MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus M1 complete genome

Total Repeats: 1542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021059	GTTGAA	2	12	1088	1099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328022
2	NC_021059	ATAAAT	2	12	1189	1200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021059	TTTAAA	2	12	1366	1377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021059	TGGCGG	2	12	3266	3277	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	479328025
5	NC_021059	GTTATC	2	12	5194	5205	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479328026
6	NC_021059	CAGATA	2	12	6103	6114	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479328026
7	NC_021059	CAAGCT	2	12	6162	6173	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479328026
8	NC_021059	GTAATG	2	12	7150	7161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
9	NC_021059	ACAATT	2	12	9149	9160	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479328028
10	NC_021059	TAGCAT	2	12	9244	9255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479328028
11	NC_021059	TAAATC	2	12	15059	15070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021059	GCTTTA	2	12	15337	15348	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479328033
13	NC_021059	TTTGAA	2	12	16158	16169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479328033
14	NC_021059	TAAAGG	2	12	18205	18216	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479328035
15	NC_021059	TTGAAG	2	12	18402	18413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328035
16	NC_021059	TGATTG	2	12	19606	19617	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479328036
17	NC_021059	TGAAAT	2	12	19937	19948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479328036
18	NC_021059	AAGGAA	2	12	20375	20386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328037
19	NC_021059	TGAATT	2	12	23304	23315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479328038
20	NC_021059	ATTTCA	2	12	25788	25799	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479328040
21	NC_021059	CTAAAG	2	12	26922	26933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479328041
22	NC_021059	ATCAGC	2	12	29105	29116	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479328043
23	NC_021059	AAAAGA	2	12	31746	31757	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479328045
24	NC_021059	ATTTTA	2	12	33754	33765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021059	TATAAA	2	12	34356	34367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021059	ATGTGT	2	12	35274	35285	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479328050
27	NC_021059	TGAGAA	2	12	36129	36140	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479328051
28	NC_021059	TATCAA	2	12	39837	39848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479328055
29	NC_021059	TCATGA	2	12	43104	43115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479328059
30	NC_021059	TTTATC	2	12	48604	48615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479328063
31	NC_021059	AACTTG	2	12	48898	48909	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479328063
32	NC_021059	AAAGGA	2	12	49022	49033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328063
33	NC_021059	ATCTTT	2	12	53163	53174	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479328067
34	NC_021059	ATTCTG	2	12	56483	56494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021059	TTATTT	2	12	56994	57005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021059	TTAAAC	2	12	58106	58117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479328072
37	NC_021059	TTATGC	2	12	58899	58910	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479328073
38	NC_021059	CATTTT	2	12	62755	62766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479328077
39	NC_021059	GTTTAA	2	12	64158	64169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479328079
40	NC_021059	AAAAAT	2	12	65889	65900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021059	AATGAA	2	12	67125	67136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479328082
42	NC_021059	ACAACT	2	12	69190	69201	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479328083
43	NC_021059	GCTAAA	2	12	70429	70440	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479328085
44	NC_021059	GTATGA	2	12	77715	77726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328092
45	NC_021059	AATTAA	2	12	80521	80532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021059	GAAGGT	2	12	82491	82502	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479328095
47	NC_021059	TATTAA	2	12	85554	85565	50 %	50 %	0 %	0 %	479328100
48	NC_021059	ACAAAT	2	12	86509	86520	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479328101
49	NC_021059	AATTAA	2	12	86600	86611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328101
50	NC_021059	ATTTAT	2	12	88842	88853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021059	TTAATG	2	12	89364	89375	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479328104
52	NC_021059	AAGTCA	2	12	90572	90583	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479328106
53	NC_021059	AAAAAG	2	12	90686	90697	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479328106
54	NC_021059	GAAAAA	2	12	90999	91010	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479328106
55	NC_021059	AATTAT	2	12	93238	93249	50 %	50 %	0 %	0 %	479328108
56	NC_021059	ACCCTT	2	12	95077	95088	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479328109
57	NC_021059	ATTTCT	2	12	99604	99615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479328114
58	NC_021059	ATATTT	2	12	99712	99723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328114
59	NC_021059	AAGGAA	2	12	100696	100707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328115
60	NC_021059	TTTAGC	2	12	101745	101756	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479328116
61	NC_021059	AAATAA	2	12	101796	101807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479328116
62	NC_021059	GTTAGA	2	12	103919	103930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328117
63	NC_021059	AAAAGA	2	12	103973	103984	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479328117
64	NC_021059	GCTAAA	2	12	106760	106771	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479328119
65	NC_021059	AACAAA	2	12	107181	107192	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021059	TAAAGA	2	12	110072	110083	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479328123
67	NC_021059	AACCAC	2	12	113941	113952	50 %	0 %	0 %	50 %	479328125
68	NC_021059	AATATA	2	12	115643	115654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021059	AATGAA	2	12	115655	115666	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021059	AACCGA	2	12	117261	117272	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479328127
71	NC_021059	CATTAC	2	12	118963	118974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328128
72	NC_021059	ATAGAT	2	12	122162	122173	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479328130
73	NC_021059	TATCAT	2	12	122929	122940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479328131
74	NC_021059	TTTATT	2	12	123337	123348	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479328132
75	NC_021059	TATTTG	2	12	123423	123434	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479328132
76	NC_021059	TAAATA	2	12	124856	124867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328132
77	NC_021059	TTTTTC	2	12	126676	126687	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479328133
78	NC_021059	TAACAA	2	12	128127	128138	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021059	TAAGCC	2	12	128536	128547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479328135
80	NC_021059	ATCGCA	2	12	129751	129762	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479328136
81	NC_021059	TTTGAA	2	12	130782	130793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479328137
82	NC_021059	GCAATG	2	12	139739	139750	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479328143
83	NC_021059	TGAAGA	2	12	140574	140585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479328144
84	NC_021059	TTTCAT	2	12	141255	141266	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479328145
85	NC_021059	TGTATA	2	12	145932	145943	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479328151
86	NC_021059	TCGAAA	2	12	147433	147444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479328153
87	NC_021059	CTATTG	2	12	150019	150030	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479328155
88	NC_021059	ATTAAG	2	12	150956	150967	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021059	CATATG	2	12	151222	151233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479328156
90	NC_021059	AATGTA	2	12	152123	152134	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021059	CTGTAA	2	12	153946	153957	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021059	GGTATG	2	12	154267	154278	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479328159
93	NC_021059	CAGATT	2	12	156865	156876	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479328161
94	NC_021059	AGATAT	2	12	164264	164275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479328168
95	NC_021059	GTTTTT	2	12	165173	165184	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021059	TAAAGC	2	12	165874	165885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479328170
97	NC_021059	TTTTGA	2	12	166060	166071	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479328170
98	NC_021059	GATATG	2	12	174170	174181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328177
99	NC_021059	ATTTGA	2	12	178077	178088	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479328181
100	NC_021059	GATTTT	2	12	182588	182599	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021059	ACAAAG	2	12	187108	187119	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479328190
102	NC_021059	TGTAAT	2	12	188132	188143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479328191
103	NC_021059	AAAGAT	2	12	189121	189132	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479328193
104	NC_021059	CAATAT	2	12	191592	191603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479328194
105	NC_021059	TTGGTA	2	12	195447	195458	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479328199
106	NC_021059	GCGATT	2	12	195467	195478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479328199
107	NC_021059	AAATTT	2	12	195565	195576	50 %	50 %	0 %	0 %	479328199
108	NC_021059	ACCTGC	2	12	198467	198478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479328202
109	NC_021059	AAGATA	2	12	198613	198624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479328202
110	NC_021059	CGTTAA	2	12	201547	201558	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479328204
111	NC_021059	CTATTA	2	12	203398	203409	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479328204
112	NC_021059	TATGAT	2	12	204932	204943	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479328204
113	NC_021059	TTGAAA	2	12	205384	205395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479328204
114	NC_021059	AACATT	2	12	207824	207835	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479328204
115	NC_021059	AGCAAC	2	12	211314	211325	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479328208
116	NC_021059	TGTTTG	2	12	211362	211373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328208
117	NC_021059	CACCTT	2	12	213366	213377	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479328210
118	NC_021059	ACCTTT	2	12	213871	213882	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479328210
119	NC_021059	TTTATA	2	12	213967	213978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021059	ATTAAT	2	12	213990	214001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021059	GTAAAT	2	12	217606	217617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479328213
122	NC_021059	ATTTTA	2	12	219202	219213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328214
123	NC_021059	TATCTT	2	12	223817	223828	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479328217
124	NC_021059	ATTTGG	2	12	224830	224841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479328218
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137	NC_021059	GGAATA	2	12	275700	275711	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_021059	ACGATG	2	12	297264	297275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479328274
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144	NC_021059	AAGTAA	2	12	308246	308257	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479328284
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231	NC_021059	AAAATA	2	12	499922	499933	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_021059	GTTGGT	2	12	501276	501287	0 %	50 %	50 %	0 %	479328476
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235	NC_021059	AATTTA	2	12	503851	503862	50 %	50 %	0 %	0 %	479328478
236	NC_021059	CAAGAA	2	12	506976	506987	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479328481
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238	NC_021059	AAAATG	2	12	516574	516585	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479328485
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