MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021052	GCGTA	2	10	1071	1080	20 %	20 %	40 %	20 %	482546030
2	NC_021052	TATGG	2	10	1436	1445	20 %	40 %	40 %	0 %	482546030
3	NC_021052	TTTCG	2	10	1720	1729	0 %	60 %	20 %	20 %	482546030
4	NC_021052	GAGAA	2	10	3215	3224	60 %	0 %	40 %	0 %	482546032
5	NC_021052	TGCTT	2	10	3396	3405	0 %	60 %	20 %	20 %	482546032
6	NC_021052	ACTGT	2	10	5098	5107	20 %	40 %	20 %	20 %	482546032
7	NC_021052	ATTCT	2	10	5382	5391	20 %	60 %	0 %	20 %	482546033
8	NC_021052	TTGAA	2	10	6264	6273	40 %	40 %	20 %	0 %	482546033
9	NC_021052	ATGGA	2	10	9092	9101	40 %	20 %	40 %	0 %	482546035
10	NC_021052	TAAGA	2	10	10093	10102	60 %	20 %	20 %	0 %	482546035
11	NC_021052	TTCAT	2	10	10276	10285	20 %	60 %	0 %	20 %	482546035
12	NC_021052	CTTCT	2	10	14934	14943	0 %	60 %	0 %	40 %	482546037
13	NC_021052	CTGAA	2	10	15308	15317	40 %	20 %	20 %	20 %	482546037
14	NC_021052	GAAGA	2	10	16687	16696	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021052	GAAGG	2	10	17243	17252	40 %	0 %	60 %	0 %	482546039
16	NC_021052	CGGAA	2	10	20263	20272	40 %	0 %	40 %	20 %	482546040
17	NC_021052	GATAC	2	10	20844	20853	40 %	20 %	20 %	20 %	482546041
18	NC_021052	TTTCT	2	10	26200	26209	0 %	80 %	0 %	20 %	482546048
19	NC_021052	TTTTG	2	10	26711	26720	0 %	80 %	20 %	0 %	482546049
20	NC_021052	TGCTC	2	10	28648	28657	0 %	40 %	20 %	40 %	482546050
21	NC_021052	ATGTC	2	10	29550	29559	20 %	40 %	20 %	20 %	482546050
22	NC_021052	AATAA	2	10	31089	31098	80 %	20 %	0 %	0 %	482546053
23	NC_021052	GTTTT	2	10	34290	34299	0 %	80 %	20 %	0 %	482546057
24	NC_021052	TTTCT	2	10	34963	34972	0 %	80 %	0 %	20 %	482546059
25	NC_021052	GAATC	2	10	35472	35481	40 %	20 %	20 %	20 %	482546059
26	NC_021052	TTTGG	2	10	37137	37146	0 %	60 %	40 %	0 %	482546060
27	NC_021052	AGAAT	2	10	39498	39507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021052	AGGGG	2	10	39729	39738	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021052	AGAGA	2	10	42126	42135	60 %	0 %	40 %	0 %	482546063
30	NC_021052	GCTCT	2	10	42193	42202	0 %	40 %	20 %	40 %	482546063
31	NC_021052	GGATC	2	10	45996	46005	20 %	20 %	40 %	20 %	482546068
32	NC_021052	TAAAT	2	10	46037	46046	60 %	40 %	0 %	0 %	482546068
33	NC_021052	CAGAG	2	10	46200	46209	40 %	0 %	40 %	20 %	482546069
34	NC_021052	GCGAT	2	10	46352	46361	20 %	20 %	40 %	20 %	482546069
35	NC_021052	AGATG	2	10	46587	46596	40 %	20 %	40 %	0 %	482546069
36	NC_021052	TTTTC	2	10	47605	47614	0 %	80 %	0 %	20 %	482546071
37	NC_021052	GAGCA	2	10	49296	49305	40 %	0 %	40 %	20 %	482546072
38	NC_021052	CAATT	2	10	51687	51696	40 %	40 %	0 %	20 %	482546073
39	NC_021052	GGCGT	2	10	54323	54332	0 %	20 %	60 %	20 %	482546074
40	NC_021052	GGATA	2	10	54616	54625	40 %	20 %	40 %	0 %	482546075
41	NC_021052	CCATT	2	10	56283	56292	20 %	40 %	0 %	40 %	482546077
42	NC_021052	CAATT	2	10	57888	57897	40 %	40 %	0 %	20 %	482546079
43	NC_021052	AAAAG	2	10	60304	60313	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021052	GAAAA	2	10	60430	60439	80 %	0 %	20 %	0 %	482546081
45	NC_021052	GAGGT	2	10	61398	61407	20 %	20 %	60 %	0 %	482546081
46	NC_021052	ATTTT	2	10	61740	61749	20 %	80 %	0 %	0 %	482546081
47	NC_021052	AGGTA	2	10	63703	63712	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021052	TTTGG	2	10	63919	63928	0 %	60 %	40 %	0 %	482546082
49	NC_021052	GTTAT	2	10	64393	64402	20 %	60 %	20 %	0 %	482546082
50	NC_021052	TCCTT	2	10	64886	64895	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_021052	CTCCA	2	10	65040	65049	20 %	20 %	0 %	60 %	482546083
52	NC_021052	CGTTT	2	10	65249	65258	0 %	60 %	20 %	20 %	482546084
53	NC_021052	TTCTA	2	10	66073	66082	20 %	60 %	0 %	20 %	482546084
54	NC_021052	TTAGT	2	10	66422	66431	20 %	60 %	20 %	0 %	482546084
55	NC_021052	TAGGT	2	10	67163	67172	20 %	40 %	40 %	0 %	482546085
56	NC_021052	AGGGA	2	10	67793	67802	40 %	0 %	60 %	0 %	482546086
57	NC_021052	CTTAA	2	10	70665	70674	40 %	40 %	0 %	20 %	482546088
58	NC_021052	ACAAA	2	10	71764	71773	80 %	0 %	0 %	20 %	482546090
59	NC_021052	TCCGG	2	10	81552	81561	0 %	20 %	40 %	40 %	482546098
60	NC_021052	TGGCT	2	10	83902	83911	0 %	40 %	40 %	20 %	482546100
61	NC_021052	TTTCT	2	10	84311	84320	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021052	AAGAA	2	10	85073	85082	80 %	0 %	20 %	0 %	482546101
63	NC_021052	ATAGG	2	10	90208	90217	40 %	20 %	40 %	0 %	482546104
64	NC_021052	AAAGC	2	10	90366	90375	60 %	0 %	20 %	20 %	482546104
65	NC_021052	ACAAT	2	10	91226	91235	60 %	20 %	0 %	20 %	482546105
66	NC_021052	AGAAA	2	10	92843	92852	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021052	ACACA	2	10	94204	94213	60 %	0 %	0 %	40 %	482546107
68	NC_021052	TGTTT	2	10	95147	95156	0 %	80 %	20 %	0 %	482546109
69	NC_021052	CTTTG	2	10	95566	95575	0 %	60 %	20 %	20 %	482546109
70	NC_021052	GCATC	2	10	96215	96224	20 %	20 %	20 %	40 %	482546109
71	NC_021052	AAAGT	2	10	101710	101719	60 %	20 %	20 %	0 %	482546112
72	NC_021052	CGATG	2	10	101786	101795	20 %	20 %	40 %	20 %	482546112
73	NC_021052	CGAAG	2	10	102626	102635	40 %	0 %	40 %	20 %	482546112
74	NC_021052	GGAAG	2	10	104407	104416	40 %	0 %	60 %	0 %	482546113
75	NC_021052	AAGAG	2	10	104683	104692	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021052	ACTCC	2	10	104983	104992	20 %	20 %	0 %	60 %	482546114
77	NC_021052	TGTCT	2	10	110020	110029	0 %	60 %	20 %	20 %	482546119
78	NC_021052	GGAAA	2	10	112772	112781	60 %	0 %	40 %	0 %	482546123
79	NC_021052	TGGCA	2	10	114642	114651	20 %	20 %	40 %	20 %	482546126
80	NC_021052	TTAGA	2	10	115368	115377	40 %	40 %	20 %	0 %	482546126
81	NC_021052	CGTGG	2	10	118348	118357	0 %	20 %	60 %	20 %	482546130
82	NC_021052	AACGT	2	10	118475	118484	40 %	20 %	20 %	20 %	482546130
83	NC_021052	AAGAG	2	10	120128	120137	60 %	0 %	40 %	0 %	482546131
84	NC_021052	ATGGC	2	10	124199	124208	20 %	20 %	40 %	20 %	482546134
85	NC_021052	ATGCA	2	10	125905	125914	40 %	20 %	20 %	20 %	482546136
86	NC_021052	GCTGA	2	10	127306	127315	20 %	20 %	40 %	20 %	482546137
87	NC_021052	CTCAC	2	10	128883	128892	20 %	20 %	0 %	60 %	482546139
88	NC_021052	AGAAA	2	10	130012	130021	80 %	0 %	20 %	0 %	482546141
89	NC_021052	GATAA	2	10	132640	132649	60 %	20 %	20 %	0 %	482546142
90	NC_021052	AGAAA	2	10	132941	132950	80 %	0 %	20 %	0 %	482546142
91	NC_021052	CTTTT	2	10	139008	139017	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021052	GGTCG	2	10	139988	139997	0 %	20 %	60 %	20 %	482546144
93	NC_021052	TGGGA	2	10	142398	142407	20 %	20 %	60 %	0 %	482546146
94	NC_021052	GCTTT	2	10	142900	142909	0 %	60 %	20 %	20 %	482546147
95	NC_021052	AGAAA	2	10	143359	143368	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021052	TCCCA	2	10	146606	146615	20 %	20 %	0 %	60 %	482546149
97	NC_021052	AAAAC	2	10	147048	147057	80 %	0 %	0 %	20 %	482546149
98	NC_021052	CAGCC	2	10	150936	150945	20 %	0 %	20 %	60 %	482546152
99	NC_021052	AGACA	2	10	152996	153005	60 %	0 %	20 %	20 %	482546153
100	NC_021052	GAAAT	2	10	153039	153048	60 %	20 %	20 %	0 %	482546153
101	NC_021052	GTATC	2	10	154062	154071	20 %	40 %	20 %	20 %	482546153
102	NC_021052	GAAGA	2	10	155533	155542	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021052	CTTTT	2	10	161052	161061	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021052	CGATT	2	10	162601	162610	20 %	40 %	20 %	20 %	482546155
105	NC_021052	CTTTT	2	10	165061	165070	0 %	80 %	0 %	20 %	482546159
106	NC_021052	GAAGA	2	10	165548	165557	60 %	0 %	40 %	0 %	482546160
107	NC_021052	TAGAA	2	10	169521	169530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021052	CTATT	2	10	169909	169918	20 %	60 %	0 %	20 %	482546163
109	NC_021052	TGGAT	2	10	170192	170201	20 %	40 %	40 %	0 %	482546163
110	NC_021052	ATCCT	2	10	171157	171166	20 %	40 %	0 %	40 %	482546164
111	NC_021052	CAAGC	2	10	171242	171251	40 %	0 %	20 %	40 %	482546164
112	NC_021052	ATTGT	2	10	171812	171821	20 %	60 %	20 %	0 %	482546164
113	NC_021052	CATTG	2	10	172542	172551	20 %	40 %	20 %	20 %	482546165
114	NC_021052	GTCGT	2	10	176975	176984	0 %	40 %	40 %	20 %	482546168
115	NC_021052	ATGGA	2	10	178780	178789	40 %	20 %	40 %	0 %	482546171
116	NC_021052	TGCAG	2	10	179433	179442	20 %	20 %	40 %	20 %	482546172
117	NC_021052	AAGGG	2	10	181641	181650	40 %	0 %	60 %	0 %	482546174
118	NC_021052	AAGAA	2	10	182103	182112	80 %	0 %	20 %	0 %	482546174
119	NC_021052	AGCAG	2	10	182499	182508	40 %	0 %	40 %	20 %	482546174
120	NC_021052	AATCA	2	10	182674	182683	60 %	20 %	0 %	20 %	482546174
121	NC_021052	GTTTT	2	10	184476	184485	0 %	80 %	20 %	0 %	482546176
122	NC_021052	CTTTT	2	10	185555	185564	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021052	TTTTA	2	10	186300	186309	20 %	80 %	0 %	0 %	482546179
124	NC_021052	AGAGC	2	10	188588	188597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021052	TCTGT	2	10	191656	191665	0 %	60 %	20 %	20 %	482546184
126	NC_021052	AAAGA	2	10	194764	194773	80 %	0 %	20 %	0 %	482546186
127	NC_021052	CCCTA	2	10	195701	195710	20 %	20 %	0 %	60 %	482546187
128	NC_021052	TCTTT	2	10	196451	196460	0 %	80 %	0 %	20 %	482546188
129	NC_021052	ATCCA	2	10	200369	200378	40 %	20 %	0 %	40 %	482546190
130	NC_021052	TGTAT	2	10	203436	203445	20 %	60 %	20 %	0 %	482546197
131	NC_021052	GTTTT	2	10	203807	203816	0 %	80 %	20 %	0 %	482546198
132	NC_021052	TTAAA	2	10	204332	204341	60 %	40 %	0 %	0 %	482546198
133	NC_021052	TTTCA	2	10	204951	204960	20 %	60 %	0 %	20 %	482546198
134	NC_021052	CTGTC	2	10	206989	206998	0 %	40 %	20 %	40 %	482546199
135	NC_021052	AAGAG	2	10	208258	208267	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021052	GCTAG	2	10	208284	208293	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021052	CGATA	2	10	208732	208741	40 %	20 %	20 %	20 %	482546201
138	NC_021052	AGAGG	2	10	209354	209363	40 %	0 %	60 %	0 %	482546201
139	NC_021052	CTTTC	2	10	209369	209378	0 %	60 %	0 %	40 %	482546201
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144	NC_021052	TCGTT	2	10	216670	216679	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_021052	CAATC	2	10	218169	218178	40 %	20 %	0 %	40 %	482546208
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236	NC_021052	TATTT	2	10	329279	329288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_021052	TGGTA	2	10	329937	329946	20 %	40 %	40 %	0 %	482546304
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259	NC_021052	GAAGG	2	10	352666	352675	40 %	0 %	60 %	0 %	482546323
260	NC_021052	GAGCT	2	10	353706	353715	20 %	20 %	40 %	20 %	482546324
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262	NC_021052	CTATT	2	10	358380	358389	20 %	60 %	0 %	20 %	482546330
263	NC_021052	TCCTA	2	10	358427	358436	20 %	40 %	0 %	40 %	482546330
264	NC_021052	ACGAT	2	10	360342	360351	40 %	20 %	20 %	20 %	482546331
265	NC_021052	AATTT	2	10	361233	361242	40 %	60 %	0 %	0 %	482546332
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381	NC_021052	TGAGT	2	10	504610	504619	20 %	40 %	40 %	0 %	482546459
382	NC_021052	AGAAA	2	10	504978	504987	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
383	NC_021052	TTGAG	2	10	505360	505369	20 %	40 %	40 %	0 %	482546460
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385	NC_021052	AGAGA	2	10	507463	507472	60 %	0 %	40 %	0 %	482546464
386	NC_021052	ACGAT	2	10	509409	509418	40 %	20 %	20 %	20 %	482546466
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395	NC_021052	CTCTA	2	10	519323	519332	20 %	40 %	0 %	40 %	482546479
396	NC_021052	CTAAG	2	10	520914	520923	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
397	NC_021052	CAAGA	2	10	521555	521564	60 %	0 %	20 %	20 %	482546482
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