MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 12921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021050	GAA	2	6	139	144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545087
2	NC_021050	TAA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545087
3	NC_021050	ACA	2	6	299	304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545087
4	NC_021050	TCA	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545087
5	NC_021050	ATA	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545087
6	NC_021050	ATG	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545087
7	NC_021050	TTG	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545087
8	NC_021050	ATG	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545087
9	NC_021050	TTC	2	6	636	641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545087
10	NC_021050	AAG	2	6	695	700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545087
11	NC_021050	GAA	3	9	724	732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545087
12	NC_021050	TGA	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545087
13	NC_021050	GGT	2	6	813	818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545087
14	NC_021050	GCT	2	6	856	861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545087
15	NC_021050	GGT	2	6	872	877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545087
16	NC_021050	TAA	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545087
17	NC_021050	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545087
18	NC_021050	GAA	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545087
19	NC_021050	GAG	2	6	1047	1052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545088
20	NC_021050	TCT	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545088
21	NC_021050	CTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545088
22	NC_021050	TAA	3	9	1216	1224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545088
23	NC_021050	AAT	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545088
24	NC_021050	TCT	2	6	1470	1475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545088
25	NC_021050	GAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545088
26	NC_021050	AGG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545088
27	NC_021050	TGT	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545088
28	NC_021050	ACA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545088
29	NC_021050	TGA	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545088
30	NC_021050	CAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545088
31	NC_021050	TAA	2	6	1911	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545088
32	NC_021050	TCT	2	6	1920	1925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545088
33	NC_021050	GAA	2	6	1929	1934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545088
34	NC_021050	TAA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545088
35	NC_021050	GAG	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545088
36	NC_021050	CTT	3	9	2150	2158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545088
37	NC_021050	TAA	2	6	2230	2235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545088
38	NC_021050	CAG	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545088
39	NC_021050	AAC	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545088
40	NC_021050	GAG	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545089
41	NC_021050	CTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545089
42	NC_021050	ATT	2	6	2663	2668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545089
43	NC_021050	GTC	2	6	2792	2797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545089
44	NC_021050	AGG	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545089
45	NC_021050	ATT	2	6	2885	2890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545089
46	NC_021050	ATC	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545090
47	NC_021050	ATG	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545090
48	NC_021050	AAC	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545090
49	NC_021050	ACA	2	6	3259	3264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545090
50	NC_021050	TCA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545090
51	NC_021050	GGT	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545090
52	NC_021050	TTG	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545090
53	NC_021050	AAG	2	6	3591	3596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
54	NC_021050	AGC	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545090
55	NC_021050	TGG	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545090
56	NC_021050	GAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
57	NC_021050	TGG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545090
58	NC_021050	TCT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545090
59	NC_021050	ATG	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545090
60	NC_021050	AAG	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
61	NC_021050	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545090
62	NC_021050	TCA	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545090
63	NC_021050	TTG	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545090
64	NC_021050	TGT	2	6	4034	4039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545090
65	NC_021050	AGA	2	6	4151	4156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
66	NC_021050	CAA	2	6	4223	4228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545090
67	NC_021050	AAG	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
68	NC_021050	AGC	2	6	4322	4327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545090
69	NC_021050	AAG	2	6	4408	4413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
70	NC_021050	TAT	2	6	4586	4591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545090
71	NC_021050	AAG	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
72	NC_021050	AGA	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
73	NC_021050	GAA	2	6	4690	4695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
74	NC_021050	ACT	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545090
75	NC_021050	AGA	2	6	4791	4796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
76	NC_021050	GAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
77	NC_021050	GTT	2	6	4963	4968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545090
78	NC_021050	AAG	2	6	5116	5121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545090
79	NC_021050	TCT	2	6	5140	5145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545090
80	NC_021050	TTA	2	6	5441	5446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545091
81	NC_021050	AGA	2	6	5575	5580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545091
82	NC_021050	TCA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545091
83	NC_021050	TAT	2	6	5774	5779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545091
84	NC_021050	TTG	2	6	5872	5877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545091
85	NC_021050	ATT	2	6	5936	5941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545091
86	NC_021050	AGA	3	9	6001	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545091
87	NC_021050	TCG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545091
88	NC_021050	TAC	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545091
89	NC_021050	AGA	2	6	6163	6168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545091
90	NC_021050	AGA	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545091
91	NC_021050	TTG	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545092
92	NC_021050	ATT	2	6	6588	6593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545092
93	NC_021050	TTC	2	6	6664	6669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545092
94	NC_021050	TTG	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545092
95	NC_021050	TTG	2	6	6881	6886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545092
96	NC_021050	TGT	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545092
97	NC_021050	GTT	2	6	6945	6950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545092
98	NC_021050	TGG	2	6	6958	6963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545092
99	NC_021050	TTG	2	6	6967	6972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545092
100	NC_021050	TCA	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545092
101	NC_021050	GTG	2	6	7039	7044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545092
102	NC_021050	TTC	2	6	7384	7389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545092
103	NC_021050	ACC	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545092
104	NC_021050	AGT	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545092
105	NC_021050	ATG	2	6	7625	7630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545093
106	NC_021050	GCT	2	6	7657	7662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545093
107	NC_021050	GAT	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545093
108	NC_021050	CGA	2	6	7811	7816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545093
109	NC_021050	CTT	3	9	7835	7843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545093
110	NC_021050	GTA	2	6	7844	7849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545093
111	NC_021050	GAA	2	6	7909	7914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545093
112	NC_021050	AAT	2	6	7956	7961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545093
113	NC_021050	AAT	2	6	7993	7998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545093
114	NC_021050	TTC	2	6	8019	8024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545093
115	NC_021050	AGC	2	6	8031	8036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545093
116	NC_021050	AGA	2	6	8160	8165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545093
117	NC_021050	AGG	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545093
118	NC_021050	TGA	2	6	8271	8276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545093
119	NC_021050	CTA	2	6	8309	8314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545093
120	NC_021050	ATG	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545093
121	NC_021050	TAC	2	6	8511	8516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545093
122	NC_021050	CGA	2	6	8583	8588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545093
123	NC_021050	TCA	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545093
124	NC_021050	TGA	2	6	8630	8635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545093
125	NC_021050	AAT	2	6	8734	8739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545093
126	NC_021050	AGA	2	6	8841	8846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545093
127	NC_021050	TCA	2	6	8900	8905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545093
128	NC_021050	TTG	2	6	8922	8927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545093
129	NC_021050	TAG	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545093
130	NC_021050	AAG	2	6	9119	9124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545093
131	NC_021050	TCT	2	6	9148	9153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545093
132	NC_021050	TCT	2	6	9160	9165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545093
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135	NC_021050	GAC	2	6	9561	9566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545093
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271	NC_021050	TTC	2	6	19708	19713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545098
272	NC_021050	TGA	2	6	19744	19749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545098
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381	NC_021050	TGA	2	6	28432	28437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545108
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385	NC_021050	GTT	2	6	28532	28537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545108
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500	NC_021050	GCT	2	6	38833	38838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545119

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