MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 11514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021040	ATT	3	9	8	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021040	TGA	2	6	52	57	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021040	GAA	2	6	59	64	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021040	TAT	2	6	71	76	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021040	ATT	2	6	150	155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021040	AGT	2	6	398	403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021040	CAA	2	6	463	468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021040	GAT	2	6	487	492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021040	ATA	2	6	526	531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021040	TAG	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021040	GAA	2	6	594	599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021040	AAT	2	6	604	609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021040	GAA	2	6	2598	2603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021040	TGC	2	6	2619	2624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021040	GAT	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021040	ATG	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021040	TGC	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021040	ATA	2	6	3437	3442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021040	ATA	2	6	4431	4436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021040	GGA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021040	AAT	2	6	5066	5071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021040	GTT	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021040	TAA	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021040	GTA	2	6	5183	5188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021040	TTG	2	6	5198	5203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021040	TTA	2	6	5206	5211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021040	GTT	3	9	5319	5327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021040	TAT	2	6	5366	5371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021040	TAA	2	6	5374	5379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021040	TAG	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021040	CTG	2	6	5390	5395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021040	GAT	2	6	6274	6279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021040	GAA	2	6	6325	6330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021040	ACA	2	6	6355	6360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021040	TGT	2	6	6402	6407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021040	ATA	2	6	6485	6490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021040	AGG	2	6	7747	7752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021040	ATA	2	6	7756	7761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021040	AAT	2	6	8033	8038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021040	TTG	2	6	8046	8051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021040	TAT	2	6	9591	9596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021040	AGG	2	6	9606	9611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021040	ATA	2	6	10824	10829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021040	GAG	2	6	12164	12169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021040	TAT	2	6	12196	12201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021040	TAA	2	6	13167	13172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021040	GCG	2	6	13201	13206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021040	AAC	2	6	13273	13278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021040	TAG	2	6	13305	13310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021040	GAA	2	6	13312	13317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021040	ACA	2	6	13390	13395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021040	GGT	2	6	13420	13425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021040	CCG	2	6	14751	14756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_021040	GGT	2	6	14776	14781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021040	TTC	2	6	14814	14819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021040	AGA	2	6	14842	14847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021040	AGT	2	6	14887	14892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021040	TGA	2	6	14896	14901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021040	TTG	2	6	14916	14921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021040	AGA	2	6	14944	14949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021040	AGG	2	6	14964	14969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021040	TCT	2	6	20805	20810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021040	GGA	2	6	20982	20987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021040	TGC	2	6	20990	20995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021040	TGA	2	6	21150	21155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021040	GAT	2	6	21184	21189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021040	GCA	2	6	21204	21209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021040	AGG	2	6	21274	21279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021040	TAA	2	6	22394	22399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021040	GTG	2	6	22400	22405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021040	AGA	2	6	22445	22450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021040	AAG	2	6	23052	23057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021040	TGT	2	6	23087	23092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021040	TCT	2	6	23112	23117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021040	GAA	2	6	23210	23215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021040	AAT	2	6	25324	25329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021040	TAA	2	6	25352	25357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021040	TAA	2	6	25363	25368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021040	GGA	2	6	25431	25436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021040	GAT	2	6	28804	28809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021040	CGA	2	6	28846	28851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021040	GAA	2	6	28877	28882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021040	GGA	2	6	31250	31255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021040	TAT	2	6	34845	34850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021040	TTA	2	6	34875	34880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021040	TAA	2	6	34928	34933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021040	AGC	2	6	34967	34972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021040	CAG	2	6	34993	34998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021040	TCC	2	6	35582	35587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_021040	ATC	2	6	35786	35791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021040	AGG	2	6	35938	35943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021040	TAT	2	6	37539	37544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021040	GTT	2	6	37581	37586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021040	ATG	2	6	37642	37647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021040	GGA	2	6	37672	37677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021040	AGG	2	6	37724	37729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021040	GAT	2	6	38299	38304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021040	CAT	2	6	38315	38320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021040	ATT	2	6	38345	38350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021040	ATG	2	6	38364	38369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021040	AAT	2	6	38385	38390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021040	GTG	2	6	39626	39631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021040	AGT	2	6	43020	43025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021040	TCA	2	6	43026	43031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021040	CTG	2	6	43078	43083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021040	TTA	2	6	43203	43208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021040	GGT	2	6	43232	43237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021040	GAA	2	6	43352	43357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021040	TTA	2	6	43408	43413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021040	ATA	2	6	49187	49192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021040	CCT	2	6	49510	49515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021040	TAA	2	6	49524	49529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021040	ATA	2	6	49675	49680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021040	AGG	2	6	49686	49691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021040	AAT	2	6	49703	49708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021040	CAG	2	6	50577	50582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021040	TTC	2	6	50586	50591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021040	AGC	2	6	50668	50673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021040	ATG	2	6	50877	50882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021040	ACA	2	6	50987	50992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021040	AAC	2	6	51039	51044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021040	CTG	2	6	51113	51118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021040	GCG	2	6	51135	51140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021040	TGA	2	6	51316	51321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021040	GAA	2	6	51323	51328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021040	ATT	2	6	51330	51335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021040	TGT	2	6	51391	51396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021040	ATG	2	6	51456	51461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021040	ATG	2	6	51609	51614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021040	CTG	2	6	51686	51691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021040	GTG	2	6	51805	51810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021040	GGA	2	6	52144	52149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021040	CTG	2	6	52244	52249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021040	GGA	2	6	52267	52272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021040	AAT	2	6	52367	52372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021040	TAA	2	6	52381	52386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021040	GAA	2	6	52484	52489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021040	CTG	2	6	52496	52501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021040	CAG	2	6	52576	52581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021040	AAT	2	6	52621	52626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021040	CCG	2	6	52641	52646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_021040	TGA	2	6	52666	52671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_021040	GGT	2	6	146443	146448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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