MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus champanellensis 18P13

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021039	TTTCGT	2	12	22053	22064	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021039	TGTTTT	2	12	45928	45939	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021039	AGCGAG	2	12	68557	68568	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021039	TTCTAT	2	12	76562	76573	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021039	GCAGGG	2	12	79972	79983	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021039	GGCGCA	2	12	100459	100470	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021039	AGGGCA	2	12	101790	101801	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021039	TCAACG	2	12	101850	101861	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021039	AATCCG	2	12	151479	151490	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021039	CAAAAA	2	12	158401	158412	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021039	ATTATA	2	12	168344	168355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021039	CTGATT	2	12	169681	169692	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021039	CAGTGC	2	12	171811	171822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021039	ACGGTG	2	12	187597	187608	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021039	AAATCA	2	12	194797	194808	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021039	AGCAGG	2	12	202325	202336	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021039	GCAGCC	2	12	202537	202548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021039	CGGCTC	2	12	213786	213797	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021039	TCGCCA	2	12	217267	217278	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021039	TTGGTG	2	12	229035	229046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021039	CTCCTG	2	12	229412	229423	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021039	TGCCAA	2	12	229661	229672	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021039	CTTGGG	2	12	267168	267179	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021039	TTCTGT	2	12	287890	287901	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021039	CGGTGA	2	12	291315	291326	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021039	CGATCT	2	12	292221	292232	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021039	AAGAAA	2	12	301115	301126	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021039	TTTCTT	2	12	301419	301430	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021039	CAGTTC	2	12	318175	318186	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021039	CTTGCC	2	12	322885	322896	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021039	CCAGCA	2	12	335498	335509	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021039	ATGTTG	2	12	335584	335595	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021039	CACCTC	2	12	335649	335660	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021039	GCCGCT	2	12	341173	341184	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021039	ACCAAA	2	12	345994	346005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021039	GCTTTT	2	12	355636	355647	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021039	GGGCAA	2	12	413943	413954	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021039	GTAGCC	2	12	416770	416781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021039	TCCTCG	2	12	417419	417430	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021039	TCTTTT	2	12	462975	462986	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021039	GAAGGA	2	12	464961	464972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021039	GGGAAA	2	12	484227	484238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021039	TCAGGA	2	12	488557	488568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021039	CTTTTT	2	12	503766	503777	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021039	GCGGCA	2	12	532724	532735	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021039	CTTGCG	2	12	540625	540636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021039	TCCAGC	2	12	568775	568786	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021039	GCCACC	2	12	569552	569563	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021039	CTTTAT	2	12	586135	586146	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021039	TGCGCA	2	12	630068	630079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021039	GCGGGA	2	12	630534	630545	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021039	CATTGA	2	12	631206	631217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021039	CAATAT	2	12	675771	675782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021039	GCTGGC	2	12	727512	727523	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021039	CAATAT	2	12	728046	728057	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021039	TCAGAT	2	12	731604	731615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021039	CTTTGG	2	12	742987	742998	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021039	GTCAGT	2	12	752144	752155	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021039	TTGACT	2	12	769505	769516	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021039	ACACCA	2	12	770845	770856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021039	ACACCA	2	12	771178	771189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021039	GATGTT	2	12	772795	772806	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021039	CACAAC	2	12	773190	773201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021039	CTACCA	2	12	775610	775621	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021039	TCCGGA	2	12	776250	776261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021039	TCCGGA	2	12	776778	776789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021039	CACAAC	2	12	776829	776840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021039	TCCTTC	2	12	776968	776979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021039	CTGACC	2	12	805970	805981	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021039	GGCAGC	2	12	806677	806688	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021039	GTGTTC	2	12	806780	806791	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021039	GTTTTG	2	12	806954	806965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021039	CGGGGA	2	12	813901	813912	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021039	GCCTAT	2	12	814672	814683	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021039	AATGGG	2	12	828102	828113	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021039	GCAACC	2	12	828457	828468	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021039	TGCAAC	2	12	828612	828623	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021039	TGCAAC	2	12	828690	828701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021039	GATGGA	2	12	828852	828863	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021039	CCGGCT	2	12	828875	828886	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021039	GTGCAG	2	12	829606	829617	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021039	GGATCT	2	12	835942	835953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021039	AGCATG	2	12	836100	836111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021039	CGTGGG	2	12	849607	849618	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021039	CATACC	2	12	850523	850534	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021039	TTCTGA	2	12	858469	858480	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021039	AGTGAG	2	12	895106	895117	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021039	CAATGC	2	12	901466	901477	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021039	TCCTGT	2	12	903719	903730	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021039	TGCGGT	2	12	907145	907156	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021039	TACCGG	2	12	909438	909449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021039	AGCCGG	2	12	913694	913705	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021039	GCTGGA	2	12	921866	921877	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021039	GGCTGC	2	12	922036	922047	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021039	AACCGG	2	12	927116	927127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021039	GCAGTG	2	12	927395	927406	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021039	ACATGA	2	12	935315	935326	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021039	CATTTT	2	12	957342	957353	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021039	GAAAGA	2	12	957474	957485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021039	ATATAC	2	12	1000144	1000155	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021039	TATACA	2	12	1045165	1045176	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021039	TGCATA	2	12	1048599	1048610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021039	CAGTTC	2	12	1062110	1062121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021039	AGCCGG	2	12	1064198	1064209	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021039	CCCACG	2	12	1069105	1069116	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_021039	CGGATT	2	12	1097089	1097100	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021039	ACGGAG	2	12	1110789	1110800	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021039	GCGGTG	2	12	1129174	1129185	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021039	TTTTCC	2	12	1163515	1163526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021039	GATATG	2	12	1165930	1165941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021039	GGTGAG	2	12	1182719	1182730	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021039	AGTGAC	2	12	1194143	1194154	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021039	CCTCTG	2	12	1229977	1229988	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021039	ATGTGC	2	12	1260057	1260068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021039	AACCTG	2	12	1263025	1263036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021039	AGCTAA	2	12	1276009	1276020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021039	GGAGTG	2	12	1291077	1291088	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021039	GCTGCA	2	12	1304191	1304202	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021039	GGACAA	2	12	1305509	1305520	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021039	GATTTG	2	12	1305669	1305680	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021039	GTATGA	2	12	1306916	1306927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021039	ACAACG	2	12	1306990	1307001	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021039	AGTATG	2	12	1308424	1308435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021039	CACTTA	2	12	1309283	1309294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021039	CAAAAA	2	12	1312608	1312619	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021039	GCGAAA	2	12	1341560	1341571	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021039	CTGAAC	2	12	1347769	1347780	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021039	AACGAC	2	12	1363770	1363781	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021039	CTATTG	2	12	1375265	1375276	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_021039	TTGCTG	2	12	1377874	1377885	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_021039	GAAAAG	2	12	1388225	1388236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021039	CAATTT	2	12	1393060	1393071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.