MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Enterobacter cloacae subsp. cloacae NCTC 9394 draft genome

Total Repeats: 3345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021046	CGCTG	2	10	945	954	0 %	20 %	40 %	40 %	479270913
2	NC_021046	TGCGA	2	10	2360	2369	20 %	20 %	40 %	20 %	479270915
3	NC_021046	AAGAT	2	10	2872	2881	60 %	20 %	20 %	0 %	479270916
4	NC_021046	GTTTT	2	10	4437	4446	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021046	GAAGG	2	10	6749	6758	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021046	CGTCA	2	10	9883	9892	20 %	20 %	20 %	40 %	479270919
7	NC_021046	AAGCG	2	10	11015	11024	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021046	CAGGG	2	10	13254	13263	20 %	0 %	60 %	20 %	479270920
9	NC_021046	ACTTC	2	10	15274	15283	20 %	40 %	0 %	40 %	479270921
10	NC_021046	GGCTG	2	10	15375	15384	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021046	TGAAC	2	10	16539	16548	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021046	TGCGC	2	10	16728	16737	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_021046	ACGCC	2	10	19313	19322	20 %	0 %	20 %	60 %	479270923
14	NC_021046	CAGGC	2	10	22007	22016	20 %	0 %	40 %	40 %	479270925
15	NC_021046	CGCGG	2	10	24932	24941	0 %	0 %	60 %	40 %	479270927
16	NC_021046	GGGCA	2	10	27610	27619	20 %	0 %	60 %	20 %	479270930
17	NC_021046	GCCCG	2	10	28141	28150	0 %	0 %	40 %	60 %	479270930
18	NC_021046	CCTTT	2	10	28259	28268	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_021046	CGCTG	2	10	29436	29445	0 %	20 %	40 %	40 %	479270932
20	NC_021046	GCAGA	2	10	32901	32910	40 %	0 %	40 %	20 %	479270937
21	NC_021046	GCGAG	2	10	33108	33117	20 %	0 %	60 %	20 %	479270938
22	NC_021046	TGCAG	2	10	33309	33318	20 %	20 %	40 %	20 %	479270938
23	NC_021046	CCAGC	2	10	36245	36254	20 %	0 %	20 %	60 %	479270941
24	NC_021046	GCTGA	2	10	36383	36392	20 %	20 %	40 %	20 %	479270941
25	NC_021046	GCACC	2	10	36409	36418	20 %	0 %	20 %	60 %	479270941
26	NC_021046	GCGAT	2	10	38148	38157	20 %	20 %	40 %	20 %	479270942
27	NC_021046	CTGAA	2	10	40067	40076	40 %	20 %	20 %	20 %	479270943
28	NC_021046	CTGGC	2	10	41759	41768	0 %	20 %	40 %	40 %	479270945
29	NC_021046	ATACC	2	10	43270	43279	40 %	20 %	0 %	40 %	479270946
30	NC_021046	GCCAG	2	10	45208	45217	20 %	0 %	40 %	40 %	479270948
31	NC_021046	ACCCC	2	10	45229	45238	20 %	0 %	0 %	80 %	479270948
32	NC_021046	TCGCG	2	10	47440	47449	0 %	20 %	40 %	40 %	479270951
33	NC_021046	CAGCA	2	10	49510	49519	40 %	0 %	20 %	40 %	479270952
34	NC_021046	CGGGC	2	10	50014	50023	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021046	GGTGC	2	10	53288	53297	0 %	20 %	60 %	20 %	479270956
36	NC_021046	CGTCG	2	10	53708	53717	0 %	20 %	40 %	40 %	479270956
37	NC_021046	GCGAG	2	10	53746	53755	20 %	0 %	60 %	20 %	479270956
38	NC_021046	CAGCA	2	10	53805	53814	40 %	0 %	20 %	40 %	479270956
39	NC_021046	TGGCG	2	10	56983	56992	0 %	20 %	60 %	20 %	479270959
40	NC_021046	TGTGG	2	10	62409	62418	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021046	GCTCA	2	10	62421	62430	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_021046	GAAAA	2	10	65409	65418	80 %	0 %	20 %	0 %	479270967
43	NC_021046	CTGGC	2	10	69550	69559	0 %	20 %	40 %	40 %	479270971
44	NC_021046	CCTGA	2	10	69831	69840	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_021046	TGCGT	2	10	72327	72336	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021046	TGGCA	2	10	72539	72548	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021046	GCAGC	2	10	72795	72804	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_021046	AGGCG	2	10	73993	74002	20 %	0 %	60 %	20 %	479270974
49	NC_021046	CAGCT	2	10	74507	74516	20 %	20 %	20 %	40 %	479270975
50	NC_021046	GCTTT	2	10	75265	75274	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021046	TGGCC	2	10	77969	77978	0 %	20 %	40 %	40 %	479270979
52	NC_021046	ACCGC	2	10	78654	78663	20 %	0 %	20 %	60 %	479270980
53	NC_021046	CACTT	2	10	79464	79473	20 %	40 %	0 %	40 %	479270980
54	NC_021046	CAGGG	2	10	83121	83130	20 %	0 %	60 %	20 %	479270985
55	NC_021046	TGTAC	2	10	83995	84004	20 %	40 %	20 %	20 %	479270986
56	NC_021046	TGGCC	2	10	85537	85546	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_021046	GTACG	2	10	86099	86108	20 %	20 %	40 %	20 %	479270987
58	NC_021046	CACTT	2	10	87933	87942	20 %	40 %	0 %	40 %	479270989
59	NC_021046	GTTCC	2	10	88624	88633	0 %	40 %	20 %	40 %	479270989
60	NC_021046	GGGCA	2	10	89798	89807	20 %	0 %	60 %	20 %	479270989
61	NC_021046	GGGCA	2	10	90071	90080	20 %	0 %	60 %	20 %	479270989
62	NC_021046	CCGTT	2	10	94245	94254	0 %	40 %	20 %	40 %	479270993
63	NC_021046	CACAA	2	10	94931	94940	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021046	AGGTA	2	10	94965	94974	40 %	20 %	40 %	0 %	479270994
65	NC_021046	ACCTG	2	10	95236	95245	20 %	20 %	20 %	40 %	479270994
66	NC_021046	GTAAA	2	10	95861	95870	60 %	20 %	20 %	0 %	479270994
67	NC_021046	CTGGG	2	10	96891	96900	0 %	20 %	60 %	20 %	479270995
68	NC_021046	AGCGC	2	10	98256	98265	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_021046	ACGGT	2	10	101305	101314	20 %	20 %	40 %	20 %	479270998
70	NC_021046	CGGCC	2	10	102792	102801	0 %	0 %	40 %	60 %	479270999
71	NC_021046	TGCCG	2	10	104201	104210	0 %	20 %	40 %	40 %	479271000
72	NC_021046	AGCGC	2	10	105602	105611	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_021046	TGCTA	2	10	107277	107286	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021046	GATCA	2	10	109012	109021	40 %	20 %	20 %	20 %	479271004
75	NC_021046	AACCG	2	10	109225	109234	40 %	0 %	20 %	40 %	479271004
76	NC_021046	TGGCA	2	10	109621	109630	20 %	20 %	40 %	20 %	479271004
77	NC_021046	GTCAG	2	10	110479	110488	20 %	20 %	40 %	20 %	479271006
78	NC_021046	CCTGC	2	10	114869	114878	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_021046	TCGGT	2	10	117840	117849	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021046	TAAGG	2	10	119484	119493	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021046	CCGAC	2	10	122800	122809	20 %	0 %	20 %	60 %	479271008
82	NC_021046	CCGCG	2	10	123728	123737	0 %	0 %	40 %	60 %	479271009
83	NC_021046	GAGAT	2	10	124519	124528	40 %	20 %	40 %	0 %	479271009
84	NC_021046	AGCTC	2	10	125165	125174	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_021046	TCGAA	2	10	126582	126591	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021046	CCGCC	2	10	127183	127192	0 %	0 %	20 %	80 %	479271012
87	NC_021046	GCTTT	2	10	128040	128049	0 %	60 %	20 %	20 %	479271013
88	NC_021046	CTGGT	2	10	130773	130782	0 %	40 %	40 %	20 %	479271016
89	NC_021046	GCGTG	2	10	131964	131973	0 %	20 %	60 %	20 %	479271017
90	NC_021046	CAAAC	2	10	132305	132314	60 %	0 %	0 %	40 %	479271017
91	NC_021046	CGATC	2	10	133792	133801	20 %	20 %	20 %	40 %	479271020
92	NC_021046	TGGGC	2	10	134898	134907	0 %	20 %	60 %	20 %	479271021
93	NC_021046	GCCCT	2	10	135516	135525	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_021046	AAGCG	2	10	136406	136415	40 %	0 %	40 %	20 %	479271022
95	NC_021046	ACCAG	2	10	140317	140326	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_021046	GCCAG	2	10	140710	140719	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_021046	ACGGA	2	10	145073	145082	40 %	0 %	40 %	20 %	479271025
98	NC_021046	ACGGA	2	10	146273	146282	40 %	0 %	40 %	20 %	479271025
99	NC_021046	TCACT	2	10	147732	147741	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_021046	ACCTG	2	10	148201	148210	20 %	20 %	20 %	40 %	479271028
101	NC_021046	TGATC	2	10	148370	148379	20 %	40 %	20 %	20 %	479271028
102	NC_021046	GAAGT	2	10	151395	151404	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021046	GATCT	2	10	154045	154054	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021046	CGGTG	2	10	156646	156655	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021046	GCCAG	2	10	159670	159679	20 %	0 %	40 %	40 %	479271036
106	NC_021046	CGGTC	2	10	159973	159982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_021046	CCGCT	2	10	165359	165368	0 %	20 %	20 %	60 %	479271041
108	NC_021046	TGCCA	2	10	166186	166195	20 %	20 %	20 %	40 %	479271042
109	NC_021046	GCGCA	2	10	167438	167447	20 %	0 %	40 %	40 %	479271042
110	NC_021046	GCGCC	2	10	167617	167626	0 %	0 %	40 %	60 %	479271042
111	NC_021046	AGCGC	2	10	168993	169002	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_021046	TCTTT	2	10	170131	170140	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_021046	AAGCG	2	10	171476	171485	40 %	0 %	40 %	20 %	479271046
114	NC_021046	CACGC	2	10	173269	173278	20 %	0 %	20 %	60 %	479271047
115	NC_021046	TCATC	2	10	173954	173963	20 %	40 %	0 %	40 %	479271048
116	NC_021046	ACCAG	2	10	174530	174539	40 %	0 %	20 %	40 %	479271049
117	NC_021046	GTTGC	2	10	176352	176361	0 %	40 %	40 %	20 %	479271052
118	NC_021046	GCGCG	2	10	177054	177063	0 %	0 %	60 %	40 %	479271052
119	NC_021046	TGCTG	2	10	183815	183824	0 %	40 %	40 %	20 %	479271059
120	NC_021046	CACGC	2	10	184443	184452	20 %	0 %	20 %	60 %	479271059
121	NC_021046	AGCGC	2	10	186167	186176	20 %	0 %	40 %	40 %	479271060
122	NC_021046	AAAAG	2	10	188246	188255	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021046	TCCAC	2	10	190319	190328	20 %	20 %	0 %	60 %	479271063
124	NC_021046	GCCCG	2	10	190362	190371	0 %	0 %	40 %	60 %	479271063
125	NC_021046	AGCCC	2	10	193631	193640	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_021046	CCAGA	2	10	193659	193668	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_021046	CAGCG	2	10	193926	193935	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_021046	CGCGG	2	10	196412	196421	0 %	0 %	60 %	40 %	479271067
129	NC_021046	TATCT	2	10	196547	196556	20 %	60 %	0 %	20 %	479271067
130	NC_021046	GCGTC	2	10	197746	197755	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_021046	AGCGC	2	10	202453	202462	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_021046	GTCAT	2	10	205954	205963	20 %	40 %	20 %	20 %	479271072
133	NC_021046	CGGTT	2	10	206545	206554	0 %	40 %	40 %	20 %	479271073
134	NC_021046	TGCCC	2	10	207709	207718	0 %	20 %	20 %	60 %	479271075
135	NC_021046	CGCGC	2	10	208537	208546	0 %	0 %	40 %	60 %	479271076
136	NC_021046	ACGGC	2	10	208782	208791	20 %	0 %	40 %	40 %	479271076
137	NC_021046	GTTGC	2	10	209864	209873	0 %	40 %	40 %	20 %	479271077
138	NC_021046	GTGAG	2	10	211036	211045	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021046	CAGAA	2	10	212584	212593	60 %	0 %	20 %	20 %	479271078
140	NC_021046	TCGCG	2	10	213444	213453	0 %	20 %	40 %	40 %	479271080
141	NC_021046	GACGT	2	10	214284	214293	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021046	AGCTG	2	10	214870	214879	20 %	20 %	40 %	20 %	479271081
143	NC_021046	TGCCG	2	10	215407	215416	0 %	20 %	40 %	40 %	479271081
144	NC_021046	AGTGG	2	10	215961	215970	20 %	20 %	60 %	0 %	479271082
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146	NC_021046	TCAAT	2	10	219407	219416	40 %	40 %	0 %	20 %	479271084
147	NC_021046	GCGAA	2	10	225433	225442	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_021046	GCGGA	2	10	231809	231818	20 %	0 %	60 %	20 %	479271092
149	NC_021046	AACAG	2	10	232844	232853	60 %	0 %	20 %	20 %	479271094
150	NC_021046	GCAGG	2	10	232974	232983	20 %	0 %	60 %	20 %	479271094
151	NC_021046	TGGCC	2	10	233171	233180	0 %	20 %	40 %	40 %	479271094
152	NC_021046	ACTGA	2	10	234929	234938	40 %	20 %	20 %	20 %	479271095
153	NC_021046	GGTCT	2	10	234980	234989	0 %	40 %	40 %	20 %	479271095
154	NC_021046	CGGCT	2	10	235779	235788	0 %	20 %	40 %	40 %	479271096
155	NC_021046	CAATA	2	10	239052	239061	60 %	20 %	0 %	20 %	479271099
156	NC_021046	GAACG	2	10	239822	239831	40 %	0 %	40 %	20 %	479271099
157	NC_021046	CAGGA	2	10	241229	241238	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
158	NC_021046	CCAAC	2	10	241723	241732	40 %	0 %	0 %	60 %	479271103
159	NC_021046	AGGCC	2	10	242171	242180	20 %	0 %	40 %	40 %	479271103
160	NC_021046	ATGAA	2	10	243307	243316	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021046	CGCCA	2	10	245697	245706	20 %	0 %	20 %	60 %	479271104
162	NC_021046	CGGCA	2	10	247440	247449	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_021046	CTTCC	2	10	247724	247733	0 %	40 %	0 %	60 %	479271105
164	NC_021046	CGCTT	2	10	250391	250400	0 %	40 %	20 %	40 %	479271107
165	NC_021046	GACGC	2	10	251794	251803	20 %	0 %	40 %	40 %	479271108
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187	NC_021046	CTGGC	2	10	287716	287725	0 %	20 %	40 %	40 %	479271137
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198	NC_021046	CCAAT	2	10	310981	310990	40 %	20 %	0 %	40 %	479271150
199	NC_021046	AAAGC	2	10	312520	312529	60 %	0 %	20 %	20 %	479271151
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203	NC_021046	TAATG	2	10	317028	317037	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_021046	CGGTG	2	10	356945	356954	0 %	20 %	60 %	20 %	479271190
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239	NC_021046	TGCTG	2	10	363541	363550	0 %	40 %	40 %	20 %	479271195
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243	NC_021046	CCACG	2	10	373200	373209	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
244	NC_021046	GCCCG	2	10	373218	373227	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
245	NC_021046	AGCAG	2	10	374674	374683	40 %	0 %	40 %	20 %	479271205
246	NC_021046	CGGCG	2	10	376760	376769	0 %	0 %	60 %	40 %	479271206
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249	NC_021046	GCGCC	2	10	379815	379824	0 %	0 %	40 %	60 %	479271210
250	NC_021046	GCCCG	2	10	380845	380854	0 %	0 %	40 %	60 %	479271210
251	NC_021046	GGGCA	2	10	383495	383504	20 %	0 %	60 %	20 %	479271213
252	NC_021046	CGCGC	2	10	385309	385318	0 %	0 %	40 %	60 %	479271215
253	NC_021046	TGCTG	2	10	385869	385878	0 %	40 %	40 %	20 %	479271215
254	NC_021046	GGCGC	2	10	386362	386371	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
255	NC_021046	GTGAG	2	10	388119	388128	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
256	NC_021046	GGCCG	2	10	390658	390667	0 %	0 %	60 %	40 %	479271218
257	NC_021046	GCCAG	2	10	391130	391139	20 %	0 %	40 %	40 %	479271219
258	NC_021046	GCCGC	2	10	393068	393077	0 %	0 %	40 %	60 %	479271222
259	NC_021046	CCCGG	2	10	393319	393328	0 %	0 %	40 %	60 %	479271222
260	NC_021046	TAAAC	2	10	394733	394742	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
261	NC_021046	GCACA	2	10	398527	398536	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
262	NC_021046	GCAAA	2	10	406912	406921	60 %	0 %	20 %	20 %	479271233
263	NC_021046	CGCGC	2	10	411115	411124	0 %	0 %	40 %	60 %	479271236
264	NC_021046	AGTAA	2	10	411681	411690	60 %	20 %	20 %	0 %	479271236
265	NC_021046	AACGG	2	10	413876	413885	40 %	0 %	40 %	20 %	479271238
266	NC_021046	CGCAA	2	10	415939	415948	40 %	0 %	20 %	40 %	479271239
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268	NC_021046	GCCTG	2	10	417947	417956	0 %	20 %	40 %	40 %	479271240
269	NC_021046	CTGAT	2	10	418036	418045	20 %	40 %	20 %	20 %	479271240
270	NC_021046	AGCTC	2	10	418217	418226	20 %	20 %	20 %	40 %	479271240
271	NC_021046	TCTGT	2	10	419135	419144	0 %	60 %	20 %	20 %	479271241
272	NC_021046	CTCAC	2	10	419940	419949	20 %	20 %	0 %	60 %	479271241
273	NC_021046	CAGGT	2	10	421220	421229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
274	NC_021046	AAGCG	2	10	422769	422778	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
275	NC_021046	CCAGC	2	10	423481	423490	20 %	0 %	20 %	60 %	479271244
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278	NC_021046	CTGTT	2	10	434348	434357	0 %	60 %	20 %	20 %	479271252
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284	NC_021046	TGCAG	2	10	442840	442849	20 %	20 %	40 %	20 %	479271259
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288	NC_021046	CATTC	2	10	446527	446536	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
289	NC_021046	GAGGT	2	10	447231	447240	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_021046	CTGTT	2	10	450830	450839	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_021046	TCTGG	2	10	451584	451593	0 %	40 %	40 %	20 %	479271268
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