MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f) plasmid pL2/434/Bu(f)

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021049	TGAT	2	8	174	181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021049	GTTT	2	8	805	812	0 %	75 %	25 %	0 %	482546022
3	NC_021049	TAAA	2	8	1621	1628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021049	ATTA	2	8	1654	1661	50 %	50 %	0 %	0 %	482546023
5	NC_021049	TTTA	2	8	1727	1734	25 %	75 %	0 %	0 %	482546023
6	NC_021049	AACC	2	8	1800	1807	50 %	0 %	0 %	50 %	482546023
7	NC_021049	ATCC	2	8	2451	2458	25 %	25 %	0 %	50 %	482546023
8	NC_021049	GAAA	2	8	2571	2578	75 %	0 %	25 %	0 %	482546023
9	NC_021049	TTCC	2	8	2830	2837	0 %	50 %	0 %	50 %	482546024
10	NC_021049	AAAC	2	8	2951	2958	75 %	0 %	0 %	25 %	482546024
11	NC_021049	AAAG	2	8	3475	3482	75 %	0 %	25 %	0 %	482546024
12	NC_021049	TCCT	2	8	4656	4663	0 %	50 %	0 %	50 %	482546025
13	NC_021049	TTTC	2	8	4789	4796	0 %	75 %	0 %	25 %	482546025
14	NC_021049	CAGA	2	8	4815	4822	50 %	0 %	25 %	25 %	482546025
15	NC_021049	CAAT	2	8	5652	5659	50 %	25 %	0 %	25 %	482546026
16	NC_021049	TATC	2	8	6498	6505	25 %	50 %	0 %	25 %	482546027
17	NC_021049	GAAG	2	8	6533	6540	50 %	0 %	50 %	0 %	482546027
18	NC_021049	TTGG	2	8	6688	6695	0 %	50 %	50 %	0 %	482546027
19	NC_021049	AACT	2	8	6757	6764	50 %	25 %	0 %	25 %	482546027
20	NC_021049	GGAA	2	8	7015	7022	50 %	0 %	50 %	0 %	482546027
21	NC_021049	CCGA	2	8	7387	7394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021049	AATT	2	8	7458	7465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.