MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Moranella endobia PCVAL

Total Repeats: 278

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021057	AGTAA	2	10	1677	1686	60 %	20 %	20 %	0 %	479324020
2	NC_021057	CTTCA	2	10	3983	3992	20 %	40 %	0 %	40 %	479324021
3	NC_021057	AGTAA	2	10	5247	5256	60 %	20 %	20 %	0 %	479324023
4	NC_021057	CCTAT	2	10	5524	5533	20 %	40 %	0 %	40 %	479324023
5	NC_021057	TAATT	2	10	5594	5603	40 %	60 %	0 %	0 %	479324023
6	NC_021057	GTAAA	2	10	5779	5788	60 %	20 %	20 %	0 %	479324023
7	NC_021057	TAGCT	2	10	5990	5999	20 %	40 %	20 %	20 %	479324023
8	NC_021057	ATGCC	2	10	7869	7878	20 %	20 %	20 %	40 %	479324024
9	NC_021057	ATGCT	2	10	9922	9931	20 %	40 %	20 %	20 %	479324025
10	NC_021057	GATTA	2	10	10929	10938	40 %	40 %	20 %	0 %	479324026
11	NC_021057	GTTAT	2	10	13556	13565	20 %	60 %	20 %	0 %	479324028
12	NC_021057	TTGCT	2	10	13670	13679	0 %	60 %	20 %	20 %	479324028
13	NC_021057	AGCCT	2	10	18009	18018	20 %	20 %	20 %	40 %	479324031
14	NC_021057	CGCTA	2	10	22050	22059	20 %	20 %	20 %	40 %	479324034
15	NC_021057	TATGG	2	10	28414	28423	20 %	40 %	40 %	0 %	479324039
16	NC_021057	TTTAA	2	10	31968	31977	40 %	60 %	0 %	0 %	479324041
17	NC_021057	ACCAA	2	10	33138	33147	60 %	0 %	0 %	40 %	479324043
18	NC_021057	GGCGT	2	10	37789	37798	0 %	20 %	60 %	20 %	479324046
19	NC_021057	TTTGG	2	10	39548	39557	0 %	60 %	40 %	0 %	479324047
20	NC_021057	TTCCT	2	10	41857	41866	0 %	60 %	0 %	40 %	479324048
21	NC_021057	AGGTA	2	10	42261	42270	40 %	20 %	40 %	0 %	479324048
22	NC_021057	TAAGG	2	10	49538	49547	40 %	20 %	40 %	0 %	479324053
23	NC_021057	AACTT	2	10	52993	53002	40 %	40 %	0 %	20 %	479324055
24	NC_021057	GCCTT	2	10	53128	53137	0 %	40 %	20 %	40 %	479324055
25	NC_021057	CCAAC	2	10	56574	56583	40 %	0 %	0 %	60 %	479324058
26	NC_021057	TATCG	2	10	57436	57445	20 %	40 %	20 %	20 %	479324058
27	NC_021057	TTAGC	2	10	59265	59274	20 %	40 %	20 %	20 %	479324059
28	NC_021057	AGTGG	2	10	60053	60062	20 %	20 %	60 %	0 %	479324060
29	NC_021057	ACCGT	2	10	60695	60704	20 %	20 %	20 %	40 %	479324060
30	NC_021057	CGGCG	2	10	62107	62116	0 %	0 %	60 %	40 %	479324061
31	NC_021057	AATTA	2	10	68047	68056	60 %	40 %	0 %	0 %	479324066
32	NC_021057	CAGGC	2	10	68119	68128	20 %	0 %	40 %	40 %	479324066
33	NC_021057	GCTTA	2	10	69548	69557	20 %	40 %	20 %	20 %	479324066
34	NC_021057	CTTGC	2	10	70635	70644	0 %	40 %	20 %	40 %	479324067
35	NC_021057	TTTTA	2	10	71411	71420	20 %	80 %	0 %	0 %	479324067
36	NC_021057	GTTCA	2	10	73181	73190	20 %	40 %	20 %	20 %	479324067
37	NC_021057	AGGCA	2	10	74718	74727	40 %	0 %	40 %	20 %	479324068
38	NC_021057	CAGAT	2	10	74819	74828	40 %	20 %	20 %	20 %	479324068
39	NC_021057	CTGCA	2	10	76790	76799	20 %	20 %	20 %	40 %	479324070
40	NC_021057	GATCA	2	10	78158	78167	40 %	20 %	20 %	20 %	479324071
41	NC_021057	GGATT	2	10	82443	82452	20 %	40 %	40 %	0 %	479324074
42	NC_021057	TACCG	2	10	83091	83100	20 %	20 %	20 %	40 %	479324075
43	NC_021057	ATTGC	2	10	85402	85411	20 %	40 %	20 %	20 %	479324078
44	NC_021057	ATTAA	2	10	85693	85702	60 %	40 %	0 %	0 %	479324078
45	NC_021057	ATTAA	2	10	87331	87340	60 %	40 %	0 %	0 %	479324079
46	NC_021057	AACCT	2	10	89635	89644	40 %	20 %	0 %	40 %	479324080
47	NC_021057	GTTTT	2	10	90131	90140	0 %	80 %	20 %	0 %	479324080
48	NC_021057	GGTAG	2	10	92158	92167	20 %	20 %	60 %	0 %	479324084
49	NC_021057	TGTAC	2	10	92312	92321	20 %	40 %	20 %	20 %	479324084
50	NC_021057	TGCGC	2	10	98404	98413	0 %	20 %	40 %	40 %	479324089
51	NC_021057	ACTTG	2	10	99593	99602	20 %	40 %	20 %	20 %	479324090
52	NC_021057	AGAAA	2	10	100906	100915	80 %	0 %	20 %	0 %	479324091
53	NC_021057	ACCAG	2	10	101664	101673	40 %	0 %	20 %	40 %	479324091
54	NC_021057	GCCTG	2	10	102969	102978	0 %	20 %	40 %	40 %	479324093
55	NC_021057	TGGAT	2	10	103564	103573	20 %	40 %	40 %	0 %	479324093
56	NC_021057	AACCA	2	10	106181	106190	60 %	0 %	0 %	40 %	479324096
57	NC_021057	AATTA	2	10	106811	106820	60 %	40 %	0 %	0 %	479324096
58	NC_021057	AGCAC	2	10	113054	113063	40 %	0 %	20 %	40 %	479324099
59	NC_021057	ACCTA	2	10	113731	113740	40 %	20 %	0 %	40 %	479324100
60	NC_021057	CCATT	2	10	116554	116563	20 %	40 %	0 %	40 %	479324101
61	NC_021057	ATGGT	2	10	120090	120099	20 %	40 %	40 %	0 %	479324103
62	NC_021057	ATTTT	2	10	120183	120192	20 %	80 %	0 %	0 %	479324103
63	NC_021057	GCTTT	2	10	121580	121589	0 %	60 %	20 %	20 %	479324105
64	NC_021057	TAAGA	2	10	123120	123129	60 %	20 %	20 %	0 %	479324106
65	NC_021057	ACACG	2	10	127145	127154	40 %	0 %	20 %	40 %	479324109
66	NC_021057	ATTTT	2	10	127991	128000	20 %	80 %	0 %	0 %	479324110
67	NC_021057	TGCAA	2	10	129297	129306	40 %	20 %	20 %	20 %	479324111
68	NC_021057	ACCTA	2	10	130260	130269	40 %	20 %	0 %	40 %	479324112
69	NC_021057	AAATT	2	10	133396	133405	60 %	40 %	0 %	0 %	479324114
70	NC_021057	CTTAA	2	10	135217	135226	40 %	40 %	0 %	20 %	479324115
71	NC_021057	ATTGG	2	10	137322	137331	20 %	40 %	40 %	0 %	479324117
72	NC_021057	TTGGA	2	10	138223	138232	20 %	40 %	40 %	0 %	479324117
73	NC_021057	TTTAC	2	10	139200	139209	20 %	60 %	0 %	20 %	479324118
74	NC_021057	AAGCA	2	10	140736	140745	60 %	0 %	20 %	20 %	479324119
75	NC_021057	TACCT	2	10	146041	146050	20 %	40 %	0 %	40 %	479324123
76	NC_021057	CCTGG	2	10	147576	147585	0 %	20 %	40 %	40 %	479324124
77	NC_021057	TTGGT	2	10	148088	148097	0 %	60 %	40 %	0 %	479324124
78	NC_021057	ATAGC	2	10	148765	148774	40 %	20 %	20 %	20 %	479324125
79	NC_021057	CGTTA	2	10	149603	149612	20 %	40 %	20 %	20 %	479324125
80	NC_021057	AGGCG	2	10	151342	151351	20 %	0 %	60 %	20 %	479324126
81	NC_021057	TCAGC	2	10	152105	152114	20 %	20 %	20 %	40 %	479324126
82	NC_021057	TTGTC	2	10	152639	152648	0 %	60 %	20 %	20 %	479324126
83	NC_021057	CTCAT	2	10	154638	154647	20 %	40 %	0 %	40 %	479324127
84	NC_021057	GCGCC	2	10	160197	160206	0 %	0 %	40 %	60 %	479324133
85	NC_021057	GAACA	2	10	164497	164506	60 %	0 %	20 %	20 %	479324136
86	NC_021057	TCTCT	2	10	165512	165521	0 %	60 %	0 %	40 %	479324136
87	NC_021057	ATGGC	2	10	167609	167618	20 %	20 %	40 %	20 %	479324137
88	NC_021057	GATTT	2	10	168241	168250	20 %	60 %	20 %	0 %	479324137
89	NC_021057	GTGAT	2	10	168545	168554	20 %	40 %	40 %	0 %	479324137
90	NC_021057	TTAAC	2	10	168597	168606	40 %	40 %	0 %	20 %	479324137
91	NC_021057	AGGGC	2	10	169230	169239	20 %	0 %	60 %	20 %	479324139
92	NC_021057	CTGCT	2	10	169348	169357	0 %	40 %	20 %	40 %	479324139
93	NC_021057	CTACT	2	10	169733	169742	20 %	40 %	0 %	40 %	479324139
94	NC_021057	TAGTA	2	10	173556	173565	40 %	40 %	20 %	0 %	479324142
95	NC_021057	AGATG	2	10	173718	173727	40 %	20 %	40 %	0 %	479324142
96	NC_021057	AATAC	2	10	176258	176267	60 %	20 %	0 %	20 %	479324144
97	NC_021057	AGAAA	2	10	176273	176282	80 %	0 %	20 %	0 %	479324144
98	NC_021057	CGTGA	2	10	176364	176373	20 %	20 %	40 %	20 %	479324144
99	NC_021057	TCAGG	2	10	178321	178330	20 %	20 %	40 %	20 %	479324146
100	NC_021057	CGCGG	2	10	179522	179531	0 %	0 %	60 %	40 %	479324147
101	NC_021057	GCCGC	2	10	182022	182031	0 %	0 %	40 %	60 %	479324150
102	NC_021057	CCCTG	2	10	183760	183769	0 %	20 %	20 %	60 %	479324152
103	NC_021057	GCTGT	2	10	184689	184698	0 %	40 %	40 %	20 %	479324153
104	NC_021057	TACCA	2	10	186836	186845	40 %	20 %	0 %	40 %	479324155
105	NC_021057	CTTTA	2	10	188561	188570	20 %	60 %	0 %	20 %	479324156
106	NC_021057	ACACC	2	10	189366	189375	40 %	0 %	0 %	60 %	479324157
107	NC_021057	TGATA	2	10	192557	192566	40 %	40 %	20 %	0 %	479324160
108	NC_021057	GGTAA	2	10	196349	196358	40 %	20 %	40 %	0 %	479324162
109	NC_021057	ACACC	2	10	197897	197906	40 %	0 %	0 %	60 %	479324164
110	NC_021057	TGACT	2	10	200266	200275	20 %	40 %	20 %	20 %	479324166
111	NC_021057	CGGAC	2	10	202105	202114	20 %	0 %	40 %	40 %	479324167
112	NC_021057	CTGCG	2	10	203713	203722	0 %	20 %	40 %	40 %	479324167
113	NC_021057	TATCA	2	10	203891	203900	40 %	40 %	0 %	20 %	479324167
114	NC_021057	GCTGA	2	10	206045	206054	20 %	20 %	40 %	20 %	479324168
115	NC_021057	CAAGC	2	10	206310	206319	40 %	0 %	20 %	40 %	479324169
116	NC_021057	ATGAG	2	10	206767	206776	40 %	20 %	40 %	0 %	479324169
117	NC_021057	TGCGC	2	10	208871	208880	0 %	20 %	40 %	40 %	479324170
118	NC_021057	TGCCA	2	10	208973	208982	20 %	20 %	20 %	40 %	479324170
119	NC_021057	TATTG	2	10	209278	209287	20 %	60 %	20 %	0 %	479324170
120	NC_021057	TAAAA	2	10	209575	209584	80 %	20 %	0 %	0 %	479324170
121	NC_021057	CCGGT	2	10	210185	210194	0 %	20 %	40 %	40 %	479324171
122	NC_021057	TTACT	2	10	212510	212519	20 %	60 %	0 %	20 %	479324173
123	NC_021057	AGAGT	2	10	213208	213217	40 %	20 %	40 %	0 %	479324173
124	NC_021057	TTTAT	2	10	217204	217213	20 %	80 %	0 %	0 %	479324177
125	NC_021057	ATCGC	2	10	218633	218642	20 %	20 %	20 %	40 %	479324177
126	NC_021057	TTAAC	2	10	220091	220100	40 %	40 %	0 %	20 %	479324178
127	NC_021057	CCTTA	2	10	223482	223491	20 %	40 %	0 %	40 %	479324181
128	NC_021057	TGCTG	2	10	224661	224670	0 %	40 %	40 %	20 %	479324182
129	NC_021057	TACCA	2	10	224765	224774	40 %	20 %	0 %	40 %	479324182
130	NC_021057	CCATG	2	10	225912	225921	20 %	20 %	20 %	40 %	479324182
131	NC_021057	TAATT	2	10	228753	228762	40 %	60 %	0 %	0 %	479324184
132	NC_021057	CTGGC	2	10	231841	231850	0 %	20 %	40 %	40 %	479324187
133	NC_021057	GCACC	2	10	234291	234300	20 %	0 %	20 %	60 %	479324188
134	NC_021057	AGGGC	2	10	235998	236007	20 %	0 %	60 %	20 %	479324189
135	NC_021057	CGATG	2	10	236223	236232	20 %	20 %	40 %	20 %	479324189
136	NC_021057	AGTGC	2	10	236295	236304	20 %	20 %	40 %	20 %	479324189
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139	NC_021057	ACGTC	2	10	239371	239380	20 %	20 %	20 %	40 %	479324191
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156	NC_021057	GGCGG	2	10	283756	283765	0 %	0 %	80 %	20 %	479324241
157	NC_021057	TGCCA	2	10	286893	286902	20 %	20 %	20 %	40 %	479324243
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166	NC_021057	GGAAT	2	10	302027	302036	40 %	20 %	40 %	0 %	479324252
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169	NC_021057	TGTGG	2	10	305586	305595	0 %	40 %	60 %	0 %	479324255
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174	NC_021057	AAAAT	2	10	310179	310188	80 %	20 %	0 %	0 %	479324260
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249	NC_021057	TGTGG	2	10	462119	462128	0 %	40 %	60 %	0 %	479324370
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253	NC_021057	ATTAT	2	10	474215	474224	40 %	60 %	0 %	0 %	479324380
254	NC_021057	TGCAG	2	10	474463	474472	20 %	20 %	40 %	20 %	479324380
255	NC_021057	TTACT	2	10	479894	479903	20 %	60 %	0 %	20 %	479324384
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.