MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium cf. saccharolyticum K10

Total Repeats: 966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021047	TTTTC	2	10	3557	3566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021047	GTCCG	2	10	4618	4627	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_021047	CTTTA	2	10	4662	4671	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021047	GACAG	2	10	4717	4726	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021047	AGGAG	2	10	9072	9081	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021047	AGGAA	2	10	10600	10609	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021047	AATTT	2	10	10696	10705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021047	GGCAG	2	10	13112	13121	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021047	ACAGA	2	10	16590	16599	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021047	GAAGG	2	10	17816	17825	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021047	TTTTG	2	10	25179	25188	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021047	AAGAG	2	10	25935	25944	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021047	GATAT	2	10	26038	26047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021047	CTGAC	2	10	30284	30293	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021047	TTCCT	2	10	32139	32148	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021047	AAATA	2	10	38283	38292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021047	AGGGC	2	10	46048	46057	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021047	AGGAA	2	10	47585	47594	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021047	GATGA	2	10	50552	50561	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021047	CGGAT	2	10	58207	58216	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021047	GCAGA	2	10	58842	58851	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021047	TTCAG	2	10	59198	59207	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021047	ATATT	2	10	59459	59468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021047	AAAAC	2	10	61096	61105	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021047	TTAAA	2	10	61807	61816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021047	GCGCC	2	10	63863	63872	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_021047	CAGAA	2	10	75143	75152	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021047	GGGCA	2	10	75555	75564	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021047	CCTTC	2	10	78386	78395	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_021047	AGAGG	2	10	81158	81167	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021047	GGACT	2	10	86804	86813	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021047	TGAGA	2	10	92182	92191	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021047	GCTTT	2	10	92192	92201	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021047	AGGAT	2	10	95002	95011	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021047	AGGAT	2	10	95111	95120	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021047	ATAAA	2	10	99397	99406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021047	GATAA	2	10	105448	105457	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021047	AACAA	2	10	134898	134907	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021047	GGTCA	2	10	135931	135940	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021047	GGGCG	2	10	136291	136300	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021047	ATTTA	2	10	147195	147204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021047	AGATA	2	10	147477	147486	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021047	ACTAT	2	10	153158	153167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021047	ACAGG	2	10	156217	156226	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021047	ATATA	2	10	156346	156355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021047	TAAAA	2	10	167132	167141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021047	AAATT	2	10	168305	168314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021047	CAGGT	2	10	175136	175145	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021047	GCTGT	2	10	178864	178873	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021047	TTTTG	2	10	181864	181873	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021047	ATTTT	2	10	184430	184439	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021047	TTCTC	2	10	185310	185319	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_021047	TTACG	2	10	190553	190562	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021047	CATGC	2	10	198773	198782	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_021047	CCGGG	2	10	202037	202046	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021047	GCAGA	2	10	202453	202462	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021047	GAAAA	2	10	203978	203987	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021047	CATTC	2	10	204949	204958	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_021047	CATTT	2	10	210305	210314	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021047	ATATG	2	10	211125	211134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021047	GAAAA	2	10	212005	212014	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021047	CATGC	2	10	217870	217879	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_021047	GCTGG	2	10	220229	220238	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021047	AGAGC	2	10	228660	228669	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021047	AACAG	2	10	228858	228867	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021047	CGGAT	2	10	229297	229306	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021047	GAAAA	2	10	229633	229642	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021047	GCAGG	2	10	229792	229801	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021047	GGTAA	2	10	235962	235971	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021047	AAGCA	2	10	238201	238210	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021047	CTGAA	2	10	238475	238484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021047	GGGAG	2	10	238808	238817	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021047	CGAAG	2	10	238945	238954	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021047	CCGTA	2	10	239904	239913	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_021047	CGGGA	2	10	241006	241015	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021047	ACTAT	2	10	247780	247789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021047	CAGAA	2	10	251047	251056	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021047	TACGA	2	10	251080	251089	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_021047	TAAAA	2	10	256185	256194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021047	AGGGG	2	10	260030	260039	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021047	ACAGG	2	10	260277	260286	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021047	AAAAG	2	10	268479	268488	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021047	CTCCC	2	10	273248	273257	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
84	NC_021047	AGCTC	2	10	273388	273397	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_021047	CGCAG	2	10	275627	275636	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_021047	TGTCA	2	10	276228	276237	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_021047	AATAT	2	10	277628	277637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021047	AATGG	2	10	277766	277775	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021047	AGAGG	2	10	288230	288239	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021047	CTGCA	2	10	299025	299034	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_021047	ATGAG	2	10	299276	299285	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021047	AGCGC	2	10	301805	301814	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_021047	TATCA	2	10	307957	307966	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021047	GTGCG	2	10	309571	309580	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021047	AGGAG	2	10	310414	310423	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021047	GAGAG	2	10	320552	320561	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021047	AGCCA	2	10	323913	323922	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_021047	TAAAA	2	10	324093	324102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021047	GCCGC	2	10	324121	324130	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_021047	GAGCT	2	10	325035	325044	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021047	GATAT	2	10	325423	325432	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021047	GAAGG	2	10	325461	325470	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021047	AGGAG	2	10	326203	326212	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021047	AGAAA	2	10	327510	327519	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021047	TTTCC	2	10	332854	332863	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_021047	TGATA	2	10	332955	332964	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021047	GCGAA	2	10	332987	332996	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021047	CAGGG	2	10	341225	341234	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021047	GACAG	2	10	341251	341260	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021047	GGAAA	2	10	341797	341806	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021047	TGCAG	2	10	350879	350888	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021047	CTTCC	2	10	351297	351306	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_021047	TTCAT	2	10	353488	353497	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021047	AAAGG	2	10	353568	353577	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021047	ATGGA	2	10	353825	353834	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021047	AAATT	2	10	358959	358968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021047	GCGGT	2	10	364807	364816	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021047	AATAA	2	10	377524	377533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021047	AAAGA	2	10	377687	377696	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021047	GCCCT	2	10	382678	382687	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_021047	TGAAA	2	10	384886	384895	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021047	AAGCG	2	10	390038	390047	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021047	GCATG	2	10	396065	396074	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021047	GAACA	2	10	401151	401160	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021047	GATGA	2	10	403797	403806	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021047	ATGGT	2	10	404587	404596	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021047	TTTTC	2	10	404796	404805	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021047	AAAAG	2	10	417753	417762	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021047	GAAGA	2	10	423693	423702	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021047	TGTTT	2	10	429493	429502	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021047	TAATA	2	10	429503	429512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021047	GAGAG	2	10	436075	436084	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021047	ACGGA	2	10	437378	437387	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021047	TAGAA	2	10	437398	437407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021047	ATTTC	2	10	437734	437743	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021047	CGCTG	2	10	458943	458952	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_021047	CGCTT	2	10	467849	467858	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_021047	AAAGT	2	10	473354	473363	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021047	CGGCC	2	10	491236	491245	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_021047	GCCGG	2	10	491513	491522	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_021047	CGGTA	2	10	491770	491779	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021047	AGCTG	2	10	494210	494219	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021047	CCTTT	2	10	499104	499113	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_021047	CAAGG	2	10	501934	501943	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_021047	GCTTC	2	10	503468	503477	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_021047	CTGTT	2	10	503898	503907	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_021047	GTGCT	2	10	503937	503946	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_021047	CAATC	2	10	504869	504878	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_021047	AACGA	2	10	510590	510599	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_021047	CTCGG	2	10	511028	511037	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_021047	CGCAG	2	10	513280	513289	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_021047	TTTTC	2	10	516734	516743	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_021047	CCTAT	2	10	644990	644999	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_021047	GCATG	2	10	1005169	1005178	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_021047	CCAAA	2	10	1008061	1008070	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
285	NC_021047	CTTCT	2	10	1020627	1020636	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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289	NC_021047	GGGAG	2	10	1059187	1059196	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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