MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i) plasmid pL2/434/Bu(i)

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021051	TGAT	2	8	174	181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021051	GTTT	2	8	805	812	0 %	75 %	25 %	0 %	482545080
3	NC_021051	TAAA	2	8	1621	1628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021051	ATTA	2	8	1654	1661	50 %	50 %	0 %	0 %	482545081
5	NC_021051	TTTA	2	8	1727	1734	25 %	75 %	0 %	0 %	482545081
6	NC_021051	AACC	2	8	1800	1807	50 %	0 %	0 %	50 %	482545081
7	NC_021051	ATCC	2	8	2451	2458	25 %	25 %	0 %	50 %	482545081
8	NC_021051	GAAA	2	8	2571	2578	75 %	0 %	25 %	0 %	482545081
9	NC_021051	TTCC	2	8	2830	2837	0 %	50 %	0 %	50 %	482545082
10	NC_021051	AAAC	2	8	2951	2958	75 %	0 %	0 %	25 %	482545082
11	NC_021051	AAAG	2	8	3475	3482	75 %	0 %	25 %	0 %	482545082
12	NC_021051	TCCT	2	8	4656	4663	0 %	50 %	0 %	50 %	482545083
13	NC_021051	TTTC	2	8	4789	4796	0 %	75 %	0 %	25 %	482545083
14	NC_021051	CAGA	2	8	4815	4822	50 %	0 %	25 %	25 %	482545083
15	NC_021051	CAAT	2	8	5652	5659	50 %	25 %	0 %	25 %	482545084
16	NC_021051	TATC	2	8	6498	6505	25 %	50 %	0 %	25 %	482545085
17	NC_021051	GAAG	2	8	6533	6540	50 %	0 %	50 %	0 %	482545085
18	NC_021051	TTGG	2	8	6688	6695	0 %	50 %	50 %	0 %	482545085
19	NC_021051	AACT	2	8	6757	6764	50 %	25 %	0 %	25 %	482545085
20	NC_021051	GGAA	2	8	7015	7022	50 %	0 %	50 %	0 %	482545085
21	NC_021051	CCGA	2	8	7387	7394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021051	AATT	2	8	7458	7465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.