MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021081	CAAG	2	8	43	50	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021081	TTTC	2	8	58	65	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021081	AAGC	2	8	3982	3989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021081	TTGC	2	8	7340	7347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021081	CGGG	2	8	11357	11364	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021081	CCGA	2	8	12004	12011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021081	ACTG	2	8	17453	17460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021081	CCGG	2	8	20028	20035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021081	CTGG	2	8	22750	22757	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021081	GTTT	2	8	23750	23757	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021081	TATT	2	8	23783	23790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021081	ATTT	2	8	23806	23813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021081	TAAA	2	8	23833	23840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021081	GGGT	2	8	26504	26511	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021081	AGGG	2	8	27912	27919	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021081	TGGC	2	8	28390	28397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021081	CGCC	2	8	29518	29525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_021081	GCGT	2	8	30220	30227	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021081	GTCA	2	8	30337	30344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021081	CGCA	2	8	30653	30660	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021081	GCTG	2	8	30762	30769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021081	GGCT	2	8	31045	31052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021081	AGCC	2	8	31389	31396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021081	ACCC	2	8	31546	31553	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_021081	CAAA	2	8	41869	41876	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021081	ATGA	2	8	41892	41899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021081	GTGG	2	8	44340	44347	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021081	CCAA	2	8	44474	44481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021081	AGGG	2	8	48255	48262	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021081	AGCG	2	8	49414	49421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021081	GCTC	2	8	51528	51535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021081	TGGG	2	8	51931	51938	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021081	TGGT	2	8	57185	57192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021081	CCCA	2	8	60443	60450	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_021081	CGAA	2	8	83214	83221	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021081	GCCC	2	8	83232	83239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_021081	CCAG	2	8	84674	84681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021081	TCGG	2	8	89395	89402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021081	TCTG	2	8	92949	92956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021081	GATG	2	8	94056	94063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021081	CAAC	2	8	94781	94788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021081	AGGA	2	8	95770	95777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021081	CATC	2	8	96612	96619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021081	CAAC	2	8	96739	96746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021081	GAAA	2	8	97042	97049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021081	AAAG	2	8	97115	97122	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021081	GCGG	2	8	97282	97289	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021081	CGGC	2	8	97444	97451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021081	CGCT	2	8	98802	98809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021081	CTTG	2	8	108749	108756	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021081	TGAG	2	8	112233	112240	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021081	AGGG	2	8	122048	122055	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021081	AGTG	2	8	131653	131660	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021081	TCAC	2	8	131673	131680	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021081	CAAA	2	8	132354	132361	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021081	TCGG	2	8	132832	132839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021081	GGGT	2	8	134464	134471	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021081	GGGA	2	8	134759	134766	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021081	CCGA	2	8	143096	143103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021081	GGGT	2	8	145130	145137	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021081	GGCT	2	8	149954	149961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021081	CCAG	2	8	152646	152653	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021081	AACC	2	8	152720	152727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021081	GCTT	2	8	160063	160070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021081	AGGG	2	8	163986	163993	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021081	TTGC	2	8	165829	165836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021081	TGTT	2	8	168126	168133	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021081	TCGG	2	8	170240	170247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021081	TCCT	2	8	180974	180981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021081	GGAA	2	8	190167	190174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021081	TGCC	2	8	190694	190701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021081	CAGG	2	8	190904	190911	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021081	GCCC	2	8	191094	191101	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_021081	CCGA	2	8	192585	192592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021081	AGCC	2	8	193713	193720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021081	TCGG	2	8	195559	195566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021081	GCCT	2	8	195644	195651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021081	CGAA	2	8	199954	199961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021081	GATA	2	8	204494	204501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021081	GGGT	2	8	210645	210652	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021081	AGGG	2	8	213026	213033	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021081	GATG	2	8	220509	220516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021081	TGGC	2	8	222434	222441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021081	GCAG	2	8	224638	224645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021081	TGAT	2	8	225571	225578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021081	GCAA	2	8	234385	234392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021081	GGTT	2	8	234626	234633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021081	AGCA	2	8	234696	234703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021081	ACCG	2	8	235528	235535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021081	TTGG	2	8	237147	237154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021081	CGCC	2	8	240364	240371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_021081	AGTT	2	8	246632	246639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021081	GCTA	2	8	247578	247585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021081	CTCC	2	8	247612	247619	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_021081	GGTA	2	8	247895	247902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021081	CCTT	2	8	247904	247911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021081	AGGG	2	8	248019	248026	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021081	GGCT	2	8	248367	248374	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021081	TTTC	2	8	248420	248427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021081	TATT	2	8	248701	248708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021081	GCTA	2	8	249046	249053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021081	GCTA	2	8	249282	249289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021081	GCTG	2	8	262172	262179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021081	CTGG	2	8	270566	270573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021081	GCAA	2	8	271853	271860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021081	GAGT	2	8	271964	271971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021081	TAAA	2	8	278020	278027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021081	TTGC	2	8	278093	278100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021081	GTTT	2	8	280354	280361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021081	AGGG	2	8	283376	283383	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021081	GCAG	2	8	293819	293826	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021081	GGCC	2	8	296016	296023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021081	GGTG	2	8	305482	305489	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021081	TGGT	2	8	325169	325176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021081	ACCT	2	8	326429	326436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021081	AAAG	2	8	326537	326544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021081	TGGC	2	8	327809	327816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021081	TTGC	2	8	332708	332715	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021081	ATTT	2	8	338290	338297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021081	GTGA	2	8	338301	338308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021081	AAGC	2	8	339335	339342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021081	CTTT	2	8	341856	341863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021081	CTGG	2	8	353507	353514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021081	CACC	2	8	353630	353637	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_021081	TTGC	2	8	354767	354774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021081	GACC	2	8	366023	366030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021081	AAAG	2	8	366131	366138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021081	CACC	2	8	366228	366235	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_021081	GCGG	2	8	366389	366396	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021081	TGGG	2	8	368744	368751	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021081	GCCG	2	8	384110	384117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021081	GATA	2	8	385403	385410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021081	GGGA	2	8	390373	390380	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021081	GGGT	2	8	392407	392414	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021081	GGCC	2	8	394572	394579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021081	TGGG	2	8	398731	398738	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021081	CCCT	2	8	398757	398764	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_021081	GGCG	2	8	406630	406637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021081	AAGC	2	8	409638	409645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021081	GCTC	2	8	426637	426644	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021081	GACG	2	8	427541	427548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021081	CCCG	2	8	428643	428650	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_021081	CCAG	2	8	451426	451433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021081	AGCC	2	8	451525	451532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021081	CGCC	2	8	451579	451586	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_021081	CGGG	2	8	453680	453687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021081	CATA	2	8	453855	453862	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021081	CAGG	2	8	456622	456629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021081	GTCG	2	8	457138	457145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021081	GTAT	2	8	464818	464825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021081	CCAA	2	8	466646	466653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021081	GTTG	2	8	466655	466662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_021081	GCGT	2	8	474443	474450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_021081	GCCA	2	8	530555	530562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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498	NC_021081	CCCG	2	8	1544952	1544959	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
499	NC_021081	GCGG	2	8	1544961	1544968	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
500	NC_021081	GGGT	2	8	1553688	1553695	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

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