MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 2471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021030	TTCTT	2	10	778692	778701	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
502	NC_021030	GCCGA	2	10	781757	781766	20 %	0 %	40 %	40 %	479185690
503	NC_021030	GCGCC	2	10	784071	784080	0 %	0 %	40 %	60 %	479185692
504	NC_021030	CATGG	2	10	785244	785253	20 %	20 %	40 %	20 %	479185693
505	NC_021030	CCGCG	2	10	790827	790836	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
506	NC_021030	CGAAA	2	10	790860	790869	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
507	NC_021030	CGGGC	2	10	791590	791599	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
508	NC_021030	AGCGG	2	10	792703	792712	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
509	NC_021030	AATAA	2	10	793674	793683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021030	CCGCG	2	10	793791	793800	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
511	NC_021030	GAAGT	2	10	793884	793893	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021030	AACCC	2	10	794002	794011	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
513	NC_021030	CCGTG	2	10	795759	795768	0 %	20 %	40 %	40 %	479185701
514	NC_021030	TTTTC	2	10	795840	795849	0 %	80 %	0 %	20 %	479185701
515	NC_021030	GGCCG	2	10	797823	797832	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
516	NC_021030	ACGCC	2	10	800317	800326	20 %	0 %	20 %	60 %	479185705
517	NC_021030	GAGAA	2	10	802124	802133	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021030	CGCGG	2	10	803142	803151	0 %	0 %	60 %	40 %	479185708
519	NC_021030	ATCCG	2	10	804900	804909	20 %	20 %	20 %	40 %	479185709
520	NC_021030	GAACG	2	10	806033	806042	40 %	0 %	40 %	20 %	479185710
521	NC_021030	CCGCG	2	10	806537	806546	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
522	NC_021030	GCCGT	2	10	807846	807855	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
523	NC_021030	CCCGC	2	10	808792	808801	0 %	0 %	20 %	80 %	479185711
524	NC_021030	TGCGC	2	10	808844	808853	0 %	20 %	40 %	40 %	479185711
525	NC_021030	CGGCG	2	10	809929	809938	0 %	0 %	60 %	40 %	479185712
526	NC_021030	GGCCC	2	10	810979	810988	0 %	0 %	40 %	60 %	479185712
527	NC_021030	CCGCG	2	10	811632	811641	0 %	0 %	40 %	60 %	479185713
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530	NC_021030	CCACG	2	10	815360	815369	20 %	0 %	20 %	60 %	479185715
531	NC_021030	CATAT	2	10	815457	815466	40 %	40 %	0 %	20 %	479185715
532	NC_021030	CCCAG	2	10	815776	815785	20 %	0 %	20 %	60 %	479185715
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537	NC_021030	CGATA	2	10	823565	823574	40 %	20 %	20 %	20 %	479185719
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540	NC_021030	TTTTA	2	10	829151	829160	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021030	ACGCT	2	10	829383	829392	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
542	NC_021030	GTACG	2	10	831220	831229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
543	NC_021030	GATCT	2	10	833545	833554	20 %	40 %	20 %	20 %	479185723
544	NC_021030	GGCGA	2	10	833926	833935	20 %	0 %	60 %	20 %	479185723
545	NC_021030	TTTTC	2	10	838432	838441	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
546	NC_021030	TTAGT	2	10	840157	840166	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021030	TGAAA	2	10	841267	841276	60 %	20 %	20 %	0 %	479185729
548	NC_021030	CTATA	2	10	843747	843756	40 %	40 %	0 %	20 %	479185731
549	NC_021030	GAAAA	2	10	844126	844135	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021030	CAACA	2	10	844598	844607	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
551	NC_021030	CCCTG	2	10	845288	845297	0 %	20 %	20 %	60 %	479185733
552	NC_021030	TTTCA	2	10	849113	849122	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
553	NC_021030	CCCGA	2	10	851281	851290	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
554	NC_021030	GCAGC	2	10	852875	852884	20 %	0 %	40 %	40 %	479185744
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558	NC_021030	ACGAT	2	10	857555	857564	40 %	20 %	20 %	20 %	479185748
559	NC_021030	CCAGA	2	10	857978	857987	40 %	0 %	20 %	40 %	479185749
560	NC_021030	CCATG	2	10	858139	858148	20 %	20 %	20 %	40 %	479185749
561	NC_021030	GTGCG	2	10	861680	861689	0 %	20 %	60 %	20 %	479185750
562	NC_021030	CTGCA	2	10	862409	862418	20 %	20 %	20 %	40 %	479185750
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565	NC_021030	CGATC	2	10	865907	865916	20 %	20 %	20 %	40 %	479185752
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567	NC_021030	TTCCG	2	10	867866	867875	0 %	40 %	20 %	40 %	479185753
568	NC_021030	CCGGA	2	10	868355	868364	20 %	0 %	40 %	40 %	479185753
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570	NC_021030	CGGAT	2	10	870391	870400	20 %	20 %	40 %	20 %	479185753
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573	NC_021030	GAGAT	2	10	883299	883308	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021030	CTGAA	2	10	883518	883527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
575	NC_021030	CCGTA	2	10	884973	884982	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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577	NC_021030	CTCGG	2	10	891548	891557	0 %	20 %	40 %	40 %	479185761
578	NC_021030	TACGG	2	10	892544	892553	20 %	20 %	40 %	20 %	479185761
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598	NC_021030	AACAA	2	10	926190	926199	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
599	NC_021030	ACCTT	2	10	926351	926360	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
600	NC_021030	GCGCA	2	10	929169	929178	20 %	0 %	40 %	40 %	479185783
601	NC_021030	TATGG	2	10	931275	931284	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_021030	GGCAG	2	10	931814	931823	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
604	NC_021030	GTTCG	2	10	932661	932670	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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609	NC_021030	ACCGT	2	10	935347	935356	20 %	20 %	20 %	40 %	479185785
610	NC_021030	ACCCC	2	10	935872	935881	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
611	NC_021030	TTCGT	2	10	939044	939053	0 %	60 %	20 %	20 %	479185787
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617	NC_021030	GGTGG	2	10	951660	951669	0 %	20 %	80 %	0 %	479185793
618	NC_021030	CGCTG	2	10	952407	952416	0 %	20 %	40 %	40 %	479185793
619	NC_021030	CTTCG	2	10	952452	952461	0 %	40 %	20 %	40 %	479185793
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626	NC_021030	GGTGA	2	10	969639	969648	20 %	20 %	60 %	0 %	479185804
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