MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 3138

< Previous1234567Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021082	GA	4	8	2598314	2598321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021082	AG	4	8	2598350	2598357	50 %	0 %	50 %	0 %	482887371
3003	NC_021082	AT	3	6	2598463	2598468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021082	GT	3	6	2598776	2598781	0 %	50 %	50 %	0 %	482887372
3005	NC_021082	TG	3	6	2599542	2599547	0 %	50 %	50 %	0 %	482887372
3006	NC_021082	CT	3	6	2599922	2599927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_021082	AG	3	6	2601680	2601685	50 %	0 %	50 %	0 %	482887374
3008	NC_021082	AG	3	6	2602149	2602154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021082	TA	3	6	2602496	2602501	50 %	50 %	0 %	0 %	482887376
3010	NC_021082	TG	3	6	2602754	2602759	0 %	50 %	50 %	0 %	482887376
3011	NC_021082	TG	3	6	2604815	2604820	0 %	50 %	50 %	0 %	482887379
3012	NC_021082	GT	3	6	2605407	2605412	0 %	50 %	50 %	0 %	482887379
3013	NC_021082	TA	3	6	2606014	2606019	50 %	50 %	0 %	0 %	482887380
3014	NC_021082	CT	3	6	2606925	2606930	0 %	50 %	0 %	50 %	482887381
3015	NC_021082	TG	3	6	2607069	2607074	0 %	50 %	50 %	0 %	482887381
3016	NC_021082	TC	3	6	2608683	2608688	0 %	50 %	0 %	50 %	482887384
3017	NC_021082	CT	3	6	2610197	2610202	0 %	50 %	0 %	50 %	482887387
3018	NC_021082	TA	3	6	2611878	2611883	50 %	50 %	0 %	0 %	482887388
3019	NC_021082	CT	3	6	2613859	2613864	0 %	50 %	0 %	50 %	482887390
3020	NC_021082	TC	3	6	2613973	2613978	0 %	50 %	0 %	50 %	482887390
3021	NC_021082	AG	3	6	2616526	2616531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021082	AT	3	6	2616846	2616851	50 %	50 %	0 %	0 %	482887392
3023	NC_021082	AC	3	6	2618467	2618472	50 %	0 %	0 %	50 %	482887393
3024	NC_021082	TC	4	8	2619329	2619336	0 %	50 %	0 %	50 %	482887394
3025	NC_021082	CT	3	6	2619418	2619423	0 %	50 %	0 %	50 %	482887394
3026	NC_021082	TG	3	6	2624064	2624069	0 %	50 %	50 %	0 %	482887396
3027	NC_021082	CA	3	6	2624706	2624711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_021082	AC	3	6	2624840	2624845	50 %	0 %	0 %	50 %	482887397
3029	NC_021082	AG	3	6	2625528	2625533	50 %	0 %	50 %	0 %	482887397
3030	NC_021082	CT	3	6	2626022	2626027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_021082	AG	3	6	2626971	2626976	50 %	0 %	50 %	0 %	482887398
3032	NC_021082	TA	3	6	2630545	2630550	50 %	50 %	0 %	0 %	482887401
3033	NC_021082	AC	3	6	2630751	2630756	50 %	0 %	0 %	50 %	482887401
3034	NC_021082	AC	4	8	2631019	2631026	50 %	0 %	0 %	50 %	482887401
3035	NC_021082	AC	3	6	2632562	2632567	50 %	0 %	0 %	50 %	482887402
3036	NC_021082	GT	3	6	2633526	2633531	0 %	50 %	50 %	0 %	482887402
3037	NC_021082	TC	3	6	2633594	2633599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_021082	CT	3	6	2635205	2635210	0 %	50 %	0 %	50 %	482887403
3039	NC_021082	GA	3	6	2635507	2635512	50 %	0 %	50 %	0 %	482887403
3040	NC_021082	GT	3	6	2635718	2635723	0 %	50 %	50 %	0 %	482887403
3041	NC_021082	TC	3	6	2636427	2636432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_021082	AT	3	6	2636450	2636455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021082	AC	3	6	2637992	2637997	50 %	0 %	0 %	50 %	482887404
3044	NC_021082	AC	3	6	2638251	2638256	50 %	0 %	0 %	50 %	482887404
3045	NC_021082	TA	3	6	2639009	2639014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021082	GA	3	6	2639017	2639022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021082	CT	3	6	2642838	2642843	0 %	50 %	0 %	50 %	482887407
3048	NC_021082	GT	3	6	2643746	2643751	0 %	50 %	50 %	0 %	482887408
3049	NC_021082	AG	3	6	2643945	2643950	50 %	0 %	50 %	0 %	482887408
3050	NC_021082	GT	3	6	2646886	2646891	0 %	50 %	50 %	0 %	482887412
3051	NC_021082	TC	3	6	2648224	2648229	0 %	50 %	0 %	50 %	482887414
3052	NC_021082	AT	3	6	2649236	2649241	50 %	50 %	0 %	0 %	482887415
3053	NC_021082	AT	3	6	2651337	2651342	50 %	50 %	0 %	0 %	482887417
3054	NC_021082	AT	3	6	2651485	2651490	50 %	50 %	0 %	0 %	482887417
3055	NC_021082	AC	3	6	2651634	2651639	50 %	0 %	0 %	50 %	482887418
3056	NC_021082	AC	3	6	2651944	2651949	50 %	0 %	0 %	50 %	482887418
3057	NC_021082	AT	3	6	2653067	2653072	50 %	50 %	0 %	0 %	482887419
3058	NC_021082	CT	3	6	2654562	2654567	0 %	50 %	0 %	50 %	482887420
3059	NC_021082	TC	3	6	2654659	2654664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_021082	CT	3	6	2654938	2654943	0 %	50 %	0 %	50 %	482887421
3061	NC_021082	AT	3	6	2656247	2656252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021082	TC	3	6	2656486	2656491	0 %	50 %	0 %	50 %	482887424
3063	NC_021082	AC	3	6	2657380	2657385	50 %	0 %	0 %	50 %	482887425
3064	NC_021082	TG	4	8	2657638	2657645	0 %	50 %	50 %	0 %	482887425
3065	NC_021082	GA	4	8	2658297	2658304	50 %	0 %	50 %	0 %	482887425
3066	NC_021082	AG	3	6	2658332	2658337	50 %	0 %	50 %	0 %	482887425
3067	NC_021082	GT	3	6	2659785	2659790	0 %	50 %	50 %	0 %	482887427
3068	NC_021082	TC	3	6	2660273	2660278	0 %	50 %	0 %	50 %	482887427
3069	NC_021082	GT	3	6	2662171	2662176	0 %	50 %	50 %	0 %	482887428
3070	NC_021082	TA	3	6	2663990	2663995	50 %	50 %	0 %	0 %	482887431
3071	NC_021082	CA	3	6	2665039	2665044	50 %	0 %	0 %	50 %	482887432
3072	NC_021082	TC	3	6	2666143	2666148	0 %	50 %	0 %	50 %	482887433
3073	NC_021082	TG	4	8	2667138	2667145	0 %	50 %	50 %	0 %	482887434
3074	NC_021082	TA	3	6	2669164	2669169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021082	AT	3	6	2669228	2669233	50 %	50 %	0 %	0 %	482887436
3076	NC_021082	TA	3	6	2669599	2669604	50 %	50 %	0 %	0 %	482887436
3077	NC_021082	TG	3	6	2670031	2670036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021082	TG	3	6	2670162	2670167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_021082	GA	3	6	2670664	2670669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021082	TC	3	6	2672340	2672345	0 %	50 %	0 %	50 %	482887437
3081	NC_021082	GA	3	6	2672441	2672446	50 %	0 %	50 %	0 %	482887437
3082	NC_021082	TA	3	6	2673267	2673272	50 %	50 %	0 %	0 %	482887438
3083	NC_021082	AG	3	6	2674273	2674278	50 %	0 %	50 %	0 %	482887439
3084	NC_021082	AC	3	6	2675436	2675441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_021082	GT	3	6	2675562	2675567	0 %	50 %	50 %	0 %	482887441
3086	NC_021082	CT	4	8	2677797	2677804	0 %	50 %	0 %	50 %	482887443
3087	NC_021082	CT	3	6	2678156	2678161	0 %	50 %	0 %	50 %	482887443
3088	NC_021082	CT	3	6	2678212	2678217	0 %	50 %	0 %	50 %	482887443
3089	NC_021082	AT	3	6	2679687	2679692	50 %	50 %	0 %	0 %	482887444
3090	NC_021082	TA	3	6	2680097	2680102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021082	GT	3	6	2680360	2680365	0 %	50 %	50 %	0 %	482887445
3092	NC_021082	CT	3	6	2680907	2680912	0 %	50 %	0 %	50 %	482887446
3093	NC_021082	AG	3	6	2681196	2681201	50 %	0 %	50 %	0 %	482887446
3094	NC_021082	AT	3	6	2682751	2682756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021082	GC	3	6	2683520	2683525	0 %	0 %	50 %	50 %	482887448
3096	NC_021082	AC	3	6	2686651	2686656	50 %	0 %	0 %	50 %	482887451
3097	NC_021082	CA	3	6	2687719	2687724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_021082	CT	3	6	2688278	2688283	0 %	50 %	0 %	50 %	482887452
3099	NC_021082	TG	3	6	2688412	2688417	0 %	50 %	50 %	0 %	482887452
3100	NC_021082	GT	3	6	2689256	2689261	0 %	50 %	50 %	0 %	482887452
3101	NC_021082	TA	3	6	2691065	2691070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021082	TC	3	6	2693359	2693364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_021082	AG	3	6	2696586	2696591	50 %	0 %	50 %	0 %	482887459
3104	NC_021082	TG	3	6	2697186	2697191	0 %	50 %	50 %	0 %	482887460
3105	NC_021082	TC	3	6	2701397	2701402	0 %	50 %	0 %	50 %	482887464
3106	NC_021082	AT	3	6	2702255	2702260	50 %	50 %	0 %	0 %	482887465
3107	NC_021082	CA	4	8	2703171	2703178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_021082	TC	3	6	2705040	2705045	0 %	50 %	0 %	50 %	482887469
3109	NC_021082	CA	3	6	2705254	2705259	50 %	0 %	0 %	50 %	482887469
3110	NC_021082	CT	3	6	2705715	2705720	0 %	50 %	0 %	50 %	482887469
3111	NC_021082	CA	3	6	2706584	2706589	50 %	0 %	0 %	50 %	482887469
3112	NC_021082	GT	3	6	2707651	2707656	0 %	50 %	50 %	0 %	482887470
3113	NC_021082	AG	3	6	2710054	2710059	50 %	0 %	50 %	0 %	482887473
3114	NC_021082	TG	3	6	2710790	2710795	0 %	50 %	50 %	0 %	482887475
3115	NC_021082	TG	3	6	2711259	2711264	0 %	50 %	50 %	0 %	482887476
3116	NC_021082	AT	3	6	2711554	2711559	50 %	50 %	0 %	0 %	482887477
3117	NC_021082	TA	3	6	2711898	2711903	50 %	50 %	0 %	0 %	482887477
3118	NC_021082	CT	3	6	2712022	2712027	0 %	50 %	0 %	50 %	482887477
3119	NC_021082	GT	3	6	2712582	2712587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_021082	TA	3	6	2712736	2712741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021082	AT	3	6	2712945	2712950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021082	CT	3	6	2712996	2713001	0 %	50 %	0 %	50 %	482887478
3123	NC_021082	AC	3	6	2713465	2713470	50 %	0 %	0 %	50 %	482887478
3124	NC_021082	GT	3	6	2713900	2713905	0 %	50 %	50 %	0 %	482887478
3125	NC_021082	AC	3	6	2715649	2715654	50 %	0 %	0 %	50 %	482887479
3126	NC_021082	GA	3	6	2715803	2715808	50 %	0 %	50 %	0 %	482887479
3127	NC_021082	GT	3	6	2717253	2717258	0 %	50 %	50 %	0 %	482887481
3128	NC_021082	TC	3	6	2717845	2717850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_021082	AT	3	6	2721400	2721405	50 %	50 %	0 %	0 %	482887488
3130	NC_021082	CT	3	6	2721597	2721602	0 %	50 %	0 %	50 %	482887488
3131	NC_021082	CA	3	6	2724789	2724794	50 %	0 %	0 %	50 %	482887491
3132	NC_021082	AC	3	6	2725055	2725060	50 %	0 %	0 %	50 %	482887491
3133	NC_021082	AT	3	6	2726136	2726141	50 %	50 %	0 %	0 %	482887494
3134	NC_021082	TA	3	6	2726640	2726645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_021082	AT	3	6	2728657	2728662	50 %	50 %	0 %	0 %	482887495
3136	NC_021082	CA	3	6	2730958	2730963	50 %	0 %	0 %	50 %	482887497
3137	NC_021082	CT	3	6	2731614	2731619	0 %	50 %	0 %	50 %	482887497
3138	NC_021082	CA	3	6	2731783	2731788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

< Previous1234567Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.