MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus M1 complete genome

Total Repeats: 43905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021059	ATT	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
2	NC_021059	TTA	2	6	84	89	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
3	NC_021059	AAC	2	6	127	132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328022
4	NC_021059	AGT	2	6	277	282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328022
5	NC_021059	TTG	2	6	300	305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328022
6	NC_021059	TTA	2	6	428	433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
7	NC_021059	AGA	2	6	628	633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328022
8	NC_021059	TCA	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328022
9	NC_021059	GAA	2	6	707	712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328022
10	NC_021059	TCT	2	6	723	728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479328022
11	NC_021059	ATT	2	6	781	786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
12	NC_021059	ACA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328022
13	NC_021059	TTA	2	6	890	895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
14	NC_021059	GGT	2	6	905	910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328022
15	NC_021059	TTA	2	6	918	923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
16	NC_021059	TGA	2	6	937	942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328022
17	NC_021059	GTT	2	6	944	949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328022
18	NC_021059	TCT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479328022
19	NC_021059	AGA	2	6	988	993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328022
20	NC_021059	GGT	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328022
21	NC_021059	ATG	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328022
22	NC_021059	TTC	2	6	1100	1105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479328022
23	NC_021059	GAC	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328022
24	NC_021059	AAT	2	6	1249	1254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021059	GCA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021059	TAA	2	6	1344	1349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021059	ATT	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021059	AAG	2	6	1583	1588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328023
29	NC_021059	GTA	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328023
30	NC_021059	ATT	2	6	1639	1644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328023
31	NC_021059	TGG	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328023
32	NC_021059	ATG	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328024
33	NC_021059	GTC	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328024
34	NC_021059	AGA	2	6	2162	2167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328024
35	NC_021059	CTC	2	6	2188	2193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479328024
36	NC_021059	GAC	2	6	2200	2205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328024
37	NC_021059	CTG	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328024
38	NC_021059	AAT	2	6	2289	2294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328024
39	NC_021059	CAG	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328024
40	NC_021059	AAG	2	6	2461	2466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328024
41	NC_021059	ATT	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328024
42	NC_021059	GAA	2	6	2532	2537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328024
43	NC_021059	ATA	2	6	2557	2562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328024
44	NC_021059	GAT	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328024
45	NC_021059	TTA	3	9	2745	2753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328024
46	NC_021059	GAT	2	6	2775	2780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328024
47	NC_021059	TTA	2	6	2796	2801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328024
48	NC_021059	ACA	2	6	2956	2961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328025
49	NC_021059	ATA	2	6	3088	3093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328025
50	NC_021059	GTT	2	6	3135	3140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328025
51	NC_021059	TGG	2	6	3254	3259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328025
52	NC_021059	TGG	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328025
53	NC_021059	TCA	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328025
54	NC_021059	TCA	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328025
55	NC_021059	AAG	2	6	3418	3423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328025
56	NC_021059	CAG	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328025
57	NC_021059	TGA	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328025
58	NC_021059	AGA	2	6	3599	3604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328025
59	NC_021059	ATG	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328025
60	NC_021059	TCA	2	6	3692	3697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328025
61	NC_021059	GAT	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328025
62	NC_021059	GGT	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328025
63	NC_021059	AGA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328025
64	NC_021059	ATT	2	6	4016	4021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328025
65	NC_021059	TAT	2	6	4088	4093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328025
66	NC_021059	GGC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479328025
67	NC_021059	TGC	2	6	4112	4117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328025
68	NC_021059	CGT	2	6	4140	4145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328025
69	NC_021059	GAA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328025
70	NC_021059	TTA	2	6	4488	4493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328025
71	NC_021059	TTC	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479328025
72	NC_021059	TAT	2	6	4590	4595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328025
73	NC_021059	ACA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328025
74	NC_021059	AGA	2	6	4829	4834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328025
75	NC_021059	AGG	2	6	4888	4893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021059	TCG	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328026
77	NC_021059	TTG	2	6	5209	5214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328026
78	NC_021059	GCA	3	9	5253	5261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328026
79	NC_021059	TAA	2	6	5318	5323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328026
80	NC_021059	ATG	2	6	5350	5355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
81	NC_021059	TTA	2	6	5400	5405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
82	NC_021059	CCA	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479328026
83	NC_021059	GGA	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479328026
84	NC_021059	CTG	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328026
85	NC_021059	GAA	2	6	5649	5654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
86	NC_021059	TTG	2	6	5677	5682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328026
87	NC_021059	TGA	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
88	NC_021059	CAT	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328026
89	NC_021059	TTA	2	6	5935	5940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
90	NC_021059	AAG	2	6	5947	5952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
91	NC_021059	ATT	2	6	5962	5967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
92	NC_021059	GTT	2	6	5985	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328026
93	NC_021059	AGA	2	6	5991	5996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
94	NC_021059	ATT	2	6	6081	6086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
95	NC_021059	CAA	2	6	6135	6140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328026
96	NC_021059	TTA	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
97	NC_021059	TGA	2	6	6281	6286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
98	NC_021059	TTA	2	6	6294	6299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
99	NC_021059	TGA	2	6	6344	6349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
100	NC_021059	TCG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328026
101	NC_021059	AGA	2	6	6410	6415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
102	NC_021059	ATA	2	6	6439	6444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328026
103	NC_021059	GTG	2	6	6490	6495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328026
104	NC_021059	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328026
105	NC_021059	GAA	2	6	6525	6530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
106	NC_021059	ATG	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
107	NC_021059	CTT	2	6	6740	6745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479328026
108	NC_021059	GTG	2	6	6763	6768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328026
109	NC_021059	AGA	2	6	6839	6844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
110	NC_021059	TGA	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
111	NC_021059	AAG	2	6	6880	6885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
112	NC_021059	CAT	2	6	6910	6915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328026
113	NC_021059	TGA	2	6	7037	7042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
114	NC_021059	TAG	2	6	7048	7053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
115	NC_021059	GTG	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328026
116	NC_021059	GAA	2	6	7188	7193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
117	NC_021059	ATT	2	6	7224	7229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
118	NC_021059	GCA	2	6	7266	7271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328026
119	NC_021059	TGA	2	6	7298	7303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
120	NC_021059	AGA	2	6	7334	7339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
121	NC_021059	AGA	2	6	7343	7348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
122	NC_021059	AAC	3	9	7402	7410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328026
123	NC_021059	ATG	2	6	7426	7431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
124	NC_021059	AGA	2	6	7472	7477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
125	NC_021059	ATG	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
126	NC_021059	GAA	2	6	7530	7535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
127	NC_021059	ACA	2	6	7541	7546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328026
128	NC_021059	ATC	2	6	7547	7552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328026
129	NC_021059	GAA	2	6	7557	7562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
130	NC_021059	TAA	2	6	7563	7568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328026
131	NC_021059	TGG	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328027
132	NC_021059	CAC	2	6	7709	7714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479328027
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256	NC_021059	TTA	2	6	15172	15177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_021059	ATA	2	6	15241	15246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_021059	CAA	2	6	15302	15307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328033
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260	NC_021059	TTA	2	6	15449	15454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328033
261	NC_021059	AAC	2	6	15465	15470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328033
262	NC_021059	CAT	2	6	15501	15506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328033
263	NC_021059	ATT	2	6	15529	15534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328033
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265	NC_021059	TAC	2	6	15626	15631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328033
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371	NC_021059	TAT	2	6	22539	22544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_021059	ATT	2	6	23321	23326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328038
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387	NC_021059	AAC	2	6	23510	23515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328038
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392	NC_021059	ATT	3	9	23833	23841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328039
393	NC_021059	CGA	3	9	23843	23851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328039
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499	NC_021059	GAA	2	6	29933	29938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328043
500	NC_021059	ATG	2	6	30001	30006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328043

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