MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Taylorella asinigenitalis 14/45 draft genome

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021033	CTTTG	2	10	125	134	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021033	CTTGA	2	10	13982	13991	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021033	AATAA	2	10	37078	37087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021033	TAAAA	2	10	43550	43559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021033	AGTTT	2	10	82273	82282	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021033	CAAAC	2	10	85842	85851	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_021033	AAATG	2	10	88360	88369	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021033	CAAAT	2	10	136971	136980	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021033	AAAAT	2	10	142361	142370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021033	ATTTT	2	10	156915	156924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021033	AACAT	2	10	158169	158178	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021033	AATGC	2	10	158739	158748	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021033	AAATA	2	10	159338	159347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021033	ATTCA	2	10	180607	180616	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021033	TAAAA	2	10	186389	186398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021033	TTTCA	2	10	207033	207042	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021033	AATTT	2	10	207120	207129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021033	CCCAT	2	10	207786	207795	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_021033	ACCCA	2	10	215673	215682	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_021033	AATTA	2	10	231086	231095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021033	GGTGT	2	10	248926	248935	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021033	TTAAG	2	10	249041	249050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021033	TATGA	2	10	249100	249109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021033	AACTT	2	10	250517	250526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021033	TTAAT	2	10	286547	286556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021033	TTTTA	2	10	296708	296717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021033	AAAAG	2	10	298428	298437	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021033	TAAAA	2	10	317346	317355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021033	TAATA	2	10	329838	329847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021033	GCATT	2	10	352059	352068	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021033	ATTGA	2	10	356545	356554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021033	TAAAA	2	10	361451	361460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021033	TTAAA	2	10	379342	379351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021033	TAAAA	2	10	418925	418934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021033	GTTTC	2	10	435223	435232	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021033	GAAAT	2	10	438138	438147	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021033	TAGAA	2	10	449050	449059	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021033	AGATT	2	10	450203	450212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021033	TAATT	2	10	458240	458249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021033	AAAAG	2	10	458335	458344	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021033	GGGGT	2	10	460317	460326	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021033	TCTTT	2	10	463574	463583	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021033	AAGAA	2	10	463603	463612	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021033	CTGTA	2	10	508901	508910	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021033	ATTAA	2	10	508995	509004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021033	AGCTG	2	10	511056	511065	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021033	TTTAA	2	10	518938	518947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021033	ATTAA	2	10	532972	532981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021033	AAATT	2	10	532996	533005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021033	CAAAT	2	10	535755	535764	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021033	AAACA	2	10	535932	535941	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021033	CGATA	2	10	559880	559889	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021033	TGCAT	2	10	559994	560003	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021033	GATGA	2	10	560156	560165	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021033	ATTTT	2	10	576115	576124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021033	TAAAA	2	10	579715	579724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021033	GCTTA	2	10	596606	596615	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021033	AAGTT	2	10	624190	624199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021033	ATCTT	2	10	632884	632893	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021033	CTTAT	2	10	665418	665427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021033	CGTCA	2	10	677120	677129	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_021033	TTGAT	2	10	692012	692021	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021033	ATAAC	2	10	715624	715633	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021033	ATTTT	2	10	723849	723858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021033	TTATT	2	10	737326	737335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021033	CAATT	2	10	803475	803484	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021033	GTATC	2	10	816577	816586	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021033	TTCAT	2	10	816611	816620	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021033	TACAA	2	10	827658	827667	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021033	TTTTA	2	10	862546	862555	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021033	GCTTT	2	10	877271	877280	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021033	CATAT	2	10	878212	878221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021033	TAATT	2	10	881391	881400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021033	TAAAT	2	10	905483	905492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021033	AAATT	2	10	930968	930977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021033	TAGAA	2	10	979157	979166	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021033	TTTTA	2	10	1011608	1011617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021033	TATAT	2	10	1041040	1041049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021033	ATCAA	2	10	1068481	1068490	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021033	AAAAT	2	10	1075668	1075677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021033	TAAAA	2	10	1075687	1075696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021033	TTATG	2	10	1078761	1078770	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021033	GCGGA	2	10	1092024	1092033	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021033	AAAAT	2	10	1130201	1130210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021033	GTTAA	2	10	1218293	1218302	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021033	CAAAT	2	10	1221972	1221981	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_021033	TAATT	2	10	1221983	1221992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021033	CTTTA	2	10	1243638	1243647	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021033	CACGA	2	10	1267736	1267745	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_021033	TGTCA	2	10	1272359	1272368	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021033	ATTAA	2	10	1284388	1284397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021033	CACTG	2	10	1322301	1322310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_021033	ATTTT	2	10	1364028	1364037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021033	GATAA	2	10	1365794	1365803	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021033	AAATT	2	10	1367948	1367957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021033	AATCT	2	10	1442975	1442984	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021033	GGTGT	2	10	1480388	1480397	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021033	CTTCG	2	10	1480622	1480631	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_021033	AAATA	2	10	1482929	1482938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021033	GTTTT	2	10	1483407	1483416	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021033	TAAAA	2	10	1491880	1491889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021033	CTTTG	2	10	1496231	1496240	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021033	TAAAA	2	10	1531211	1531220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021033	TGGGT	2	10	1534510	1534519	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021033	AGAAA	2	10	1534799	1534808	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021033	TTCGC	2	10	1535623	1535632	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_021033	TGTGA	2	10	1536381	1536390	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021033	CTCAT	2	10	1537458	1537467	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_021033	GGGAG	2	10	1539791	1539800	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.