MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus M1 complete genome

Total Repeats: 625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021059	TGAAC	2	10	4872	4881	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021059	AGGAA	2	10	12239	12248	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021059	GTAGG	2	10	12299	12308	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021059	TCGAT	2	10	21707	21716	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021059	ATATT	2	10	22245	22254	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021059	GAAAA	2	10	41749	41758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021059	ATGTT	2	10	41767	41776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021059	CAAAA	2	10	42244	42253	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021059	TTGAA	2	10	42364	42373	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021059	GAAGG	2	10	42630	42639	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021059	GATTA	2	10	45854	45863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021059	ACTGT	2	10	47193	47202	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021059	CTTAT	2	10	53954	53963	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021059	CTATT	2	10	55064	55073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021059	AGAAA	2	10	55820	55829	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021059	TTCTT	2	10	56965	56974	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021059	ACAAA	2	10	57150	57159	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021059	AAATT	2	10	61458	61467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021059	ATGAG	2	10	65763	65772	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021059	TTTGT	2	10	72169	72178	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021059	TTTTA	2	10	88217	88226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021059	GTGTT	2	10	93847	93856	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021059	AGAAA	2	10	100885	100894	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021059	TAAAG	2	10	100926	100935	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021059	ATTCA	2	10	101198	101207	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021059	GTAAT	2	10	122465	122474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021059	ATTTT	2	10	166782	166791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021059	GATTT	2	10	166836	166845	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021059	GGGGC	2	10	167105	167114	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021059	CAAAA	2	10	190550	190559	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021059	AAAGC	2	10	190900	190909	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021059	CGTTT	2	10	192119	192128	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021059	TATCA	2	10	200695	200704	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021059	ATCAT	2	10	208827	208836	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021059	CAACT	2	10	220958	220967	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_021059	GCTTT	2	10	225470	225479	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021059	TGAAG	2	10	225672	225681	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021059	AAAAT	2	10	225743	225752	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021059	TGATT	2	10	225816	225825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021059	TAACA	2	10	232041	232050	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021059	TAATG	2	10	240339	240348	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021059	AATAT	2	10	251221	251230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021059	TATTT	2	10	257212	257221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021059	AACAT	2	10	265503	265512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021059	GATAA	2	10	269456	269465	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021059	ATAAC	2	10	274103	274112	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021059	TGAAT	2	10	274214	274223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021059	ATTAA	2	10	274355	274364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021059	AAAGT	2	10	278099	278108	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021059	TAAAA	2	10	279812	279821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021059	AAATT	2	10	281128	281137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021059	TAAAA	2	10	295275	295284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021059	GAAAA	2	10	303066	303075	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021059	ATAAA	2	10	303184	303193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021059	TCATA	2	10	311593	311602	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021059	ATTTA	2	10	327418	327427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021059	TAAAT	2	10	361720	361729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021059	AAATT	2	10	365413	365422	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021059	ATTTT	2	10	367278	367287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021059	AGTGA	2	10	371188	371197	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021059	ATAGA	2	10	373515	373524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021059	TGACA	2	10	373707	373716	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021059	GATAA	2	10	386010	386019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021059	GTAAT	2	10	420816	420825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021059	AGATA	2	10	421801	421810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021059	AGAAT	2	10	422042	422051	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021059	TAAGG	2	10	422106	422115	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021059	TAAAT	2	10	429551	429560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021059	ACAGT	2	10	432124	432133	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021059	CATAA	2	10	442601	442610	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021059	TAAAA	2	10	442825	442834	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021059	AATAT	2	10	444970	444979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021059	AAAGT	2	10	456927	456936	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021059	AAATT	2	10	460116	460125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021059	TTAAA	2	10	464312	464321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021059	TAAAG	2	10	470450	470459	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021059	CTCAC	2	10	472355	472364	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_021059	CAAAG	2	10	472380	472389	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_021059	TTGTA	2	10	480381	480390	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021059	ATTAT	2	10	480548	480557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021059	CTTAA	2	10	490089	490098	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021059	TGGTG	2	10	507906	507915	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021059	CAACT	2	10	508471	508480	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_021059	GATTT	2	10	517007	517016	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021059	ATATA	2	10	519425	519434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021059	CAAAG	2	10	525973	525982	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_021059	TTGAT	2	10	529134	529143	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021059	AGACA	2	10	543095	543104	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021059	AAGTA	2	10	545530	545539	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021059	TTAAA	2	10	547654	547663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021059	GATAA	2	10	547693	547702	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021059	ATATA	2	10	562964	562973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021059	AAAAT	2	10	567739	567748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021059	TTTAT	2	10	567848	567857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021059	TTATG	2	10	570854	570863	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021059	ATTTA	2	10	570999	571008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021059	TGAAT	2	10	577271	577280	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021059	GTATA	2	10	577328	577337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021059	TATAA	2	10	581045	581054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021059	GTTTA	2	10	597211	597220	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021059	TAAAG	2	10	601405	601414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021059	ATATT	2	10	607540	607549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021059	TTAAC	2	10	610434	610443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021059	AATTT	2	10	610519	610528	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021059	ATAAA	2	10	618724	618733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021059	TTATA	2	10	633101	633110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021059	CACAT	2	10	633497	633506	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_021059	ATGAT	2	10	642521	642530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021059	TAATT	2	10	646008	646017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021059	TAAGT	2	10	650993	651002	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021059	TATTG	2	10	652453	652462	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021059	AGTTC	2	10	655001	655010	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_021059	TTTAA	2	10	655549	655558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021059	AAATT	2	10	658793	658802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021059	TAAAT	2	10	661386	661395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021059	AAATT	2	10	663390	663399	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021059	TAAAA	2	10	670529	670538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021059	ATTAA	2	10	672717	672726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021059	TTATT	2	10	672766	672775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021059	CAATA	2	10	672832	672841	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021059	TTAAT	2	10	675457	675466	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021059	ATTTT	2	10	677744	677753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021059	ATATA	2	10	677800	677809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021059	ATAAA	2	10	684436	684445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021059	TTTTA	2	10	686702	686711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021059	AAAGG	2	10	687023	687032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021059	ATATA	2	10	690393	690402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021059	AAACT	2	10	693918	693927	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021059	TTCAC	2	10	699131	699140	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_021059	TTTGT	2	10	703039	703048	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021059	AATGA	2	10	703112	703121	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021059	GGTTG	2	10	710114	710123	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021059	AGTAG	2	10	719822	719831	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021059	AAGTT	2	10	720271	720280	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021059	AATTG	2	10	720303	720312	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021059	AAACT	2	10	722178	722187	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021059	ATTTA	2	10	722569	722578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021059	AAAGT	2	10	724817	724826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021059	AATTT	2	10	727426	727435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021059	CATGA	2	10	729586	729595	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021059	ATCAT	2	10	734108	734117	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021059	AATTT	2	10	739000	739009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021059	AATTA	2	10	745802	745811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021059	ATTTA	2	10	749983	749992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021059	AAAGT	2	10	750076	750085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021059	TAAAG	2	10	751911	751920	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021059	ATTTT	2	10	762463	762472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021059	TAAGT	2	10	765485	765494	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_021059	AAAGT	2	10	771239	771248	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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