MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus champanellensis 18P13

Total Repeats: 1240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021039	TACA	2	8	543	550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021039	CTGT	2	8	1543	1550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021039	GTGC	2	8	1581	1588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021039	TTCT	2	8	1801	1808	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021039	AGAT	2	8	1852	1859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021039	AAAG	2	8	2167	2174	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021039	ATGC	2	8	3642	3649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021039	CTAT	2	8	3804	3811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021039	TTCC	2	8	7131	7138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021039	GATT	2	8	9397	9404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021039	TGTA	2	8	9863	9870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021039	GGCT	2	8	10903	10910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021039	GGAG	2	8	10929	10936	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021039	CTGT	2	8	11083	11090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021039	GCAA	2	8	11197	11204	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021039	CAAA	2	8	18935	18942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021039	CGTT	2	8	19342	19349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021039	CATA	2	8	21000	21007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021039	TCGG	2	8	22153	22160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021039	TCCG	2	8	22175	22182	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021039	GTTG	2	8	22183	22190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021039	CGGA	2	8	23090	23097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021039	TCCT	2	8	23131	23138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021039	TTTC	2	8	23845	23852	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021039	CTTT	2	8	33596	33603	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021039	AATG	2	8	33637	33644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021039	CAAA	2	8	34984	34991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021039	CTTT	2	8	35017	35024	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021039	GCGG	2	8	38076	38083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021039	CACC	2	8	40624	40631	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_021039	TGCC	2	8	42380	42387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021039	TGAT	2	8	43373	43380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021039	GGGA	2	8	43383	43390	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021039	CTGT	2	8	49697	49704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021039	AATC	2	8	51136	51143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021039	AGGG	2	8	52636	52643	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021039	CAAA	2	8	65245	65252	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021039	GCGA	2	8	65855	65862	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021039	GATT	2	8	65876	65883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021039	TAGA	2	8	65904	65911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021039	GAGC	2	8	66427	66434	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021039	AGAT	2	8	66899	66906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021039	GAGC	2	8	67425	67432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021039	AAGC	2	8	67982	67989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021039	GCGA	2	8	68141	68148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021039	GAGC	2	8	68284	68291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021039	CCCG	2	8	69824	69831	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_021039	ATGG	2	8	70124	70131	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021039	TTTG	2	8	70725	70732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021039	CTTT	2	8	70751	70758	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021039	ATTT	2	8	76387	76394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021039	CCAA	2	8	76520	76527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021039	ACTG	2	8	77366	77373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021039	ATCA	2	8	77507	77514	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021039	TGAT	2	8	77526	77533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021039	ATGG	2	8	77811	77818	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021039	TTCC	2	8	77998	78005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021039	TCAG	2	8	78690	78697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021039	GCAG	2	8	79178	79185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021039	TGCG	2	8	79310	79317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021039	GATG	2	8	79339	79346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021039	CTGG	2	8	79475	79482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021039	AGAA	2	8	79713	79720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021039	CTGA	2	8	79910	79917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021039	TCCA	2	8	80013	80020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021039	CGGG	2	8	80098	80105	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021039	GCCT	2	8	80535	80542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021039	AGCC	2	8	80669	80676	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021039	CGTC	2	8	80812	80819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021039	GAAG	2	8	88408	88415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021039	CAGA	2	8	88787	88794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021039	CAGG	2	8	88984	88991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021039	GAAT	2	8	96815	96822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021039	AATA	2	8	99840	99847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021039	TTGA	2	8	99865	99872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021039	TTTC	2	8	100005	100012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021039	GAGC	2	8	101599	101606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021039	GCTT	2	8	105609	105616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021039	GAAC	2	8	106452	106459	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021039	CGGG	2	8	113508	113515	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021039	CTGC	2	8	115285	115292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021039	GCAC	2	8	115746	115753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021039	GAAC	2	8	115930	115937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021039	TGCT	2	8	115938	115945	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021039	CTGT	2	8	124030	124037	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021039	AAGC	2	8	124277	124284	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021039	GGCA	2	8	124341	124348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021039	AGCA	2	8	135775	135782	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021039	CCCT	2	8	136512	136519	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_021039	CAAC	2	8	136689	136696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021039	GATT	2	8	136863	136870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021039	AAAG	2	8	137064	137071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021039	AAAT	2	8	138569	138576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021039	ACTT	2	8	138755	138762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021039	AATA	2	8	141445	141452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021039	TATG	2	8	141823	141830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021039	GCAG	2	8	142021	142028	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021039	AAAT	2	8	142722	142729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021039	AGTC	2	8	142775	142782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021039	ACGG	2	8	144114	144121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021039	CTGT	2	8	144503	144510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021039	AGCA	2	8	152649	152656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021039	CCAA	2	8	158306	158313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021039	CCTC	2	8	158811	158818	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_021039	AAAC	2	8	159380	159387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021039	CTTC	2	8	161263	161270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021039	ATGC	2	8	162957	162964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021039	GGAA	2	8	163860	163867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021039	GAAT	2	8	165085	165092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021039	AATG	2	8	165206	165213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021039	GAAA	2	8	165227	165234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021039	CCGT	2	8	168402	168409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021039	TCGT	2	8	169191	169198	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021039	TTTC	2	8	169573	169580	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021039	AAAC	2	8	169882	169889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021039	ACAA	2	8	169923	169930	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021039	CAGC	2	8	170294	170301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021039	TGAA	2	8	170428	170435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021039	TGAT	2	8	170731	170738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021039	GCCT	2	8	171646	171653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021039	GACT	2	8	175118	175125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021039	GAAA	2	8	175472	175479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021039	GCCA	2	8	175572	175579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021039	CGTG	2	8	180455	180462	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021039	TCTA	2	8	181768	181775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021039	CAGC	2	8	182099	182106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021039	ATGA	2	8	182215	182222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021039	TTGA	2	8	185754	185761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021039	ATAC	2	8	186949	186956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021039	GGAT	2	8	187460	187467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021039	CAGA	2	8	187740	187747	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021039	TTTC	2	8	188347	188354	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021039	TAAA	2	8	199132	199139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021039	GACA	2	8	200149	200156	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021039	TTGA	2	8	200261	200268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021039	TCCG	2	8	202030	202037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021039	GCGA	2	8	209987	209994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021039	ACCC	2	8	210017	210024	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_021039	CAAG	2	8	210575	210582	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021039	ATCC	2	8	217673	217680	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021039	CTTT	2	8	218979	218986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021039	AAAT	2	8	219160	219167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021039	CCAC	2	8	223350	223357	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_021039	GCGA	2	8	223379	223386	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021039	AGAT	2	8	226026	226033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021039	CTGC	2	8	226579	226586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021039	TGCA	2	8	227392	227399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021039	TGCC	2	8	228631	228638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021039	GTCC	2	8	228731	228738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021039	TCCC	2	8	232395	232402	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
151	NC_021039	TCTT	2	8	232433	232440	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_021039	CCAG	2	8	236651	236658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021039	TGAA	2	8	236902	236909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021039	GCGA	2	8	242499	242506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_021039	ACCC	2	8	242767	242774	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
156	NC_021039	TGCA	2	8	248345	248352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_021039	CCAC	2	8	249893	249900	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
159	NC_021039	CTCC	2	8	251158	251165	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
160	NC_021039	TGCC	2	8	251650	251657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
161	NC_021039	CATG	2	8	251728	251735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_021039	CTTT	2	8	264072	264079	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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164	NC_021039	TCCA	2	8	265647	265654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_021039	AGTA	2	8	267368	267375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_021039	TTTG	2	8	271234	271241	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021039	CATG	2	8	271265	271272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_021039	TTTG	2	8	271355	271362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021039	GAAA	2	8	272109	272116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021039	TGTA	2	8	274052	274059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021039	AGGA	2	8	274248	274255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021039	TACT	2	8	278997	279004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_021039	TTTG	2	8	279167	279174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_021039	CTTT	2	8	282388	282395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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179	NC_021039	TCGC	2	8	283516	283523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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182	NC_021039	TGCC	2	8	287386	287393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
183	NC_021039	CTGC	2	8	287539	287546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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187	NC_021039	TGTT	2	8	289756	289763	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_021039	GTTG	2	8	292981	292988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
192	NC_021039	ATCC	3	12	298906	298917	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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221	NC_021039	GTGG	2	8	345946	345953	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_021039	TGAA	2	8	398578	398585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
236	NC_021039	GGAT	2	8	409141	409148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_021039	TTTG	2	8	560823	560830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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