MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus M1 complete genome

Total Repeats: 1915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021059	ATTA	2	8	1214	1221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021059	AATT	2	8	1470	1477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021059	CTAC	2	8	10467	10474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021059	ACGT	2	8	10631	10638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021059	TAAA	2	8	12434	12441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021059	TGCT	2	8	21693	21700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021059	ATCT	2	8	22027	22034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021059	GCCT	2	8	22155	22162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021059	ATTT	2	8	22487	22494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021059	TTGA	2	8	28770	28777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021059	ATCA	2	8	28830	28837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021059	ATTA	2	8	32072	32079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021059	ATTA	2	8	32105	32112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021059	AAAG	2	8	32134	32141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021059	AATA	2	8	33578	33585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021059	TAAA	2	8	33794	33801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021059	TTTG	2	8	34489	34496	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021059	AATA	2	8	34504	34511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021059	ATAA	2	8	34962	34969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021059	TCAT	2	8	35632	35639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021059	GATT	2	8	36618	36625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021059	TTTC	2	8	36652	36659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021059	GATA	2	8	36863	36870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021059	TTAT	3	12	37307	37318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021059	TCAA	2	8	40689	40696	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021059	GAAA	2	8	41740	41747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021059	CGAT	2	8	42696	42703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021059	ATTT	2	8	43028	43035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021059	ATGA	2	8	44994	45001	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021059	TCAA	2	8	45590	45597	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021059	AGTA	2	8	45997	46004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021059	ATTA	2	8	46024	46031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021059	TAAA	2	8	46050	46057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021059	AATG	2	8	52491	52498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021059	AGGG	2	8	53848	53855	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021059	CAAA	2	8	53965	53972	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021059	TAAA	2	8	54799	54806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021059	GTAT	2	8	54914	54921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021059	TAAA	2	8	54934	54941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021059	AAAG	2	8	54998	55005	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021059	GAAA	2	8	55570	55577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021059	TTTG	2	8	56913	56920	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021059	ACAT	2	8	56940	56947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021059	TTAT	2	8	57093	57100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021059	TTTC	2	8	57274	57281	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021059	ATGC	2	8	60189	60196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021059	AATT	2	8	60421	60428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021059	TTCT	2	8	60528	60535	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021059	TAAA	2	8	61580	61587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021059	AATT	2	8	63746	63753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021059	AATT	2	8	63775	63782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021059	ATTC	2	8	63808	63815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021059	AAAT	2	8	65089	65096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021059	TTAA	2	8	65881	65888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021059	AAGA	2	8	66739	66746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021059	TCCC	2	8	73043	73050	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_021059	GATA	2	8	73269	73276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021059	ACAA	2	8	73647	73654	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021059	TTAT	3	12	73713	73724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021059	TGAT	2	8	77095	77102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021059	TCAA	2	8	79336	79343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021059	ATTG	2	8	79369	79376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021059	TATT	2	8	82656	82663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021059	AATA	2	8	82664	82671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021059	CATT	2	8	83179	83186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021059	TTTG	2	8	84937	84944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021059	TTAA	2	8	85662	85669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021059	TTCA	2	8	85993	86000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021059	ATAA	2	8	86199	86206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021059	ATAA	2	8	86209	86216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021059	ATCA	2	8	86334	86341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021059	GATA	2	8	87464	87471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021059	CATA	2	8	88906	88913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021059	TCCA	2	8	90077	90084	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021059	TAAT	2	8	94049	94056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021059	TGAC	2	8	94084	94091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021059	ATTT	2	8	95776	95783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021059	CATT	2	8	99235	99242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021059	TAGT	2	8	99289	99296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021059	GATT	2	8	99300	99307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021059	TTGA	2	8	100822	100829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021059	AATA	2	8	102004	102011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021059	AGCT	2	8	105832	105839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021059	TAAT	2	8	105977	105984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021059	AGAA	2	8	105996	106003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021059	TTGT	2	8	107115	107122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021059	AATC	2	8	108835	108842	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021059	AATC	2	8	109669	109676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021059	ATAA	2	8	112915	112922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021059	TTAT	2	8	115706	115713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021059	ATAA	2	8	116004	116011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021059	CAAT	2	8	117876	117883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021059	AGGG	2	8	120931	120938	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021059	AAAG	2	8	122513	122520	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021059	ATAA	2	8	123054	123061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021059	TATT	2	8	123092	123099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021059	AGTA	2	8	125034	125041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021059	TTGT	2	8	125177	125184	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021059	TGTA	2	8	126702	126709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021059	AAAT	2	8	126802	126809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021059	ATTG	2	8	128047	128054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021059	GTTA	2	8	128169	128176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021059	TAAA	2	8	142814	142821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021059	TAAA	2	8	142852	142859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021059	TAAA	2	8	143309	143316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021059	GAAA	2	8	144142	144149	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021059	ATAA	2	8	144960	144967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021059	AAAT	2	8	151119	151126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021059	ATTA	2	8	151153	151160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021059	ATTA	2	8	151992	151999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021059	TAAA	2	8	152016	152023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021059	GAGC	2	8	152930	152937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021059	TGAA	2	8	152993	153000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021059	ATAG	2	8	153905	153912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021059	TAAA	2	8	156182	156189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021059	CTTT	2	8	160615	160622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021059	CTTT	2	8	161891	161898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021059	ATTT	2	8	161978	161985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021059	AAGA	2	8	163564	163571	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021059	GAGT	2	8	163587	163594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021059	ACTT	2	8	165149	165156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021059	TAAT	2	8	166919	166926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021059	AAAT	2	8	166959	166966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021059	AAAT	2	8	167177	167184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021059	CCAA	2	8	167279	167286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021059	GTAA	2	8	167358	167365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021059	GAAA	2	8	167453	167460	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021059	GTTA	2	8	167509	167516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021059	AAGG	2	8	167868	167875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021059	ATTT	2	8	168112	168119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021059	TATT	2	8	170956	170963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021059	ATAA	2	8	171083	171090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021059	TAAT	2	8	171118	171125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021059	ATTT	2	8	173536	173543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021059	TAAA	2	8	185244	185251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021059	AATA	2	8	190468	190475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021059	ATTA	2	8	190700	190707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021059	GTTT	2	8	190748	190755	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021059	TAAC	2	8	190848	190855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021059	ATTT	2	8	191090	191097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021059	TTTA	2	8	192361	192368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021059	GAGT	2	8	194112	194119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021059	TCAT	2	8	198862	198869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021059	TTTG	2	8	198945	198952	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021059	ATTT	2	8	200311	200318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021059	ATTT	2	8	200323	200330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021059	ATGT	2	8	200554	200561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021059	TTAA	2	8	200675	200682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021059	AGTA	2	8	200717	200724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021059	AAGT	2	8	208722	208729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021059	ATCA	2	8	208861	208868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_021059	ATGT	2	8	214124	214131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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