MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Raoultella ornithinolytica B6

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021066	CGCTGC	2	12	20411	20422	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021066	GATAAA	2	12	63081	63092	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021066	TCACAT	2	12	96710	96721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021066	GGGAGC	2	12	125271	125282	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021066	AGGTCG	2	12	125507	125518	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021066	TTATTT	2	12	192847	192858	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021066	TTTTCT	2	12	221809	221820	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021066	TAACAG	2	12	313162	313173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021066	GAGATT	2	12	334777	334788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021066	GCAAGA	2	12	365167	365178	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021066	CTACGC	2	12	378085	378096	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021066	GCACAG	2	12	429136	429147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021066	ATTAAT	2	12	473499	473510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021066	TTTCAT	2	12	481658	481669	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021066	CTTTTT	2	12	484821	484832	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021066	ATTTTT	2	12	493508	493519	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021066	CCCTGA	5	30	493582	493611	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021066	CGAATC	2	12	526314	526325	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021066	AGCGCA	2	12	564933	564944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021066	GGCCAG	2	12	606260	606271	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021066	AAAATG	2	12	642635	642646	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021066	GGCGAA	2	12	642824	642835	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021066	ATATCT	2	12	648533	648544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021066	TTTTTA	2	12	680413	680424	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021066	AGAGCG	2	12	730896	730907	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021066	ATGAAA	2	12	764403	764414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021066	GGCGCA	2	12	774709	774720	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021066	CTGACC	3	18	842664	842681	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021066	CTGGCC	2	12	842682	842693	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021066	AATTTT	2	12	845617	845628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021066	TACCCA	2	12	896146	896157	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021066	GGGAAG	2	12	930525	930536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021066	TTTTTA	2	12	930565	930576	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021066	CAGCGA	2	12	936077	936088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021066	TATTTT	2	12	952362	952373	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021066	ATGACG	2	12	1013918	1013929	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021066	TTTTTC	2	12	1122198	1122209	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021066	TCAGCG	2	12	1122296	1122307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021066	GCTGTT	2	12	1133590	1133601	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021066	AACATA	2	12	1146892	1146903	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021066	TAATGT	2	12	1195391	1195402	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021066	GATCAA	2	12	1223530	1223541	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021066	ATTTTT	2	12	1231316	1231327	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021066	AATCAA	2	12	1244561	1244572	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021066	CAGGAT	2	12	1251212	1251223	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021066	TCACGA	2	12	1286876	1286887	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021066	CCTCTC	2	12	1343423	1343434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_021066	CGTCGC	2	12	1349854	1349865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021066	TATTCA	2	12	1375637	1375648	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021066	TGTGGA	2	12	1405474	1405485	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021066	TCCGGC	2	12	1405598	1405609	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021066	TCCCCT	2	12	1460311	1460322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_021066	GTTTTA	2	12	1490302	1490313	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021066	GGTGAC	2	12	1519282	1519293	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021066	TGACAT	2	12	1549023	1549034	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021066	CGCCTG	2	12	1578245	1578256	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021066	TATGTT	2	12	1609943	1609954	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021066	AATATA	2	12	1687432	1687443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021066	TTAAAA	2	12	1705843	1705854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021066	TCAGGA	2	12	1718578	1718589	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021066	TTTTCG	2	12	1726594	1726605	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021066	GTTCAG	2	12	1737338	1737349	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021066	TACACA	2	12	1745667	1745678	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021066	TGAGCG	2	12	1752871	1752882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021066	CCTCAA	2	12	1764260	1764271	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021066	CCAGCA	2	12	1774752	1774763	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021066	GAAACA	2	12	1879050	1879061	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021066	CAACCA	2	12	1906011	1906022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021066	TGCGCC	2	12	1907742	1907753	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021066	CGATGA	2	12	1968996	1969007	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021066	GGCGCT	2	12	1979015	1979026	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021066	GAAGCA	2	12	2041628	2041639	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021066	CCCCTG	2	12	2140553	2140564	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021066	AGATAA	2	12	2157707	2157718	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021066	ATTCAA	2	12	2159348	2159359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021066	TTCATT	2	12	2185262	2185273	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021066	CATAGC	2	12	2238303	2238314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021066	AAATAA	2	12	2291285	2291296	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021066	TAAATA	2	12	2338748	2338759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021066	CCATTA	2	12	2369331	2369342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021066	CGCTGG	2	12	2376503	2376514	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021066	CAGCGC	2	12	2377716	2377727	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021066	TTCAGA	2	12	2392718	2392729	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021066	CGCTTT	2	12	2409465	2409476	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021066	TTTTCA	2	12	2493776	2493787	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021066	CGCGTC	2	12	2600046	2600057	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021066	CGATAA	2	12	2629157	2629168	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021066	TATCAT	2	12	2629173	2629184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021066	ATTTGC	2	12	2638502	2638513	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021066	CTGGCA	2	12	2765338	2765349	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021066	TCCCTG	2	12	2792936	2792947	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021066	TCCAGC	2	12	2871933	2871944	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021066	GAAAAA	2	12	2918504	2918515	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021066	CAAACT	2	12	2945827	2945838	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021066	AAAAAT	2	12	2991702	2991713	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021066	TCATCT	2	12	3009402	3009413	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021066	TCGATA	2	12	3032258	3032269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021066	GAAAAG	2	12	3063599	3063610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021066	AGAAAA	2	12	3084710	3084721	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021066	AAAGAG	2	12	3127037	3127048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021066	TGCATA	2	12	3129682	3129693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021066	TAAAAA	2	12	3152474	3152485	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021066	CCCAAT	2	12	3215013	3215024	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021066	AGCGAG	2	12	3251691	3251702	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021066	TGCATG	2	12	3305257	3305268	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021066	AGCGCC	2	12	3318073	3318084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021066	ATGGTG	2	12	3340520	3340531	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021066	ATCATT	2	12	3370562	3370573	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021066	ATTAAA	2	12	3463571	3463582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021066	TAAATA	2	12	3463606	3463617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021066	CTCCCT	2	12	3495764	3495775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021066	ATTGAT	2	12	3499461	3499472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021066	TTCGTT	3	18	3507664	3507681	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021066	CTTCCC	2	12	3513609	3513620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_021066	TCCCCT	9	54	3532810	3532863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_021066	CCCCAA	2	12	3543366	3543377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_021066	CGCCTG	2	12	3555605	3555616	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021066	GTTGCC	2	12	3607808	3607819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021066	GTGCCA	2	12	3621180	3621191	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021066	GTGCCA	2	12	3621281	3621292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021066	GAAACA	2	12	3644773	3644784	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021066	GAAAAA	2	12	3697732	3697743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021066	GTCCGG	2	12	3710436	3710447	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021066	CCTTTA	2	12	3710554	3710565	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021066	GTCCGG	2	12	3718246	3718257	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021066	CTGACC	2	12	3745743	3745754	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021066	GTATCA	2	12	3754872	3754883	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_021066	AAAGAC	2	12	3766028	3766039	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021066	ATAAAA	2	12	3782152	3782163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021066	GCTTAC	2	12	3812976	3812987	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021066	ATTAAA	2	12	3843775	3843786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.