MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 2313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021040	CAAAT	2	10	728	737	60 %	20 %	0 %	20 %	479201825
2	NC_021040	TCATA	2	10	2442	2451	40 %	40 %	0 %	20 %	479201826
3	NC_021040	TAAAA	2	10	3414	3423	80 %	20 %	0 %	0 %	479201827
4	NC_021040	TTTAA	2	10	4514	4523	40 %	60 %	0 %	0 %	479201828
5	NC_021040	AATAG	2	10	5669	5678	60 %	20 %	20 %	0 %	479201829
6	NC_021040	AATTG	2	10	5719	5728	40 %	40 %	20 %	0 %	479201829
7	NC_021040	ATTTA	2	10	6003	6012	40 %	60 %	0 %	0 %	479201829
8	NC_021040	TGTTA	2	10	7770	7779	20 %	60 %	20 %	0 %	479201833
9	NC_021040	AATGG	2	10	8153	8162	40 %	20 %	40 %	0 %	479201835
10	NC_021040	ATATT	2	10	8989	8998	40 %	60 %	0 %	0 %	479201835
11	NC_021040	ATTAT	2	10	9268	9277	40 %	60 %	0 %	0 %	479201835
12	NC_021040	TGGAA	2	10	9678	9687	40 %	20 %	40 %	0 %	479201836
13	NC_021040	ATATT	2	10	12806	12815	40 %	60 %	0 %	0 %	479201839
14	NC_021040	TCAAA	2	10	15943	15952	60 %	20 %	0 %	20 %	479201843
15	NC_021040	AAGAG	2	10	20501	20510	60 %	0 %	40 %	0 %	479201845
16	NC_021040	GAAAT	2	10	24837	24846	60 %	20 %	20 %	0 %	479201850
17	NC_021040	GAAAT	2	10	29073	29082	60 %	20 %	20 %	0 %	479201853
18	NC_021040	TGGTA	2	10	31200	31209	20 %	40 %	40 %	0 %	479201855
19	NC_021040	ACTGA	2	10	31860	31869	40 %	20 %	20 %	20 %	479201856
20	NC_021040	AGATG	2	10	33404	33413	40 %	20 %	40 %	0 %	479201856
21	NC_021040	ATACG	2	10	33884	33893	40 %	20 %	20 %	20 %	479201856
22	NC_021040	CAATA	2	10	35552	35561	60 %	20 %	0 %	20 %	479201858
23	NC_021040	TTATC	2	10	36020	36029	20 %	60 %	0 %	20 %	479201859
24	NC_021040	GCAGA	2	10	38259	38268	40 %	0 %	40 %	20 %	479201861
25	NC_021040	TGGAC	2	10	38559	38568	20 %	20 %	40 %	20 %	479201862
26	NC_021040	ATATT	2	10	40814	40823	40 %	60 %	0 %	0 %	479201864
27	NC_021040	CATGT	2	10	48301	48310	20 %	40 %	20 %	20 %	479201868
28	NC_021040	TAATA	2	10	55737	55746	60 %	40 %	0 %	0 %	479201873
29	NC_021040	ATACC	2	10	56280	56289	40 %	20 %	0 %	40 %	479201874
30	NC_021040	CGACA	2	10	56713	56722	40 %	0 %	20 %	40 %	479201874
31	NC_021040	GAAAC	2	10	57215	57224	60 %	0 %	20 %	20 %	479201875
32	NC_021040	TTGCA	2	10	60965	60974	20 %	40 %	20 %	20 %	479201879
33	NC_021040	ATGGG	2	10	63226	63235	20 %	20 %	60 %	0 %	479201881
34	NC_021040	GAAAT	2	10	63550	63559	60 %	20 %	20 %	0 %	479201882
35	NC_021040	CATTT	2	10	63899	63908	20 %	60 %	0 %	20 %	479201882
36	NC_021040	GATGC	2	10	64355	64364	20 %	20 %	40 %	20 %	479201882
37	NC_021040	TTCCG	2	10	65882	65891	0 %	40 %	20 %	40 %	479201884
38	NC_021040	TACAG	2	10	68714	68723	40 %	20 %	20 %	20 %	479201886
39	NC_021040	GACTT	2	10	69837	69846	20 %	40 %	20 %	20 %	479201886
40	NC_021040	ACGAT	2	10	70329	70338	40 %	20 %	20 %	20 %	479201886
41	NC_021040	AAAAT	2	10	70620	70629	80 %	20 %	0 %	0 %	479201886
42	NC_021040	GCACT	2	10	79205	79214	20 %	20 %	20 %	40 %	479201896
43	NC_021040	TGCAC	2	10	79276	79285	20 %	20 %	20 %	40 %	479201896
44	NC_021040	AAAAT	2	10	84107	84116	80 %	20 %	0 %	0 %	479201897
45	NC_021040	AACAG	2	10	84967	84976	60 %	0 %	20 %	20 %	479201899
46	NC_021040	ATCTG	2	10	87675	87684	20 %	40 %	20 %	20 %	479201899
47	NC_021040	GGAAT	2	10	88922	88931	40 %	20 %	40 %	0 %	479201900
48	NC_021040	TGAGA	2	10	89636	89645	40 %	20 %	40 %	0 %	479201900
49	NC_021040	CGGTT	2	10	89714	89723	0 %	40 %	40 %	20 %	479201900
50	NC_021040	AAATA	2	10	90216	90225	80 %	20 %	0 %	0 %	479201900
51	NC_021040	TTGGA	2	10	91061	91070	20 %	40 %	40 %	0 %	479201901
52	NC_021040	TTATT	2	10	95666	95675	20 %	80 %	0 %	0 %	479201905
53	NC_021040	TGACC	2	10	98126	98135	20 %	20 %	20 %	40 %	479201907
54	NC_021040	GCACA	2	10	103323	103332	40 %	0 %	20 %	40 %	479201912
55	NC_021040	CAACC	2	10	106634	106643	40 %	0 %	0 %	60 %	479201915
56	NC_021040	ATGGC	2	10	107306	107315	20 %	20 %	40 %	20 %	479201915
57	NC_021040	CCGAA	2	10	108015	108024	40 %	0 %	20 %	40 %	479201915
58	NC_021040	AAGAG	2	10	108964	108973	60 %	0 %	40 %	0 %	479201915
59	NC_021040	GGCGG	2	10	109392	109401	0 %	0 %	80 %	20 %	479201916
60	NC_021040	GACAG	2	10	111098	111107	40 %	0 %	40 %	20 %	479201916
61	NC_021040	TGGTC	2	10	113534	113543	0 %	40 %	40 %	20 %	479201917
62	NC_021040	CATTA	2	10	113654	113663	40 %	40 %	0 %	20 %	479201917
63	NC_021040	GAAAA	2	10	114832	114841	80 %	0 %	20 %	0 %	479201917
64	NC_021040	ATACC	2	10	116762	116771	40 %	20 %	0 %	40 %	479201919
65	NC_021040	TACTT	2	10	116809	116818	20 %	60 %	0 %	20 %	479201919
66	NC_021040	AGTAA	2	10	120195	120204	60 %	20 %	20 %	0 %	479201923
67	NC_021040	CATGC	2	10	120270	120279	20 %	20 %	20 %	40 %	479201923
68	NC_021040	TACAG	2	10	120503	120512	40 %	20 %	20 %	20 %	479201923
69	NC_021040	AATCC	2	10	125629	125638	40 %	20 %	0 %	40 %	479201926
70	NC_021040	AGAAA	2	10	125971	125980	80 %	0 %	20 %	0 %	479201926
71	NC_021040	ACCGC	2	10	128576	128585	20 %	0 %	20 %	60 %	479201928
72	NC_021040	TCAGA	2	10	135242	135251	40 %	20 %	20 %	20 %	479201933
73	NC_021040	GGTGA	2	10	136165	136174	20 %	20 %	60 %	0 %	479201934
74	NC_021040	ACAGC	2	10	141927	141936	40 %	0 %	20 %	40 %	479201938
75	NC_021040	ATCAT	2	10	147887	147896	40 %	40 %	0 %	20 %	479201943
76	NC_021040	CCACA	2	10	148261	148270	40 %	0 %	0 %	60 %	479201943
77	NC_021040	AAAAG	2	10	148313	148322	80 %	0 %	20 %	0 %	479201943
78	NC_021040	TGGAC	2	10	150383	150392	20 %	20 %	40 %	20 %	479201945
79	NC_021040	ATTAA	2	10	152910	152919	60 %	40 %	0 %	0 %	479201946
80	NC_021040	GAAAA	2	10	154418	154427	80 %	0 %	20 %	0 %	479201948
81	NC_021040	AAAAT	2	10	154704	154713	80 %	20 %	0 %	0 %	479201949
82	NC_021040	CATAT	2	10	159290	159299	40 %	40 %	0 %	20 %	479201954
83	NC_021040	CAATG	2	10	159529	159538	40 %	20 %	20 %	20 %	479201954
84	NC_021040	ACGGA	2	10	159627	159636	40 %	0 %	40 %	20 %	479201954
85	NC_021040	TCATA	2	10	161026	161035	40 %	40 %	0 %	20 %	479201956
86	NC_021040	CCACA	2	10	161766	161775	40 %	0 %	0 %	60 %	479201957
87	NC_021040	GCGGA	2	10	163237	163246	20 %	0 %	60 %	20 %	479201959
88	NC_021040	GGAAT	2	10	163263	163272	40 %	20 %	40 %	0 %	479201959
89	NC_021040	ATCCG	2	10	163531	163540	20 %	20 %	20 %	40 %	479201959
90	NC_021040	TTATT	2	10	168475	168484	20 %	80 %	0 %	0 %	479201963
91	NC_021040	AAAGG	2	10	171669	171678	60 %	0 %	40 %	0 %	479201964
92	NC_021040	GAAGA	2	10	181736	181745	60 %	0 %	40 %	0 %	479201974
93	NC_021040	GAAAA	2	10	181842	181851	80 %	0 %	20 %	0 %	479201974
94	NC_021040	AAAAG	2	10	182004	182013	80 %	0 %	20 %	0 %	479201974
95	NC_021040	AAAAT	2	10	186571	186580	80 %	20 %	0 %	0 %	479201980
96	NC_021040	AAAAG	2	10	188968	188977	80 %	0 %	20 %	0 %	479201982
97	NC_021040	AGTAA	2	10	189826	189835	60 %	20 %	20 %	0 %	479201982
98	NC_021040	GATAC	2	10	190121	190130	40 %	20 %	20 %	20 %	479201982
99	NC_021040	ATTGA	2	10	190727	190736	40 %	40 %	20 %	0 %	479201983
100	NC_021040	ATATT	2	10	192277	192286	40 %	60 %	0 %	0 %	479201985
101	NC_021040	AAAAG	2	10	193500	193509	80 %	0 %	20 %	0 %	479201985
102	NC_021040	TAAAG	2	10	193649	193658	60 %	20 %	20 %	0 %	479201985
103	NC_021040	TTTAA	2	10	193995	194004	40 %	60 %	0 %	0 %	479201985
104	NC_021040	GAAAG	2	10	196123	196132	60 %	0 %	40 %	0 %	479201987
105	NC_021040	ATTTT	2	10	196489	196498	20 %	80 %	0 %	0 %	479201988
106	NC_021040	AAAAT	2	10	197873	197882	80 %	20 %	0 %	0 %	479201989
107	NC_021040	CAGTA	2	10	200237	200246	40 %	20 %	20 %	20 %	479201992
108	NC_021040	GGCAT	2	10	205417	205426	20 %	20 %	40 %	20 %	479201997
109	NC_021040	GAACC	2	10	212433	212442	40 %	0 %	20 %	40 %	479202003
110	NC_021040	ATCCC	2	10	213519	213528	20 %	20 %	0 %	60 %	479202004
111	NC_021040	AAAAG	2	10	215826	215835	80 %	0 %	20 %	0 %	479202006
112	NC_021040	ATATT	2	10	215990	215999	40 %	60 %	0 %	0 %	479202006
113	NC_021040	TTTTG	2	10	217582	217591	0 %	80 %	20 %	0 %	479202008
114	NC_021040	AAAGA	2	10	218049	218058	80 %	0 %	20 %	0 %	479202008
115	NC_021040	AGAAA	2	10	220486	220495	80 %	0 %	20 %	0 %	479202009
116	NC_021040	AAATG	2	10	220602	220611	60 %	20 %	20 %	0 %	479202009
117	NC_021040	TGGAA	2	10	221409	221418	40 %	20 %	40 %	0 %	479202009
118	NC_021040	TGTGC	2	10	225736	225745	0 %	40 %	40 %	20 %	479202011
119	NC_021040	ATTTT	2	10	227745	227754	20 %	80 %	0 %	0 %	479202014
120	NC_021040	AAGAT	2	10	229371	229380	60 %	20 %	20 %	0 %	479202015
121	NC_021040	TAAAA	2	10	229883	229892	80 %	20 %	0 %	0 %	479202016
122	NC_021040	ATTTC	2	10	230113	230122	20 %	60 %	0 %	20 %	479202017
123	NC_021040	GTAAA	2	10	230708	230717	60 %	20 %	20 %	0 %	479202017
124	NC_021040	GGATC	2	10	231577	231586	20 %	20 %	40 %	20 %	479202017
125	NC_021040	TAAAA	2	10	232328	232337	80 %	20 %	0 %	0 %	479202017
126	NC_021040	CGGGA	2	10	233642	233651	20 %	0 %	60 %	20 %	479202019
127	NC_021040	CAGAA	2	10	234078	234087	60 %	0 %	20 %	20 %	479202020
128	NC_021040	CAGAT	2	10	236719	236728	40 %	20 %	20 %	20 %	479202022
129	NC_021040	GACGG	2	10	239739	239748	20 %	0 %	60 %	20 %	479202026
130	NC_021040	CAATG	2	10	240363	240372	40 %	20 %	20 %	20 %	479202026
131	NC_021040	GTGAT	2	10	241162	241171	20 %	40 %	40 %	0 %	479202027
132	NC_021040	GAAAA	2	10	241403	241412	80 %	0 %	20 %	0 %	479202028
133	NC_021040	GAAAA	2	10	242347	242356	80 %	0 %	20 %	0 %	479202029
134	NC_021040	GATTT	2	10	243785	243794	20 %	60 %	20 %	0 %	479202030
135	NC_021040	TGGCT	2	10	243811	243820	0 %	40 %	40 %	20 %	479202030
136	NC_021040	GCAGA	2	10	245130	245139	40 %	0 %	40 %	20 %	479202031
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