MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021081	GT	3	6	5150	5155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021081	CT	3	6	21733	21738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021081	CG	3	6	29847	29852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021081	CG	3	6	30206	30211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021081	CG	3	6	30525	30530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021081	CG	3	6	31185	31190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021081	CG	3	6	31315	31320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021081	GC	3	6	31460	31465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021081	TC	3	6	31620	31625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021081	TG	3	6	51560	51565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021081	TG	4	8	52477	52484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021081	AG	3	6	57988	57993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021081	AG	3	6	63304	63309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021081	TA	3	6	66905	66910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021081	CA	3	6	85721	85726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021081	TC	3	6	92248	92253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021081	AC	3	6	94104	94109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021081	GC	3	6	94123	94128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021081	CT	3	6	96809	96814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021081	CA	3	6	99927	99932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021081	AG	3	6	101295	101300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021081	GT	3	6	121942	121947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021081	TA	3	6	122085	122090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021081	CA	3	6	132039	132044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021081	TG	3	6	155155	155160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021081	AT	3	6	165213	165218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021081	AC	3	6	166847	166852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021081	TC	3	6	190047	190052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021081	AC	3	6	190679	190684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021081	AC	3	6	190849	190854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021081	AG	3	6	200204	200209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021081	CA	3	6	204515	204520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021081	GT	3	6	210682	210687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021081	GA	3	6	218624	218629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021081	AG	3	6	220454	220459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021081	CG	4	8	226871	226878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021081	GT	3	6	234849	234854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021081	GT	3	6	234900	234905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021081	AC	3	6	236779	236784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021081	AC	3	6	240430	240435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021081	GC	3	6	241814	241819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021081	AC	3	6	241835	241840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021081	AT	3	6	247308	247313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021081	TG	3	6	247341	247346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021081	AG	3	6	247703	247708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021081	AT	3	6	248646	248651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021081	GT	3	6	249035	249040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021081	CT	3	6	260341	260346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021081	TG	3	6	270587	270592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021081	GC	3	6	270596	270601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021081	AT	3	6	270629	270634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021081	GC	3	6	272674	272679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021081	TA	3	6	295403	295408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021081	TG	4	8	295437	295444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021081	TG	3	6	305333	305338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021081	AC	3	6	325122	325127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021081	GC	3	6	327852	327857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021081	AC	3	6	332676	332681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021081	GC	3	6	332727	332732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021081	TG	3	6	352621	352626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021081	TA	3	6	359718	359723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021081	CT	3	6	388721	388726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021081	CG	3	6	401883	401888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021081	CG	3	6	405609	405614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021081	TG	3	6	409857	409862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021081	CA	3	6	409872	409877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021081	TC	3	6	409931	409936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021081	GT	3	6	411506	411511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021081	AG	3	6	417783	417788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021081	AT	3	6	418536	418541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021081	AT	3	6	418558	418563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021081	GT	3	6	423516	423521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021081	GA	3	6	425379	425384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021081	CG	3	6	427863	427868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021081	GA	3	6	431030	431035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021081	GA	3	6	449826	449831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021081	GC	3	6	453805	453810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021081	CG	3	6	464755	464760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021081	CG	3	6	464802	464807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021081	GA	3	6	465995	466000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021081	AC	3	6	466608	466613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021081	CG	3	6	466635	466640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021081	CT	3	6	468362	468367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021081	CT	3	6	470151	470156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021081	CT	3	6	471781	471786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021081	AT	3	6	474429	474434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021081	AC	3	6	484853	484858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021081	AC	3	6	488248	488253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021081	AG	3	6	490927	490932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021081	TG	3	6	492208	492213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021081	GC	3	6	493237	493242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021081	TC	3	6	516164	516169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021081	AT	3	6	521152	521157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021081	CA	3	6	523685	523690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021081	GT	3	6	523937	523942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021081	GT	3	6	524107	524112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021081	GA	3	6	524739	524744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021081	TG	3	6	583065	583070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021081	CA	3	6	591082	591087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021081	TG	3	6	602404	602409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021081	TA	3	6	606504	606509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021081	CG	3	6	607303	607308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021081	TG	3	6	609566	609571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021081	GC	3	6	620284	620289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021081	AC	3	6	620770	620775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021081	GT	3	6	624570	624575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021081	AT	3	6	632968	632973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021081	GT	3	6	644995	645000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021081	AG	3	6	645398	645403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021081	AC	3	6	651321	651326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021081	GC	3	6	669452	669457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021081	TG	3	6	682900	682905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021081	GT	3	6	705070	705075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021081	AG	3	6	717803	717808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021081	GC	3	6	720013	720018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021081	AT	3	6	756454	756459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021081	GC	3	6	764804	764809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021081	TG	3	6	767170	767175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021081	AT	3	6	787258	787263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021081	AG	3	6	789948	789953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021081	GA	4	8	790251	790258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021081	TC	3	6	821384	821389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021081	CA	3	6	821714	821719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021081	CT	3	6	821800	821805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021081	GC	3	6	822121	822126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021081	CG	3	6	822444	822449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021081	CT	3	6	823409	823414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021081	TC	3	6	824118	824123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021081	AG	3	6	824280	824285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021081	TG	3	6	825298	825303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021081	CA	3	6	837882	837887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021081	CA	4	8	846574	846581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021081	GC	3	6	847040	847045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021081	CG	3	6	848296	848301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021081	GT	3	6	848325	848330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021081	TG	3	6	854464	854469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021081	TG	3	6	865844	865849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021081	GA	3	6	880079	880084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021081	GC	3	6	902251	902256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021081	TG	3	6	911428	911433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021081	GT	3	6	929679	929684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021081	AC	3	6	932542	932547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021081	GC	3	6	935072	935077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021081	GA	3	6	944232	944237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021081	GC	3	6	945074	945079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021081	GC	3	6	988301	988306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021081	GC	4	8	996487	996494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021081	CA	3	6	999448	999453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021081	CA	3	6	1001353	1001358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021081	AC	3	6	1012901	1012906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021081	GT	3	6	1016270	1016275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021081	GT	3	6	1019242	1019247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021081	CG	3	6	1041192	1041197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021081	GC	3	6	1041238	1041243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_021081	AG	3	6	1056956	1056961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.