MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Taylorella asinigenitalis 14/45 draft genome

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021033	AAGT	2	8	11082	11089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021033	TGTT	2	8	13854	13861	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021033	ATTT	2	8	14000	14007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021033	GAAC	2	8	17610	17617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021033	CGCT	2	8	35795	35802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021033	ATAG	2	8	37782	37789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021033	ATTA	2	8	41491	41498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021033	GAAT	2	8	69549	69556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021033	TCTA	2	8	82348	82355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021033	AAAC	2	8	83547	83554	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021033	TAAA	2	8	88288	88295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021033	TTAT	2	8	88315	88322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021033	TAAT	2	8	91242	91249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021033	AATT	2	8	105070	105077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021033	AATC	2	8	110795	110802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021033	AAAT	2	8	116763	116770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021033	AGTA	2	8	122860	122867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021033	TTAT	2	8	134583	134590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021033	TTAC	2	8	151539	151546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021033	TTGA	2	8	157949	157956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021033	ATCA	2	8	158126	158133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021033	ATAA	2	8	158879	158886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021033	ATTT	2	8	159163	159170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021033	ATAA	2	8	159172	159179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021033	CTAG	2	8	159414	159421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021033	AAGA	2	8	159479	159486	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021033	AATA	2	8	159495	159502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021033	ACCC	2	8	164562	164569	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_021033	ATTT	2	8	180617	180624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021033	TATT	2	8	180680	180687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021033	GGCA	2	8	186411	186418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021033	TAAA	2	8	189574	189581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021033	CTTG	2	8	192765	192772	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021033	TAAA	2	8	209598	209605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021033	TAAA	2	8	212567	212574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021033	ATTA	2	8	217131	217138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021033	AAAT	2	8	217141	217148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021033	AGGA	2	8	220476	220483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021033	TCCC	2	8	229085	229092	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_021033	GTTT	2	8	230129	230136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021033	AAAT	2	8	234413	234420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021033	CATT	2	8	234482	234489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021033	TACA	2	8	241648	241655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021033	TTTA	2	8	241662	241669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021033	TTCT	2	8	249122	249129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021033	GAAT	2	8	249195	249202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021033	TTAC	2	8	250767	250774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021033	TTAA	2	8	262959	262966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021033	TTAA	2	8	282338	282345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021033	GATT	2	8	294194	294201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021033	AATT	2	8	294208	294215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021033	TCCA	2	8	303697	303704	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021033	TACG	2	8	307727	307734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021033	TAAA	2	8	320404	320411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021033	CTTA	2	8	323934	323941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021033	AATG	2	8	329452	329459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021033	TTAG	2	8	329950	329957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021033	CATA	2	8	330940	330947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021033	TAAT	2	8	330992	330999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021033	ATTA	2	8	331015	331022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021033	ATTA	2	8	359366	359373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021033	CTTT	2	8	360024	360031	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021033	TAAT	2	8	361400	361407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021033	ATAA	2	8	379299	379306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021033	TATT	2	8	387485	387492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021033	TAAA	2	8	391060	391067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021033	TAAT	2	8	391083	391090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021033	TCAT	2	8	393746	393753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021033	AATT	2	8	412590	412597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021033	CAAA	2	8	416976	416983	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021033	AAGT	2	8	422410	422417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021033	TTAA	2	8	428695	428702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021033	ATTT	2	8	435172	435179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021033	TTTC	2	8	438995	439002	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021033	TCAT	2	8	439069	439076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021033	TATT	2	8	439483	439490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021033	TTAA	2	8	443897	443904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021033	CAAT	2	8	443997	444004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021033	AAGA	2	8	449122	449129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021033	TGAT	2	8	450947	450954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021033	GCCT	2	8	451046	451053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021033	GATG	2	8	451383	451390	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021033	CGGT	2	8	451526	451533	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021033	GATG	2	8	451563	451570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021033	TGCT	2	8	451643	451650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021033	TATT	2	8	457223	457230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021033	TTTA	2	8	462327	462334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021033	ATTG	2	8	464450	464457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021033	GAAG	2	8	469155	469162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021033	AACC	2	8	470850	470857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021033	ATAA	2	8	470905	470912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021033	ATAG	2	8	470965	470972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021033	GTTC	2	8	470980	470987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021033	GTTC	2	8	472388	472395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021033	GGGC	2	8	481578	481585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021033	AAAT	2	8	484294	484301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021033	ATTA	2	8	504166	504173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021033	AATT	2	8	508748	508755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021033	ATTT	2	8	508974	508981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021033	TTTA	2	8	510718	510725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021033	TTAG	2	8	510770	510777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021033	TTAA	2	8	510856	510863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021033	ATTA	2	8	533022	533029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021033	ACTG	2	8	535124	535131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021033	GAAA	2	8	536060	536067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021033	AAAT	2	8	536090	536097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021033	TTTG	2	8	537720	537727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021033	CATT	2	8	543889	543896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021033	TCTA	2	8	554998	555005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021033	TGCT	2	8	559555	559562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021033	TGCA	2	8	560199	560206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021033	ATAA	2	8	564051	564058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021033	TAAA	2	8	576055	576062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021033	TAAG	2	8	579682	579689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021033	ATTA	2	8	589412	589419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021033	CAAA	2	8	593359	593366	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021033	TTTA	2	8	604945	604952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021033	AAAC	2	8	615501	615508	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021033	TAGC	2	8	616990	616997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021033	CCAA	2	8	622983	622990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021033	TTAT	2	8	627957	627964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021033	TTAA	2	8	630539	630546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021033	TTAA	2	8	632147	632154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021033	GTAA	2	8	646778	646785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021033	GTTA	2	8	646826	646833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021033	ATGA	2	8	647149	647156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021033	AGTA	2	8	665615	665622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021033	AAAT	2	8	676766	676773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021033	AAAT	2	8	676837	676844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021033	ATAC	2	8	677016	677023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021033	TAGT	2	8	686587	686594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021033	ATTA	2	8	691836	691843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021033	TAAA	2	8	692259	692266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021033	AAAT	2	8	704712	704719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021033	TTTA	2	8	705813	705820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021033	AGCA	2	8	715261	715268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021033	CCAT	2	8	715927	715934	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021033	AGGA	2	8	715938	715945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021033	AATA	2	8	725654	725661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021033	TTCT	2	8	725706	725713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021033	TTTA	2	8	725794	725801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021033	CTTT	2	8	732310	732317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021033	TTAG	2	8	737285	737292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021033	TTAA	2	8	740261	740268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021033	AAAT	2	8	741608	741615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021033	AATA	2	8	742027	742034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021033	AAAT	2	8	742240	742247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021033	CTTT	2	8	742259	742266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021033	TAAT	2	8	743784	743791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021033	GAAA	2	8	751044	751051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021033	CATA	2	8	751087	751094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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294	NC_021033	CATG	2	8	1499354	1499361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
295	NC_021033	ATTT	2	8	1499387	1499394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_021033	ATTA	2	8	1505029	1505036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_021033	TTGT	2	8	1505044	1505051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
298	NC_021033	TGAG	2	8	1505127	1505134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
299	NC_021033	ATAA	2	8	1506011	1506018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_021033	AAAT	2	8	1519074	1519081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_021033	CATC	2	8	1519343	1519350	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
302	NC_021033	CACC	2	8	1520224	1520231	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
303	NC_021033	TGAT	2	8	1520563	1520570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
304	NC_021033	TTGT	2	8	1521393	1521400	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
305	NC_021033	TTAG	2	8	1521865	1521872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
306	NC_021033	GTTT	2	8	1521935	1521942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
307	NC_021033	TTAT	2	8	1521955	1521962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_021033	ATAA	2	8	1526592	1526599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_021033	CGAA	2	8	1530854	1530861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
310	NC_021033	TAAA	2	8	1531122	1531129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_021033	TTAA	2	8	1531242	1531249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_021033	CTAG	2	8	1535505	1535512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
313	NC_021033	GTTT	2	8	1537130	1537137	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
314	NC_021033	GACA	2	8	1537301	1537308	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
315	NC_021033	TACG	2	8	1537672	1537679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
316	NC_021033	GCTT	2	8	1537877	1537884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
317	NC_021033	TTCG	2	8	1538014	1538021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
318	NC_021033	GTGG	2	8	1539540	1539547	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.