MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021050	GCGTA	2	10	1071	1080	20 %	20 %	40 %	20 %	482545088
2	NC_021050	TATGG	2	10	1436	1445	20 %	40 %	40 %	0 %	482545088
3	NC_021050	TTTCG	2	10	1720	1729	0 %	60 %	20 %	20 %	482545088
4	NC_021050	GAGAA	2	10	3215	3224	60 %	0 %	40 %	0 %	482545090
5	NC_021050	TGCTT	2	10	3396	3405	0 %	60 %	20 %	20 %	482545090
6	NC_021050	ACTGT	2	10	5098	5107	20 %	40 %	20 %	20 %	482545090
7	NC_021050	ATTCT	2	10	5382	5391	20 %	60 %	0 %	20 %	482545091
8	NC_021050	TTGAA	2	10	6264	6273	40 %	40 %	20 %	0 %	482545091
9	NC_021050	ATGGA	2	10	9092	9101	40 %	20 %	40 %	0 %	482545093
10	NC_021050	TAAGA	2	10	10093	10102	60 %	20 %	20 %	0 %	482545093
11	NC_021050	TTCAT	2	10	10276	10285	20 %	60 %	0 %	20 %	482545093
12	NC_021050	CTTCT	2	10	14934	14943	0 %	60 %	0 %	40 %	482545095
13	NC_021050	CTGAA	2	10	15308	15317	40 %	20 %	20 %	20 %	482545095
14	NC_021050	GAAGA	2	10	16687	16696	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021050	GAAGG	2	10	17243	17252	40 %	0 %	60 %	0 %	482545097
16	NC_021050	CGGAA	2	10	20263	20272	40 %	0 %	40 %	20 %	482545098
17	NC_021050	GATAC	2	10	20844	20853	40 %	20 %	20 %	20 %	482545099
18	NC_021050	TTTCT	2	10	26200	26209	0 %	80 %	0 %	20 %	482545106
19	NC_021050	TTTTG	2	10	26711	26720	0 %	80 %	20 %	0 %	482545107
20	NC_021050	TGCTC	2	10	28648	28657	0 %	40 %	20 %	40 %	482545108
21	NC_021050	ATGTC	2	10	29550	29559	20 %	40 %	20 %	20 %	482545108
22	NC_021050	AATAA	2	10	31089	31098	80 %	20 %	0 %	0 %	482545111
23	NC_021050	GTTTT	2	10	34290	34299	0 %	80 %	20 %	0 %	482545115
24	NC_021050	TTTCT	2	10	34963	34972	0 %	80 %	0 %	20 %	482545117
25	NC_021050	GAATC	2	10	35472	35481	40 %	20 %	20 %	20 %	482545117
26	NC_021050	TTTGG	2	10	37137	37146	0 %	60 %	40 %	0 %	482545118
27	NC_021050	AGAAT	2	10	39498	39507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021050	AGGGG	2	10	39729	39738	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021050	AGAGA	2	10	42126	42135	60 %	0 %	40 %	0 %	482545121
30	NC_021050	GCTCT	2	10	42193	42202	0 %	40 %	20 %	40 %	482545121
31	NC_021050	GGATC	2	10	45996	46005	20 %	20 %	40 %	20 %	482545126
32	NC_021050	TAAAT	2	10	46037	46046	60 %	40 %	0 %	0 %	482545126
33	NC_021050	CAGAG	2	10	46200	46209	40 %	0 %	40 %	20 %	482545127
34	NC_021050	GCGAT	2	10	46352	46361	20 %	20 %	40 %	20 %	482545127
35	NC_021050	AGATG	2	10	46587	46596	40 %	20 %	40 %	0 %	482545127
36	NC_021050	TTTTC	2	10	47605	47614	0 %	80 %	0 %	20 %	482545129
37	NC_021050	GAGCA	2	10	49296	49305	40 %	0 %	40 %	20 %	482545130
38	NC_021050	CAATT	2	10	51687	51696	40 %	40 %	0 %	20 %	482545131
39	NC_021050	GGCGT	2	10	54323	54332	0 %	20 %	60 %	20 %	482545132
40	NC_021050	GGATA	2	10	54616	54625	40 %	20 %	40 %	0 %	482545133
41	NC_021050	CCATT	2	10	56283	56292	20 %	40 %	0 %	40 %	482545135
42	NC_021050	CAATT	2	10	57888	57897	40 %	40 %	0 %	20 %	482545137
43	NC_021050	AAAAG	2	10	60304	60313	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021050	GAAAA	2	10	60430	60439	80 %	0 %	20 %	0 %	482545139
45	NC_021050	GAGGT	2	10	61398	61407	20 %	20 %	60 %	0 %	482545139
46	NC_021050	ATTTT	2	10	61740	61749	20 %	80 %	0 %	0 %	482545139
47	NC_021050	AGGTA	2	10	63703	63712	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021050	TTTGG	2	10	63919	63928	0 %	60 %	40 %	0 %	482545140
49	NC_021050	GTTAT	2	10	64393	64402	20 %	60 %	20 %	0 %	482545140
50	NC_021050	TCCTT	2	10	64886	64895	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_021050	CTCCA	2	10	65040	65049	20 %	20 %	0 %	60 %	482545141
52	NC_021050	CGTTT	2	10	65249	65258	0 %	60 %	20 %	20 %	482545142
53	NC_021050	TTCTA	2	10	66073	66082	20 %	60 %	0 %	20 %	482545142
54	NC_021050	TTAGT	2	10	66422	66431	20 %	60 %	20 %	0 %	482545142
55	NC_021050	TAGGT	2	10	67163	67172	20 %	40 %	40 %	0 %	482545143
56	NC_021050	AGGGA	2	10	67793	67802	40 %	0 %	60 %	0 %	482545144
57	NC_021050	CTTAA	2	10	70665	70674	40 %	40 %	0 %	20 %	482545146
58	NC_021050	ACAAA	2	10	71764	71773	80 %	0 %	0 %	20 %	482545148
59	NC_021050	TCCGG	2	10	81552	81561	0 %	20 %	40 %	40 %	482545156
60	NC_021050	TGGCT	2	10	83902	83911	0 %	40 %	40 %	20 %	482545158
61	NC_021050	TTTCT	2	10	84311	84320	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021050	AAGAA	2	10	85073	85082	80 %	0 %	20 %	0 %	482545159
63	NC_021050	ATAGG	2	10	90208	90217	40 %	20 %	40 %	0 %	482545162
64	NC_021050	AAAGC	2	10	90366	90375	60 %	0 %	20 %	20 %	482545162
65	NC_021050	ACAAT	2	10	91226	91235	60 %	20 %	0 %	20 %	482545163
66	NC_021050	AGAAA	2	10	92843	92852	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021050	ACACA	2	10	94204	94213	60 %	0 %	0 %	40 %	482545165
68	NC_021050	TGTTT	2	10	95147	95156	0 %	80 %	20 %	0 %	482545167
69	NC_021050	CTTTG	2	10	95566	95575	0 %	60 %	20 %	20 %	482545167
70	NC_021050	GCATC	2	10	96215	96224	20 %	20 %	20 %	40 %	482545167
71	NC_021050	AAAGT	2	10	101710	101719	60 %	20 %	20 %	0 %	482545170
72	NC_021050	CGATG	2	10	101786	101795	20 %	20 %	40 %	20 %	482545170
73	NC_021050	CGAAG	2	10	102626	102635	40 %	0 %	40 %	20 %	482545170
74	NC_021050	GGAAG	2	10	104407	104416	40 %	0 %	60 %	0 %	482545171
75	NC_021050	AAGAG	2	10	104683	104692	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021050	ACTCC	2	10	104983	104992	20 %	20 %	0 %	60 %	482545172
77	NC_021050	TGTCT	2	10	110020	110029	0 %	60 %	20 %	20 %	482545177
78	NC_021050	GGAAA	2	10	112772	112781	60 %	0 %	40 %	0 %	482545181
79	NC_021050	TGGCA	2	10	114642	114651	20 %	20 %	40 %	20 %	482545184
80	NC_021050	TTAGA	2	10	115368	115377	40 %	40 %	20 %	0 %	482545184
81	NC_021050	CGTGG	2	10	118348	118357	0 %	20 %	60 %	20 %	482545188
82	NC_021050	AACGT	2	10	118475	118484	40 %	20 %	20 %	20 %	482545188
83	NC_021050	AAGAG	2	10	120128	120137	60 %	0 %	40 %	0 %	482545189
84	NC_021050	ATGGC	2	10	124199	124208	20 %	20 %	40 %	20 %	482545192
85	NC_021050	ATGCA	2	10	125905	125914	40 %	20 %	20 %	20 %	482545194
86	NC_021050	GCTGA	2	10	127306	127315	20 %	20 %	40 %	20 %	482545195
87	NC_021050	CTCAC	2	10	128883	128892	20 %	20 %	0 %	60 %	482545197
88	NC_021050	AGAAA	2	10	130012	130021	80 %	0 %	20 %	0 %	482545199
89	NC_021050	GATAA	2	10	132640	132649	60 %	20 %	20 %	0 %	482545200
90	NC_021050	AGAAA	2	10	132941	132950	80 %	0 %	20 %	0 %	482545200
91	NC_021050	CTTTT	2	10	139008	139017	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021050	GGTCG	2	10	139988	139997	0 %	20 %	60 %	20 %	482545202
93	NC_021050	TGGGA	2	10	142398	142407	20 %	20 %	60 %	0 %	482545204
94	NC_021050	GCTTT	2	10	142900	142909	0 %	60 %	20 %	20 %	482545205
95	NC_021050	AGAAA	2	10	143359	143368	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021050	TCCCA	2	10	146606	146615	20 %	20 %	0 %	60 %	482545207
97	NC_021050	AAAAC	2	10	147048	147057	80 %	0 %	0 %	20 %	482545207
98	NC_021050	CAGCC	2	10	150936	150945	20 %	0 %	20 %	60 %	482545210
99	NC_021050	AGACA	2	10	152996	153005	60 %	0 %	20 %	20 %	482545211
100	NC_021050	GAAAT	2	10	153039	153048	60 %	20 %	20 %	0 %	482545211
101	NC_021050	GTATC	2	10	154062	154071	20 %	40 %	20 %	20 %	482545211
102	NC_021050	GAAGA	2	10	155533	155542	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021050	CTTTT	2	10	161052	161061	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021050	CGATT	2	10	162601	162610	20 %	40 %	20 %	20 %	482545213
105	NC_021050	CTTTT	2	10	165061	165070	0 %	80 %	0 %	20 %	482545217
106	NC_021050	GAAGA	2	10	165548	165557	60 %	0 %	40 %	0 %	482545218
107	NC_021050	TAGAA	2	10	169521	169530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021050	CTATT	2	10	169909	169918	20 %	60 %	0 %	20 %	482545221
109	NC_021050	TGGAT	2	10	170192	170201	20 %	40 %	40 %	0 %	482545221
110	NC_021050	ATCCT	2	10	171157	171166	20 %	40 %	0 %	40 %	482545222
111	NC_021050	CAAGC	2	10	171242	171251	40 %	0 %	20 %	40 %	482545222
112	NC_021050	ATTGT	2	10	171812	171821	20 %	60 %	20 %	0 %	482545222
113	NC_021050	CATTG	2	10	172542	172551	20 %	40 %	20 %	20 %	482545223
114	NC_021050	GTCGT	2	10	176975	176984	0 %	40 %	40 %	20 %	482545226
115	NC_021050	ATGGA	2	10	178780	178789	40 %	20 %	40 %	0 %	482545229
116	NC_021050	TGCAG	2	10	179433	179442	20 %	20 %	40 %	20 %	482545230
117	NC_021050	AAGGG	2	10	181641	181650	40 %	0 %	60 %	0 %	482545232
118	NC_021050	AAGAA	2	10	182103	182112	80 %	0 %	20 %	0 %	482545232
119	NC_021050	AGCAG	2	10	182499	182508	40 %	0 %	40 %	20 %	482545232
120	NC_021050	AATCA	2	10	182674	182683	60 %	20 %	0 %	20 %	482545232
121	NC_021050	GTTTT	2	10	184476	184485	0 %	80 %	20 %	0 %	482545234
122	NC_021050	CTTTT	2	10	185555	185564	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021050	TTTTA	2	10	186300	186309	20 %	80 %	0 %	0 %	482545237
124	NC_021050	AGAGC	2	10	188588	188597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021050	TCTGT	2	10	191656	191665	0 %	60 %	20 %	20 %	482545242
126	NC_021050	AAAGA	2	10	194764	194773	80 %	0 %	20 %	0 %	482545244
127	NC_021050	CCCTA	2	10	195701	195710	20 %	20 %	0 %	60 %	482545245
128	NC_021050	TCTTT	2	10	196451	196460	0 %	80 %	0 %	20 %	482545246
129	NC_021050	ATCCA	2	10	200369	200378	40 %	20 %	0 %	40 %	482545248
130	NC_021050	TGTAT	2	10	203436	203445	20 %	60 %	20 %	0 %	482545255
131	NC_021050	GTTTT	2	10	203807	203816	0 %	80 %	20 %	0 %	482545256
132	NC_021050	TTAAA	2	10	204332	204341	60 %	40 %	0 %	0 %	482545256
133	NC_021050	TTTCA	2	10	204951	204960	20 %	60 %	0 %	20 %	482545256
134	NC_021050	CTGTC	2	10	206989	206998	0 %	40 %	20 %	40 %	482545257
135	NC_021050	AAGAG	2	10	208258	208267	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021050	GCTAG	2	10	208284	208293	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021050	CGATA	2	10	208732	208741	40 %	20 %	20 %	20 %	482545259
138	NC_021050	AGAGG	2	10	209354	209363	40 %	0 %	60 %	0 %	482545259
139	NC_021050	CTTTC	2	10	209369	209378	0 %	60 %	0 %	40 %	482545259
140	NC_021050	TGGGG	2	10	210358	210367	0 %	20 %	80 %	0 %	482545260
141	NC_021050	TCTAT	2	10	211848	211857	20 %	60 %	0 %	20 %	482545262
142	NC_021050	CACAT	2	10	213615	213624	40 %	20 %	0 %	40 %	482545262
143	NC_021050	TGTCG	2	10	215915	215924	0 %	40 %	40 %	20 %	482545264
144	NC_021050	TCGTT	2	10	216670	216679	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_021050	CAATC	2	10	218169	218178	40 %	20 %	0 %	40 %	482545266
146	NC_021050	ATGAT	2	10	219390	219399	40 %	40 %	20 %	0 %	482545269
147	NC_021050	TTCTT	2	10	219627	219636	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_021050	TAATT	2	10	220927	220936	40 %	60 %	0 %	0 %	482545272
149	NC_021050	GGTAG	2	10	223809	223818	20 %	20 %	60 %	0 %	482545273
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151	NC_021050	GATCC	2	10	225827	225836	20 %	20 %	20 %	40 %	482545274
152	NC_021050	TAGCT	2	10	226382	226391	20 %	40 %	20 %	20 %	482545275
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155	NC_021050	TGATT	2	10	228600	228609	20 %	60 %	20 %	0 %	482545277
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159	NC_021050	TGTCT	2	10	234027	234036	0 %	60 %	20 %	20 %	482545280
160	NC_021050	GCCTG	2	10	235986	235995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_021050	TACAA	2	10	237980	237989	60 %	20 %	0 %	20 %	482545286
162	NC_021050	GGGAT	2	10	237993	238002	20 %	20 %	60 %	0 %	482545286
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165	NC_021050	CTTCA	2	10	241467	241476	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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172	NC_021050	AGTGG	2	10	248682	248691	20 %	20 %	60 %	0 %	482545296
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176	NC_021050	TTCTC	2	10	250320	250329	0 %	60 %	0 %	40 %	482545296
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182	NC_021050	TTGAT	2	10	258037	258046	20 %	60 %	20 %	0 %	482545300
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186	NC_021050	TAAAG	2	10	262292	262301	60 %	20 %	20 %	0 %	482545306
187	NC_021050	TAAAA	2	10	264320	264329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021050	ATAAA	2	10	264351	264360	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_021050	TCTTT	2	10	264657	264666	0 %	80 %	0 %	20 %	482545310
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191	NC_021050	TTTCT	2	10	265879	265888	0 %	80 %	0 %	20 %	482545310
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214	NC_021050	GCTTT	2	10	302458	302467	0 %	60 %	20 %	20 %	482545344
215	NC_021050	TTAGA	2	10	303981	303990	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
216	NC_021050	AGTTG	2	10	305180	305189	20 %	40 %	40 %	0 %	482545346
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230	NC_021050	TGTGA	2	10	325526	325535	20 %	40 %	40 %	0 %	482545357
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234	NC_021050	TTACA	2	10	326768	326777	40 %	40 %	0 %	20 %	482545358
235	NC_021050	GTCTT	2	10	327464	327473	0 %	60 %	20 %	20 %	482545359
236	NC_021050	TATTT	2	10	329279	329288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_021050	TGGTA	2	10	329937	329946	20 %	40 %	40 %	0 %	482545362
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243	NC_021050	AAAGA	2	10	335450	335459	80 %	0 %	20 %	0 %	482545367
244	NC_021050	GGTGT	2	10	335554	335563	0 %	40 %	60 %	0 %	482545367
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248	NC_021050	GAAGG	2	10	339152	339161	40 %	0 %	60 %	0 %	482545370
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252	NC_021050	GGAAA	2	10	346055	346064	60 %	0 %	40 %	0 %	482545375
253	NC_021050	AGAGG	2	10	347779	347788	40 %	0 %	60 %	0 %	482545376
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255	NC_021050	GGATA	2	10	349584	349593	40 %	20 %	40 %	0 %	482545377
256	NC_021050	ATCCG	2	10	350309	350318	20 %	20 %	20 %	40 %	482545379
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258	NC_021050	CCTAT	2	10	351867	351876	20 %	40 %	0 %	40 %	482545380
259	NC_021050	GAAGG	2	10	352666	352675	40 %	0 %	60 %	0 %	482545381
260	NC_021050	GAGCT	2	10	353706	353715	20 %	20 %	40 %	20 %	482545382
261	NC_021050	AAAGA	2	10	355339	355348	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_021050	CTATT	2	10	358380	358389	20 %	60 %	0 %	20 %	482545388
263	NC_021050	TCCTA	2	10	358427	358436	20 %	40 %	0 %	40 %	482545388
264	NC_021050	ACGAT	2	10	360342	360351	40 %	20 %	20 %	20 %	482545389
265	NC_021050	AATTT	2	10	361233	361242	40 %	60 %	0 %	0 %	482545390
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267	NC_021050	CGATG	2	10	364414	364423	20 %	20 %	40 %	20 %	482545392
268	NC_021050	TGCAA	2	10	364572	364581	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
269	NC_021050	TTTAT	2	10	366417	366426	20 %	80 %	0 %	0 %	482545396
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275	NC_021050	CCGTA	2	10	376053	376062	20 %	20 %	20 %	40 %	482545405
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282	NC_021050	CCTTC	2	10	386265	386274	0 %	40 %	0 %	60 %	482545413
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381	NC_021050	TGAGT	2	10	504610	504619	20 %	40 %	40 %	0 %	482545517
382	NC_021050	AGAAA	2	10	504978	504987	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
383	NC_021050	TTGAG	2	10	505360	505369	20 %	40 %	40 %	0 %	482545518
384	NC_021050	ATAGA	2	10	505382	505391	60 %	20 %	20 %	0 %	482545518
385	NC_021050	AGAGA	2	10	507463	507472	60 %	0 %	40 %	0 %	482545522
386	NC_021050	ACGAT	2	10	509409	509418	40 %	20 %	20 %	20 %	482545524
387	NC_021050	CGATA	2	10	510221	510230	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
388	NC_021050	TATGC	2	10	511172	511181	20 %	40 %	20 %	20 %	482545525
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391	NC_021050	TATCA	2	10	511539	511548	40 %	40 %	0 %	20 %	482545527
392	NC_021050	GATCT	2	10	511685	511694	20 %	40 %	20 %	20 %	482545527
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394	NC_021050	CTCTT	2	10	516831	516840	0 %	60 %	0 %	40 %	482545533
395	NC_021050	CTCTA	2	10	519323	519332	20 %	40 %	0 %	40 %	482545536
396	NC_021050	CTAAG	2	10	520914	520923	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
397	NC_021050	CAAGA	2	10	521555	521564	60 %	0 %	20 %	20 %	482545539
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399	NC_021050	AAACC	2	10	523427	523436	60 %	0 %	0 %	40 %	482545541
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