MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces sp. PAMC26508 plasmid pSP01

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021056	GATCCC	2	12	3689	3700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479323917
2	NC_021056	ACGCGG	2	12	5172	5183	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323918
3	NC_021056	GGCCCT	2	12	5878	5889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479323918
4	NC_021056	GACCTG	2	12	7540	7551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323921
5	NC_021056	ACTCGT	2	12	8630	8641	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479323921
6	NC_021056	TGCGAC	2	12	11971	11982	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323924
7	NC_021056	CGGGCG	2	12	13260	13271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479323926
8	NC_021056	TCGGCG	2	12	14403	14414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479323926
9	NC_021056	GCTCCC	2	12	18791	18802	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	479323929
10	NC_021056	ACCACG	2	12	22617	22628	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479323934
11	NC_021056	GCGAAG	2	12	23270	23281	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479323935
12	NC_021056	TGGTCC	2	12	25404	25415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479323938
13	NC_021056	CGGCCG	2	12	25930	25941	0 %	0 %	50 %	50 %	479323940
14	NC_021056	TATCTG	2	12	28025	28036	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479323942
15	NC_021056	CCCACA	2	12	30355	30366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479323945
16	NC_021056	GCCAGC	2	12	30607	30618	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479323946
17	NC_021056	GGTGGG	2	12	30932	30943	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	479323946
18	NC_021056	CGGCAT	2	12	31220	31231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323947
19	NC_021056	ATGACC	2	12	35012	35023	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479323950
20	NC_021056	GACCGA	2	12	36622	36633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479323953
21	NC_021056	CGGCCC	2	12	39332	39343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479323955
22	NC_021056	TACGGC	2	12	39684	39695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323956
23	NC_021056	GAGCCG	2	12	39742	39753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323956
24	NC_021056	CGCGGG	2	12	40869	40880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479323958
25	NC_021056	CGCGGG	2	12	40930	40941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479323958
26	NC_021056	GCAGAA	2	12	46542	46553	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479323966
27	NC_021056	ACATCG	2	12	48812	48823	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479323970
28	NC_021056	CGTCAC	2	12	50743	50754	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479323972
29	NC_021056	TCCGCC	2	12	50829	50840	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	479323972
30	NC_021056	GGCCGG	2	12	52014	52025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479323974
31	NC_021056	GCCGAG	2	12	52819	52830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323974
32	NC_021056	CAGCGG	2	12	53592	53603	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323974
33	NC_021056	CCCGGA	2	12	55262	55273	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479323977
34	NC_021056	CCTGGG	2	12	56575	56586	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479323978
35	NC_021056	GCAGGA	2	12	58815	58826	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479323979
36	NC_021056	TGGGGG	2	12	61886	61897	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	479323984
37	NC_021056	ACGGAA	2	12	62180	62191	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479323984
38	NC_021056	CAGGCC	2	12	62717	62728	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479323985
39	NC_021056	GACGCG	2	12	64625	64636	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323988
40	NC_021056	GCTGCC	2	12	64892	64903	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479323988
41	NC_021056	CGCCGA	2	12	65900	65911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479323989
42	NC_021056	TCGGCC	2	12	66655	66666	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479323990
43	NC_021056	CGGCGC	2	12	68500	68511	0 %	0 %	50 %	50 %	479323992
44	NC_021056	CCGCGG	2	12	69806	69817	0 %	0 %	50 %	50 %	479323993
45	NC_021056	TGCTGT	2	12	69851	69862	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479323993
46	NC_021056	GCCGAC	2	12	70573	70584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479323993
47	NC_021056	GGCGCT	2	12	72047	72058	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479323995
48	NC_021056	TGGTCG	2	12	74431	74442	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479323997
49	NC_021056	TTGGAG	2	12	74565	74576	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479323997
50	NC_021056	GCCGAT	2	12	74583	74594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323997
51	NC_021056	GACGTC	2	12	74679	74690	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323997
52	NC_021056	GCCCGC	2	12	74865	74876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479323997
53	NC_021056	CGTCGA	2	12	75410	75421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479323997
54	NC_021056	GTGGAG	2	12	75795	75806	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	479323997
55	NC_021056	CAGGCG	2	12	77036	77047	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479323999
56	NC_021056	GCGGTG	2	12	77392	77403	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	479323999
57	NC_021056	CGTCGA	2	12	83832	83843	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479324005
58	NC_021056	CCAGCT	2	12	90112	90123	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479324008
59	NC_021056	GGCTGC	2	12	95507	95518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479324009
60	NC_021056	CACGCG	2	12	96209	96220	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324010
61	NC_021056	GGAGCC	2	12	98456	98467	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479324012
62	NC_021056	GCCAAG	2	12	98586	98597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324012
63	NC_021056	GTCACC	2	12	100654	100665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479324014
64	NC_021056	AAGGCG	2	12	100732	100743	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479324014
65	NC_021056	CGAGGA	2	12	101524	101535	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479324015

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.