MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptomyces sp. PAMC26508 plasmid pSP01

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021056	GCCACA	2	12	644	655	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021056	CGGCAC	2	12	2367	2378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021056	GATCCC	2	12	3689	3700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479323917
4	NC_021056	ACGCGG	2	12	5172	5183	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323918
5	NC_021056	GGCCCT	2	12	5878	5889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479323918
6	NC_021056	GACCTG	2	12	7540	7551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323921
7	NC_021056	ACTCGT	2	12	8630	8641	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479323921
8	NC_021056	CCCCGG	2	12	11379	11390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021056	TGCGAC	2	12	11971	11982	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323924
10	NC_021056	CGGGCG	2	12	13260	13271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479323926
11	NC_021056	TCGGCG	2	12	14403	14414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479323926
12	NC_021056	GCTCCC	2	12	18791	18802	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	479323929
13	NC_021056	CTCGGC	3	18	19706	19723	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021056	ACCACG	2	12	22617	22628	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479323934
15	NC_021056	GCGAAG	2	12	23270	23281	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479323935
16	NC_021056	TGGTCC	2	12	25404	25415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479323938
17	NC_021056	CGGCCG	2	12	25930	25941	0 %	0 %	50 %	50 %	479323940
18	NC_021056	CGGTGG	2	12	27596	27607	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021056	TATCTG	2	12	28025	28036	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479323942
20	NC_021056	CCCACA	2	12	30355	30366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479323945
21	NC_021056	GCCAGC	2	12	30607	30618	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479323946
22	NC_021056	GGTGGG	2	12	30932	30943	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	479323946
23	NC_021056	CGGCAT	2	12	31220	31231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323947
24	NC_021056	ATGACC	2	12	35012	35023	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479323950
25	NC_021056	GACCGA	2	12	36622	36633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479323953
26	NC_021056	CGGCCC	2	12	39332	39343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479323955
27	NC_021056	TACGGC	2	12	39684	39695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323956
28	NC_021056	GAGCCG	2	12	39742	39753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323956
29	NC_021056	CGCGGG	2	12	40564	40575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021056	CGCGGG	2	12	40625	40636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021056	CGCGGG	2	12	40686	40697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021056	CGCGGG	2	12	40747	40758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021056	CGCGGG	2	12	40808	40819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021056	CGCGGG	2	12	40869	40880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479323958
35	NC_021056	CGCGGG	2	12	40930	40941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479323958
36	NC_021056	CGCGGG	2	12	40991	41002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021056	GCAGAA	2	12	46542	46553	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479323966
38	NC_021056	ACATCG	2	12	48812	48823	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479323970
39	NC_021056	CGTCAC	2	12	50743	50754	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479323972
40	NC_021056	TCCGCC	2	12	50829	50840	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	479323972
41	NC_021056	CGCGGG	2	12	51209	51220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021056	CGCGGG	2	12	51270	51281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021056	GGCCGG	2	12	52014	52025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479323974
44	NC_021056	GCCGAG	2	12	52819	52830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323974
45	NC_021056	CAGCGG	2	12	53592	53603	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323974
46	NC_021056	CCCGGA	2	12	55262	55273	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479323977
47	NC_021056	CCTGGG	2	12	56575	56586	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479323978
48	NC_021056	GCAGGA	2	12	58815	58826	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479323979
49	NC_021056	TGGGGG	2	12	61886	61897	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	479323984
50	NC_021056	ACGGAA	2	12	62180	62191	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479323984
51	NC_021056	CAGGCC	2	12	62717	62728	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479323985
52	NC_021056	GACGCG	2	12	64625	64636	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323988
53	NC_021056	GCTGCC	2	12	64892	64903	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479323988
54	NC_021056	CGCCGA	2	12	65900	65911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479323989
55	NC_021056	TCGGCC	2	12	66655	66666	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479323990
56	NC_021056	CGGCGC	2	12	68500	68511	0 %	0 %	50 %	50 %	479323992
57	NC_021056	CCGCGG	2	12	69806	69817	0 %	0 %	50 %	50 %	479323993
58	NC_021056	TGCTGT	2	12	69851	69862	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479323993
59	NC_021056	GCCGAC	2	12	70573	70584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479323993
60	NC_021056	GGCGCT	2	12	72047	72058	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479323995
61	NC_021056	TGGTCG	2	12	74431	74442	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479323997
62	NC_021056	TTGGAG	2	12	74565	74576	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479323997
63	NC_021056	GCCGAT	2	12	74583	74594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323997
64	NC_021056	GACGTC	2	12	74679	74690	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323997
65	NC_021056	GCCCGC	2	12	74865	74876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479323997
66	NC_021056	CGTCGA	2	12	75410	75421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323997
67	NC_021056	GTGGAG	2	12	75795	75806	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	479323997
68	NC_021056	CAGGCG	2	12	77036	77047	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323999
69	NC_021056	GCGGTG	2	12	77392	77403	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	479323999
70	NC_021056	TTCCCG	2	12	83159	83170	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021056	CGTCGA	2	12	83832	83843	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479324005
72	NC_021056	GGCGGG	2	12	85285	85296	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021056	CCAGCT	2	12	90112	90123	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479324008
74	NC_021056	TGCGGG	2	12	90541	90552	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021056	CGCGGG	2	12	91205	91216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021056	AGACGG	2	12	91404	91415	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021056	CCAGCC	2	12	92700	92711	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_021056	GGCTGC	2	12	95507	95518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479324009
79	NC_021056	CACGCG	2	12	96209	96220	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324010
80	NC_021056	GGAGCC	2	12	98456	98467	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479324012
81	NC_021056	GCCAAG	2	12	98586	98597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324012
82	NC_021056	GTCACC	2	12	100654	100665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479324014
83	NC_021056	AAGGCG	2	12	100732	100743	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479324014
84	NC_021056	CGAGGA	2	12	101524	101535	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479324015

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.