MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 1665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021030	AGAAC	2	10	147	156	60 %	0 %	20 %	20 %	479185171
2	NC_021030	CCGCA	2	10	6326	6335	20 %	0 %	20 %	60 %	479185172
3	NC_021030	GCGCT	2	10	6900	6909	0 %	20 %	40 %	40 %	479185172
4	NC_021030	CTGGG	2	10	13333	13342	0 %	20 %	60 %	20 %	479185173
5	NC_021030	GGAGC	2	10	14013	14022	20 %	0 %	60 %	20 %	479185173
6	NC_021030	GGGCA	2	10	14557	14566	20 %	0 %	60 %	20 %	479185173
7	NC_021030	CGCGA	2	10	15064	15073	20 %	0 %	40 %	40 %	479185174
8	NC_021030	GCGGG	2	10	15714	15723	0 %	0 %	80 %	20 %	479185174
9	NC_021030	TCCGG	2	10	17352	17361	0 %	20 %	40 %	40 %	479185174
10	NC_021030	TCCCT	2	10	22076	22085	0 %	40 %	0 %	60 %	479185175
11	NC_021030	CGGCC	2	10	22883	22892	0 %	0 %	40 %	60 %	479185176
12	NC_021030	CGTCG	2	10	23841	23850	0 %	20 %	40 %	40 %	479185176
13	NC_021030	CGGAC	2	10	24258	24267	20 %	0 %	40 %	40 %	479185176
14	NC_021030	AGGAG	2	10	26449	26458	40 %	0 %	60 %	0 %	479185177
15	NC_021030	TGTCC	2	10	27721	27730	0 %	40 %	20 %	40 %	479185178
16	NC_021030	GGGAG	2	10	29004	29013	20 %	0 %	80 %	0 %	479185179
17	NC_021030	CATGT	2	10	29279	29288	20 %	40 %	20 %	20 %	479185179
18	NC_021030	CTCCA	2	10	31526	31535	20 %	20 %	0 %	60 %	479185179
19	NC_021030	TCCGG	2	10	34100	34109	0 %	20 %	40 %	40 %	479185181
20	NC_021030	TACCG	2	10	34691	34700	20 %	20 %	20 %	40 %	479185181
21	NC_021030	TGCCG	2	10	35370	35379	0 %	20 %	40 %	40 %	479185181
22	NC_021030	GTGCC	2	10	37092	37101	0 %	20 %	40 %	40 %	479185184
23	NC_021030	CGATA	2	10	39427	39436	40 %	20 %	20 %	20 %	479185185
24	NC_021030	CCGGA	2	10	41099	41108	20 %	0 %	40 %	40 %	479185186
25	NC_021030	GCTTT	2	10	42678	42687	0 %	60 %	20 %	20 %	479185186
26	NC_021030	GACGG	2	10	47994	48003	20 %	0 %	60 %	20 %	479185188
27	NC_021030	CGAGC	2	10	48048	48057	20 %	0 %	40 %	40 %	479185188
28	NC_021030	GGCGC	2	10	48931	48940	0 %	0 %	60 %	40 %	479185189
29	NC_021030	GGCGA	2	10	48987	48996	20 %	0 %	60 %	20 %	479185189
30	NC_021030	GAAGG	2	10	50061	50070	40 %	0 %	60 %	0 %	479185189
31	NC_021030	GGGAA	2	10	50602	50611	40 %	0 %	60 %	0 %	479185190
32	NC_021030	TGGCA	2	10	51795	51804	20 %	20 %	40 %	20 %	479185190
33	NC_021030	CGCTT	2	10	52621	52630	0 %	40 %	20 %	40 %	479185190
34	NC_021030	TTCGG	2	10	54940	54949	0 %	40 %	40 %	20 %	479185191
35	NC_021030	CGGAG	2	10	55020	55029	20 %	0 %	60 %	20 %	479185191
36	NC_021030	GACGA	2	10	59933	59942	40 %	0 %	40 %	20 %	479185193
37	NC_021030	GTGAA	2	10	60504	60513	40 %	20 %	40 %	0 %	479185194
38	NC_021030	GTCGC	2	10	60566	60575	0 %	20 %	40 %	40 %	479185194
39	NC_021030	CATAC	2	10	62180	62189	40 %	20 %	0 %	40 %	479185195
40	NC_021030	CCGTT	2	10	62890	62899	0 %	40 %	20 %	40 %	479185195
41	NC_021030	AGACC	2	10	63787	63796	40 %	0 %	20 %	40 %	479185197
42	NC_021030	CCAGT	2	10	66102	66111	20 %	20 %	20 %	40 %	479185199
43	NC_021030	CGAGG	2	10	67062	67071	20 %	0 %	60 %	20 %	479185199
44	NC_021030	TTCAC	2	10	71472	71481	20 %	40 %	0 %	40 %	479185201
45	NC_021030	ACCGC	2	10	73979	73988	20 %	0 %	20 %	60 %	479185202
46	NC_021030	GCCGT	2	10	73994	74003	0 %	20 %	40 %	40 %	479185202
47	NC_021030	GCCGA	2	10	74291	74300	20 %	0 %	40 %	40 %	479185202
48	NC_021030	CGGGT	2	10	74521	74530	0 %	20 %	60 %	20 %	479185202
49	NC_021030	AACAG	2	10	75096	75105	60 %	0 %	20 %	20 %	479185202
50	NC_021030	AGCGC	2	10	78972	78981	20 %	0 %	40 %	40 %	479185204
51	NC_021030	ACCGT	2	10	80027	80036	20 %	20 %	20 %	40 %	479185204
52	NC_021030	CGCCC	2	10	82203	82212	0 %	0 %	20 %	80 %	479185205
53	NC_021030	TCGCC	2	10	82403	82412	0 %	20 %	20 %	60 %	479185205
54	NC_021030	CGTGC	2	10	82744	82753	0 %	20 %	40 %	40 %	479185205
55	NC_021030	CCTGC	2	10	83076	83085	0 %	20 %	20 %	60 %	479185205
56	NC_021030	AGGGC	2	10	85449	85458	20 %	0 %	60 %	20 %	479185207
57	NC_021030	CGGGA	2	10	86840	86849	20 %	0 %	60 %	20 %	479185207
58	NC_021030	CGGGG	2	10	91014	91023	0 %	0 %	80 %	20 %	479185209
59	NC_021030	CCAGC	2	10	94004	94013	20 %	0 %	20 %	60 %	479185211
60	NC_021030	GCGAG	2	10	100781	100790	20 %	0 %	60 %	20 %	479185214
61	NC_021030	CGGCG	2	10	100811	100820	0 %	0 %	60 %	40 %	479185214
62	NC_021030	TGATC	2	10	101197	101206	20 %	40 %	20 %	20 %	479185215
63	NC_021030	GTCGT	2	10	108089	108098	0 %	40 %	40 %	20 %	479185222
64	NC_021030	ACTCG	2	10	108292	108301	20 %	20 %	20 %	40 %	479185222
65	NC_021030	CCTCG	2	10	112881	112890	0 %	20 %	20 %	60 %	479185226
66	NC_021030	CGGGG	2	10	118740	118749	0 %	0 %	80 %	20 %	479185230
67	NC_021030	CCGGG	2	10	118974	118983	0 %	0 %	60 %	40 %	479185230
68	NC_021030	GCGGT	2	10	120533	120542	0 %	20 %	60 %	20 %	479185231
69	NC_021030	ACCTT	2	10	121096	121105	20 %	40 %	0 %	40 %	479185231
70	NC_021030	AACCG	2	10	123426	123435	40 %	0 %	20 %	40 %	479185235
71	NC_021030	GCGCT	2	10	124364	124373	0 %	20 %	40 %	40 %	479185235
72	NC_021030	GCCGG	2	10	125915	125924	0 %	0 %	60 %	40 %	479185236
73	NC_021030	CCGCG	2	10	135266	135275	0 %	0 %	40 %	60 %	479185241
74	NC_021030	TCGCC	2	10	138766	138775	0 %	20 %	20 %	60 %	479185245
75	NC_021030	CCAGC	2	10	142065	142074	20 %	0 %	20 %	60 %	479185247
76	NC_021030	GCCGA	2	10	143650	143659	20 %	0 %	40 %	40 %	479185248
77	NC_021030	GCGCA	2	10	155783	155792	20 %	0 %	40 %	40 %	479185253
78	NC_021030	GTCGA	2	10	155825	155834	20 %	20 %	40 %	20 %	479185253
79	NC_021030	CGCGC	2	10	155904	155913	0 %	0 %	40 %	60 %	479185253
80	NC_021030	CGGCT	2	10	156469	156478	0 %	20 %	40 %	40 %	479185253
81	NC_021030	GTTCG	2	10	159849	159858	0 %	40 %	40 %	20 %	479185254
82	NC_021030	GCGTC	2	10	165586	165595	0 %	20 %	40 %	40 %	479185257
83	NC_021030	TCCGC	2	10	167313	167322	0 %	20 %	20 %	60 %	479185258
84	NC_021030	GCGTC	2	10	167553	167562	0 %	20 %	40 %	40 %	479185258
85	NC_021030	CGGCC	2	10	167782	167791	0 %	0 %	40 %	60 %	479185258
86	NC_021030	TCGTT	2	10	168565	168574	0 %	60 %	20 %	20 %	479185259
87	NC_021030	AACAA	2	10	169527	169536	80 %	0 %	0 %	20 %	479185261
88	NC_021030	AAAGC	2	10	171696	171705	60 %	0 %	20 %	20 %	479185264
89	NC_021030	CCGTT	2	10	172820	172829	0 %	40 %	20 %	40 %	479185264
90	NC_021030	TTATA	2	10	174890	174899	40 %	60 %	0 %	0 %	479185266
91	NC_021030	GTACT	2	10	175065	175074	20 %	40 %	20 %	20 %	479185266
92	NC_021030	CGGGT	2	10	176516	176525	0 %	20 %	60 %	20 %	479185267
93	NC_021030	TTACC	2	10	178680	178689	20 %	40 %	0 %	40 %	479185269
94	NC_021030	TTCGT	2	10	179963	179972	0 %	60 %	20 %	20 %	479185269
95	NC_021030	GCTTC	2	10	182455	182464	0 %	40 %	20 %	40 %	479185270
96	NC_021030	TATCG	2	10	182729	182738	20 %	40 %	20 %	20 %	479185270
97	NC_021030	GTTCG	2	10	183551	183560	0 %	40 %	40 %	20 %	479185272
98	NC_021030	TCCTT	2	10	183566	183575	0 %	60 %	0 %	40 %	479185272
99	NC_021030	AAGCG	2	10	183986	183995	40 %	0 %	40 %	20 %	479185273
100	NC_021030	TGCGT	2	10	185141	185150	0 %	40 %	40 %	20 %	479185275
101	NC_021030	TTTCT	2	10	186720	186729	0 %	80 %	0 %	20 %	479185277
102	NC_021030	ACCCG	2	10	188369	188378	20 %	0 %	20 %	60 %	479185278
103	NC_021030	CCCAA	2	10	192243	192252	40 %	0 %	0 %	60 %	479185283
104	NC_021030	CTTCC	2	10	194495	194504	0 %	40 %	0 %	60 %	479185284
105	NC_021030	CCAAG	2	10	196418	196427	40 %	0 %	20 %	40 %	479185286
106	NC_021030	TCTTT	2	10	197040	197049	0 %	80 %	0 %	20 %	479185287
107	NC_021030	CCGCA	2	10	203578	203587	20 %	0 %	20 %	60 %	479185295
108	NC_021030	CCTTG	2	10	205128	205137	0 %	40 %	20 %	40 %	479185298
109	NC_021030	TTGCT	2	10	206620	206629	0 %	60 %	20 %	20 %	479185300
110	NC_021030	CGCTT	2	10	207746	207755	0 %	40 %	20 %	40 %	479185303
111	NC_021030	GCAAG	2	10	208326	208335	40 %	0 %	40 %	20 %	479185304
112	NC_021030	TCCAA	2	10	211661	211670	40 %	20 %	0 %	40 %	479185308
113	NC_021030	GCTTT	2	10	212271	212280	0 %	60 %	20 %	20 %	479185309
114	NC_021030	CCCGG	2	10	212325	212334	0 %	0 %	40 %	60 %	479185309
115	NC_021030	AAAAG	2	10	214341	214350	80 %	0 %	20 %	0 %	479185313
116	NC_021030	GCCGC	2	10	218439	218448	0 %	0 %	40 %	60 %	479185316
117	NC_021030	CCGCG	2	10	222359	222368	0 %	0 %	40 %	60 %	479185317
118	NC_021030	GGGTG	2	10	223486	223495	0 %	20 %	80 %	0 %	479185318
119	NC_021030	GGCCG	2	10	230914	230923	0 %	0 %	60 %	40 %	479185321
120	NC_021030	GGCGC	2	10	231439	231448	0 %	0 %	60 %	40 %	479185321
121	NC_021030	CGCTG	2	10	232169	232178	0 %	20 %	40 %	40 %	479185322
122	NC_021030	CGCTG	2	10	234048	234057	0 %	20 %	40 %	40 %	479185323
123	NC_021030	CGCTG	2	10	236503	236512	0 %	20 %	40 %	40 %	479185324
124	NC_021030	ATCCG	2	10	242068	242077	20 %	20 %	20 %	40 %	479185328
125	NC_021030	GTCGA	2	10	248699	248708	20 %	20 %	40 %	20 %	479185332
126	NC_021030	CGGCC	2	10	250255	250264	0 %	0 %	40 %	60 %	479185333
127	NC_021030	AAAAT	2	10	253660	253669	80 %	20 %	0 %	0 %	479185335
128	NC_021030	GTTCG	2	10	254525	254534	0 %	40 %	40 %	20 %	479185335
129	NC_021030	CGGTG	2	10	255338	255347	0 %	20 %	60 %	20 %	479185335
130	NC_021030	GCGCC	2	10	256851	256860	0 %	0 %	40 %	60 %	479185337
131	NC_021030	GAACG	2	10	257356	257365	40 %	0 %	40 %	20 %	479185337
132	NC_021030	TTTTG	2	10	258924	258933	0 %	80 %	20 %	0 %	479185340
133	NC_021030	TGGCT	2	10	266107	266116	0 %	40 %	40 %	20 %	479185343
134	NC_021030	CGTCG	2	10	270932	270941	0 %	20 %	40 %	40 %	479185345
135	NC_021030	GCGTC	2	10	272051	272060	0 %	20 %	40 %	40 %	479185347
136	NC_021030	CTGGG	2	10	272562	272571	0 %	20 %	60 %	20 %	479185347
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166	NC_021030	GGGCG	2	10	328774	328783	0 %	0 %	80 %	20 %	479185383
167	NC_021030	CGTGG	2	10	330052	330061	0 %	20 %	60 %	20 %	479185384
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175	NC_021030	GCCTC	2	10	341805	341814	0 %	20 %	20 %	60 %	479185394
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246	NC_021030	AAGGT	2	10	507866	507875	40 %	20 %	40 %	0 %	479185514
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254	NC_021030	TCGTC	2	10	517333	517342	0 %	40 %	20 %	40 %	479185519
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257	NC_021030	TGTCG	2	10	522054	522063	0 %	40 %	40 %	20 %	479185522
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260	NC_021030	GTGGA	2	10	539606	539615	20 %	20 %	60 %	0 %	479185534
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389	NC_021030	CCATG	2	10	858139	858148	20 %	20 %	20 %	40 %	479185749
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391	NC_021030	CTGCA	2	10	862409	862418	20 %	20 %	20 %	40 %	479185750
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