MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f) plasmid pL2/434/Bu(f)

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021049	AAT	2	6	530	535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546021
2	NC_021049	TTG	2	6	553	558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546021
3	NC_021049	TAA	2	6	693	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546021
4	NC_021049	TAA	2	6	957	962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546022
5	NC_021049	TGA	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546022
6	NC_021049	AAC	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546022
7	NC_021049	GCC	2	6	1063	1068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482546022
8	NC_021049	AAT	2	6	1084	1089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546022
9	NC_021049	CTG	2	6	1092	1097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546022
10	NC_021049	TCC	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546022
11	NC_021049	TAA	2	6	1162	1167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546022
12	NC_021049	TTA	2	6	1211	1216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546022
13	NC_021049	GTT	2	6	1228	1233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546022
14	NC_021049	CAA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546022
15	NC_021049	TGT	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546022
16	NC_021049	CAA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546022
17	NC_021049	CCA	2	6	1322	1327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546022
18	NC_021049	ATT	2	6	1414	1419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546022
19	NC_021049	TGT	2	6	1477	1482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546022
20	NC_021049	ATT	2	6	1490	1495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546022
21	NC_021049	TTC	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546023
22	NC_021049	AGA	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546023
23	NC_021049	TCT	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546023
24	NC_021049	GCT	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546023
25	NC_021049	TTC	2	6	2189	2194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546023
26	NC_021049	CTA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546023
27	NC_021049	CTT	2	6	2353	2358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546023
28	NC_021049	AAC	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546023
29	NC_021049	GCT	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546023
30	NC_021049	TCT	2	6	2648	2653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546023
31	NC_021049	TGA	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546023
32	NC_021049	AGA	2	6	2821	2826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546024
33	NC_021049	TCT	2	6	3089	3094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546024
34	NC_021049	CTT	2	6	3189	3194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546024
35	NC_021049	AAT	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546024
36	NC_021049	TCT	2	6	3209	3214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546024
37	NC_021049	AAT	2	6	3268	3273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546024
38	NC_021049	CAA	2	6	3279	3284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546024
39	NC_021049	GCT	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546024
40	NC_021049	ATC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546024
41	NC_021049	TTC	2	6	3718	3723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546024
42	NC_021049	ATC	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546024
43	NC_021049	CAT	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546024
44	NC_021049	ACG	2	6	3841	3846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546024
45	NC_021049	ATG	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546024
46	NC_021049	AAC	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546024
47	NC_021049	GCA	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546025
48	NC_021049	TTA	2	6	4297	4302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546025
49	NC_021049	CAA	2	6	4322	4327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546025
50	NC_021049	CTT	2	6	4471	4476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546025
51	NC_021049	AGC	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546025
52	NC_021049	AGG	2	6	4721	4726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546025
53	NC_021049	CTC	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546025
54	NC_021049	CAA	2	6	4776	4781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546025
55	NC_021049	ATT	2	6	4830	4835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546025
56	NC_021049	TGG	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546025
57	NC_021049	GAT	2	6	5093	5098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546025
58	NC_021049	TCT	2	6	5115	5120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546025
59	NC_021049	AGA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546025
60	NC_021049	TTG	2	6	5433	5438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546026
61	NC_021049	CTC	2	6	5503	5508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546026
62	NC_021049	AAC	2	6	6092	6097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546026
63	NC_021049	TGT	2	6	6389	6394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546027
64	NC_021049	AGA	2	6	6395	6400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546027
65	NC_021049	AGG	2	6	6411	6416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546027
66	NC_021049	ATG	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546027
67	NC_021049	TTC	2	6	6479	6484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546027
68	NC_021049	AGA	2	6	6739	6744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546027
69	NC_021049	GTT	2	6	6782	6787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546027
70	NC_021049	GAG	2	6	6788	6793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546027
71	NC_021049	AAG	2	6	6844	6849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546027
72	NC_021049	TCT	2	6	6908	6913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546027
73	NC_021049	TTC	2	6	6922	6927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546027
74	NC_021049	AAT	2	6	6956	6961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546027
75	NC_021049	TCT	2	6	7026	7031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546027
76	NC_021049	AAG	2	6	7041	7046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546027
77	NC_021049	CTT	2	6	7080	7085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546027

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.