MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Taylorella asinigenitalis 14/45 draft genome

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021033	ATTTAC	2	12	53906	53917	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021033	AATTTT	2	12	105996	106007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021033	ATTAAG	2	12	116147	116158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021033	TTAAAT	2	12	139269	139280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021033	ATATAG	2	12	174350	174361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021033	AAAAAG	2	12	195564	195575	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021033	CAAATC	2	12	222337	222348	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021033	GGGGTG	2	12	460714	460725	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021033	AATTTT	2	12	478840	478851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021033	TTATTT	2	12	601212	601223	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021033	TTTTCA	2	12	715761	715772	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021033	TAATTA	2	12	723862	723873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021033	CGCAGC	2	12	754574	754585	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021033	ATAATC	2	12	772235	772246	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021033	AATTTA	2	12	801056	801067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021033	AGCAAA	2	12	803397	803408	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021033	TTTCTA	2	12	805864	805875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021033	TAAAAT	2	12	833279	833290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021033	TAATAT	2	12	876878	876889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021033	TAAAAA	2	12	896400	896411	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021033	ACTAAG	2	12	902807	902818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021033	CTTTGA	2	12	916895	916906	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021033	AATATT	2	12	931003	931014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021033	TATAAA	2	12	943013	943024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021033	AAAATT	2	12	1012248	1012259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021033	ATCAAA	2	12	1104404	1104415	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021033	AACTTT	2	12	1238395	1238406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021033	TACTAT	2	12	1272415	1272426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021033	ATCTAC	2	12	1285425	1285436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021033	AGCCAT	3	18	1331051	1331068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021033	AAATTA	2	12	1375329	1375340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021033	AAAATC	2	12	1426871	1426882	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021033	GCCATA	3	18	1519294	1519311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021033	ATTACC	2	12	1520155	1520166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021033	CTTTGT	2	12	1522495	1522506	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021033	GTTTAC	2	12	1526652	1526663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021033	AGTGTT	2	12	1534898	1534909	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.