MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 21469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021028	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535789
2	NC_021028	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535789
3	NC_021028	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535789
4	NC_021028	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535789
5	NC_021028	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535789
6	NC_021028	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535789
7	NC_021028	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535789
8	NC_021028	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535789
9	NC_021028	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535789
10	NC_021028	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535789
11	NC_021028	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535789
12	NC_021028	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535789
13	NC_021028	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535789
14	NC_021028	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535789
15	NC_021028	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535790
16	NC_021028	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535790
17	NC_021028	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535790
18	NC_021028	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535790
19	NC_021028	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535790
20	NC_021028	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535790
21	NC_021028	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535790
22	NC_021028	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535790
23	NC_021028	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535790
24	NC_021028	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535790
25	NC_021028	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535790
26	NC_021028	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535790
27	NC_021028	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535790
28	NC_021028	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535790
29	NC_021028	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535791
30	NC_021028	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535791
31	NC_021028	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535791
32	NC_021028	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535791
33	NC_021028	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
34	NC_021028	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
35	NC_021028	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535792
36	NC_021028	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535792
37	NC_021028	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535792
38	NC_021028	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
39	NC_021028	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
40	NC_021028	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535792
41	NC_021028	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
42	NC_021028	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535792
43	NC_021028	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
44	NC_021028	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535792
45	NC_021028	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
46	NC_021028	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535792
47	NC_021028	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
48	NC_021028	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
49	NC_021028	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535793
50	NC_021028	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535793
51	NC_021028	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535793
52	NC_021028	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535793
53	NC_021028	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535793
54	NC_021028	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535793
55	NC_021028	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535793
56	NC_021028	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535793
57	NC_021028	ACT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535793
58	NC_021028	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
59	NC_021028	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535794
60	NC_021028	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
61	NC_021028	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
62	NC_021028	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535794
63	NC_021028	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535794
64	NC_021028	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
65	NC_021028	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535794
66	NC_021028	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
67	NC_021028	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
68	NC_021028	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
69	NC_021028	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
70	NC_021028	AGA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
71	NC_021028	AGA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
72	NC_021028	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
73	NC_021028	GGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535794
74	NC_021028	CGT	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535794
75	NC_021028	ACA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535794
76	NC_021028	TGT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535794
77	NC_021028	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535794
78	NC_021028	TGA	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
79	NC_021028	TGA	4	12	6731	6742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
80	NC_021028	TGA	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
81	NC_021028	GAT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
82	NC_021028	GTA	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
83	NC_021028	CGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535794
84	NC_021028	TGT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535794
85	NC_021028	TGA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
86	NC_021028	TGA	2	6	7160	7165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
87	NC_021028	GAA	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
88	NC_021028	CCG	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535794
89	NC_021028	ACA	2	6	7423	7428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535794
90	NC_021028	GAC	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535794
91	NC_021028	TAT	2	6	7583	7588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
92	NC_021028	TTA	2	6	7908	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
93	NC_021028	GTA	2	6	8136	8141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
94	NC_021028	ATA	2	6	8215	8220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535794
95	NC_021028	ATT	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
96	NC_021028	TTA	2	6	8409	8414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
97	NC_021028	GAA	2	6	8433	8438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
98	NC_021028	CGT	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535795
99	NC_021028	TGC	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535795
100	NC_021028	GCA	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535795
101	NC_021028	AGA	2	6	8759	8764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535795
102	NC_021028	AAT	2	6	8791	8796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535796
103	NC_021028	CGT	2	6	8821	8826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535796
104	NC_021028	TGA	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535796
105	NC_021028	TAT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535796
106	NC_021028	TGA	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535796
107	NC_021028	TGC	2	6	9051	9056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535796
108	NC_021028	TAT	2	6	9079	9084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535796
109	NC_021028	TTA	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535797
110	NC_021028	GAA	2	6	9197	9202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535797
111	NC_021028	ATT	2	6	9220	9225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535797
112	NC_021028	AAG	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535797
113	NC_021028	ATT	2	6	9270	9275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535798
114	NC_021028	TTG	2	6	9276	9281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535798
115	NC_021028	AGT	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535798
116	NC_021028	TTA	2	6	9353	9358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535798
117	NC_021028	TAG	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535798
118	NC_021028	ATC	2	6	9547	9552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535798
119	NC_021028	CAA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535798
120	NC_021028	AAG	2	6	9667	9672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535798
121	NC_021028	ATC	2	6	9677	9682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535798
122	NC_021028	GAA	2	6	9789	9794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535798
123	NC_021028	ACT	2	6	9876	9881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535798
124	NC_021028	AAG	2	6	9886	9891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535798
125	NC_021028	TAT	2	6	9951	9956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535798
126	NC_021028	ATA	2	6	10081	10086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535798
127	NC_021028	GAT	2	6	10221	10226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535798
128	NC_021028	TCT	2	6	10251	10256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535798
129	NC_021028	AAG	2	6	10553	10558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535799
130	NC_021028	TGG	2	6	10600	10605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535799
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250	NC_021028	GTA	2	6	26103	26108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535807
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252	NC_021028	AGT	2	6	26269	26274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535807
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254	NC_021028	TCA	2	6	26350	26355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535807
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378	NC_021028	ATG	2	6	36906	36911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
379	NC_021028	ATC	2	6	36944	36949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535831
380	NC_021028	TGA	2	6	37123	37128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
381	NC_021028	GTG	2	6	37178	37183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535831
382	NC_021028	GAA	2	6	37259	37264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535831
383	NC_021028	TGA	2	6	37360	37365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
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393	NC_021028	GTG	2	6	38025	38030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535831
394	NC_021028	TGA	2	6	38034	38039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
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400	NC_021028	GAA	2	6	38890	38895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535833
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500	NC_021028	GTT	2	6	46180	46185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535843

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