	TTC	2	6	7854	7859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884701
88	NC_021082	CAC	2	6	7927	7932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884701
89	NC_021082	CAT	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884701
90	NC_021082	GAT	2	6	8061	8066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884701
91	NC_021082	TGC	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884701
92	NC_021082	GTT	2	6	8117	8122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884701
93	NC_021082	TTG	2	6	8256	8261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884701
94	NC_021082	AAT	2	6	8423	8428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884702
95	NC_021082	TCA	2	6	8499	8504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884702
96	NC_021082	TCA	3	9	8523	8531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884702
97	NC_021082	CCA	2	6	8716	8721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884702
98	NC_021082	CAT	2	6	8803	8808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884702
99	NC_021082	ATC	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884702
100	NC_021082	CGG	2	6	9108	9113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884702
101	NC_021082	TCT	2	6	9150	9155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884702
102	NC_021082	TTA	2	6	9192	9197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884702
103	NC_021082	TTC	2	6	9220	9225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884702
104	NC_021082	CGG	4	12	9343	9354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884702
105	NC_021082	AAT	2	6	9358	9363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884702
106	NC_021082	ATC	3	9	9368	9376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884702
107	NC_021082	TTC	2	6	9377	9382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884702
108	NC_021082	CTG	2	6	9419	9424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884702
109	NC_021082	GAA	2	6	9427	9432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884702
110	NC_021082	GTT	2	6	9505	9510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884702
111	NC_021082	TGA	2	6	9749	9754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884703
112	NC_021082	AAT	2	6	9904	9909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884703
113	NC_021082	TCG	2	6	9957	9962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884703
114	NC_021082	TTC	2	6	10056	10061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884704
115	NC_021082	ATT	2	6	10389	10394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884705
116	NC_021082	TTA	2	6	10418	10423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884705
117	NC_021082	CTT	2	6	10434	10439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884705
118	NC_021082	TTC	2	6	10489	10494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884705
119	NC_021082	TAA	2	6	10618	10623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884705
120	NC_021082	ATA	2	6	10880	10885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884706
121	NC_021082	AAT	2	6	10917	10922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884706
122	NC_021082	CCA	2	6	11066	11071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884706
123	NC_021082	GCT	2	6	11174	11179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884706
124	NC_021082	TAC	2	6	11199	11204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884706
125	NC_021082	TCA	2	6	11261	11266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884706
126	NC_021082	TTG	2	6	11461	11466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884706
127	NC_021082	ATT	2	6	11482	11487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884706
128	NC_021082	AGA	2	6	11663	11668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884706
129	NC_021082	AAT	2	6	11758	11763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884707
130	NC_021082	GTT	2	6	11874	11879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884707
131	NC_021082	CTG	2	6	12098	12103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884708
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134	NC_021082	CTT	2	6	12352	12357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884708
135	NC_021082	GTT	2	6	12442	12447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884708
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139	NC_021082	GCA	2	6	12633	12638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884709
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144	NC_021082	CGG	2	6	13064	13069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884709
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150	NC_021082	TGA	2	6	13348	13353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884709
151	NC_021082	CTT	2	6	13474	13479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884709
152	NC_021082	CTT	2	6	13483	13488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884709
153	NC_021082	GAA	2	6	13516	13521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884709
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241	NC_021082	TAC	2	6	21517	21522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884717
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253	NC_021082	ATT	2	6	22259	22264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884717
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