MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 2852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021050	TCTT	2	8	110	117	0 %	75 %	0 %	25 %	482545087
2	NC_021050	TTGT	2	8	305	312	0 %	75 %	25 %	0 %	482545087
3	NC_021050	CATG	2	8	468	475	25 %	25 %	25 %	25 %	482545087
4	NC_021050	AAAG	2	8	883	890	75 %	0 %	25 %	0 %	482545087
5	NC_021050	GCTA	2	8	975	982	25 %	25 %	25 %	25 %	482545087
6	NC_021050	CATG	2	8	1294	1301	25 %	25 %	25 %	25 %	482545088
7	NC_021050	AGAT	2	8	1346	1353	50 %	25 %	25 %	0 %	482545088
8	NC_021050	AGGA	2	8	1424	1431	50 %	0 %	50 %	0 %	482545088
9	NC_021050	GTCT	2	8	1837	1844	0 %	50 %	25 %	25 %	482545088
10	NC_021050	TTTG	2	8	2044	2051	0 %	75 %	25 %	0 %	482545088
11	NC_021050	CCTT	2	8	2067	2074	0 %	50 %	0 %	50 %	482545088
12	NC_021050	AAGG	2	8	2314	2321	50 %	0 %	50 %	0 %	482545088
13	NC_021050	TTTG	2	8	4348	4355	0 %	75 %	25 %	0 %	482545090
14	NC_021050	TGCT	2	8	4430	4437	0 %	50 %	25 %	25 %	482545090
15	NC_021050	GTTT	2	8	4578	4585	0 %	75 %	25 %	0 %	482545090
16	NC_021050	CAGC	2	8	4657	4664	25 %	0 %	25 %	50 %	482545090
17	NC_021050	AAAC	2	8	4737	4744	75 %	0 %	0 %	25 %	482545090
18	NC_021050	AATC	2	8	4896	4903	50 %	25 %	0 %	25 %	482545090
19	NC_021050	CCTT	2	8	5366	5373	0 %	50 %	0 %	50 %	482545091
20	NC_021050	CTTT	2	8	5961	5968	0 %	75 %	0 %	25 %	482545091
21	NC_021050	CTTA	2	8	6240	6247	25 %	50 %	0 %	25 %	482545091
22	NC_021050	TTCG	2	8	6300	6307	0 %	50 %	25 %	25 %	482545091
23	NC_021050	TTCG	2	8	6642	6649	0 %	50 %	25 %	25 %	482545092
24	NC_021050	GAAA	2	8	6728	6735	75 %	0 %	25 %	0 %	482545092
25	NC_021050	TTCT	2	8	6760	6767	0 %	75 %	0 %	25 %	482545092
26	NC_021050	TTGT	2	8	7216	7223	0 %	75 %	25 %	0 %	482545092
27	NC_021050	TCTA	2	8	7683	7690	25 %	50 %	0 %	25 %	482545093
28	NC_021050	AAGA	2	8	7753	7760	75 %	0 %	25 %	0 %	482545093
29	NC_021050	TGTT	2	8	8211	8218	0 %	75 %	25 %	0 %	482545093
30	NC_021050	AATA	2	8	8412	8419	75 %	25 %	0 %	0 %	482545093
31	NC_021050	ACAT	2	8	8446	8453	50 %	25 %	0 %	25 %	482545093
32	NC_021050	GAAA	2	8	8589	8596	75 %	0 %	25 %	0 %	482545093
33	NC_021050	TTGC	2	8	9371	9378	0 %	50 %	25 %	25 %	482545093
34	NC_021050	GCTT	2	8	10419	10426	0 %	50 %	25 %	25 %	482545093
35	NC_021050	TCGA	2	8	10495	10502	25 %	25 %	25 %	25 %	482545093
36	NC_021050	GAAG	2	8	10835	10842	50 %	0 %	50 %	0 %	482545094
37	NC_021050	TAGG	2	8	11008	11015	25 %	25 %	50 %	0 %	482545094
38	NC_021050	TTAC	2	8	11294	11301	25 %	50 %	0 %	25 %	482545094
39	NC_021050	GAGT	2	8	11902	11909	25 %	25 %	50 %	0 %	482545094
40	NC_021050	GATG	2	8	12327	12334	25 %	25 %	50 %	0 %	482545094
41	NC_021050	AAAT	2	8	13207	13214	75 %	25 %	0 %	0 %	482545094
42	NC_021050	AGGG	2	8	13360	13367	25 %	0 %	75 %	0 %	482545094
43	NC_021050	TTCA	2	8	13642	13649	25 %	50 %	0 %	25 %	482545094
44	NC_021050	TAGT	2	8	13811	13818	25 %	50 %	25 %	0 %	482545095
45	NC_021050	TTTA	2	8	14223	14230	25 %	75 %	0 %	0 %	482545095
46	NC_021050	GGAT	2	8	14506	14513	25 %	25 %	50 %	0 %	482545095
47	NC_021050	TGCT	2	8	14587	14594	0 %	50 %	25 %	25 %	482545095
48	NC_021050	GATC	2	8	15153	15160	25 %	25 %	25 %	25 %	482545095
49	NC_021050	AGAA	2	8	15666	15673	75 %	0 %	25 %	0 %	482545096
50	NC_021050	AGAA	2	8	15841	15848	75 %	0 %	25 %	0 %	482545096
51	NC_021050	GCAG	2	8	16435	16442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021050	GAAA	2	8	16838	16845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021050	TTCA	2	8	17392	17399	25 %	50 %	0 %	25 %	482545097
54	NC_021050	CGTA	2	8	18031	18038	25 %	25 %	25 %	25 %	482545097
55	NC_021050	CTTT	2	8	20186	20193	0 %	75 %	0 %	25 %	482545098
56	NC_021050	TAAT	3	12	20972	20983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021050	TTTC	2	8	21212	21219	0 %	75 %	0 %	25 %	482545100
58	NC_021050	TATC	2	8	21731	21738	25 %	50 %	0 %	25 %	482545100
59	NC_021050	TCGG	2	8	22084	22091	0 %	25 %	50 %	25 %	482545100
60	NC_021050	TTCC	2	8	22254	22261	0 %	50 %	0 %	50 %	482545100
61	NC_021050	TTCT	2	8	22374	22381	0 %	75 %	0 %	25 %	482545100
62	NC_021050	AGGG	2	8	22426	22433	25 %	0 %	75 %	0 %	482545100
63	NC_021050	TCTT	2	8	22926	22933	0 %	75 %	0 %	25 %	482545101
64	NC_021050	TACA	2	8	23216	23223	50 %	25 %	0 %	25 %	482545102
65	NC_021050	GGAA	2	8	23536	23543	50 %	0 %	50 %	0 %	482545102
66	NC_021050	AAAC	2	8	23613	23620	75 %	0 %	0 %	25 %	482545102
67	NC_021050	AAAG	2	8	24239	24246	75 %	0 %	25 %	0 %	482545102
68	NC_021050	GGAT	2	8	24519	24526	25 %	25 %	50 %	0 %	482545103
69	NC_021050	CTCC	2	8	24844	24851	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_021050	CCGA	2	8	25090	25097	25 %	0 %	25 %	50 %	482545105
71	NC_021050	CGAG	2	8	26408	26415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021050	AAAG	2	8	26647	26654	75 %	0 %	25 %	0 %	482545107
73	NC_021050	GCCT	2	8	27780	27787	0 %	25 %	25 %	50 %	482545107
74	NC_021050	CTAG	2	8	27954	27961	25 %	25 %	25 %	25 %	482545107
75	NC_021050	TGGC	2	8	28047	28054	0 %	25 %	50 %	25 %	482545107
76	NC_021050	AGCG	2	8	29191	29198	25 %	0 %	50 %	25 %	482545108
77	NC_021050	ATGA	2	8	29771	29778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021050	AGAA	2	8	29783	29790	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021050	AGCT	2	8	29831	29838	25 %	25 %	25 %	25 %	482545109
80	NC_021050	GATA	2	8	30197	30204	50 %	25 %	25 %	0 %	482545110
81	NC_021050	GTTC	2	8	32705	32712	0 %	50 %	25 %	25 %	482545113
82	NC_021050	ACAA	2	8	32999	33006	75 %	0 %	0 %	25 %	482545114
83	NC_021050	TATT	2	8	33009	33016	25 %	75 %	0 %	0 %	482545114
84	NC_021050	GAAA	2	8	33900	33907	75 %	0 %	25 %	0 %	482545115
85	NC_021050	ACAA	2	8	34118	34125	75 %	0 %	0 %	25 %	482545115
86	NC_021050	GGTA	2	8	34831	34838	25 %	25 %	50 %	0 %	482545117
87	NC_021050	TTGC	2	8	35052	35059	0 %	50 %	25 %	25 %	482545117
88	NC_021050	TCTT	2	8	35142	35149	0 %	75 %	0 %	25 %	482545117
89	NC_021050	GAGG	2	8	35448	35455	25 %	0 %	75 %	0 %	482545117
90	NC_021050	CATC	2	8	35643	35650	25 %	25 %	0 %	50 %	482545117
91	NC_021050	CTTG	2	8	36977	36984	0 %	50 %	25 %	25 %	482545118
92	NC_021050	CAGC	2	8	37183	37190	25 %	0 %	25 %	50 %	482545118
93	NC_021050	GAAA	2	8	37539	37546	75 %	0 %	25 %	0 %	482545118
94	NC_021050	CAAT	2	8	37798	37805	50 %	25 %	0 %	25 %	482545118
95	NC_021050	ATTT	2	8	38747	38754	25 %	75 %	0 %	0 %	482545119
96	NC_021050	CTTT	2	8	38851	38858	0 %	75 %	0 %	25 %	482545119
97	NC_021050	AAGG	2	8	38890	38897	50 %	0 %	50 %	0 %	482545119
98	NC_021050	TTAT	2	8	39004	39011	25 %	75 %	0 %	0 %	482545119
99	NC_021050	ATTT	2	8	39630	39637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021050	ATAC	2	8	39803	39810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021050	TCGT	2	8	39948	39955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021050	AGGG	2	8	40113	40120	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021050	TTTG	2	8	40386	40393	0 %	75 %	25 %	0 %	482545120
104	NC_021050	CAGA	2	8	40903	40910	50 %	0 %	25 %	25 %	482545121
105	NC_021050	CTTC	2	8	40996	41003	0 %	50 %	0 %	50 %	482545121
106	NC_021050	AAAC	2	8	41212	41219	75 %	0 %	0 %	25 %	482545121
107	NC_021050	AACC	2	8	41240	41247	50 %	0 %	0 %	50 %	482545121
108	NC_021050	TTGA	2	8	41890	41897	25 %	50 %	25 %	0 %	482545121
109	NC_021050	GAAG	2	8	42234	42241	50 %	0 %	50 %	0 %	482545121
110	NC_021050	AATA	2	8	43054	43061	75 %	25 %	0 %	0 %	482545121
111	NC_021050	TTTA	2	8	43074	43081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021050	AAGC	2	8	43733	43740	50 %	0 %	25 %	25 %	482545124
113	NC_021050	TCAC	2	8	43909	43916	25 %	25 %	0 %	50 %	482545124
114	NC_021050	GATC	2	8	44332	44339	25 %	25 %	25 %	25 %	482545125
115	NC_021050	GAGT	2	8	45034	45041	25 %	25 %	50 %	0 %	482545126
116	NC_021050	TTCT	2	8	45814	45821	0 %	75 %	0 %	25 %	482545126
117	NC_021050	AGAA	2	8	46433	46440	75 %	0 %	25 %	0 %	482545127
118	NC_021050	TAAA	2	8	46664	46671	75 %	25 %	0 %	0 %	482545128
119	NC_021050	GAAG	2	8	46771	46778	50 %	0 %	50 %	0 %	482545128
120	NC_021050	GTTG	2	8	47328	47335	0 %	50 %	50 %	0 %	482545128
121	NC_021050	GAAG	2	8	47592	47599	50 %	0 %	50 %	0 %	482545129
122	NC_021050	TCTG	2	8	47703	47710	0 %	50 %	25 %	25 %	482545129
123	NC_021050	GGAG	2	8	48003	48010	25 %	0 %	75 %	0 %	482545129
124	NC_021050	TTGC	2	8	48686	48693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021050	AAGA	2	8	49542	49549	75 %	0 %	25 %	0 %	482545130
126	NC_021050	GCAG	2	8	50698	50705	25 %	0 %	50 %	25 %	482545131
127	NC_021050	AAAC	2	8	50992	50999	75 %	0 %	0 %	25 %	482545131
128	NC_021050	CCTC	2	8	52015	52022	0 %	25 %	0 %	75 %	482545131
129	NC_021050	AATC	2	8	52178	52185	50 %	25 %	0 %	25 %	482545131
130	NC_021050	GGAT	2	8	52669	52676	25 %	25 %	50 %	0 %	482545131
131	NC_021050	AGGA	2	8	52848	52855	50 %	0 %	50 %	0 %	482545131
132	NC_021050	TTTC	2	8	53624	53631	0 %	75 %	0 %	25 %	482545132
133	NC_021050	TGCC	2	8	54068	54075	0 %	25 %	25 %	50 %	482545132
134	NC_021050	GTTT	2	8	54248	54255	0 %	75 %	25 %	0 %	482545132
135	NC_021050	TACA	2	8	54795	54802	50 %	25 %	0 %	25 %	482545133
136	NC_021050	AGGA	2	8	54959	54966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021050	AGAA	2	8	54999	55006	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021050	ATTT	2	8	55234	55241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021050	GATC	2	8	55944	55951	25 %	25 %	25 %	25 %	482545135
140	NC_021050	CAAT	2	8	56439	56446	50 %	25 %	0 %	25 %	482545135
141	NC_021050	TCTT	2	8	56455	56462	0 %	75 %	0 %	25 %	482545135
142	NC_021050	ATCA	2	8	56629	56636	50 %	25 %	0 %	25 %	482545136
143	NC_021050	CTTT	2	8	56810	56817	0 %	75 %	0 %	25 %	482545136
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