MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus LAL14/1

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021058	TACAAA	2	12	5743	5754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021058	TGGTAT	2	12	17808	17819	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021058	CTTTTC	2	12	32726	32737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021058	TATTTA	2	12	38254	38265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021058	ATAAGA	2	12	44781	44792	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021058	TCTAGT	2	12	48124	48135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021058	AATAAA	2	12	72041	72052	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021058	AGTTAA	2	12	90803	90814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021058	GTATGA	2	12	106336	106347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021058	AAAATA	2	12	120186	120197	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021058	CTAGAG	2	12	140205	140216	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021058	AATATT	2	12	164939	164950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021058	GTAAGC	2	12	215485	215496	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021058	TTACAT	2	12	217660	217671	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021058	ATAAGT	2	12	270202	270213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021058	TTATGT	2	12	275036	275047	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021058	CTCATA	2	12	293020	293031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021058	CTCATT	2	12	296766	296777	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021058	TTTCTT	2	12	303585	303596	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021058	AAAAGA	2	12	312176	312187	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021058	ATTTAT	2	12	316791	316802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021058	GCATTA	2	12	321519	321530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021058	CTTTTC	2	12	335160	335171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021058	TTCTTT	2	12	348303	348314	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021058	CAGAAA	2	12	348665	348676	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021058	TTCTCA	2	12	354824	354835	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021058	GCCTTA	2	12	355932	355943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021058	TAAAAA	2	12	361980	361991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021058	CAGCTT	2	12	368843	368854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021058	ACTTAT	2	12	393842	393853	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021058	AATACT	2	12	443861	443872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021058	TATATT	2	12	449800	449811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021058	TAAATT	2	12	449918	449929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021058	GATAAA	2	12	451376	451387	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021058	GAAATA	2	12	453312	453323	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021058	TTTCAT	2	12	455045	455056	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021058	AAGGAA	2	12	457755	457766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021058	AAAATT	2	12	460312	460323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021058	TTTACC	2	12	471071	471082	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021058	ACGTTA	2	12	492488	492499	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021058	TTTCTT	2	12	495764	495775	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021058	CTCATA	2	12	512561	512572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021058	AAATTT	2	12	519800	519811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021058	TTGGCT	2	12	527670	527681	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021058	ACTTCC	2	12	530455	530466	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021058	AGCCAA	2	12	539328	539339	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021058	GAGATG	2	12	540848	540859	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021058	ATAATT	2	12	561131	561142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021058	AGGGGT	2	12	562399	562410	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021058	TCACTT	2	12	574137	574148	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021058	TAGTTT	2	12	574635	574646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021058	TAGTTT	2	12	575165	575176	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021058	TGATAA	2	12	575643	575654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021058	AGTTCT	2	12	576159	576170	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021058	TTTAGT	2	12	585132	585143	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021058	TTAGTT	2	12	586027	586038	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021058	TGATAA	2	12	586331	586342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021058	TTATCA	2	12	597216	597227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021058	AAACTA	2	12	597585	597596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021058	AAACTA	2	12	597944	597955	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021058	AAACTA	2	12	598124	598135	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021058	AAACTA	2	12	598780	598791	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021058	AAACTA	2	12	598901	598912	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021058	AAGAAA	2	12	605765	605776	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021058	CTCATA	2	12	613209	613220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021058	ACTCCT	2	12	615358	615369	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021058	CCTCTT	2	12	618291	618302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021058	TTGGCT	2	12	624159	624170	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021058	GATGTA	2	12	662506	662517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021058	ATGTTT	2	12	705229	705240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021058	TTATAT	2	12	705654	705665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021058	TTCCAA	2	12	727892	727903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021058	AAAATA	2	12	735698	735709	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021058	ATTAAT	2	12	745788	745799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021058	CCTCTT	2	12	745979	745990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021058	GCCATA	2	12	747698	747709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021058	TGGTTC	2	12	747893	747904	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021058	ACTTAT	2	12	750149	750160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021058	AAGAAA	2	12	763977	763988	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021058	ACTTAT	2	12	789781	789792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021058	AATAAA	2	12	798610	798621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021058	TCTTTA	2	12	825276	825287	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021058	ATATTT	2	12	833555	833566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021058	ATCCAA	2	12	844274	844285	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021058	ATAAGT	2	12	845492	845503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021058	ACTTAT	2	12	873468	873479	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021058	AAGAGG	2	12	882508	882519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021058	TAATAC	2	12	910779	910790	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021058	AATTGT	2	12	915783	915794	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021058	AAAACA	2	12	936960	936971	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021058	AAAGTA	2	12	1011396	1011407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021058	TTCCAT	2	12	1011589	1011600	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021058	TAAAGA	2	12	1054703	1054714	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021058	ACTCTT	2	12	1065247	1065258	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021058	ATTTAT	2	12	1128838	1128849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021058	TCATAA	2	12	1255649	1255660	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021058	GTATGA	2	12	1265407	1265418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021058	GGGGAT	2	12	1265662	1265673	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021058	GAATTA	2	12	1370970	1370981	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021058	AACCGA	2	12	1373201	1373212	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021058	ATATGA	2	12	1375263	1375274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021058	AAGAGA	2	12	1379260	1379271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021058	TCTAAG	2	12	1379577	1379588	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021058	TACAAA	2	12	1398690	1398701	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021058	TAAAAA	2	12	1423823	1423834	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021058	CTTAAT	2	12	1590239	1590250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021058	TATAAA	2	12	1628607	1628618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021058	AATATA	2	12	1735512	1735523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021058	ATTTAT	2	12	1735527	1735538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021058	ACTATC	2	12	1759376	1759387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021058	TTTTAT	2	12	1802468	1802479	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021058	GATAAA	2	12	1860711	1860722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021058	TTAGCT	2	12	1860792	1860803	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021058	TAACAT	2	12	1895540	1895551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021058	CTAATA	2	12	1897447	1897458	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021058	TTAATT	2	12	1910826	1910837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021058	GGAATT	2	12	1934744	1934755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021058	TCCTTT	2	12	1943198	1943209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021058	AAGAAA	2	12	1965326	1965337	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021058	TTTATG	2	12	1973115	1973126	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021058	CATACC	2	12	1987456	1987467	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021058	ATCTTC	2	12	2006424	2006435	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021058	AAGAAA	2	12	2007911	2007922	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021058	TACAAA	2	12	2014043	2014054	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021058	TATTTT	2	12	2022147	2022158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021058	TTCCTT	2	12	2065148	2065159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021058	ATCATA	2	12	2071786	2071797	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_021058	TTATTT	2	12	2075685	2075696	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021058	AAAAAG	2	12	2086783	2086794	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021058	ATAAGT	2	12	2096977	2096988	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021058	ATTGAA	2	12	2101774	2101785	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021058	TAATTA	2	12	2106096	2106107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021058	ATAAAA	2	12	2153079	2153090	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021058	TAAAAT	2	12	2153102	2153113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021058	AAAAAG	2	12	2169702	2169713	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.