MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 7499

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021081	CCGC	2	8	197128	197135	0 %	0 %	25 %	75 %	482881848
502	NC_021081	GGCT	2	8	198564	198571	0 %	25 %	50 %	25 %	482881848
503	NC_021081	CGAG	2	8	198929	198936	25 %	0 %	50 %	25 %	482881849
504	NC_021081	TGGG	2	8	199065	199072	0 %	25 %	75 %	0 %	482881850
505	NC_021081	CGAA	2	8	199954	199961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_021081	TGGC	2	8	200838	200845	0 %	25 %	50 %	25 %	482881852
507	NC_021081	CCTT	2	8	200951	200958	0 %	50 %	0 %	50 %	482881852
508	NC_021081	CTGG	2	8	201010	201017	0 %	25 %	50 %	25 %	482881852
509	NC_021081	TGGA	2	8	201022	201029	25 %	25 %	50 %	0 %	482881852
510	NC_021081	CGGG	2	8	201051	201058	0 %	0 %	75 %	25 %	482881852
511	NC_021081	GCGG	2	8	201825	201832	0 %	0 %	75 %	25 %	482881852
512	NC_021081	AGCG	2	8	202091	202098	25 %	0 %	50 %	25 %	482881852
513	NC_021081	TGGT	2	8	203394	203401	0 %	50 %	50 %	0 %	482881854
514	NC_021081	CTGG	2	8	203561	203568	0 %	25 %	50 %	25 %	482881854
515	NC_021081	CTGG	2	8	203609	203616	0 %	25 %	50 %	25 %	482881854
516	NC_021081	GATA	2	8	204494	204501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021081	AGCC	2	8	204690	204697	25 %	0 %	25 %	50 %	482881855
518	NC_021081	AACC	2	8	204837	204844	50 %	0 %	0 %	50 %	482881855
519	NC_021081	CAGG	2	8	205393	205400	25 %	0 %	50 %	25 %	482881855
520	NC_021081	CTAC	2	8	205615	205622	25 %	25 %	0 %	50 %	482881855
521	NC_021081	AAAG	2	8	206033	206040	75 %	0 %	25 %	0 %	482881855
522	NC_021081	CAGC	2	8	206380	206387	25 %	0 %	25 %	50 %	482881856
523	NC_021081	GGTG	2	8	207617	207624	0 %	25 %	75 %	0 %	482881858
524	NC_021081	CCAG	2	8	208120	208127	25 %	0 %	25 %	50 %	482881858
525	NC_021081	TCCG	2	8	208286	208293	0 %	25 %	25 %	50 %	482881858
526	NC_021081	GCAT	2	8	208934	208941	25 %	25 %	25 %	25 %	482881859
527	NC_021081	CAGC	2	8	209059	209066	25 %	0 %	25 %	50 %	482881859
528	NC_021081	AGGT	2	8	209453	209460	25 %	25 %	50 %	0 %	482881859
529	NC_021081	GCTC	2	8	209580	209587	0 %	25 %	25 %	50 %	482881859
530	NC_021081	GGCC	2	8	210570	210577	0 %	0 %	50 %	50 %	482881859
531	NC_021081	GGGT	2	8	210645	210652	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021081	CAGC	2	8	211097	211104	25 %	0 %	25 %	50 %	482881860
533	NC_021081	TGGC	2	8	211245	211252	0 %	25 %	50 %	25 %	482881860
534	NC_021081	GACC	2	8	212291	212298	25 %	0 %	25 %	50 %	482881860
535	NC_021081	AGGG	2	8	213026	213033	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021081	CAAA	2	8	213135	213142	75 %	0 %	0 %	25 %	482881862
537	NC_021081	GTGG	2	8	213228	213235	0 %	25 %	75 %	0 %	482881862
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539	NC_021081	CTGG	2	8	213457	213464	0 %	25 %	50 %	25 %	482881862
540	NC_021081	GAAG	2	8	213602	213609	50 %	0 %	50 %	0 %	482881862
541	NC_021081	CAGG	2	8	214659	214666	25 %	0 %	50 %	25 %	482881864
542	NC_021081	GCGG	2	8	215022	215029	0 %	0 %	75 %	25 %	482881865
543	NC_021081	GCAC	2	8	216589	216596	25 %	0 %	25 %	50 %	482881866
544	NC_021081	AATT	2	8	216774	216781	50 %	50 %	0 %	0 %	482881867
545	NC_021081	CCTT	2	8	216788	216795	0 %	50 %	0 %	50 %	482881867
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548	NC_021081	GAGC	2	8	218127	218134	25 %	0 %	50 %	25 %	482881868
549	NC_021081	GGCC	2	8	218979	218986	0 %	0 %	50 %	50 %	482881869
550	NC_021081	AAGA	2	8	219019	219026	75 %	0 %	25 %	0 %	482881869
551	NC_021081	CTGG	2	8	219141	219148	0 %	25 %	50 %	25 %	482881869
552	NC_021081	GACC	2	8	219171	219178	25 %	0 %	25 %	50 %	482881869
553	NC_021081	CGGG	2	8	219573	219580	0 %	0 %	75 %	25 %	482881869
554	NC_021081	CAGC	2	8	220389	220396	25 %	0 %	25 %	50 %	482881869
555	NC_021081	GATG	2	8	220509	220516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021081	GCCA	2	8	220899	220906	25 %	0 %	25 %	50 %	482881870
557	NC_021081	AGCC	2	8	221328	221335	25 %	0 %	25 %	50 %	482881870
558	NC_021081	TGGG	2	8	221692	221699	0 %	25 %	75 %	0 %	482881871
559	NC_021081	ACCG	2	8	221886	221893	25 %	0 %	25 %	50 %	482881871
560	NC_021081	GCTG	2	8	221951	221958	0 %	25 %	50 %	25 %	482881871
561	NC_021081	TGGC	2	8	222434	222441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
562	NC_021081	GGCC	2	8	222937	222944	0 %	0 %	50 %	50 %	482881872
563	NC_021081	GGGC	2	8	223222	223229	0 %	0 %	75 %	25 %	482881872
564	NC_021081	GTTG	2	8	223266	223273	0 %	50 %	50 %	0 %	482881873
565	NC_021081	GGCA	2	8	223279	223286	25 %	0 %	50 %	25 %	482881873
566	NC_021081	GCGG	2	8	223465	223472	0 %	0 %	75 %	25 %	482881873
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568	NC_021081	GGCT	2	8	223656	223663	0 %	25 %	50 %	25 %	482881873
569	NC_021081	ATAG	2	8	223829	223836	50 %	25 %	25 %	0 %	482881873
570	NC_021081	GCAG	2	8	224638	224645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
571	NC_021081	TCCT	2	8	225271	225278	0 %	50 %	0 %	50 %	482881874
572	NC_021081	TGAT	2	8	225571	225578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021081	CACC	2	8	225702	225709	25 %	0 %	0 %	75 %	482881875
574	NC_021081	AACG	2	8	225764	225771	50 %	0 %	25 %	25 %	482881875
575	NC_021081	CCCA	2	8	226984	226991	25 %	0 %	0 %	75 %	482881876
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581	NC_021081	GGGT	2	8	228911	228918	0 %	25 %	75 %	0 %	482881876
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590	NC_021081	GGGT	2	8	231397	231404	0 %	25 %	75 %	0 %	482881879
591	NC_021081	CGGC	2	8	231525	231532	0 %	0 %	50 %	50 %	482881879
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594	NC_021081	TGGG	2	8	233092	233099	0 %	25 %	75 %	0 %	482881880
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598	NC_021081	CTCG	2	8	233673	233680	0 %	25 %	25 %	50 %	482881880
599	NC_021081	GCGG	2	8	233823	233830	0 %	0 %	75 %	25 %	482881880
600	NC_021081	GGCC	3	12	234235	234246	0 %	0 %	50 %	50 %	482881880
601	NC_021081	GCAA	2	8	234385	234392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_021081	GGTT	2	8	234626	234633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021081	AGCA	2	8	234696	234703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_021081	ACCG	2	8	235528	235535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_021081	CTGG	2	8	236187	236194	0 %	25 %	50 %	25 %	482881882
606	NC_021081	TGCT	2	8	236796	236803	0 %	50 %	25 %	25 %	482881883
607	NC_021081	TGGC	2	8	236805	236812	0 %	25 %	50 %	25 %	482881883
608	NC_021081	TCCA	2	8	236833	236840	25 %	25 %	0 %	50 %	482881883
609	NC_021081	TTGG	2	8	237147	237154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021081	CCCG	2	8	237293	237300	0 %	0 %	25 %	75 %	482881884
611	NC_021081	GGCG	2	8	237529	237536	0 %	0 %	75 %	25 %	482881884
612	NC_021081	GCGG	2	8	237799	237806	0 %	0 %	75 %	25 %	482881884
613	NC_021081	CAGC	2	8	238551	238558	25 %	0 %	25 %	50 %	482881886
614	NC_021081	TGGC	2	8	238597	238604	0 %	25 %	50 %	25 %	482881886
615	NC_021081	TGGG	2	8	239092	239099	0 %	25 %	75 %	0 %	482881886
616	NC_021081	GGCT	2	8	239128	239135	0 %	25 %	50 %	25 %	482881886
617	NC_021081	GCCC	2	8	239296	239303	0 %	0 %	25 %	75 %	482881886
618	NC_021081	CCGC	2	8	239342	239349	0 %	0 %	25 %	75 %	482881886
619	NC_021081	GGCG	2	8	239610	239617	0 %	0 %	75 %	25 %	482881887
620	NC_021081	AGGC	2	8	240221	240228	25 %	0 %	50 %	25 %	482881887
621	NC_021081	CGCC	2	8	240364	240371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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624	NC_021081	GCTG	2	8	241167	241174	0 %	25 %	50 %	25 %	482881888
625	NC_021081	TACC	2	8	241290	241297	25 %	25 %	0 %	50 %	482881888
626	NC_021081	GCCC	2	8	241356	241363	0 %	0 %	25 %	75 %	482881888
627	NC_021081	GCCT	2	8	242456	242463	0 %	25 %	25 %	50 %	482881890
628	NC_021081	GGAA	2	8	242490	242497	50 %	0 %	50 %	0 %	482881890
629	NC_021081	GTGC	2	8	242561	242568	0 %	25 %	50 %	25 %	482881890
630	NC_021081	GCCT	2	8	242797	242804	0 %	25 %	25 %	50 %	482881890
631	NC_021081	TGGG	2	8	242934	242941	0 %	25 %	75 %	0 %	482881890
632	NC_021081	CTGG	2	8	243355	243362	0 %	25 %	50 %	25 %	482881890
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