MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 3198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021040	TTTTG	2	10	126	135	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021040	CAAAT	2	10	728	737	60 %	20 %	0 %	20 %	479201825
3	NC_021040	TCATA	2	10	2442	2451	40 %	40 %	0 %	20 %	479201826
4	NC_021040	TAAAA	2	10	3414	3423	80 %	20 %	0 %	0 %	479201827
5	NC_021040	TTTAA	2	10	4514	4523	40 %	60 %	0 %	0 %	479201828
6	NC_021040	TATAA	2	10	5299	5308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021040	AATAG	2	10	5669	5678	60 %	20 %	20 %	0 %	479201829
8	NC_021040	AATTG	2	10	5719	5728	40 %	40 %	20 %	0 %	479201829
9	NC_021040	ATTTA	2	10	6003	6012	40 %	60 %	0 %	0 %	479201829
10	NC_021040	AAATA	2	10	6622	6631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021040	TGTTA	2	10	7770	7779	20 %	60 %	20 %	0 %	479201833
12	NC_021040	AATGG	2	10	8153	8162	40 %	20 %	40 %	0 %	479201835
13	NC_021040	ATATT	2	10	8989	8998	40 %	60 %	0 %	0 %	479201835
14	NC_021040	ATTAT	2	10	9268	9277	40 %	60 %	0 %	0 %	479201835
15	NC_021040	TGGAA	2	10	9678	9687	40 %	20 %	40 %	0 %	479201836
16	NC_021040	AGAAA	2	10	12108	12117	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021040	ATCAA	2	10	12186	12195	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021040	ATATT	2	10	12806	12815	40 %	60 %	0 %	0 %	479201839
19	NC_021040	AGGCT	2	10	13124	13133	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021040	GGAAA	2	10	13441	13450	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021040	TCAAA	2	10	15943	15952	60 %	20 %	0 %	20 %	479201843
22	NC_021040	AAGAG	2	10	20501	20510	60 %	0 %	40 %	0 %	479201845
23	NC_021040	GAAAT	2	10	24837	24846	60 %	20 %	20 %	0 %	479201850
24	NC_021040	GAAAT	2	10	29073	29082	60 %	20 %	20 %	0 %	479201853
25	NC_021040	TGGTA	2	10	31200	31209	20 %	40 %	40 %	0 %	479201855
26	NC_021040	ACTGA	2	10	31860	31869	40 %	20 %	20 %	20 %	479201856
27	NC_021040	AGATG	2	10	33404	33413	40 %	20 %	40 %	0 %	479201856
28	NC_021040	ATACG	2	10	33884	33893	40 %	20 %	20 %	20 %	479201856
29	NC_021040	CAATA	2	10	35552	35561	60 %	20 %	0 %	20 %	479201858
30	NC_021040	TTATC	2	10	36020	36029	20 %	60 %	0 %	20 %	479201859
31	NC_021040	ACAAA	2	10	37662	37671	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021040	GCAGA	2	10	38259	38268	40 %	0 %	40 %	20 %	479201861
33	NC_021040	TGGAC	2	10	38559	38568	20 %	20 %	40 %	20 %	479201862
34	NC_021040	CAGGT	2	10	39658	39667	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021040	ATATT	2	10	40814	40823	40 %	60 %	0 %	0 %	479201864
36	NC_021040	AGATT	2	10	42985	42994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021040	CATGT	2	10	48301	48310	20 %	40 %	20 %	20 %	479201868
38	NC_021040	TAATA	2	10	55737	55746	60 %	40 %	0 %	0 %	479201873
39	NC_021040	ATACC	2	10	56280	56289	40 %	20 %	0 %	40 %	479201874
40	NC_021040	CGACA	2	10	56713	56722	40 %	0 %	20 %	40 %	479201874
41	NC_021040	GAAAC	2	10	57215	57224	60 %	0 %	20 %	20 %	479201875
42	NC_021040	TTGCA	2	10	60965	60974	20 %	40 %	20 %	20 %	479201879
43	NC_021040	ATGGG	2	10	63226	63235	20 %	20 %	60 %	0 %	479201881
44	NC_021040	GAAAT	2	10	63550	63559	60 %	20 %	20 %	0 %	479201882
45	NC_021040	CATTT	2	10	63899	63908	20 %	60 %	0 %	20 %	479201882
46	NC_021040	GATGC	2	10	64355	64364	20 %	20 %	40 %	20 %	479201882
47	NC_021040	TTCCG	2	10	65882	65891	0 %	40 %	20 %	40 %	479201884
48	NC_021040	GTTAT	2	10	66530	66539	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021040	TGATC	2	10	67785	67794	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021040	TACAG	2	10	68714	68723	40 %	20 %	20 %	20 %	479201886
51	NC_021040	GACTT	2	10	69837	69846	20 %	40 %	20 %	20 %	479201886
52	NC_021040	ACGAT	2	10	70329	70338	40 %	20 %	20 %	20 %	479201886
53	NC_021040	AAAAT	2	10	70620	70629	80 %	20 %	0 %	0 %	479201886
54	NC_021040	AGAAT	2	10	72488	72497	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021040	GCAGC	2	10	78087	78096	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021040	ACGGA	2	10	78117	78126	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021040	ATTAA	2	10	79071	79080	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021040	GCACT	2	10	79205	79214	20 %	20 %	20 %	40 %	479201896
59	NC_021040	TGCAC	2	10	79276	79285	20 %	20 %	20 %	40 %	479201896
60	NC_021040	AAAAG	2	10	80713	80722	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021040	AAAAT	2	10	84107	84116	80 %	20 %	0 %	0 %	479201897
62	NC_021040	AACAG	2	10	84967	84976	60 %	0 %	20 %	20 %	479201899
63	NC_021040	ATCTG	2	10	87675	87684	20 %	40 %	20 %	20 %	479201899
64	NC_021040	GGAAT	2	10	88922	88931	40 %	20 %	40 %	0 %	479201900
65	NC_021040	TGAGA	2	10	89636	89645	40 %	20 %	40 %	0 %	479201900
66	NC_021040	CGGTT	2	10	89714	89723	0 %	40 %	40 %	20 %	479201900
67	NC_021040	AAATA	2	10	90216	90225	80 %	20 %	0 %	0 %	479201900
68	NC_021040	GACAT	2	10	90369	90378	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021040	TTGGA	2	10	91061	91070	20 %	40 %	40 %	0 %	479201901
70	NC_021040	AGAAT	2	10	95123	95132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021040	TTATT	2	10	95666	95675	20 %	80 %	0 %	0 %	479201905
72	NC_021040	TGACC	2	10	98126	98135	20 %	20 %	20 %	40 %	479201907
73	NC_021040	CAGTA	2	10	98353	98362	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021040	ATTCA	2	10	98599	98608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021040	GCACA	2	10	103323	103332	40 %	0 %	20 %	40 %	479201912
76	NC_021040	CAACC	2	10	106634	106643	40 %	0 %	0 %	60 %	479201915
77	NC_021040	ATGGC	2	10	107306	107315	20 %	20 %	40 %	20 %	479201915
78	NC_021040	CCGAA	2	10	108015	108024	40 %	0 %	20 %	40 %	479201915
79	NC_021040	AAGAG	2	10	108964	108973	60 %	0 %	40 %	0 %	479201915
80	NC_021040	GGCGG	2	10	109392	109401	0 %	0 %	80 %	20 %	479201916
81	NC_021040	GACAG	2	10	111098	111107	40 %	0 %	40 %	20 %	479201916
82	NC_021040	TGGTC	2	10	113534	113543	0 %	40 %	40 %	20 %	479201917
83	NC_021040	CATTA	2	10	113654	113663	40 %	40 %	0 %	20 %	479201917
84	NC_021040	GAAAA	2	10	114832	114841	80 %	0 %	20 %	0 %	479201917
85	NC_021040	ATACC	2	10	116762	116771	40 %	20 %	0 %	40 %	479201919
86	NC_021040	TACTT	2	10	116809	116818	20 %	60 %	0 %	20 %	479201919
87	NC_021040	AGTAA	2	10	120195	120204	60 %	20 %	20 %	0 %	479201923
88	NC_021040	CATGC	2	10	120270	120279	20 %	20 %	20 %	40 %	479201923
89	NC_021040	TACAG	2	10	120503	120512	40 %	20 %	20 %	20 %	479201923
90	NC_021040	TAAAA	2	10	120838	120847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021040	AATCC	2	10	125629	125638	40 %	20 %	0 %	40 %	479201926
92	NC_021040	AGAAA	2	10	125971	125980	80 %	0 %	20 %	0 %	479201926
93	NC_021040	GTCTT	2	10	127646	127655	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021040	GATAT	2	10	127690	127699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021040	ACCGC	2	10	128576	128585	20 %	0 %	20 %	60 %	479201928
96	NC_021040	CTGAA	2	10	128735	128744	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021040	TCAGA	2	10	135242	135251	40 %	20 %	20 %	20 %	479201933
98	NC_021040	GGTGA	2	10	136165	136174	20 %	20 %	60 %	0 %	479201934
99	NC_021040	TGATT	2	10	139619	139628	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021040	CGTCC	2	10	139766	139775	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_021040	GGTTT	2	10	141379	141388	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021040	ACAGC	2	10	141927	141936	40 %	0 %	20 %	40 %	479201938
103	NC_021040	ATCAT	2	10	147887	147896	40 %	40 %	0 %	20 %	479201943
104	NC_021040	CCACA	2	10	148261	148270	40 %	0 %	0 %	60 %	479201943
105	NC_021040	AAAAG	2	10	148313	148322	80 %	0 %	20 %	0 %	479201943
106	NC_021040	TGGAC	2	10	150383	150392	20 %	20 %	40 %	20 %	479201945
107	NC_021040	TCCTC	2	10	151443	151452	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_021040	TCCTC	2	10	151496	151505	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_021040	ATTAA	2	10	152910	152919	60 %	40 %	0 %	0 %	479201946
110	NC_021040	GAAAA	2	10	154418	154427	80 %	0 %	20 %	0 %	479201948
111	NC_021040	AAAAT	2	10	154704	154713	80 %	20 %	0 %	0 %	479201949
112	NC_021040	GAGAT	2	10	156295	156304	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021040	CAATG	2	10	156854	156863	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021040	AGAAA	2	10	157127	157136	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021040	CATAT	2	10	159290	159299	40 %	40 %	0 %	20 %	479201954
116	NC_021040	CAATG	2	10	159529	159538	40 %	20 %	20 %	20 %	479201954
117	NC_021040	ACGGA	2	10	159627	159636	40 %	0 %	40 %	20 %	479201954
118	NC_021040	AAAAT	2	10	160496	160505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021040	TCATA	2	10	161026	161035	40 %	40 %	0 %	20 %	479201956
120	NC_021040	CCACA	2	10	161766	161775	40 %	0 %	0 %	60 %	479201957
121	NC_021040	AGGGC	2	10	162567	162576	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021040	GCGGA	2	10	163237	163246	20 %	0 %	60 %	20 %	479201959
123	NC_021040	GGAAT	2	10	163263	163272	40 %	20 %	40 %	0 %	479201959
124	NC_021040	ATCCG	2	10	163531	163540	20 %	20 %	20 %	40 %	479201959
125	NC_021040	GGAAA	2	10	165697	165706	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021040	TTCAC	2	10	166314	166323	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_021040	TTCCA	2	10	166361	166370	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_021040	ATATG	2	10	166685	166694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021040	ATTTT	2	10	167447	167456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021040	TTATT	2	10	168475	168484	20 %	80 %	0 %	0 %	479201963
131	NC_021040	AAATA	2	10	169757	169766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021040	AAAGC	2	10	170809	170818	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021040	TGGTA	2	10	171284	171293	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021040	AAAGG	2	10	171669	171678	60 %	0 %	40 %	0 %	479201964
135	NC_021040	ATTTT	2	10	175428	175437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021040	AGAAA	2	10	176968	176977	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021040	GAAGA	2	10	181736	181745	60 %	0 %	40 %	0 %	479201974
138	NC_021040	GAAAA	2	10	181842	181851	80 %	0 %	20 %	0 %	479201974
139	NC_021040	AAAAG	2	10	182004	182013	80 %	0 %	20 %	0 %	479201974
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252	NC_021040	CAGCG	2	10	339012	339021	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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254	NC_021040	AGCGG	2	10	340514	340523	20 %	0 %	60 %	20 %	479202114
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256	NC_021040	TGGTA	2	10	342199	342208	20 %	40 %	40 %	0 %	479202116
257	NC_021040	GAAGA	2	10	345624	345633	60 %	0 %	40 %	0 %	479202120
258	NC_021040	TGCGG	2	10	345859	345868	0 %	20 %	60 %	20 %	479202120
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260	NC_021040	TATAT	2	10	346942	346951	40 %	60 %	0 %	0 %	479202121
261	NC_021040	TAATC	2	10	347133	347142	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
262	NC_021040	TTTTC	2	10	347549	347558	0 %	80 %	0 %	20 %	479202122
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264	NC_021040	GGGAG	2	10	350937	350946	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
265	NC_021040	CCGTA	2	10	352036	352045	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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268	NC_021040	GAAAA	2	10	355066	355075	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
269	NC_021040	AAGGT	2	10	356182	356191	40 %	20 %	40 %	0 %	479202126
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271	NC_021040	GAAAA	2	10	358915	358924	80 %	0 %	20 %	0 %	479202127
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273	NC_021040	GGCAG	2	10	360259	360268	20 %	0 %	60 %	20 %	479202127
274	NC_021040	CAGAC	2	10	363278	363287	40 %	0 %	20 %	40 %	479202129
275	NC_021040	GAAAA	2	10	366726	366735	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
276	NC_021040	GAATG	2	10	368512	368521	40 %	20 %	40 %	0 %	479202131
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301	NC_021040	AGCAT	2	10	402741	402750	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_021040	CGATA	2	10	532917	532926	40 %	20 %	20 %	20 %	479202265
404	NC_021040	CAATC	2	10	534075	534084	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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407	NC_021040	ACGGT	2	10	538514	538523	20 %	20 %	40 %	20 %	479202273
408	NC_021040	GCGCA	2	10	538648	538657	20 %	0 %	40 %	40 %	479202273
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