MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus M1 complete genome

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021059	ATAAAT	2	12	1189	1200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021059	TTTAAA	2	12	1366	1377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021059	TAAATC	2	12	15059	15070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021059	ATTTTA	2	12	33754	33765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021059	TATAAA	2	12	34356	34367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021059	ATTCTG	2	12	56483	56494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021059	TTATTT	2	12	56994	57005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021059	AAAAAT	2	12	65889	65900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021059	AATTAA	2	12	80521	80532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021059	ATTTAT	2	12	88842	88853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021059	AACAAA	2	12	107181	107192	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021059	AATATA	2	12	115643	115654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021059	AATGAA	2	12	115655	115666	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021059	TAACAA	2	12	128127	128138	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021059	ATTAAG	2	12	150956	150967	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021059	AATGTA	2	12	152123	152134	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021059	CTGTAA	2	12	153946	153957	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021059	GTTTTT	2	12	165173	165184	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021059	GATTTT	2	12	182588	182599	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021059	TTTATA	2	12	213967	213978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021059	ATTAAT	2	12	213990	214001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021059	ATATGA	2	12	260889	260900	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021059	CTTCAA	2	12	265877	265888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021059	GGAATA	2	12	275700	275711	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021059	ATATAG	2	12	296928	296939	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021059	ATTTTC	2	12	302244	302255	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021059	ATAATT	2	12	303195	303206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021059	AACGAT	2	12	310512	310523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021059	TAACTT	2	12	319432	319443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021059	ATATGA	2	12	373585	373596	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021059	TTGTAA	2	12	383341	383352	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021059	AATGTA	2	12	421259	421270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021059	AATTTG	2	12	421366	421377	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021059	TAAAGA	2	12	423339	423350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021059	TTGAAA	2	12	444733	444744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021059	TGTATA	2	12	460129	460140	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021059	TTTTTA	2	12	473318	473329	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021059	AAAATG	2	12	478751	478762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021059	ACGTTG	2	12	499198	499209	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021059	AAAATA	2	12	499922	499933	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021059	TATGGT	2	12	508060	508071	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021059	TTATAA	2	12	519235	519246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021059	AAATTT	2	12	525994	526005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021059	TTATAA	2	12	581127	581138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021059	GTTATA	2	12	581798	581809	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021059	CTTAAA	2	12	590230	590241	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021059	ACATGT	2	12	600200	600211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021059	ATTGCG	2	12	629372	629383	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021059	AATGAT	2	12	633290	633301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021059	TAGATG	2	12	633363	633374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021059	TAAAAT	2	12	648684	648695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021059	TTTTAA	2	12	660789	660800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021059	CATTAT	2	12	677100	677111	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021059	CATCAA	2	12	687764	687775	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021059	TAATTT	2	12	692004	692015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021059	TGAATA	2	12	708482	708493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021059	GGATTC	2	12	719833	719844	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021059	AAATAT	2	12	722625	722636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021059	TTAAAA	2	12	734628	734639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021059	TAGTTA	2	12	739063	739074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021059	TTTTTA	2	12	757338	757349	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021059	TGAAAA	2	12	765580	765591	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021059	AATGAT	2	12	794350	794361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021059	ACAAAA	2	12	834592	834603	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021059	TAAAAA	2	12	853793	853804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021059	TATCAA	2	12	860221	860232	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021059	TTTTGA	2	12	863993	864004	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021059	TCATTT	2	12	869986	869997	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021059	AAATTA	2	12	880098	880109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021059	AAGCAC	2	12	888817	888828	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021059	TAAAAT	2	12	896493	896504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021059	TTTAAT	2	12	969214	969225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021059	ACAATA	2	12	986610	986621	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021059	AACGGA	2	12	1001132	1001143	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021059	AAAAGC	2	12	1005731	1005742	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021059	CATTTA	2	12	1031052	1031063	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021059	ATCATA	2	12	1032947	1032958	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021059	TCAAAA	2	12	1039455	1039466	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021059	ATTGCA	2	12	1040534	1040545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021059	TTTTCT	2	12	1053262	1053273	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021059	TTTATA	2	12	1089203	1089214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021059	GAATTA	2	12	1095776	1095787	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021059	ATTTTT	2	12	1113154	1113165	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021059	ATAATT	2	12	1113951	1113962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021059	TAATGA	2	12	1126990	1127001	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021059	ATTTAT	2	12	1146228	1146239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021059	ATTATA	2	12	1150146	1150157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021059	AAATTT	2	12	1150955	1150966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021059	AAGTAA	2	12	1172659	1172670	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021059	TCGTTT	2	12	1175786	1175797	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021059	TTAATT	2	12	1186502	1186513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021059	AATTAA	2	12	1189238	1189249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021059	GAAATT	2	12	1234146	1234157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021059	AATGAT	2	12	1246921	1246932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021059	TTTCAT	2	12	1277204	1277215	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021059	TATATT	2	12	1281863	1281874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021059	GGTAAA	2	12	1302386	1302397	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021059	CATATT	2	12	1306932	1306943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021059	ATGTAT	2	12	1307553	1307564	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021059	AAAGAA	2	12	1307785	1307796	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021059	TTAAAG	2	12	1313036	1313047	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021059	ATTAAA	2	12	1341644	1341655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021059	ATATAA	2	12	1349626	1349637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021059	AAAATA	2	12	1363694	1363705	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021059	GTTTTA	2	12	1379441	1379452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021059	TAAAAT	2	12	1395016	1395027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021059	TATCTT	2	12	1417851	1417862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021059	TTGATT	2	12	1417914	1417925	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021059	ATTCTA	2	12	1425254	1425265	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021059	AATAAA	2	12	1428849	1428860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021059	TATTCT	2	12	1489369	1489380	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021059	TACTTG	2	12	1499616	1499627	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021059	AAAAAT	2	12	1499632	1499643	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021059	TTAATC	2	12	1513139	1513150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021059	ATTTAC	2	12	1544638	1544649	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021059	ATTTTT	2	12	1584943	1584954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021059	TATGAT	2	12	1600594	1600605	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021059	AATAAA	2	12	1605709	1605720	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021059	ATAAAA	2	12	1609497	1609508	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021059	ACAAGA	2	12	1615074	1615085	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021059	TAAAAA	2	12	1627976	1627987	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021059	TTATAG	2	12	1637109	1637120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021059	AATTTA	2	12	1645144	1645155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021059	AGCCAA	2	12	1673030	1673041	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021059	TTGACT	2	12	1673049	1673060	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021059	TTTAAC	2	12	1677933	1677944	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021059	TTATAA	2	12	1680415	1680426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021059	ACCTTT	2	12	1690372	1690383	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021059	TTTTAT	2	12	1692840	1692851	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021059	AGTTTT	2	12	1718496	1718507	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021059	AATTAA	2	12	1719741	1719752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_021059	TTAAAT	2	12	1730200	1730211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021059	AATTTA	2	12	1732690	1732701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.