MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 1529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021028	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	480535789
2	NC_021028	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	480535789
3	NC_021028	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	480535789
4	NC_021028	GTAAA	2	10	2631	2640	60 %	20 %	20 %	0 %	480535790
5	NC_021028	AAAAT	2	10	3018	3027	80 %	20 %	0 %	0 %	480535791
6	NC_021028	TGAAA	2	10	3159	3168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021028	AAACA	2	10	4420	4429	80 %	0 %	0 %	20 %	480535793
8	NC_021028	TCAAT	2	10	6047	6056	40 %	40 %	0 %	20 %	480535794
9	NC_021028	TTTTC	2	10	6087	6096	0 %	80 %	0 %	20 %	480535794
10	NC_021028	TAAAT	2	10	6605	6614	60 %	40 %	0 %	0 %	480535794
11	NC_021028	ACTCT	2	10	6686	6695	20 %	40 %	0 %	40 %	480535794
12	NC_021028	AAACG	2	10	7929	7938	60 %	0 %	20 %	20 %	480535794
13	NC_021028	TTGGT	2	10	8158	8167	0 %	60 %	40 %	0 %	480535794
14	NC_021028	CAATT	2	10	8227	8236	40 %	40 %	0 %	20 %	480535794
15	NC_021028	AGGAA	2	10	9243	9252	60 %	0 %	40 %	0 %	480535797
16	NC_021028	ATTGA	2	10	10661	10670	40 %	40 %	20 %	0 %	480535799
17	NC_021028	ATTCT	2	10	12794	12803	20 %	60 %	0 %	20 %	480535801
18	NC_021028	TCGTG	2	10	16410	16419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021028	GTTAA	2	10	17131	17140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021028	GGGAG	2	10	17649	17658	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021028	AGGGA	2	10	19860	19869	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021028	TTGAA	2	10	20064	20073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021028	ATGGT	2	10	22450	22459	20 %	40 %	40 %	0 %	480535804
24	NC_021028	CTTTT	2	10	23618	23627	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021028	TAGAT	2	10	30898	30907	40 %	40 %	20 %	0 %	480535819
26	NC_021028	CTTAT	2	10	31406	31415	20 %	60 %	0 %	20 %	480535821
27	NC_021028	GAAGA	2	10	33279	33288	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021028	CAGAA	2	10	34286	34295	60 %	0 %	20 %	20 %	480535827
29	NC_021028	TTTTG	2	10	34536	34545	0 %	80 %	20 %	0 %	480535828
30	NC_021028	GAATG	2	10	34625	34634	40 %	20 %	40 %	0 %	480535828
31	NC_021028	GAAAC	2	10	38320	38329	60 %	0 %	20 %	20 %	480535833
32	NC_021028	TCTAA	2	10	38663	38672	40 %	40 %	0 %	20 %	480535833
33	NC_021028	CTCTT	2	10	39284	39293	0 %	60 %	0 %	40 %	480535833
34	NC_021028	AGTTG	2	10	40108	40117	20 %	40 %	40 %	0 %	480535835
35	NC_021028	ACAAG	2	10	40486	40495	60 %	0 %	20 %	20 %	480535835
36	NC_021028	GGGTG	2	10	41696	41705	0 %	20 %	80 %	0 %	480535837
37	NC_021028	CCTAT	2	10	42017	42026	20 %	40 %	0 %	40 %	480535838
38	NC_021028	ATGAC	2	10	42743	42752	40 %	20 %	20 %	20 %	480535841
39	NC_021028	AGCTG	2	10	45831	45840	20 %	20 %	40 %	20 %	480535843
40	NC_021028	GGTCA	2	10	47640	47649	20 %	20 %	40 %	20 %	480535844
41	NC_021028	ATTTT	2	10	57712	57721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021028	AATCA	2	10	64699	64708	60 %	20 %	0 %	20 %	480535861
43	NC_021028	AGCAG	2	10	65370	65379	40 %	0 %	40 %	20 %	480535862
44	NC_021028	TTGAT	2	10	72808	72817	20 %	60 %	20 %	0 %	480535867
45	NC_021028	CAGAT	2	10	75003	75012	40 %	20 %	20 %	20 %	480535869
46	NC_021028	TTTAC	2	10	75705	75714	20 %	60 %	0 %	20 %	480535869
47	NC_021028	AGAGG	2	10	76567	76576	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021028	GTGAC	2	10	79336	79345	20 %	20 %	40 %	20 %	480535872
49	NC_021028	GTGAT	2	10	80326	80335	20 %	40 %	40 %	0 %	480535872
50	NC_021028	TGGCT	2	10	83146	83155	0 %	40 %	40 %	20 %	480535873
51	NC_021028	AAATG	2	10	83752	83761	60 %	20 %	20 %	0 %	480535873
52	NC_021028	AGCTA	2	10	84646	84655	40 %	20 %	20 %	20 %	480535874
53	NC_021028	CCTTG	2	10	87536	87545	0 %	40 %	20 %	40 %	480535877
54	NC_021028	TCAAA	2	10	87730	87739	60 %	20 %	0 %	20 %	480535877
55	NC_021028	GCAAG	2	10	89399	89408	40 %	0 %	40 %	20 %	480535878
56	NC_021028	AGTGG	2	10	90097	90106	20 %	20 %	60 %	0 %	480535879
57	NC_021028	GGGTG	2	10	90135	90144	0 %	20 %	80 %	0 %	480535879
58	NC_021028	CTATT	2	10	91111	91120	20 %	60 %	0 %	20 %	480535880
59	NC_021028	GAAGC	2	10	91301	91310	40 %	0 %	40 %	20 %	480535880
60	NC_021028	GCTTG	2	10	91756	91765	0 %	40 %	40 %	20 %	480535882
61	NC_021028	GCTTT	2	10	93185	93194	0 %	60 %	20 %	20 %	480535883
62	NC_021028	TCTGG	2	10	93779	93788	0 %	40 %	40 %	20 %	480535883
63	NC_021028	AGCAT	2	10	94733	94742	40 %	20 %	20 %	20 %	480535883
64	NC_021028	TACCA	2	10	95431	95440	40 %	20 %	0 %	40 %	480535883
65	NC_021028	TTCCT	2	10	96448	96457	0 %	60 %	0 %	40 %	480535883
66	NC_021028	TTATT	2	10	97029	97038	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021028	TTGGT	2	10	100404	100413	0 %	60 %	40 %	0 %	480535886
68	NC_021028	CTTCA	2	10	101459	101468	20 %	40 %	0 %	40 %	480535887
69	NC_021028	AATCA	2	10	101571	101580	60 %	20 %	0 %	20 %	480535888
70	NC_021028	ATTCA	2	10	102945	102954	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021028	AGCTC	2	10	103789	103798	20 %	20 %	20 %	40 %	480535890
72	NC_021028	TTAAA	2	10	105392	105401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021028	TTATC	2	10	105466	105475	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021028	GCTCC	2	10	108024	108033	0 %	20 %	20 %	60 %	480535895
75	NC_021028	GCTGT	2	10	108342	108351	0 %	40 %	40 %	20 %	480535895
76	NC_021028	TATCA	2	10	108666	108675	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021028	TCTAT	2	10	109500	109509	20 %	60 %	0 %	20 %	480535896
78	NC_021028	AGAAA	2	10	110425	110434	80 %	0 %	20 %	0 %	480535896
79	NC_021028	GAAAG	2	10	110477	110486	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021028	TGACT	2	10	113471	113480	20 %	40 %	20 %	20 %	480535898
81	NC_021028	AGGGC	2	10	116906	116915	20 %	0 %	60 %	20 %	480535900
82	NC_021028	ATAAA	2	10	119202	119211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021028	TAACC	2	10	119300	119309	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_021028	ATTCT	2	10	119475	119484	20 %	60 %	0 %	20 %	480535902
85	NC_021028	TTACT	2	10	123118	123127	20 %	60 %	0 %	20 %	480535905
86	NC_021028	TGGGA	2	10	123772	123781	20 %	20 %	60 %	0 %	480535905
87	NC_021028	TGCTT	2	10	124645	124654	0 %	60 %	20 %	20 %	480535906
88	NC_021028	TGGCT	2	10	124828	124837	0 %	40 %	40 %	20 %	480535906
89	NC_021028	AGATA	2	10	128900	128909	60 %	20 %	20 %	0 %	480535911
90	NC_021028	GTTTG	2	10	129067	129076	0 %	60 %	40 %	0 %	480535911
91	NC_021028	TATTT	2	10	131016	131025	20 %	80 %	0 %	0 %	480535913
92	NC_021028	AAAGC	2	10	133926	133935	60 %	0 %	20 %	20 %	480535915
93	NC_021028	GGCTT	2	10	135350	135359	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021028	CACAA	2	10	135689	135698	60 %	0 %	0 %	40 %	480535917
95	NC_021028	GGAAT	2	10	138596	138605	40 %	20 %	40 %	0 %	480535920
96	NC_021028	AGGAT	2	10	139161	139170	40 %	20 %	40 %	0 %	480535921
97	NC_021028	CTTTG	2	10	140470	140479	0 %	60 %	20 %	20 %	480535921
98	NC_021028	GGCTT	2	10	140723	140732	0 %	40 %	40 %	20 %	480535921
99	NC_021028	TCTTT	2	10	143340	143349	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_021028	ACAGT	2	10	150295	150304	40 %	20 %	20 %	20 %	480535928
101	NC_021028	AATAA	2	10	151039	151048	80 %	20 %	0 %	0 %	480535929
102	NC_021028	GCTTT	2	10	153284	153293	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021028	TATTG	2	10	153321	153330	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021028	ATTTT	2	10	153419	153428	20 %	80 %	0 %	0 %	480535933
105	NC_021028	CAAAG	2	10	158670	158679	60 %	0 %	20 %	20 %	480535938
106	NC_021028	TAAAA	2	10	159146	159155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021028	TTCTA	2	10	159731	159740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021028	ACTAA	2	10	160674	160683	60 %	20 %	0 %	20 %	480535942
109	NC_021028	ATTAA	2	10	162697	162706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021028	CGTGG	2	10	163522	163531	0 %	20 %	60 %	20 %	480535943
111	NC_021028	GTGAA	2	10	164524	164533	40 %	20 %	40 %	0 %	480535944
112	NC_021028	AAGCA	2	10	168169	168178	60 %	0 %	20 %	20 %	480535946
113	NC_021028	GTTTG	2	10	169441	169450	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021028	ACATG	2	10	169574	169583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_021028	GAAAA	2	10	170166	170175	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021028	TTGGA	2	10	170451	170460	20 %	40 %	40 %	0 %	480535950
117	NC_021028	GTCTA	2	10	170582	170591	20 %	40 %	20 %	20 %	480535950
118	NC_021028	ATGTT	2	10	180542	180551	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021028	ACAAA	2	10	181057	181066	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021028	TTTTC	2	10	182469	182478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021028	GAAAT	2	10	183279	183288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021028	TTAGT	2	10	184150	184159	20 %	60 %	20 %	0 %	480535957
123	NC_021028	CTTGC	2	10	184506	184515	0 %	40 %	20 %	40 %	480535957
124	NC_021028	GGCCT	2	10	185460	185469	0 %	20 %	40 %	40 %	480535958
125	NC_021028	CTGTT	2	10	186028	186037	0 %	60 %	20 %	20 %	480535958
126	NC_021028	AGAAA	2	10	187564	187573	80 %	0 %	20 %	0 %	480535961
127	NC_021028	TATAC	2	10	189525	189534	40 %	40 %	0 %	20 %	480535962
128	NC_021028	AGATC	2	10	189830	189839	40 %	20 %	20 %	20 %	480535963
129	NC_021028	TGGTC	2	10	190918	190927	0 %	40 %	40 %	20 %	480535964
130	NC_021028	TTTGT	2	10	191839	191848	0 %	80 %	20 %	0 %	480535965
131	NC_021028	ACTAT	2	10	195845	195854	40 %	40 %	0 %	20 %	480535968
132	NC_021028	TGAAA	2	10	197246	197255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021028	TTGAG	2	10	198425	198434	20 %	40 %	40 %	0 %	480535971
134	NC_021028	ATTTC	2	10	198772	198781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021028	GCCTT	2	10	200399	200408	0 %	40 %	20 %	40 %	480535974
136	NC_021028	AAGTA	2	10	203181	203190	60 %	20 %	20 %	0 %	480535976
137	NC_021028	TTGAT	2	10	204340	204349	20 %	60 %	20 %	0 %	480535977
138	NC_021028	TCACT	2	10	204715	204724	20 %	40 %	0 %	40 %	480535978
139	NC_021028	ATTTT	2	10	205038	205047	20 %	80 %	0 %	0 %	480535978
140	NC_021028	TTAAG	2	10	205390	205399	40 %	40 %	20 %	0 %	480535978
141	NC_021028	CCCTG	2	10	206022	206031	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_021028	TCAGG	2	10	206305	206314	20 %	20 %	40 %	20 %	480535979
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150	NC_021028	AAGGA	2	10	218496	218505	60 %	0 %	40 %	0 %	480535992
151	NC_021028	ATGAT	2	10	221246	221255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021028	GTAGA	2	10	221417	221426	40 %	20 %	40 %	0 %	480535995
153	NC_021028	TTTAG	2	10	221902	221911	20 %	60 %	20 %	0 %	480535995
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156	NC_021028	AGCAG	2	10	225882	225891	40 %	0 %	40 %	20 %	480535998
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165	NC_021028	GTTCA	2	10	235122	235131	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_021028	TCCAA	2	10	238223	238232	40 %	20 %	0 %	40 %	480536022
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169	NC_021028	ATCGA	2	10	239677	239686	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_021028	TGGTG	2	10	243414	243423	0 %	40 %	60 %	0 %	480536030
173	NC_021028	TCTGT	2	10	243833	243842	0 %	60 %	20 %	20 %	480536030
174	NC_021028	TGGAT	2	10	243843	243852	20 %	40 %	40 %	0 %	480536030
175	NC_021028	TTTTA	2	10	244300	244309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021028	AAGAT	2	10	245346	245355	60 %	20 %	20 %	0 %	480536032
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179	NC_021028	CTATC	2	10	250292	250301	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
180	NC_021028	AAGTC	2	10	251040	251049	40 %	20 %	20 %	20 %	480536037
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183	NC_021028	GCCAT	2	10	257512	257521	20 %	20 %	20 %	40 %	480536043
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199	NC_021028	CGTAT	2	10	281160	281169	20 %	40 %	20 %	20 %	480536058
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251	NC_021028	GAAAA	2	10	334220	334229	80 %	0 %	20 %	0 %	480536108
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259	NC_021028	AGCTA	2	10	342928	342937	40 %	20 %	20 %	20 %	480536114
260	NC_021028	ACTCT	2	10	343546	343555	20 %	40 %	0 %	40 %	480536114
261	NC_021028	TGCTT	2	10	344622	344631	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
262	NC_021028	ACTTC	2	10	346148	346157	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
263	NC_021028	ATACT	2	10	346897	346906	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_021028	TGATG	2	10	349237	349246	20 %	40 %	40 %	0 %	480536116
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266	NC_021028	GTTTT	2	10	352276	352285	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_021028	ACAAA	2	10	353408	353417	80 %	0 %	0 %	20 %	480536120
268	NC_021028	TTCTT	2	10	354699	354708	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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