MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 61869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021030	TCA	2	6	182209	182214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185270
3002	NC_021030	GAA	2	6	182303	182308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185270
3003	NC_021030	TCG	2	6	182337	182342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185270
3004	NC_021030	ATT	2	6	182415	182420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185270
3005	NC_021030	GCG	2	6	182433	182438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185270
3006	NC_021030	CCG	2	6	182481	182486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185270
3007	NC_021030	GAA	2	6	182609	182614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185270
3008	NC_021030	CGG	2	6	182637	182642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185270
3009	NC_021030	TTC	2	6	182693	182698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185270
3010	NC_021030	TCG	2	6	182748	182753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_021030	GCG	2	6	182837	182842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185271
3012	NC_021030	AAG	2	6	182914	182919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185271
3013	NC_021030	CGC	2	6	183087	183092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185271
3014	NC_021030	TTA	2	6	183171	183176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185271
3015	NC_021030	GTC	2	6	183181	183186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185271
3016	NC_021030	CTT	2	6	183189	183194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185271
3017	NC_021030	GTT	2	6	183209	183214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185271
3018	NC_021030	CCG	2	6	183287	183292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185271
3019	NC_021030	TGC	2	6	183349	183354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185271
3020	NC_021030	GTT	2	6	183405	183410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185272
3021	NC_021030	GTT	2	6	183642	183647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185272
3022	NC_021030	TAC	2	6	183651	183656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185272
3023	NC_021030	CCG	2	6	183703	183708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185272
3024	NC_021030	ATC	2	6	183759	183764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185272
3025	NC_021030	TAC	2	6	183851	183856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185273
3026	NC_021030	GCT	2	6	183876	183881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185273
3027	NC_021030	CGG	2	6	184015	184020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185273
3028	NC_021030	TTC	2	6	184049	184054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185273
3029	NC_021030	GCG	3	9	184080	184088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185273
3030	NC_021030	CGT	2	6	184129	184134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185273
3031	NC_021030	CGT	2	6	184428	184433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185274
3032	NC_021030	CCG	2	6	184434	184439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185274
3033	NC_021030	GAA	2	6	184589	184594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185275
3034	NC_021030	CTT	2	6	184632	184637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185275
3035	NC_021030	CTT	2	6	184660	184665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185275
3036	NC_021030	TTC	2	6	184730	184735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185275
3037	NC_021030	TAC	2	6	184774	184779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185275
3038	NC_021030	GTC	2	6	184780	184785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185275
3039	NC_021030	GGC	2	6	184809	184814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185275
3040	NC_021030	CGT	2	6	184818	184823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185275
3041	NC_021030	TAC	2	6	184969	184974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185275
3042	NC_021030	CTT	3	9	185041	185049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185275
3043	NC_021030	GGT	2	6	185098	185103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185275
3044	NC_021030	CGT	2	6	185166	185171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185275
3045	NC_021030	TTG	2	6	185189	185194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185275
3046	NC_021030	TTG	2	6	185447	185452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185275
3047	NC_021030	CGT	2	6	185780	185785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185276
3048	NC_021030	GTC	2	6	185910	185915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185276
3049	NC_021030	TGC	2	6	185918	185923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185276
3050	NC_021030	CGC	2	6	185927	185932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185276
3051	NC_021030	GCC	2	6	185962	185967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185276
3052	NC_021030	CCG	2	6	185968	185973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185276
3053	NC_021030	GGT	2	6	186030	186035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185276
3054	NC_021030	CGT	2	6	186050	186055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185276
3055	NC_021030	GTC	2	6	186144	186149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185276
3056	NC_021030	GCC	2	6	186273	186278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185277
3057	NC_021030	TTG	2	6	186349	186354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185277
3058	NC_021030	GCT	2	6	186418	186423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185277
3059	NC_021030	CGT	2	6	186425	186430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185277
3060	NC_021030	TCG	2	6	186466	186471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185277
3061	NC_021030	GCC	2	6	186477	186482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185277
3062	NC_021030	CGG	2	6	186568	186573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185277
3063	NC_021030	TAG	2	6	186626	186631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185277
3064	NC_021030	CTT	2	6	186710	186715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185277
3065	NC_021030	CTT	2	6	186741	186746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185277
3066	NC_021030	CGG	2	6	186836	186841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185277
3067	NC_021030	CTT	2	6	186866	186871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185277
3068	NC_021030	AGT	2	6	186952	186957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185277
3069	NC_021030	CAA	2	6	187009	187014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_021030	TAT	2	6	187022	187027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_021030	CAA	2	6	187075	187080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_021030	GGT	2	6	187110	187115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021030	AAG	2	6	187185	187190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_021030	TAT	2	6	187208	187213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021030	TCG	2	6	187293	187298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_021030	CGG	2	6	187371	187376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_021030	GCG	2	6	187390	187395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_021030	TAA	2	6	187607	187612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_021030	TAT	2	6	187742	187747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021030	GCC	2	6	187810	187815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_021030	GTT	2	6	187897	187902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021030	TAA	2	6	188173	188178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185278
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3084	NC_021030	GTT	2	6	188239	188244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185278
3085	NC_021030	GAA	2	6	188263	188268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185278
3086	NC_021030	AAC	2	6	188278	188283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185278
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3088	NC_021030	GAA	2	6	188800	188805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185279
3089	NC_021030	TTA	2	6	188877	188882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185279
3090	NC_021030	TAA	2	6	188892	188897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185279
3091	NC_021030	ATT	2	6	188921	188926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185279
3092	NC_021030	AAG	2	6	188934	188939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185279
3093	NC_021030	AGA	2	6	188988	188993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185279
3094	NC_021030	GAA	2	6	189010	189015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185279
3095	NC_021030	CGA	2	6	189073	189078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185279
3096	NC_021030	GTA	2	6	189237	189242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021030	CTT	2	6	189322	189327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185280
3098	NC_021030	TCG	2	6	189338	189343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185280
3099	NC_021030	TTC	2	6	189467	189472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185280
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3101	NC_021030	CTG	2	6	189597	189602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185281
3102	NC_021030	CTT	2	6	189696	189701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185281
3103	NC_021030	TCG	2	6	189746	189751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185281
3104	NC_021030	TTC	2	6	189861	189866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185281
3105	NC_021030	TTA	2	6	189934	189939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185281
3106	NC_021030	TGA	2	6	189973	189978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185281
3107	NC_021030	CTT	2	6	190060	190065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185281
3108	NC_021030	TTC	2	6	190083	190088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185281
3109	NC_021030	TAC	2	6	190431	190436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185281
3110	NC_021030	ATA	2	6	190471	190476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185281
3111	NC_021030	CGG	2	6	190510	190515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185281
3112	NC_021030	GGC	2	6	190518	190523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185281
3113	NC_021030	GGC	2	6	190544	190549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185281
3114	NC_021030	GGT	2	6	190589	190594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185281
3115	NC_021030	CGC	2	6	190602	190607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185281
3116	NC_021030	TTG	2	6	190636	190641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185281
3117	NC_021030	CTT	2	6	190700	190705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185281
3118	NC_021030	CGC	2	6	190897	190902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185281
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3241	NC_021030	ATT	2	6	199064	199069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185290
3242	NC_021030	GTA	2	6	199139	199144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185290
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3362	NC_021030	ATT	2	6	207069	207074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185302
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3479	NC_021030	TTA	2	6	216288	216293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3484	NC_021030	CGG	2	6	216561	216566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3485	NC_021030	TCG	2	6	216627	216632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3486	NC_021030	AAG	2	6	216686	216691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3487	NC_021030	CAA	2	6	216766	216771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185315
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