MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces sp. PAMC26508 plasmid pSP01

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021056	TCCC	2	8	330	337	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_021056	CACC	2	8	1004	1011	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_021056	CGGG	2	8	1853	1860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021056	CGGC	2	8	2522	2529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021056	CGTA	2	8	2894	2901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021056	GACT	2	8	3127	3134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021056	TGGC	2	8	3390	3397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021056	GGCA	2	8	3399	3406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021056	GACG	2	8	6618	6625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021056	CCTC	2	8	9563	9570	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_021056	GCCC	2	8	9691	9698	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_021056	GGCG	2	8	10197	10204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021056	GTCG	2	8	10216	10223	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021056	GCCA	2	8	16230	16237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021056	TGAC	2	8	16535	16542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021056	CGCC	2	8	16960	16967	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_021056	AGCG	3	12	17340	17351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021056	GGGC	2	8	17486	17493	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021056	ACCC	2	8	17525	17532	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_021056	GATG	2	8	17649	17656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021056	ACAG	2	8	19391	19398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021056	CGGC	2	8	19782	19789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021056	CTCC	2	8	20187	20194	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_021056	AGGG	2	8	20702	20709	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021056	CACC	2	8	22414	22421	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_021056	GGGA	2	8	22453	22460	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021056	TCCG	2	8	26658	26665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021056	AGCC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021056	GACG	2	8	27729	27736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021056	CGCA	2	8	27846	27853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021056	CTGA	2	8	28005	28012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021056	CGAG	2	8	28266	28273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021056	CCTT	2	8	30972	30979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021056	CTGA	2	8	34553	34560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021056	GCCC	2	8	40110	40117	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_021056	GTCC	2	8	41184	41191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021056	CGGC	2	8	45564	45571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021056	CCGC	2	8	45669	45676	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_021056	GACG	2	8	45706	45713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021056	CGGG	2	8	48435	48442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021056	GTAG	2	8	48453	48460	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021056	CCAA	2	8	49175	49182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021056	CGAG	2	8	49201	49208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021056	GCTT	2	8	49921	49928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021056	CGGT	2	8	51165	51172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021056	GTTC	2	8	53699	53706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021056	CCAT	2	8	54334	54341	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021056	CGCC	2	8	61704	61711	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_021056	ATGG	2	8	61712	61719	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021056	CCCA	2	8	67320	67327	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_021056	GCCG	2	8	67594	67601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021056	ACGC	2	8	78847	78854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021056	GGAA	2	8	78900	78907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021056	CGTG	2	8	79133	79140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021056	TCCT	2	8	79469	79476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021056	GACT	2	8	79878	79885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021056	GCGA	2	8	79976	79983	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021056	TCGA	2	8	83061	83068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021056	AGCG	2	8	83144	83151	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021056	CGAG	2	8	85056	85063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021056	GATC	2	8	85203	85210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021056	CTGG	2	8	90559	90566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021056	GCGG	2	8	90878	90885	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021056	TTCG	2	8	92029	92036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021056	CGGG	2	8	103728	103735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.