MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Moranella endobia PCVAL

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021057	CTATT	2	10	1836	1845	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021057	ATGTA	2	10	6812	6821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021057	TGTAA	2	10	12555	12564	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021057	TGTCT	2	10	12577	12586	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021057	TACAA	2	10	15332	15341	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021057	ACTAG	2	10	23502	23511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021057	CCGTG	2	10	26466	26475	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_021057	AGTAT	2	10	34668	34677	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021057	AAAAT	2	10	41004	41013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021057	TAAAA	2	10	41107	41116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021057	CGAGA	2	10	45176	45185	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021057	ATAAA	2	10	45979	45988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021057	TTGTT	2	10	49216	49225	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021057	ATTAT	2	10	52423	52432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021057	CAAGA	2	10	53630	53639	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021057	TATAA	2	10	54377	54386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021057	CAATA	2	10	58005	58014	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021057	CAGGC	2	10	58310	58319	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_021057	ACCAC	2	10	59838	59847	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_021057	AACAC	2	10	67198	67207	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_021057	AGTCC	2	10	74101	74110	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_021057	AAACA	2	10	75423	75432	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021057	TCAGC	2	10	85006	85015	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_021057	GCATT	2	10	85043	85052	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021057	GTTAT	2	10	86719	86728	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021057	TGTTA	2	10	93841	93850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021057	GTTAA	2	10	93984	93993	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021057	ACACT	2	10	95961	95970	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_021057	CTATG	2	10	97318	97327	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021057	CTTAG	2	10	97584	97593	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021057	TACGA	2	10	97599	97608	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021057	GTTAT	2	10	97766	97775	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021057	TTAGC	2	10	97892	97901	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021057	GCTAA	2	10	97914	97923	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021057	TAGTA	2	10	100749	100758	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021057	TATCA	2	10	103822	103831	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021057	TATAT	2	10	107130	107139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021057	TAATA	2	10	107305	107314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021057	AAGGC	2	10	110697	110706	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021057	TTTAG	2	10	112483	112492	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021057	TAATT	2	10	119175	119184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021057	TAACA	2	10	120378	120387	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021057	GTAAG	2	10	122147	122156	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021057	CTCAT	2	10	125254	125263	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_021057	ATGTT	2	10	128706	128715	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021057	TAACC	2	10	129915	129924	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_021057	ACTAT	2	10	130894	130903	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021057	GCTAC	2	10	131124	131133	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_021057	TAATT	2	10	131180	131189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021057	AATAA	2	10	135259	135268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021057	CGATG	2	10	139074	139083	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021057	AGCAC	2	10	141558	141567	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_021057	ATTAG	2	10	146813	146822	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021057	TTTTA	2	10	150458	150467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021057	ACCAT	2	10	155018	155027	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021057	TATAA	2	10	155966	155975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021057	AGCAT	2	10	156069	156078	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021057	GTATC	2	10	156289	156298	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021057	CGATA	2	10	158747	158756	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021057	CATGT	2	10	158802	158811	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021057	CCTGG	2	10	164161	164170	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_021057	GTTAC	2	10	172887	172896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021057	CTGGT	2	10	172902	172911	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021057	TCCGG	2	10	175163	175172	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021057	AGGTC	2	10	175479	175488	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021057	TATGC	2	10	175494	175503	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021057	TATTG	2	10	178505	178514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021057	GTTCA	2	10	189963	189972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021057	TGCCG	2	10	192864	192873	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_021057	CATAT	2	10	192920	192929	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021057	TGATA	2	10	196985	196994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021057	CTCTG	2	10	197066	197075	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_021057	ATAGA	3	15	201237	201251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021057	TTTTG	2	10	201354	201363	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021057	ATGTT	2	10	201526	201535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021057	CATGC	2	10	206176	206185	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_021057	AATAA	2	10	209840	209849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021057	GTGAC	2	10	221333	221342	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_021057	ATGCC	2	10	223193	223202	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_021057	GTACA	2	10	230572	230581	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021057	CAAAA	2	10	230702	230711	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021057	CATTA	2	10	231678	231687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021057	GGTGA	2	10	236671	236680	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021057	AGAGA	2	10	236729	236738	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021057	TGCCG	2	10	236982	236991	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_021057	CATAC	2	10	240407	240416	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_021057	GAATA	2	10	240606	240615	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021057	CTATT	2	10	249028	249037	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021057	CATAC	2	10	262076	262085	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_021057	TAGCA	2	10	266480	266489	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021057	AGCAG	2	10	267294	267303	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021057	GAATC	2	10	274362	274371	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021057	AAAAG	2	10	280866	280875	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021057	TTTTA	2	10	281295	281304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021057	GTTCA	2	10	283007	283016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021057	TTCAC	2	10	283507	283516	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_021057	ACACG	2	10	283680	283689	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_021057	TCAGG	2	10	284532	284541	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021057	GGGCG	2	10	284622	284631	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
100	NC_021057	CTAAA	2	10	285246	285255	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021057	AGCAA	2	10	285652	285661	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021057	TTTTA	2	10	289291	289300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021057	CTGGC	2	10	290417	290426	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_021057	TTCTG	2	10	292548	292557	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021057	TAGTG	2	10	292840	292849	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021057	TTTAC	2	10	293258	293267	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_021057	GTTAC	2	10	295649	295658	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021057	TACCA	2	10	306623	306632	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_021057	GTAGG	2	10	315535	315544	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021057	CAATG	2	10	320748	320757	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021057	ATTGA	2	10	320998	321007	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021057	TGTAG	2	10	321008	321017	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021057	AACAG	2	10	329105	329114	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021057	ATTGA	2	10	338248	338257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021057	GATCA	2	10	338792	338801	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021057	TAAAA	2	10	339223	339232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021057	GTGCT	2	10	343743	343752	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021057	CCTAT	2	10	345334	345343	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_021057	GCCTT	2	10	346100	346109	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_021057	TCGGT	2	10	346725	346734	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021057	GCATA	2	10	347562	347571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021057	TTTAA	2	10	349720	349729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021057	TAAAT	2	10	349888	349897	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021057	AAAAT	2	10	350162	350171	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021057	TTAAA	2	10	353364	353373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021057	AAACT	2	10	354088	354097	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021057	TAAAA	2	10	356807	356816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021057	CTTTT	2	10	361540	361549	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021057	AATTT	2	10	362024	362033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021057	TAGAA	2	10	363166	363175	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021057	TATAA	2	10	363246	363255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021057	ATAGT	2	10	363511	363520	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021057	CATAA	2	10	364931	364940	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021057	AAATT	2	10	364992	365001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021057	AAGAA	2	10	365135	365144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021057	AGCTG	2	10	365705	365714	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021057	TTAAT	2	10	368274	368283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021057	TTATA	2	10	370332	370341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021057	CAAAT	2	10	370491	370500	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021057	CTGAA	2	10	373179	373188	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021057	AACAG	2	10	376150	376159	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021057	ATAAC	2	10	376528	376537	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021057	GTATT	2	10	376734	376743	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021057	TTAGT	2	10	381014	381023	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021057	GTCTT	2	10	381960	381969	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021057	CATTC	2	10	382708	382717	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_021057	TGGGA	2	10	382727	382736	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021057	AATTA	2	10	383062	383071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021057	TAAGC	2	10	385083	385092	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_021057	TATTT	2	10	387349	387358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021057	CTTAA	2	10	389659	389668	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_021057	AATAG	2	10	390336	390345	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021057	CATGC	2	10	392047	392056	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_021057	TTCTT	2	10	392615	392624	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_021057	AATGG	2	10	405224	405233	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021057	TTGAC	2	10	405411	405420	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_021057	ATTTA	2	10	420246	420255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021057	TATTT	2	10	421763	421772	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021057	TTTAA	2	10	424239	424248	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021057	TGGTC	2	10	425908	425917	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
161	NC_021057	ACCAT	2	10	426091	426100	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_021057	TAAAT	2	10	431642	431651	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021057	TTTTC	2	10	437012	437021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_021057	TCATA	2	10	439188	439197	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_021057	TACAA	2	10	442959	442968	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_021057	AATAC	2	10	443964	443973	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_021057	ACATA	2	10	447354	447363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_021057	GCATC	2	10	447885	447894	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
169	NC_021057	TCTAG	2	10	455228	455237	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
170	NC_021057	TGCAT	2	10	455340	455349	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
171	NC_021057	TAAAC	2	10	457482	457491	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_021057	AACTA	2	10	457680	457689	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_021057	GTAAT	2	10	457808	457817	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021057	TAATA	2	10	458470	458479	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_021057	AGTGG	2	10	458551	458560	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021057	TCATA	2	10	458749	458758	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
177	NC_021057	GTTCA	2	10	467245	467254	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
178	NC_021057	ACTTT	2	10	467345	467354	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_021057	TAATT	2	10	473133	473142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_021057	TGTTA	2	10	479732	479741	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
181	NC_021057	CTTAA	2	10	483138	483147	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_021057	TAGCT	2	10	486456	486465	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_021057	TGAAT	2	10	486577	486586	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021057	ATATG	2	10	493810	493819	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021057	TATAA	2	10	507361	507370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021057	GATTA	2	10	508130	508139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021057	TCATT	2	10	513243	513252	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_021057	GCCTA	2	10	513259	513268	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
189	NC_021057	CCAGT	2	10	516253	516262	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
190	NC_021057	ACTGG	2	10	516655	516664	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
191	NC_021057	TAATA	2	10	516702	516711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_021057	TTATA	2	10	518106	518115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_021057	AGCTA	2	10	524433	524442	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
194	NC_021057	ATTTT	2	10	527764	527773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021057	ACTAT	2	10	528048	528057	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_021057	CCGTT	2	10	532623	532632	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
197	NC_021057	ACTAA	2	10	532861	532870	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_021057	GATAC	2	10	532871	532880	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
199	NC_021057	CAAAA	2	10	533352	533361	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
200	NC_021057	CTTAG	2	10	535013	535022	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.