MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces sp. PAMC26508 plasmid pSP01

Total Repeats: 309

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021056	CAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021056	GCA	2	6	37	42	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021056	CAA	2	6	89	94	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021056	GCA	2	6	98	103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021056	CAA	2	6	150	155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021056	GCA	2	6	159	164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021056	CAA	2	6	211	216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021056	GCA	2	6	220	225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021056	CAG	2	6	290	295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021056	GCT	2	6	538	543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021056	CCT	2	6	785	790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021056	GCC	2	6	890	895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_021056	GGA	2	6	948	953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021056	ACT	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021056	GAA	2	6	2281	2286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021056	CAG	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021056	TCG	2	6	2324	2329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021056	CGA	2	6	2404	2409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021056	TCA	2	6	2436	2441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021056	CGT	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021056	TGG	2	6	2662	2667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021056	GGC	2	6	3076	3081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021056	GGC	2	6	3088	3093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021056	CAA	2	6	3296	3301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021056	CGA	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021056	CCG	2	6	3331	3336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021056	CGT	2	6	3353	3358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021056	AGC	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021056	CCA	2	6	6479	6484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021056	GAC	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021056	GGT	2	6	6549	6554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021056	CAG	2	6	6885	6890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021056	GCC	2	6	9334	9339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021056	AAT	2	6	9381	9386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021056	CGG	2	6	9400	9405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021056	GCT	2	6	9487	9492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021056	GTC	2	6	9544	9549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021056	CGG	2	6	9615	9620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021056	CGC	3	9	9665	9673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021056	CCT	2	6	9709	9714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_021056	GTT	2	6	10239	10244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021056	TCC	2	6	10326	10331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021056	GCC	2	6	10358	10363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021056	CTC	2	6	11351	11356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_021056	GCC	2	6	11368	11373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021056	ACA	2	6	12164	12169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021056	GAT	2	6	12220	12225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021056	TCG	2	6	12247	12252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021056	GAC	2	6	12448	12453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021056	TCC	2	6	15904	15909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021056	AAC	2	6	15961	15966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021056	GCC	2	6	16138	16143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_021056	CGC	2	6	16157	16162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_021056	CGC	2	6	16286	16291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_021056	GTC	2	6	16582	16587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021056	AGC	2	6	16633	16638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021056	GGA	2	6	16659	16664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021056	GAA	2	6	16689	16694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021056	GAG	2	6	16911	16916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021056	GCA	2	6	17150	17155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021056	CAC	2	6	17196	17201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021056	CGG	2	6	17224	17229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021056	TCG	2	6	17259	17264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021056	GGA	2	6	17288	17293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021056	GCT	2	6	17379	17384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021056	ACC	2	6	17394	17399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021056	ATG	2	6	17495	17500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021056	GCA	2	6	17535	17540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021056	TTC	2	6	17551	17556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021056	CCG	2	6	17696	17701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021056	GTG	2	6	17736	17741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021056	GCA	2	6	17825	17830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021056	CGG	2	6	17970	17975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021056	CCT	2	6	18060	18065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021056	TCC	2	6	18195	18200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021056	CGG	2	6	18344	18349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021056	CGG	2	6	19471	19476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021056	CGG	2	6	19482	19487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021056	CGG	2	6	19504	19509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021056	TCG	2	6	19538	19543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021056	TGA	2	6	19760	19765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021056	ACC	2	6	20104	20109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021056	GCG	2	6	20119	20124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021056	AGC	2	6	20206	20211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021056	TCC	2	6	20257	20262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_021056	AGC	2	6	20423	20428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021056	CAC	2	6	20524	20529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021056	CCA	2	6	20710	20715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021056	CCA	2	6	20791	20796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_021056	GAG	3	9	22252	22260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021056	TGC	2	6	22307	22312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021056	CCT	2	6	22343	22348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021056	GAG	2	6	22351	22356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021056	GCT	2	6	22358	22363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021056	CGT	3	9	22368	22376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021056	TCG	2	6	22379	22384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021056	CTG	2	6	22399	22404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021056	GCT	2	6	22442	22447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021056	GGA	2	6	24148	24153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021056	CGC	2	6	24557	24562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_021056	GGC	2	6	24568	24573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021056	GAC	2	6	25037	25042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021056	GGC	2	6	25086	25091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021056	GTC	2	6	25419	25424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021056	GGT	2	6	25438	25443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021056	CGG	2	6	25757	25762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021056	CAC	2	6	26732	26737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021056	TCG	2	6	26821	26826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021056	TGG	2	6	26999	27004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021056	CGT	2	6	27061	27066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021056	GCG	2	6	27094	27099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021056	CGC	2	6	27134	27139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021056	GTG	2	6	27444	27449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021056	TTG	3	9	27528	27536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021056	TGG	2	6	27553	27558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021056	AGG	2	6	27568	27573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021056	TTC	2	6	27712	27717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021056	GCG	2	6	27825	27830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021056	AGT	2	6	27865	27870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021056	TCA	2	6	28968	28973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021056	GGC	2	6	29012	29017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021056	CAG	2	6	30424	30429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021056	CGG	2	6	30435	30440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021056	GCG	2	6	30441	30446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021056	AGG	2	6	30983	30988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021056	TAA	2	6	31052	31057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021056	CCT	2	6	32153	32158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_021056	GGA	2	6	32207	32212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021056	CGT	2	6	32475	32480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021056	AGC	2	6	34424	34429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021056	TGC	2	6	34452	34457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021056	GCC	2	6	34478	34483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_021056	CCG	2	6	34531	34536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_021056	GGA	2	6	34699	34704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021056	GGA	2	6	37394	37399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021056	GGC	2	6	40137	40142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021056	TCG	2	6	40157	40162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021056	GCC	2	6	40518	40523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_021056	GCA	2	6	41050	41055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021056	AGC	2	6	41105	41110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021056	CCA	2	6	41154	41159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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278	NC_021056	AGC	2	6	91645	91650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_021056	GCA	2	6	91661	91666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_021056	AGC	2	6	91706	91711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_021056	CTG	2	6	91778	91783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_021056	GTT	2	6	91858	91863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_021056	AGC	2	6	91889	91894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_021056	GTT	2	6	91896	91901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_021056	CTG	2	6	91963	91968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.